HIF3A

HIF3A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4WN5
Идентификаторы
Псевдонимы	HIF3A , HIF-3A, IPAS, MOP7, PASD7, bHLHe17, HIF3-альфа-1, субъединица альфа-индуцируемого гипоксией фактора 3, субъединица альфа-индуцируемого гипоксией фактора 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 609976 ; МГИ : 1859778 ; Гомологен : 9646 ; Генные карты : HIF3A ; ОМА : HIF3A – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	46,343,433 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	16,796,352 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gastric mucosa; ; apex of heart; ; right lung; ; left uterine tube; ; muscle layer of sigmoid colon; ; right auricle; ; sural nerve; ; left ventricle; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; left lung lobe; ; external carotid artery; ; internal carotid artery; ; fossa; ; human fetus; ; atrium; ; efferent ductule; ; belly cord; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; protein dimerization activity; transcription corepressor activity; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nuclear speck; mitochondrion; nucleoplasm; cytosol; plasma membrane; nucleus;
Biological process	response to hypoxia; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; multicellular organism development; angiogenesis; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; apoptotic process; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; cellular response to hypoxia; post-translational protein modification; positive regulation of nucleic acid-templated transcription; protein ubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	64344
	53417
	ENSG00000124440
	ENSMUSG00000004328
	Q9Y2N7
	Q0VBL6
	НМ_022462 ; НМ_152794 ; НМ_152795 ; НМ_152796
	НМ_001162950 ; НМ_016868
	НП_071907 ; НП_690007 ; НП_690008 ; НП_690009
	НП_001156422 ; НП_058564
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Индуцируемый гипоксией фактор 3 альфа представляет собой белок , который у человека кодируется HIF3A геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой субъединицу альфа-3 одного из нескольких гетеродимерных факторов транскрипции альфа/бета-субъединицы , которые регулируют многие адаптивные реакции на низкое напряжение кислорода ( гипоксию ). В субъединице альфа-3 отсутствует домен трансактивации, обнаруженный в факторах, содержащих субъединицы альфа-1 или альфа-2. Считается, что факторы, содержащие субъединицу альфа-3, являются негативными регуляторами экспрессии генов, индуцируемой гипоксией. Для этого гена обнаружено по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие три разные изоформы. ^[7]

У крыс он играет отрицательную роль в адаптации к гипоксии, поскольку ингибирование экспрессии HIF-3α приводит к повышению физической выносливости. ^[8]

Клиническое значение

Метилирование ДНК в интронах HIF3A связано с ИМТ и ожирением. ^[9]

См. также

Факторы, индуцирующие гипоксию

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000124440 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000004328 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хара С., Хамада Дж., Кобаяши С., Кондо Ю., Имура Н. (сентябрь 2001 г.). «Экспрессия и характеристика индуцируемого гипоксией фактора (HIF)-3альфа в почках человека: подавление HIF-опосредованной экспрессии генов с помощью HIF-3альфа». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 287 (4): 808–13. дои : 10.1006/bbrc.2001.5659 . ПМИД 11573933 .
^ Макино Ю, Цао Р, Свенссон К, Бертилссон Г, Асман М, Танака Х, Цао Ю, Беркенстам А, Поеллингер Л (декабрь 2001 г.). «Ингибирующий белок домена PAS является негативным регулятором экспрессии генов, индуцируемой гипоксией». Природа . 414 (6863): 550–4. Бибкод : 2001Natur.414..550M . дои : 10.1038/35107085 . ПМИД 11734856 . S2CID 4389117 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор 3, индуцируемый гипоксией HIF3A, альфа-субъединица» .
^ Древицкая Т, Гавенаускас Б, Дроздовска С, Носар В, Досенко В, Маньковска И (2012). «Изменения экспрессии мРНК HIF-3α в различных тканях и их роль в адаптации к периодической гипоксии и физическим нагрузкам». Патофизиология . 19 (3): 205–14. doi : 10.1016/j.pathophys.2012.06.002 . ПМИД 22884965 .
^ Дик К.Дж., Нельсон К.П., Цапроуни Л., Сандлинг Дж.К., Айсси Д., Валь С., Медури Е., Моранж П.Е., Ганьон Ф., Граллерт Х., Вальденбергер М., Петерс А., Эрдманн Дж., Хенгстенберг К., Камбьен Ф., Гудолл А.Х., Оувеханд У.Х. , Шункерт Х., Томпсон Дж.Р., Спектор Т.Д., Гигер С., Трегуэ Д.А., Делоукас П., Самани, Нью-Джерси (2014). «Метилирование ДНК и индекс массы тела: полногеномный анализ» . Ланцет . 383 (9933): 1990–1998. дои : 10.1016/S0140-6736(13)62674-4 . ПМИД 24630777 . S2CID 18026508 .

Дальнейшее чтение

Гу Ю.З., Моран С.М., Хогенеш Дж.Б., Вартман Л., Брэдфилд, Калифорния (1998). «Молекулярная характеристика и хромосомная локализация субъединицы фактора, индуцируемого гипоксией третьего альфа-класса, HIF3alpha» . Джин Экспр . 7 (3): 205–13. ПМК 6151950 . ПМИД 9840812 .
Макино Ю., Канопка А., Уилсон В.Дж., Танака Х., Поеллингер Л. (2002). «Белок ингибирующего домена PAS (IPAS) представляет собой индуцируемый гипоксией сплайсинговый вариант локуса фактора-3альфа, индуцируемого гипоксией» . Ж. Биол. Хим . 277 (36): 32405–8. дои : 10.1074/jbc.C200328200 . ПМИД 12119283 .
Мейнард М.А., Ци Х, Чунг Дж., Ли Э.Х., Кондо Ю., Хара С., Конэвей Р.К., Конэвей Дж.В., Ох М. (2003). «Множественные варианты сплайсинга альфа-локуса HIF-3 человека являются мишенями комплекса убиквитинлигазы E3 фон Хиппеля-Линдау» . Ж. Биол. Хим . 278 (13): 11032–40. дои : 10.1074/jbc.M208681200 . ПМИД 12538644 .
Мейнард М.А., Эванс А.Дж., Хосоми Т., Хара С., Джуэтт М.А., Ох М. (2006). «Человеческий HIF-3альфа4 является доминантно-негативным регулятором HIF-1, уровень которого снижается при почечно-клеточной карциноме» . ФАСЕБ Дж . 19 (11): 1396–406. дои : 10.1096/fj.05-3788com . ПМИД 16126907 . S2CID 86404533 .
Чан М.С., Пак Дж.Э., Ли Дж.А., Пак С.Г., Мён ПК, Ли Д.Х., Пак BC, Чо С. (2005). «Связывание и регуляция индуцируемого гипоксией фактора-1 с помощью ингибирующих белков PAS». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 337 (1): 209–15. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.09.038 . ПМИД 16182248 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (2006) / Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» Genome Res . 16 (1): 55–65. : 10.1101 gr.4039406 . PMID . . « 16344560 doi
Ли Ц.Ф., Ван XR, Ян Ю.В., Линь Х. (2006). «Гипоксия усиливает экспрессию индуцируемого гипоксией фактора (HIF)-3альфа в эпителиальных клетках легких: характеристика и сравнение с HIF-1альфа» . Сотовый Res . 16 (6): 548–58. дои : 10.1038/sj.cr.7310072 . ПМИД 16775626 .
Коллерс С., Мусилова П., Рубес Дж., Роча Д. (2007). «Сравнительное картирование выявляет множественные перестройки между хромосомой 6 свиньи и 19q13 человека». Аним. Жене . 37 (6): 595–6. дои : 10.1111/j.1365-2052.2006.01516.x . ПМИД 17121608 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000124440 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000004328 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11573933-5] Хара С., Хамада Дж., Кобаяши С., Кондо Ю., Имура Н. (сентябрь 2001 г.). «Экспрессия и характеристика индуцируемого гипоксией фактора (HIF)-3альфа в почках человека: подавление HIF-опосредованной экспрессии генов с помощью HIF-3альфа». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 287 (4): 808–13. дои : 10.1006/bbrc.2001.5659 . ПМИД 11573933 .

[pmid11734856-6] Макино Ю, Цао Р, Свенссон К, Бертилссон Г, Асман М, Танака Х, Цао Ю, Беркенстам А, Поеллингер Л (декабрь 2001 г.). «Ингибирующий белок домена PAS является негативным регулятором экспрессии генов, индуцируемой гипоксией». Природа . 414 (6863): 550–4. Бибкод : 2001Natur.414..550M . дои : 10.1038/35107085 . ПМИД 11734856 . S2CID 4389117 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор 3, индуцируемый гипоксией HIF3A, альфа-субъединица» .

[pmid22884965-8] Древицкая Т, Гавенаускас Б, Дроздовска С, Носар В, Досенко В, Маньковска И (2012). «Изменения экспрессии мРНК HIF-3α в различных тканях и их роль в адаптации к периодической гипоксии и физическим нагрузкам». Патофизиология . 19 (3): 205–14. doi : 10.1016/j.pathophys.2012.06.002 . ПМИД 22884965 .

[9] Дик К.Дж., Нельсон К.П., Цапроуни Л., Сандлинг Дж.К., Айсси Д., Валь С., Медури Е., Моранж П.Е., Ганьон Ф., Граллерт Х., Вальденбергер М., Петерс А., Эрдманн Дж., Хенгстенберг К., Камбьен Ф., Гудолл А.Х., Оувеханд У.Х. , Шункерт Х., Томпсон Дж.Р., Спектор Т.Д., Гигер С., Трегуэ Д.А., Делоукас П., Самани, Нью-Джерси (2014). «Метилирование ДНК и индекс массы тела: полногеномный анализ» . Ланцет . 383 (9933): 1990–1998. дои : 10.1016/S0140-6736(13)62674-4 . ПМИД 24630777 . S2CID 18026508 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]