ФАКТ (биология)
ФАКТ ( облегчает хроматина транскрипцию , [ 1 ] иногда облегчает хроматиновые транзакции [ 2 ] [ 3 ] ) представляет собой гетеродимерный белковый комплекс , который влияет на элонгацию транскрипции эукариотической РНК-полимеразы II (Pol II) как in vitro , так и in vivo . Он был открыт в 1998 году как фактор, выделенный из клеток человека, который необходим для продуктивной транскрипции Pol II in vitro на хроматинизированной матрице ДНК. [ 4 ]
FACT состоит из субъединиц массой 140 и 80 килодальтон (кДа). Субъединица массой 140 кДа кодируется геном человека SUPT16H (SPT16 у S. cerevisiae ), тогда как субъединица массой 80 кДа кодируется геном человека SSRP1 (POB3 у S. cerevisiae ). Обе эти субъединицы в дрожжах влияют на элонгацию транскрипции Pol II, а очищенный человеческий FACT специфически связывается с мононуклеосомами и димером гистонов H2A / H2B , но не с тетрамером H3 / H4 (см.: Коровская частица нуклеосомы ) или Pol II. [ 5 ]
Анализы коиммунопреципитации с мечеными рекомбинантными белками показали, что субъединица Spt16 взаимодействует с димерами H2A/H2B и мононуклеосомами, но не с тетрамерами H3/H4, тогда как субъединица SSRP1 взаимодействует только с тетрамерами H3/H4, а не с мононуклеосомами. Удаление высококислотного С-конца Spt16 (общая особенность известных шаперонов гистонов) не препятствует формированию стабильного комплекса Spt16 с SSRP1, но устраняет взаимодействие с мононуклеосомами и способность стимулировать транскрипцию in vitro на хроматинизированных матрицах. Две субъединицы вместе, но не по отдельности, могут стимулировать образование нуклеосом из свободных гистонов и ДНК (активность гистонов- шаперонов ). Эти две субъединицы высококонсервативны у всех эукариот и, как было показано, помимо транскрипции также влияют на репарацию и репликацию ДНК. [ 6 ]
В клетках FACT обогащен частями генома, участвующими в активном удлинении Pol II, как видно при окрашивании флюоресцентными антителами дрозофилы политенных хромосом и иммунопреципитации хроматина анализах (ChIP) на экстрактах клеток дрозофилы Kc. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Винклер, Дуэйн Д.; Люгер, Каролин (27 мая 2011 г.). «ФАКТ о гистоновых шаперонах: структурные идеи и механизмы реорганизации нуклеосом» . Журнал биологической химии . 286 (21): 18369–18374. дои : 10.1074/jbc.R110.180778 . ISSN 0021-9258 . ПМК 3099653 . ПМИД 21454601 .
- ^ Мартин, Бенджамин Дж. Э.; Хрушицки, Адам Т.; Хоу, ЛиЭнн Дж. (01 ноября 2018 г.). «Транкрипция способствует взаимодействию комплекса FAcilitates Chromatin Transactions (FACT) с нуклеосомами Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 210 (3): 869–881. дои : 10.1534/genetics.118.301349 . ISSN 0016-6731 . ПМК 6218215 . ПМИД 30237209 .
- ^ Фрост, Дженнифер М.; Ким, М. Ивонн; Пак, Гуен Тэ; Се, Пин-Хун; Накамура, Миюки; Лин, Сэмюэл Дж. Х.; Йо, Хёнджин; Чхве, Джэмён; Икеда, Йоко; Киносита, Тецу; Чхве, Ёнхи (15 мая 2018 г.). «Комплекс FACT необходим для деметилирования ДНК гетерохроматина во время размножения арабидопсиса» . Труды Национальной академии наук . 115 (20): Е4720–Е4729. Бибкод : 2018PNAS..115E4720F . дои : 10.1073/pnas.1713333115 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 5960277 . ПМИД 29712855 .
- ^ Орфанидес, Джордж; Лерой, Гэри; Чанг, Чунь-Сян; Лусе, Донал С.; Рейнберг, Дэнни (1998). «ФАКТ, фактор, облегчающий удлинение транскрипта через нуклеосомы» . Клетка . 92 (1): 105–116. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80903-4 . ПМИД 9489704 . S2CID 11248520 .
- ^ Орфанидес, Джордж; У, Вэй-Хуа; Лейн, Уильям С.; Хэмпси, Майкл; Рейнберг, Дэнни (1999). «Хроматин-специфичный фактор элонгации транскрипции FACT включает человеческие белки SPT16 и SSRP1». Природа . 400 (6741): 284–288. Бибкод : 1999Natur.400..284O . дои : 10.1038/22350 . ПМИД 10421373 . S2CID 4300397 .
- ^ Белоцерковская, Римма; О, Сангтак; Бондаренко Владимир А.; Орфанидес, Джордж; Студицкий, Василий; Рейнберг, Дэнни (2003). «FACT способствует транскрипционно-зависимому изменению нуклеосом». Наука . 301 (5636): 1090–1093. Бибкод : 2003Sci...301.1090B . дои : 10.1126/science.1085703 . ПМИД 12934006 . S2CID 26667338 .
- ^ Сондерс, Эбби; Вернер, Янис; Андрулис, Эрик Д.; Накаяма, Такахиро; Хиросе, Сусуму; Рейнберг, Дэнни; Лис, Джон Т. (2003). «Отслеживание FACT и комплекса элонгации РНК-полимеразы II через хроматин in vivo». Наука . 301 (5636): 1094–1096. Бибкод : 2003Sci...301.1094S . дои : 10.1126/science.1085712 . ПМИД 12934007 . S2CID 10064786 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]Рейнберг Д., Симс Р. (2006). de FACTo нуклеосомная динамика . Журнал биологической химии, 281 (33) 23297-23391.