ПКНОКС1

ПКНОКС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1X2N
Идентификаторы
Псевдонимы	PKNOX1 , PREP1, pkonx1c, УАТС/узловой 1 гомеобокс 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602100 ; МГИ : 1201409 ; Гомологен : 3363 ; Генные карты : PKNOX1 ; OMA : PKNOX1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	43,033,931 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	31,826,667 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; right lobe of thyroid gland; ; testicle; ; left testis; ; right testis; ; left lobe of thyroid gland; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; sural nerve; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; granulocyte; ; vas deferens; ; thymus; ; internal carotid artery; ; efferent ductule; ; spermatocyte; ; human fetus; ; blood; ; external carotid artery;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; sequence-specific DNA binding; DNA binding; protein heterodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; transcription regulator complex; cytosol;
Biological process	erythrocyte differentiation; regulation of transcription by RNA polymerase II; camera-type eye development; T cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; angiogenesis; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; hemopoiesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5316
	18771
	ENSG00000160199
	ENSMUSG00000006705
	P55347 ; Q96I87
	О70477
	НМ_001286258 ; НМ_004571 ; НМ_001320694 ; НМ_197976
	НМ_016670
показывать НП_001273187 ; НП_001307623 ; НП_004562 ; НП_001273187.1 ; НП_004562.2 ;
	NP_001307623.1
	НП_057879
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

PBX/Knotted 1 Гомеобокс 1 (PKNOX1) — это белок , который у человека кодируется PKNOX1 геном . ^[5]^[6]

Важным паралогом этого гена является PKNOX2 .

Функция

PKNOX1 принадлежит к с расширением трех аминокислотных петель (TALE) классу гомеодоменовых транскрипционных факторов , которые образуют транскрипционно активные комплексы, участвующие в развитии и органогенезе . PKNOX1 необходим для эмбриогенеза , но он также может действовать как супрессор опухоли во взрослом возрасте . ^[7]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160199 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006705 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бертельсен Дж., Виджано Л., Шульц Х., Ферретти Э., Консалес Г.Г., Рокки М., Блази Ф. (январь 1998 г.). «PKNOX1, ген, кодирующий PREP1, новый регулятор активности Pbx, картируется на хромосоме 21q22.3 человека и хромосоме 17B/C мыши». Геномика . 47 (2): 323–4. дои : 10.1006/geno.1997.5086 . ПМИД 9479508 .
^ «Энтрез Ген: PKNOX1 АТС/завязанный 1 гомеобокс 1» . Архивировано из оригинала 5 декабря 2010 г. Проверено 7 сентября 2017 г.
^ Пурушотаман Д., Блази Ф. (2018). «Генетика и молекулярные функции фактора транскрипции гомеодомена PREP1» . Международный журнал биологии развития . 62 (11–12): 819–825. дои : 10.1387/ijdb.180238fb . ПМИД 30604851 .

Дальнейшее чтение

Аллен Т.Д., Чжу YX, Хоули Т.С., Хоули Р.Г. (октябрь 2000 г.). «Гомеопротеины TALE как HOX11-взаимодействующие партнеры при Т-клеточном лейкозе». Лейкемия и лимфома . 39 (3–4): 241–56. дои : 10.3109/10428190009065824 . ПМИД 11342305 . S2CID 27407074 .
Чанг С.П., Шен В.Ф., Розенфельд С., Лоуренс Х.Дж., Ларгман С., Клири М.Л. (март 1995 г.). «Белки Pbx демонстрируют гексапептид-зависимое кооперативное связывание ДНК с подмножеством белков Hox» . Гены и развитие . 9 (6): 663–74. дои : 10.1101/gad.9.6.663 . ПМИД 7729685 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Хиллиер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С. и др. (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека» . Геномные исследования . 6 (9): 807–28. дои : 10.1101/гр.6.9.807 . ПМИД 8889549 .
Фелан М.Л., Физерстоун М.С. (март 1997 г.). «Различные остатки N-концевого плеча HOX ответственны за специфичность распознавания ДНК мономерами HOX и гетеродимерами HOX.PBX» . Журнал биологической химии . 272 (13): 8635–43. дои : 10.1074/jbc.272.13.8635 . ПМИД 9079695 .
Чен Х., Россье С., Накамура Ю., Линн А., Чакраварти А., Антонаракис С.Е. (апрель 1997 г.). «Клонирование нового гена, содержащего гомеобокс, PKNOX1, и картирование хромосомы 21q22.3 человека». Геномика . 41 (2): 193–200. дои : 10.1006/geno.1997.4632 . ПМИД 9143494 .
ЛеБрун Д.П., Мэтьюз Б.П., Фельдман Б.Дж., Клири М.Л. (октябрь 1997 г.). «Химерные онкопротеины E2A-PBX1 и E2A-HLF сконцентрированы внутри сферических ядерных доменов» . Онкоген . 15 (17): 2059–67. дои : 10.1038/sj.onc.1201367 . ПМИД 9366523 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Prep1, новый функциональный партнер белков Pbx» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1423–33. дои : 10.1093/emboj/17.5.1423 . ПМК 1170490 . ПМИД 9482739 .
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1434–45. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .
Грин, Северная Каролина, Рамбальди И., Тиклс Дж., Физерстоун М.С. (май 1998 г.). «Консервативный С-концевой домен в PBX увеличивает связывание ДНК с помощью гомеодомена PBX и не является основным местом контакта для мотива YPWM HOXA1» . Журнал биологической химии . 273 (21): 13273–9. дои : 10.1074/jbc.273.21.13273 . ПМИД 9582372 .
Бертельсен Дж., Килструп-Нильсен С., Блази Ф., Мавилио Ф., Заппавинья В. (апрель 1999 г.). «Субклеточная локализация белков PBX1 и EXD зависит от сигналов ядерного импорта и экспорта и модулируется за счет ассоциации с PREP1 и HTH» . Гены и развитие . 13 (8): 946–53. дои : 10.1101/gad.13.8.946 . ПМК 316640 . ПМИД 10215622 .
Джейкобс Ю., Шнабель К.А., Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменовых белков Hox и TALE опосредует активность энхансера заднего мозга Hoxb2» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5134–42. дои : 10.1128/mcb.19.7.5134 . ПМЦ 84356 . ПМИД 10373562 .
Кнопфлер П.С., Бергстром Д.А., Уэцуки Т., Дак-Корытко И., Сан Ю.Х., Райт В.Е. и др. (сентябрь 1999 г.). «Консервативный мотив, N-концевой по отношению к ДНК-связывающим доменам миогенных факторов транскрипции bHLH, опосредует совместное связывание ДНК с pbx-Meis1/Prep1» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (18): 3752–61. дои : 10.1093/нар/27.18.3752 . ПМК 148632 . ПМИД 10471746 .
Кёмювес Л.Г., Шен В.Ф., Квонг А., Стельницки Е., Розенфельд С., Ода Ю. и др. (август 2000 г.). «Изменения в структуре и локализации гомеодоменного белка HOXB6 во время развития и дифференцировки эпидермиса человека» . Динамика развития . 218 (4): 636–47. doi : 10.1002/1097-0177(2000)9999:9999<::AID-DVDY1014>3.0.CO;2-I . ПМИД 10906782 .
Окада Ю., Мацуура Э., Нагай Р., Сато Т., Ватанабэ А., Морита И., Дой Т. (май 2003 г.). «PREP1, белок-гомолог MEIS1, регулирует экспрессию гена PF4». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 305 (1): 155–9. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00718-6 . ПМИД 12732210 .

Внешние ссылки

PKNOX1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 21 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160199 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006705 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9479508-5] Бертельсен Дж., Виджано Л., Шульц Х., Ферретти Э., Консалес Г.Г., Рокки М., Блази Ф. (январь 1998 г.). «PKNOX1, ген, кодирующий PREP1, новый регулятор активности Pbx, картируется на хромосоме 21q22.3 человека и хромосоме 17B/C мыши». Геномика . 47 (2): 323–4. дои : 10.1006/geno.1997.5086 . ПМИД 9479508 .

[entrez-6] «Энтрез Ген: PKNOX1 АТС/завязанный 1 гомеобокс 1» . Архивировано из оригинала 5 декабря 2010 г. Проверено 7 сентября 2017 г.

[7] Пурушотаман Д., Блази Ф. (2018). «Генетика и молекулярные функции фактора транскрипции гомеодомена PREP1» . Международный журнал биологии развития . 62 (11–12): 819–825. дои : 10.1387/ijdb.180238fb . ПМИД 30604851 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]