Белок 1 структурно-специфического распознавания

ССРП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4IFS
Идентификаторы
Псевдонимы	SSRP1 , FACT, FACT80, T160, белок структурно-специфического распознавания 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604328 ; МГИ : 107912 ; Гомологен : 110735 ; Генные карты : SSRP1 ; OMA : SSRP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	57,335,892 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	84,877,453 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; tendon of biceps brachii; ; gastrocnemius muscle; ; Achilles tendon; ; islet of Langerhans; ; body of pancreas; ; left ovary; ; body of uterus; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	otic placode; ; saccule; ; otic vesicle; ; tail of embryo; ; mandibular prominence; ; abdominal wall; ; genital tubercle; ; maxillary prominence; ; primitive streak; ; somite;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; chromatin binding; protein binding; RNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; nucleosome binding; histone binding;
Cellular component	nucleolus; nucleoplasm; chromosome; nucleus; FACT complex;
Biological process	DNA replication; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; DNA repair; transcription, DNA-templated; cellular response to DNA damage stimulus; regulation of signal transduction by p53 class mediator; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6749
	20833
	ENSG00000149136
	ENSMUSG00000027067
	Q08945
	Q08943
	НМ_003146
	НМ_001136081 ; НМ_182990
	НП_003137
	НП_001129553 ; НП_892035
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица комплекса FACT SSRP1, также известная как белок 1 структурно-специфического распознавания, представляет собой белок , который у человека кодируется геном SSRP1 . ^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой субъединицу гетеродимера, который вместе с SUPT16H образует элонгации транскрипции фактор хроматина FACT . FACT специфически взаимодействует с гистонами H2A / H2B, вызывая разборку нуклеосом и элонгацию транскрипции. FACT и поврежденная цисплатином ДНК могут иметь решающее значение для противоракового механизма действия цисплатина. Этот кодируемый белок содержит групповой блок с высокой подвижностью , который, скорее всего, представляет собой элемент распознавания структуры модифицированной цисплатином ДНК. Этот белок также действует как коактиватор активатора транскрипции p63. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что структурно-специфический белок распознавания 1 взаимодействует с NEK9 . ^[6]SSRP1 далее взаимодействует с активатором транскрипции p63 . ^[7] SSRP1 усиливает активность полноразмерного p63, но не влияет на вариант p63 с делецией N-конца (DeltaN-p63).

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000149136 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027067 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 1 структурно-специфического распознавания SSRP1» .
^ Тан BC, Ли SC (март 2004 г.). «Nek9, новый FACT-ассоциированный белок, модулирует интерфазное прогрессирование» . Ж. Биол. Хим . 279 (10): 9321–30. дои : 10.1074/jbc.M311477200 . ПМИД 14660563 .
^ Цзэн SX, Дай М.С., Келлер Д.М., Лу Х (15 октября 2002 г.). «SSRP1 действует как коактиватор активатора транскрипции p63» . ЭМБО Дж . 21 (20): 5487–97. дои : 10.1093/emboj/cdf540 . ПМК 129072 . ПМИД 12374749 .

Дальнейшее чтение

Брюн С.Л., Пил П.М., Эссигманн Дж.М., Хаусман Д.Э., Липпард С.Дж. (1992). «Выделение и характеристика клонов кДНК человека, кодирующих белок группового бокса с высокой подвижностью, который распознает структурные искажения ДНК, вызванные связыванием противоракового агента цисплатина» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (6): 2307–11. Бибкод : 1992PNAS...89.2307B . дои : 10.1073/pnas.89.6.2307 . ПМК 48646 . ПМИД 1372440 .
Тони Дж.Х., Донахью Б.А., Келлетт П.Дж., Брюн С.Л., Эссигманн Дж.М., Липпард С.Дж. (1989). «Выделение кДНК, кодирующей человеческий белок, который избирательно связывается с ДНК, модифицированной противораковым препаратом цис-диамминдихлорплатина (II)» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (21): 8328–32. Бибкод : 1989PNAS...86.8328T . дои : 10.1073/pnas.86.21.8328 . ПМЦ 298274 . ПМИД 2530581 .
Нагулапалли С., Понгубала Дж.М., Атчисон М.Л. (1995). «Несколько белков физически взаимодействуют с PU.1. Транскрипционная синергия с NF-IL6 бета (C/EBP дельта, CRP3)» . Дж. Иммунол . 155 (9): 4330–8. дои : 10.4049/jimmunol.155.9.4330 . ПМИД 7594592 .
Орфанидес Г., Лерой Г., Чанг Чанг, Лусе Д.С., Рейнберг Д. (1998). «ФАКТ, фактор, который способствует удлинению транскрипта через нуклеосомы» . Клетка . 92 (1): 105–16. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80903-4 . ПМИД 9489704 . S2CID 11248520 .
Дайер М.А., Хейс П.Дж., барон М.Х. (1998). «Белок домена HMG SSRP1/PREIIBF участвует в активации гена эмбрионального бета-подобного глобина человека» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2617–28. дои : 10.1128/MCB.18.5.2617 . ПМЦ 110641 . ПМИД 9566881 .
Лерой Г., Орфанидес Г., Лейн В.С., Рейнберг Д. (1998). «Требование RSF и FACT для транскрипции шаблонов хроматина in vitro». Наука . 282 (5395): 1900–4. дои : 10.1126/science.282.5395.1900 . ПМИД 9836642 .
Келли Д.Э., Стоукс Д.Г., Перри Р.П. (1999). «CHD1 взаимодействует с SSRP1 и зависит как от его хромодомена, так и от его АТФазно-геликазоподобного домена для правильной ассоциации с хроматином». Хромосома . 108 (1): 10–25. дои : 10.1007/s004120050347 . ПМИД 10199952 . S2CID 12945778 .
Спенсер Дж.А., Барон М.Х., Олсон Э.Н. (1999). «Кооперативная активация транскрипции с помощью фактора ответа сыворотки и белка группы высокой подвижности SSRP1» . Ж. Биол. Хим . 274 (22): 15686–93. дои : 10.1074/jbc.274.22.15686 . ПМИД 10336466 .
Орфанидес Г., Ву В.Х., Лейн В.С., Хэмпси М., Рейнберг Д. (1999). «Хроматин-специфичный фактор элонгации транскрипции FACT включает человеческие белки SPT16 и SSRP1». Природа . 400 (6741): 284–8. Бибкод : 1999Natur.400..284O . дои : 10.1038/22350 . ПМИД 10421373 . S2CID 4300397 .
Вада Т., Орфанидес Г., Хасегава Дж., Ким Д.К., Сима Д., Ямагути Ю., Фукуда А., Хисатакэ К., О С., Рейнберг Д., Ханда Х. (2000). «FACT снимает DSIF/NELF-опосредованное ингибирование элонгации транскрипции и выявляет функциональные различия между P-TEFb и TFIIH» . Мол. Клетка . 5 (6): 1067–72. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80272-5 . ПМИД 10912001 .
Келлер Д.М., Цзэн Х., Ван Ю., Чжан К.Х., Капур М., Шу Х., Гудман Р., Лозано Г., Чжао Ю., Лу Х. (2001). «Комплекс серин-392 киназы p53, индуцированный повреждением ДНК, содержит CK2, hSpt16 и SSRP1» . Мол. Клетка . 7 (2): 283–92. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00176-9 . ПМИД 11239457 .
Ярнелл А.Т., О С., Рейнберг Д., Липпард С.Дж. (2001). «Взаимодействие FACT, SSRP1 и домена группы высокой подвижности (HMG) SSRP1 с ДНК, поврежденной противораковым препаратом цисплатином» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 25736–41. дои : 10.1074/jbc.M101208200 . ПМИД 11344167 .
Санторо П., Де Андреа М., Мильяретти Г., Трапани С., Ландольфо С., Гарильо М. (2002). «Высокая распространенность аутоантител против белка группы ядерной группы высокой подвижности (HMG) SSRP1 в сыворотке пациентов с системной красной волчанкой, но не с другими ревматическими заболеваниями». Дж. Ревматол . 29 (1): 90–3. ПМИД 11824977 .
Ройг Дж., Михайлов А., Белхэм С., Авруч Дж. (2002). «Nercc1, киназа семейства NIMA млекопитающих, связывает Ran GTPase и регулирует митотическую прогрессию» . Генс Дев . 16 (13): 1640–58. дои : 10.1101/gad.972202 . ЧВК 186374 . ПМИД 12101123 .
Цзэн С.С., Дай М.С., Келлер Д.М., Лу Х. (2002). «SSRP1 действует как коактиватор активатора транскрипции p63» . ЭМБО Дж . 21 (20): 5487–97. дои : 10.1093/emboj/cdf540 . ПМК 129072 . ПМИД 12374749 .
Келлер Д.М., Лу Х (2003). «Фосфорилирование серина 392 p53 увеличивается после УФ-излучения за счет индукции сборки комплекса CK2.hSPT16.SSRP1» . Ж. Биол. Хим . 277 (51): 50206–13. дои : 10.1074/jbc.M209820200 . ПМИД 12393879 .
Белоцерковская Р., О С., Бондаренко В.А., Орфанидес Г., Студицкий В.М., Рейнберг Д. (2003). «FACT способствует транскрипционно-зависимому изменению нуклеосом». Наука . 301 (5636): 1090–3. Бибкод : 2003Sci...301.1090B . дои : 10.1126/science.1085703 . ПМИД 12934006 . S2CID 26667338 .
Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж.Л., Линк Эй.Дж., Паттон Дж.Г. (2003). «Регуляция альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков» . Мол. Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. дои : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . ПМК 207616 . ПМИД 14559993 .
Тан BC, Ли SC (2004). «Nek9, новый FACT-ассоциированный белок, модулирует интерфазное прогрессирование» . Ж. Биол. Хим . 279 (10): 9321–30. дои : 10.1074/jbc.M311477200 . ПМИД 14660563 .

Внешние ссылки

SSRP1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000149136 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027067 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 1 структурно-специфического распознавания SSRP1» .

[pmid14660563-6] Тан BC, Ли SC (март 2004 г.). «Nek9, новый FACT-ассоциированный белок, модулирует интерфазное прогрессирование» . Ж. Биол. Хим . 279 (10): 9321–30. дои : 10.1074/jbc.M311477200 . ПМИД 14660563 .

[pmid12374749-7] Цзэн SX, Дай М.С., Келлер Д.М., Лу Х (15 октября 2002 г.). «SSRP1 действует как коактиватор активатора транскрипции p63» . ЭМБО Дж . 21 (20): 5487–97. дои : 10.1093/emboj/cdf540 . ПМК 129072 . ПМИД 12374749 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]