HOXD9

HOXD9
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXD9 , HOX4, HOX4C, Hox-4.3, Hox-5.2, гомеобокс D9
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142982 ; МГИ : 96210 ; Гомологен : 8409 ; Генные карты : HOXD9 ; OMA : HOXD9 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	176,124,937 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	74,530,552 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of uterus; ; tendon of biceps brachii; ; canal of the cervix; ; vagina; ; ectocervix; ; myometrium; ; muscle layer of sigmoid colon; ; buccal mucosa cell; ; testicle; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; gastrula; ; decidua; ; medullary collecting duct; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; seminal vesicula; ; medial head of gastrocnemius muscle; ; cumulus cell; ; tail of embryo; ; urothelium;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleolus;
Biological process	embryonic skeletal system morphogenesis; forelimb morphogenesis; peripheral nervous system neuron development; proximal/distal pattern formation; regulation of transcription, DNA-templated; adult locomotory behavior; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; hindlimb morphogenesis; transcription, DNA-templated; single fertilization; embryonic skeletal system development; mammary gland development; multicellular organism development; regulation of gene expression; skeletal muscle tissue development; embryonic forelimb morphogenesis; anterior/posterior pattern specification; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3235
	15438
	ENSG00000128709
	ENSMUSG00000043342
	P28356
	P28357
	НМ_014213
	НМ_013555
	НП_055028
	НП_038583
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-D9 — это белок , который у человека кодируется HOXD9 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов гомеобокса. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство транскрипционных факторов, играющих важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя сходными кластерами гомеобоксных генов: HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, расположенными на разных хромосомах и состоящими из 9–11 генов, расположенных тандемно. Этот ген является одним из нескольких гомеобоксных генов HOXD, расположенных в участках хромосомы 2q31-2q37. Делеции, которые удалили весь кластер генов HOXD или 5'-конец этого кластера, были связаны с тяжелыми аномалиями конечностей и половых органов. Точная роль этого гена не определена. ^[7]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000128709 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043342 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXD9 D9» .

Дальнейшее чтение

Заппавинья В., Ренучи А., Изписуа-Бельмонте Х.К., Урьер Г., Пешле С., Дюбуле Д. (1992). «Гены HOX4 кодируют факторы транскрипции с потенциальными способностями ауто- и перекрестной регуляции» . ЭМБО Дж . 10 (13): 4177–87. дои : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb04996.x . ПМК 453170 . ПМИД 1756725 .
Оливер Г., Сиделл Н., Фиске В., Хайнцманн С., Мохандас Т., Спаркс Р.С., Де Робертис Э.М. (1989). «Дополнительные градиенты гомеопротеина в развивающихся зачатках конечностей» . Генс Дев . 3 (5): 641–50. дои : 10.1101/gad.3.5.641 . ПМИД 2568311 .
Акампора Д, Д'Эспозито М, Файелла А, Паннесе М, Мильяччо Е, Морелли Ф, Сторнаиуоло А, Нигро В, Симеоне А, Бончинелли Э (1990). «Семейство генов HOX человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (24): 10385–402. дои : 10.1093/нар/17.24.10385 . ПМК 335308 . ПМИД 2574852 .
Канцлер Б., Виалле Ж.П., Ле Муэллик Х., Бончинелли Э., Дюбул Д., Дуайи Д. (1995). «Дифференциальная экспрессия двух разных семейств генов гомеобокса во время морфогенеза тегумента мыши». Межд. Дж. Дев. Биол . 38 (4): 633–40. ПМИД 7779685 .
Заппавинья В., Сартори Д., Мавилио Ф. (1994). «Специфичность функции белка HOX зависит от взаимодействий ДНК-белок и белок-белок, опосредованных гомео-доменом» . Генс Дев . 8 (6): 732–44. дои : 10.1101/gad.8.6.732 . ПМИД 7926763 .
Заппавинья В., Фальсиола Л., Хельмер-Циттерих М., Мавилио Ф., Бьянки М.Э. (1996). «HMG1 взаимодействует с белками HOX и усиливает их связывание с ДНК и активацию транскрипции» . ЭМБО Дж . 15 (18): 4981–91. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00878.x . ПМЦ 452236 . ПМИД 8890171 .
Фелан М.Л., Физерстоун М.С. (1997). «Различные остатки N-концевого плеча HOX ответственны за специфичность распознавания ДНК мономерами HOX и гетеродимерами HOX.PBX» . Ж. Биол. Хим . 272 (13): 8635–43. дои : 10.1074/jbc.272.13.8635 . ПМИД 9079695 .
Дель Кампо М, Джонс МК, Веракса А.Н., Карри С.Дж., Джонс К.Л., Маскарелло Дж.Т., Али-Кан-Кэттс З., Драмхеллер Т., Макгиннис В. (1999). «Монодактильные конечности и аномальные гениталии связаны с гемизиготностью области 2q31 человека, которая включает кластер HOXD» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 65 (1): 104–10. дои : 10.1086/302467 . ПМК 1378080 . ПМИД 10364522 .
де ла Крус CC, Дер-Авакян А., Спиропулос Д.Д., Тье Д.Д., Карпентер Э.М. (2000). «Целевое нарушение Hoxd9 и Hoxd10 изменяет локомоторное поведение, идентичность позвонков и развитие периферической нервной системы» . Дев. Биол . 216 (2): 595–610. дои : 10.1006/dbio.1999.9528 . ПМИД 10642795 .
Лимонги М.З., Пелличча Ф., Гаддини Л., Рокки А. (2000). «Кластеризация двух хрупких сайтов и семи гомеобоксных генов в области хромосомы человека 2q31 → q32.1». Цитогенет. Клеточная генетика . 90 (1–2): 151–3. дои : 10.1159/000015651 . ПМИД 11060466 . S2CID 35579702 .
Гудман Ф.Р., Маевски Ф., Коллинз А.Л., Мошенник П.Дж. (2002). «Микроделеция размером 117 КБ, удаляющая HOXD9–HOXD13 и EVX2, вызывает синполидактилию» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (2): 547–55. дои : 10.1086/338921 . ПМЦ 384929 . ПМИД 11778160 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (2002). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Нгуен Н.К., Хиросе Т., Наказава М., Кобата Т., Накамура Х., Нисиока К., Накадзима Т. (2002). «Экспрессия HOXD9 в фибробластоподобных синовиоцитах пациентов с ревматоидным артритом». Межд. Дж. Мол. Мед . 10 (1): 41–8. дои : 10.3892/ijmm.10.1.41 . ПМИД 12060849 .
Мешин-Невиль А., Лефевр О., Беллок Дж.П., Кедингер М., Саймон-Ассманн П. (2003). «[Повышение экспрессии гена HOXA9 при болезни Гиршпрунга]». Гастроэнтерол. Клин. Биол . 26 (12): 1110–7. ПМИД 12520199 .
Лю Д.Б., Гу З.Д., Цао XZ, Лю Х., Ли Цзюй (2005). «Иммуноцитохимическое обнаружение экспрессии гомеодоменовых белков HoxD9 и Pbx1 при китайской плоскоклеточной карциноме пищевода» . Мир Дж. Гастроэнтерол . 11 (10): 1562–6. дои : 10.3748/wjg.v11.i10.1562 . ПМК 4305705 . ПМИД 15770739 .
Чжао X, Сунь М, Чжао Дж, Лейва Дж.А., Чжу Х, Ян В, Цзэн Икс, Ао Ю, Лю Ц, Лю Г, Ло ВХ, Джабс Э.В., Амзель Л.М., Шань Х, Чжан Икс (2007). «Мутации в HOXD13 лежат в основе синдактилии типа V и нового синдрома брахидактилии-синдактилии» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 80 (2): 361–71. дои : 10.1086/511387 . ПМЦ 1785357 . ПМИД 17236141 .

Внешние ссылки

HOXD9 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000128709 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000043342 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXD9 D9» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]