ПАКС5

ПАКС5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1K78, 1MDM
Идентификаторы
Псевдонимы	PAX5 , ALL3, BSAP, спаренная коробка 5, PAX-5
Внешние идентификаторы	Опустить : 167414 ; МГИ : 97489 ; Гомологен : 56419 ; Генные карты : PAX5 ; ОМА : PAX5 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	37,034,268 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	44,710,487 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; epithelium of nasopharynx; ; lymph node; ; appendix; ; bone marrow cells; ; spleen; ; mucosa of ileum; ; granulocyte; ; blood; ; tonsil;
	Top expressed in
	spleen; ; mesenteric lymph nodes; ; blood; ; female urethra; ; substantia nigra; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; secondary oocyte; ; zygote; ; granulocyte; ; lumbar spinal ganglion;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; fibrillar center; cytosol; intracellular membrane-bounded organelle; nucleoplasm;
Biological process	cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; lateral ventricle development; human ageing; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; nervous system development; multicellular organism development; adult behavior; humoral immune response; spermatogenesis; negative regulation of histone H3-K9 methylation; cerebral cortex development; animal organ morphogenesis; skeletal muscle cell differentiation; embryonic cranial skeleton morphogenesis; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; regulation of B cell receptor signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5079
	18507
	ENSG00000196092
	ENSMUSG00000014030
	Q02548
	Q02650
показывать НМ_001280547 ; НМ_001280548 ; НМ_001280549 ; НМ_001280550 ; НМ_001280551 ;
	NM_001280552; NM_001280553; NM_001280554; NM_001280555; NM_001280556; NM_016734
	НМ_008782
показывать НП_001267476 ; НП_001267477 ; НП_001267478 ; НП_001267479 ; НП_001267480 ;
	NP_001267481; NP_001267482; NP_001267483; NP_001267484; NP_001267485; NP_057953; NP_001267480.1
	НП_032808
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок парного бокса Pax-5 — это белок , который у человека кодируется PAX5 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Ген PAX5 является членом парного бокса (PAX) семейства транскрипционных факторов . Центральной особенностью этого семейства генов является новый высококонсервативный ДНК-связывающий домен , известный как парный ящик . Белки PAX являются важными регуляторами раннего развития, и считается, что изменения в экспрессии их генов способствуют неопластической трансформации . Ген PAX5 кодирует белок-специфический активатор линии B-клеток (BSAP), который экспрессируется на ранних, но не поздних стадиях дифференцировки B-клеток. Его экспрессия также была обнаружена в развитии ЦНС и семенников, поэтому продукт гена PAX5 может не только играть важную роль в дифференцировке B-клеток, но также в развитии нервной системы и сперматогенезе . ^[7]

Клиническое значение

Ген PAX5 расположен в районе хромосомы 9p13, который участвует в транслокациях t(9;14)(p13;q32), рецидивирующих при мелких лимфомах плазмоцитоидного лимфоцитарных подтипа и в производных крупноклеточных лимфомах. Эта транслокация приводит к тому, что мощный энхансер E-mu локуса гена IgH оказывается в непосредственной близости от промоторов PAX5, что позволяет предположить, что нарушение регуляции транскрипции гена PAX5 способствует патогенезу этих лимфом. ^[7]

До 97% клеток Рида-Штернберга экспрессируют лимфомы Ходжкина Pax-5. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что PAX5 взаимодействует с TLE4. ^[9]^[10] и белок 6, ассоциированный со смертью . ^[11]

См. также

Гены Пакса

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196092 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014030 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Адамс Б., Дорфлер П., Агуцци А., Козьмик З., Урбанек П., Маурер-Фоги И., Бусслингер М. (сентябрь 1992 г.). «Pax-5 кодирует фактор транскрипции BSAP и экспрессируется в B-лимфоцитах, развивающейся ЦНС и семенниках взрослых» . Гены и развитие . 6 (9): 1589–607. дои : 10.1101/gad.6.9.1589 . ПМИД 1516825 .
^ Пильц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт С.М. (март 1993 г.). «Картирование человеческих гомологов мышиных генов, содержащих парный ящик». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. дои : 10.1007/BF00290430 . ПМИД 8431641 . S2CID 30845070 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: ген 5 парного бокса PAX5 (специфический активатор линии B-клеток)» .
^ Торлакович Э., Торлакович Г., Нгуен П.Л., Бруннинг Р.Д., Делаби Дж. (октябрь 2002 г.). «Ценность иммуноокрашивания анти-pax-5 в обычно фиксированных и залитых в парафин срезах: новый пан-маркер пре-B и B-клеток». Американский журнал хирургической патологии . 26 (10): 1343–50. дои : 10.1097/00000478-200210000-00011 . ПМИД 12360049 . S2CID 7703197 .
^ Эберхард Д., Хименес Г., Хиви Б., Бусслингер М. (май 2000 г.). «Репрессия транскрипции Pax5 (BSAP) посредством взаимодействия с корепрессорами семейства Граучо» . Журнал ЭМБО . 19 (10): 2292–303. дои : 10.1093/emboj/19.10.2292 . ПМЦ 384353 . ПМИД 10811620 .
^ Милили М., Готье Л., Веран Дж., Маттей М.Г., Шифф С. (август 2002 г.). «Новый белок Groucho TLE4 может регулировать репрессивную активность Pax5 в В-лимфоцитах человека» . Иммунология . 106 (4): 447–55. дои : 10.1046/j.1365-2567.2002.01456.x . ПМЦ 1782747 . ПМИД 12153506 .
^ Емельянов А.В., Ковач Ч.Р., Сепульведа М.А., Бирштейн Б.К. (март 2002 г.). «Взаимодействие Pax5 (BSAP) с Daxx может привести к активации транскрипции в B-клетках» . Журнал биологической химии . 277 (13): 11156–64. дои : 10.1074/jbc.M111763200 . ПМИД 11799127 .

Дальнейшее чтение

Хэгман Дж., Уит В., Фицсиммонс Д., Ходсдон В., Негри Дж., Дизон Ф. (1999). «Pax-5/BSAP: регулятор специфической экспрессии и дифференцировки генов в B-лимфоцитах». Трансдукция сигнала и координация развития и функции В-лимфоцитов I. Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 245. стр. 169–94. дои : 10.1007/978-3-642-57066-7_5 . ISBN 978-3-642-63017-0 . ПМИД 10533313 .
Каламе К.Л., Лин К.И., Туняплин С. (2003). «Регуляторные механизмы, определяющие развитие и функцию плазматических клеток». Ежегодный обзор иммунологии . 21 : 205–30. doi : 10.1146/annurev.immunol.21.120601.141138 . ПМИД 12524387 .
Каротта С., Холмс М.Л., Приданс К., Натт С.Л. (ноябрь 2006 г.). «Pax5 поддерживает клеточную идентичность, подавляя экспрессию генов во время дифференцировки B-клеток» . Клеточный цикл . 5 (21): 2452–6. дои : 10.4161/cc.5.21.3396 . hdl : 20.500.11820/32181dc9-83a3-496f-be53-c380d717da39 . ПМИД 17102626 .
Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козьмик З., Бусслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семейства PAX-9». Природная генетика . 3 (4): 292–8. дои : 10.1038/ng0493-292 . ПМИД 7981748 . S2CID 21338655 .
Бусслингер М., Кликс Н., Пфеффер П., Гранингер П.Г., Козьмик З. (июнь 1996 г.). «Нарушение регуляции PAX-5 путем транслокации энхансера Emu локуса IgH, соседнего с двумя альтернативными промоторами PAX-5 при диффузной крупноклеточной лимфоме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (12): 6129–34. Бибкод : 1996PNAS...93.6129B . дои : 10.1073/pnas.93.12.6129 . ПМК 39201 . ПМИД 8650231 .
Иида С., Рао П.Х., Налласивам П., Хибшуш Х., Батлер М., Луи Д.К., Демин В., Оно Х., Чаганти Р.С., Далла-Фавера Р. (декабрь 1996 г.). «Хромосомная транслокация t(9;14)(p13;q32), связанная с лимфоплазмоцитоидной лимфомой, включает ген PAX-5» . Кровь . 88 (11): 4110–7. дои : 10.1182/blood.V88.11.4110.4110 . ПМИД 8943844 .
Канеко Х, Ариясу Т, Иноуэ Р, Фукао Т, Касахара К, Терамото Т, Мацуи Э, Хаякава С, Кондо Н (февраль 1998 г.). «Экспрессия гена Pax5 в кроветворных клетках и тканях человека: сравнение с иммунодефицитными донорами» . Клиническая и экспериментальная иммунология . 111 (2): 339–44. дои : 10.1046/j.1365-2249.1998.00509.x . ПМК 1904901 . ПМИД 9486401 .
Веркочи Л.К., Беринштейн Н.Л. (октябрь 1998 г.). «Выделение генов, отрицательно или положительно коэкспрессируемых с геном 1, активирующим рекомбинацию человека (RAG1), с помощью дифференциальной ПЦР-дисплея (DD RT-PCR)» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (19): 4497–507. дои : 10.1093/нар/26.19.4497 . ПМК 147860 . ПМИД 9742255 .
Уит В., Фитцсиммонс Д., Леннокс Х., Крауткрамер С.Р., Джентиле Л.Н., Макинтош Л.П., Хэгман Дж. (март 1999 г.). «Высококонсервативная бета-шпилька парного ДНК-связывающего домена необходима для сборки тройных комплексов Pax-Ets» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (3): 2231–41. дои : 10.1128/mcb.19.3.2231 . ПМК 84016 . ПМИД 10022910 .
Эберхард Д., Бусслингер М. (апрель 1999 г.). «Частичный гомеодомен фактора транскрипции Pax-5 (BSAP) представляет собой мотив взаимодействия ретинобластомы и ТАТА-связывающих белков». Исследования рака . 59 (7 дополнений): 1716–1724 гг., обсуждение 1724–1725 гг. ПМИД 10197586 .
Либерманн Т.А., Пан З., Акбарали Ю., Хетерингтон С.Дж., Болтакс Дж., Йерго Д.А., Чжан Д.Е. (август 1999 г.). «AML1 (CBFalpha2) взаимодействует со специфичным для B-клеток активирующим белком (BSAP/PAX5) при активации промотора гена BLK, специфичного для B-клеток» . Журнал биологической химии . 274 (35): 24671–6. дои : 10.1074/jbc.274.35.24671 . ПМИД 10455134 .
Натт С.Л., Хиви Б., Ролинк АГ, Басслингер М. (октябрь 1999 г.). «Приверженность B-лимфоидной линии зависит от транскрипционного фактора Pax5». Природа . 401 (6753): 556–62. Бибкод : 1999Natur.401..556N . дои : 10.1038/44076 . ПМИД 10524622 . S2CID 4414876 .
Ролинк АГ, Натт С.Л., Мельчерс Ф., Басслингер М. (октябрь 1999 г.). «Долгосрочное восстановление развития Т-клеток in vivo предшественниками В-клеток с дефицитом Pax5». Природа . 401 (6753): 603–6. Бибкод : 1999Natur.401..603R . дои : 10.1038/44164 . ПМИД 10524629 . S2CID 12257992 .
Ковач Ч.Р., Емельянов А., Сингх М., Ашуян Н., Бирштейн Б.К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие BSAP (Pax5)-импортин альфа 1 (Rch1) идентифицирует последовательность ядерной локализации» . Журнал биологической химии . 275 (22): 16752–7. дои : 10.1074/jbc.M001551200 . ПМИД 10748034 .
Эберхард Д., Хименес Г., Хиви Б., Бусслингер М. (май 2000 г.). «Репрессия транскрипции Pax5 (BSAP) посредством взаимодействия с корепрессорами семейства Граучо» . Журнал ЭМБО . 19 (10): 2292–303. дои : 10.1093/emboj/19.10.2292 . ПМЦ 384353 . ПМИД 10811620 .
Робертс Э.К., Дид Р.В., Иноуэ Т., Нортон Дж.Д., Шаррокс А.Д. (январь 2001 г.). «Белки id спираль-петля-спираль противодействуют активности фактора транскрипции pax, ингибируя связывание ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (2): 524–33. дои : 10.1128/MCB.21.2.524-533.2001 . ПМЦ 86614 . ПМИД 11134340 .
Паскуалуччи Л., Ноймайстер П., Гуссенс Т., Нанджангуд Г., Чаганти Р.С., Купперс Р., Далла-Фавера Р. (июль 2001 г.). «Гипермутация множественных протоонкогенов в В-клеточных диффузных крупноклеточных лимфомах». Природа . 412 (6844): 341–6. Бибкод : 2001Natur.412..341P . дои : 10.1038/35085588 . ПМИД 11460166 . S2CID 4373198 .

Внешние ссылки

PAX5 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук PAX5
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q02548 (белок спаренного бокса Pax-5) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196092 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014030 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1516825-5] Адамс Б., Дорфлер П., Агуцци А., Козьмик З., Урбанек П., Маурер-Фоги И., Бусслингер М. (сентябрь 1992 г.). «Pax-5 кодирует фактор транскрипции BSAP и экспрессируется в B-лимфоцитах, развивающейся ЦНС и семенниках взрослых» . Гены и развитие . 6 (9): 1589–607. дои : 10.1101/gad.6.9.1589 . ПМИД 1516825 .

[pmid8431641-6] Пильц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт С.М. (март 1993 г.). «Картирование человеческих гомологов мышиных генов, содержащих парный ящик». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. дои : 10.1007/BF00290430 . ПМИД 8431641 . S2CID 30845070 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: ген 5 парного бокса PAX5 (специфический активатор линии B-клеток)» .

[pmid12360049-8] Торлакович Э., Торлакович Г., Нгуен П.Л., Бруннинг Р.Д., Делаби Дж. (октябрь 2002 г.). «Ценность иммуноокрашивания анти-pax-5 в обычно фиксированных и залитых в парафин срезах: новый пан-маркер пре-B и B-клеток». Американский журнал хирургической патологии . 26 (10): 1343–50. дои : 10.1097/00000478-200210000-00011 . ПМИД 12360049 . S2CID 7703197 .

[pmid10811620-9] Эберхард Д., Хименес Г., Хиви Б., Бусслингер М. (май 2000 г.). «Репрессия транскрипции Pax5 (BSAP) посредством взаимодействия с корепрессорами семейства Граучо» . Журнал ЭМБО . 19 (10): 2292–303. дои : 10.1093/emboj/19.10.2292 . ПМЦ 384353 . ПМИД 10811620 .

[pmid12153506-10] Милили М., Готье Л., Веран Дж., Маттей М.Г., Шифф С. (август 2002 г.). «Новый белок Groucho TLE4 может регулировать репрессивную активность Pax5 в В-лимфоцитах человека» . Иммунология . 106 (4): 447–55. дои : 10.1046/j.1365-2567.2002.01456.x . ПМЦ 1782747 . ПМИД 12153506 .

[pmid11799127-11] Емельянов А.В., Ковач Ч.Р., Сепульведа М.А., Бирштейн Б.К. (март 2002 г.). «Взаимодействие Pax5 (BSAP) с Daxx может привести к активации транскрипции в B-клетках» . Журнал биологической химии . 277 (13): 11156–64. дои : 10.1074/jbc.M111763200 . ПМИД 11799127 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]