EBF1

EBF1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3LYR, 3MQI
Идентификаторы
Псевдонимы	EBF1 , COE1, EBF, O/E-1, OLF1, ранний фактор B-клеток 1, ранний фактор B-клеток 1, фактор транскрипции EBF 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 164343 ; МГИ : 95275 ; Гомологен : 7297 ; GeneCards : EBF1 ; ОМА : EBF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	159,099,916 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	45,008,091 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	synovial joint; ; synovial membrane; ; Achilles tendon; ; oocyte; ; buccal mucosa cell; ; skin of hip; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; parietal pleura; ; vena cava; ; spinal ganglia;
	Top expressed in
	external carotid artery; ; internal carotid artery; ; trigeminal ganglion; ; superior cervical ganglion; ; spinal ganglia; ; neural tube; ; ankle; ; lumbar spinal ganglion; ; subcutaneous adipose tissue; ; brown adipose tissue;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; metal ion binding; DNA-binding transcription factor activity; protein dimerization activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; C2H2 zinc finger domain binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	multicellular organism development; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1879
	13591
	ENSG00000164330
	ENSMUSG00000057098
	Q9UH73
	Q07802
showНМ_001290360 ; НМ_024007 ; НМ_182708 ; НМ_001324101 ; НМ_001324103 ;
	NM_001324106; NM_001324107; NM_001324108; NM_001324109; NM_001324111; NM_001364155; NM_001364156; NM_001364157; NM_001364158; NM_001364159
	НМ_001290709 ; НМ_001290710 ; НМ_001290711 ; НМ_007897
showНП_001277289 ; НП_001311030 ; НП_001311032 ; НП_001311035 ; НП_001311036 ;
	NP_001311037; NP_001311038; NP_001311040; NP_076870; NP_874367; NP_001351084; NP_001351085; NP_001351086; NP_001351087; NP_001351088
showНП_001277638 ; НП_001277639 ; НП_001277640 ; НП_031923 ; НП_001349498 ;
	NP_001349500; NP_001349503; NP_001349504; NP_001349505; NP_001349506; NP_001349507; NP_001349508
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор COE1 представляет собой белок , который у человека кодируется EBF1 геном . EBF1 означает ранний фактор B-клеток 1 . ^[5]^[6]^[7]

EBF1 контролирует экспрессию ключевых белков, необходимых для дифференцировки В-клеток, передачи сигналов и их функционирования. ^[8]^[9] Показана решающая роль этого фактора в регуляции экспрессии корецепторов семейства SLAM в В-клетках. ^[10] Кроме того, EBF1 также известен своей ролью в хондрогенной дифференцировке в мезенхимальных клетках-предшественниках зачатков конечностей . ^[11]

Взаимодействия

Было показано, что EBF1 взаимодействует с ZNF423. ^[12] и CREB-связывающий белок . ^[13]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164330 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057098 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Отчет об символах: EBF1» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго .
^ Милатович А., Цю Р.Г., Гроссшедль Р., Франке У. (апрель 1994 г.). «Ген тканеспецифического активатора транскрипции (EBF или Olf-1), экспрессируемый в ранних B-лимфоцитах, адипоцитах и обонятельных нейронах, расположен на хромосоме 5 человека, полосе q34 и проксимальной хромосоме 11 мыши». Геном млекопитающих . 5 (4): 211–215. дои : 10.1007/BF00360547 . ПМИД 8012110 . S2CID 19839522 .
^ «Ген Энтрез: ранний B-клеточный фактор 1 EBF1» .
^ Трейбер Т., Мандель Э.М., Потт С., Дьери И., Фирнер С., Лю Э.Т. и др. (май 2010 г.). «Ранний фактор 1 В-клеток регулирует генные сети В-клеток путем активации, репрессии и независимого от транскрипции равновесия хроматина» . Иммунитет . 32 (5): 714–725. doi : 10.1016/j.immuni.2010.04.013 . ПМИД 20451411 .
^ Хэгман Дж., Рамирес Дж., Лукин К. (январь 2012 г.). «Спецификация линии B-лимфоцитов, приверженность и эпигенетический контроль транскрипции с помощью раннего фактора 1 B-клеток». В Мурре С. (ред.). Эпигенетическая регуляция развития лимфоцитов . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 356. стр. 17–38. дои : 10.1007/82_2011_139 . ISBN 978-3-642-24102-4 . ISSN 0070-217X . ПМЦ 3925327 . ПМИД 21735360 .
^ Шварц А.М., Путляева Л.В., Цович М., Клепикова А.В., Акулич К.А., Воронцов И.Е. и др. (октябрь 2016 г.). «Ранний B-клеточный фактор 1 (EBF1) имеет решающее значение для контроля транскрипции гена SLAMF1 в B-клетках человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1859 (10): 1259–1268. дои : 10.1016/j.bbagrm.2016.07.004 . ПМИД 27424222 .
^ Такач Р., Ваго Дж., Полиска С., Пушпарай П.Н., Дуча Л., Ковач П. и др. (май 2023 г.). «Временная транскриптомная подпись образования хряща» . Исследования нуклеиновых кислот . 51 (8): 3590–3617. дои : 10.1093/nar/gkad210 . ПМЦ 10164575 . ПМИД 36987858 .
^ Цай Р.Ю., Рид Р.Р. (июнь 1997 г.). «Клонирование и функциональная характеристика Roaz, белка цинковых пальцев, который взаимодействует с O/E-1, регулируя экспрессию генов: значение для развития обонятельных нейронов» . Журнал неврологии . 17 (11): 4159–4169. doi : 10.1523/JNEUROSCI.17-11-04159.1997 . ПМК 6573535 . ПМИД 9151733 .
^ Чжао Ф., Маккаррик-Уолмсли Р., Акерблад П., Сигвардссон М., Кадеш Т. (июнь 2003 г.). «Ингибирование p300/CBP ранним B-клеточным фактором» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (11): 3837–3846. дои : 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003 . ПМЦ 155219 . ПМИД 12748286 .

Дальнейшее чтение

Либерг Д., Сигвардссон М., Акерблад П. (декабрь 2002 г.). «Семейство транскрипционных факторов EBF/Olf/Collier: регуляторы дифференцировки в клетках, происходящих из всех трех эмбриональных зародышевых листков» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (24): 8389–8397. дои : 10.1128/MCB.22.24.8389-8397.2002 . ПМК 139877 . ПМИД 12446759 .
Хэгман Дж., Гатч М.Дж., Лин Х., Гроссшедл Р. (июнь 1995 г.). «EBF содержит новый координационный мотив цинка и множественные домены активации димеризации и транскрипции» . Журнал ЭМБО . 14 (12): 2907–2916. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07290.x . ПМЦ 398409 . ПМИД 7796816 .
Ван М.М., Рид Р.Р. (июль 1993 г.). «Молекулярное клонирование фактора транскрипции обонятельных нейронов Olf-1 путем генетической селекции на дрожжах». Природа . 364 (6433): 121–126. Бибкод : 1993Natur.364..121W . дои : 10.1038/364121a0 . ПМИД 8321284 . S2CID 4309685 .
Хэгман Дж., Беланджер С., Трэвис А., Тёрк К.В., Гроссшедл Р. (май 1993 г.). «Клонирование и функциональная характеристика раннего B-клеточного фактора, регулятора экспрессии генов, специфичных для лимфоцитов» . Гены и развитие . 7 (5): 760–773. дои : 10.1101/gad.7.5.760 . ПМИД 8491377 .
Трэвис А., Хэгман Дж., Хван Л., Гроссшедл Р. (июнь 1993 г.). «Очистка раннего В-клеточного фактора и характеристика его ДНК-связывающей специфичности» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (6): 3392–3400. дои : 10.1128/MCB.13.6.3392 . ПМК 359803 . ПМИД 8497258 .
Цай Р.Ю., Рид Р.Р. (июнь 1997 г.). «Клонирование и функциональная характеристика Roaz, белка цинковых пальцев, который взаимодействует с O/E-1, регулируя экспрессию генов: значение для развития обонятельных нейронов» . Журнал неврологии . 17 (11): 4159–4169. doi : 10.1523/JNEUROSCI.17-11-04159.1997 . ПМК 6573535 . ПМИД 9151733 .
Гислер Р., Якобсен С.Е., Сигвардссон М. (август 2000 г.). «Клонирование раннего фактора В-клеток человека и идентификация генов-мишеней предполагают консервативную роль в развитии В-клеток у человека и мыши» . Кровь . 96 (4): 1457–1464. дои : 10.1182/blood.V96.4.1457 . ПМИД 10942392 .
Гислер Р., Сигвардссон М. (май 2002 г.). «Промотор V-preB человека является мишенью для скоординированной активации фактора ранних B-клеток и E47» . Журнал иммунологии . 168 (10): 5130–5138. дои : 10.4049/jimmunol.168.10.5130 . ПМИД 11994467 .
Смит Э.М., Гислер Р., Сигвардссон М. (июль 2002 г.). «Клонирование и характеристика промотора, фланкирующего ген раннего B-клеточного фактора (EBF), указывает на роль E-белков и ауторегуляции в контроле экспрессии EBF» . Журнал иммунологии . 169 (1): 261–270. дои : 10.4049/jimmunol.169.1.261 . ПМИД 12077253 .
Чжао Ф., Маккаррик-Уолмсли Р., Акерблад П., Сигвардссон М., Кадеш Т. (июнь 2003 г.). «Ингибирование p300/CBP ранним B-клеточным фактором» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (11): 3837–3846. дои : 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003 . ПМЦ 155219 . ПМИД 12748286 .
Мерлуцци С., Моретти М., Альтамура С., Зволло П., Сигвардссон М., Витале Г. и др. (январь 2004 г.). «Стимуляция CD40 индуцирует активацию Pax5/BSAP и EBF через APE/Ref-1-зависимый окислительно-восстановительный механизм» . Журнал биологической химии . 279 (3): 1777–1786. дои : 10.1074/jbc.M305418200 . ПМИД 14594818 .
Бонд Х.М., Месурака М., Карбоне Е., Бонелли П., Агости В., Амодио Н. и др. (март 2004 г.). «Ранний гематопоэтический белок цинковых пальцев (EHZF), человеческий гомолог мышиного Evi3, высоко экспрессируется в примитивных гемопоэтических клетках человека» . Кровь . 103 (6): 2062–2070. дои : 10.1182/кровь-2003-07-2388 . ПМИД 14630787 .
Смит Э.М., Акерблад П., Кадеш Т., Аксельсон Х., Сигвардссон М. (сентябрь 2005 г.). «Ингибирование функции EBF посредством активной передачи сигналов Notch открывает новый регуляторный путь на ранних стадиях развития B-клеток» . Кровь . 106 (6): 1995–2001. дои : 10.1182/кровь-2004-12-4744 . ПМИД 15920012 .
Акерблад П., Монссон Р., Лагергрен А., Вестерлунд С., Баста Б., Линд У. и др. (октябрь 2005 г.). «Анализ экспрессии генов показывает, что EBF-1 и PPARgamma2 индуцируют адипогенез клеток NIH-3T3 с одинаковой эффективностью и кинетикой». Физиологическая геномика . 23 (2): 206–216. doi : 10.1152/физиологгеномика.00015.2005 . ПМИД 16106032 . S2CID 42168486 .
Мартинес А., Мас А., де лас Эрас В., Арройо Р., Фернандес-Аркеро М., де ла Конча Э.Г. и др. (октябрь 2005 г.). «Ранняя ассоциация гена B-клеточного фактора с рассеянным склерозом у населения Испании» . БМК Неврология . 5:19 . дои : 10.1186/1471-2377-5-19 . ПМК 1291372 . ПМИД 16255771 .
Росслер С., Дьери И., Имхоф С., Спиваков М., Уильямс Р.Р., Бусслингер М. и др. (январь 2007 г.). «Различные промоторы опосредуют регуляцию экспрессии гена Ebf1 с помощью интерлейкина-7 и Pax5» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (2): 579–594. дои : 10.1128/MCB.01192-06 . ПМК 1800812 . ПМИД 17101802 .

Внешние ссылки

ФакторБук EBF1

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164330 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057098 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Отчет об символах: EBF1» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго .

[pmid8012110-6] Милатович А., Цю Р.Г., Гроссшедль Р., Франке У. (апрель 1994 г.). «Ген тканеспецифического активатора транскрипции (EBF или Olf-1), экспрессируемый в ранних B-лимфоцитах, адипоцитах и обонятельных нейронах, расположен на хромосоме 5 человека, полосе q34 и проксимальной хромосоме 11 мыши». Геном млекопитающих . 5 (4): 211–215. дои : 10.1007/BF00360547 . ПМИД 8012110 . S2CID 19839522 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: ранний B-клеточный фактор 1 EBF1» .

[8] Трейбер Т., Мандель Э.М., Потт С., Дьери И., Фирнер С., Лю Э.Т. и др. (май 2010 г.). «Ранний фактор 1 В-клеток регулирует генные сети В-клеток путем активации, репрессии и независимого от транскрипции равновесия хроматина» . Иммунитет . 32 (5): 714–725. doi : 10.1016/j.immuni.2010.04.013 . ПМИД 20451411 .

[9] Хэгман Дж., Рамирес Дж., Лукин К. (январь 2012 г.). «Спецификация линии B-лимфоцитов, приверженность и эпигенетический контроль транскрипции с помощью раннего фактора 1 B-клеток». В Мурре С. (ред.). Эпигенетическая регуляция развития лимфоцитов . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 356. стр. 17–38. дои : 10.1007/82_2011_139 . ISBN 978-3-642-24102-4 . ISSN 0070-217X . ПМЦ 3925327 . ПМИД 21735360 .

[10] Шварц А.М., Путляева Л.В., Цович М., Клепикова А.В., Акулич К.А., Воронцов И.Е. и др. (октябрь 2016 г.). «Ранний B-клеточный фактор 1 (EBF1) имеет решающее значение для контроля транскрипции гена SLAMF1 в B-клетках человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . 1859 (10): 1259–1268. дои : 10.1016/j.bbagrm.2016.07.004 . ПМИД 27424222 .

[11] Такач Р., Ваго Дж., Полиска С., Пушпарай П.Н., Дуча Л., Ковач П. и др. (май 2023 г.). «Временная транскриптомная подпись образования хряща» . Исследования нуклеиновых кислот . 51 (8): 3590–3617. дои : 10.1093/nar/gkad210 . ПМЦ 10164575 . ПМИД 36987858 .

[pmid9151733-12] Цай Р.Ю., Рид Р.Р. (июнь 1997 г.). «Клонирование и функциональная характеристика Roaz, белка цинковых пальцев, который взаимодействует с O/E-1, регулируя экспрессию генов: значение для развития обонятельных нейронов» . Журнал неврологии . 17 (11): 4159–4169. doi : 10.1523/JNEUROSCI.17-11-04159.1997 . ПМК 6573535 . ПМИД 9151733 .

[pmid12748286-13] Чжао Ф., Маккаррик-Уолмсли Р., Акерблад П., Сигвардссон М., Кадеш Т. (июнь 2003 г.). «Ингибирование p300/CBP ранним B-клеточным фактором» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (11): 3837–3846. дои : 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003 . ПМЦ 155219 . ПМИД 12748286 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]