BCL11A

BCL11A
Идентификаторы
Псевдонимы	BCL11A , BCL11A-L, BCL11A-S, BCL11A-XL, BCL11a-M, CTIP1, EVI9, HBFQTL5, ZNF856, B-клеточный CLL/лимфома 11A, DILOS, B-клеточный CLL/лимфома 11A, комплексный компонент BAF, ремоделирование хроматина BAF сложная субъединица SMARCM1
Внешние идентификаторы	Опустить : 606557 ; МГИ : 106190 ; Гомологен : 11284 ; Генные карты : BCL11A ; ОМА : BCL11A – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	60,554,467 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	24,174,123 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; primary visual cortex; ; Brodmann area 23; ; skin of hip; ; skin of thigh; ; middle temporal gyrus; ; postcentral gyrus; ; Region I of hippocampus proper; ; ventricular zone; ; superior frontal gyrus;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; barrel cortex; ; ganglionic eminence; ; piriform cortex; ; primary motor cortex; ; subiculum; ; medial ganglionic eminence; ; olfactory tubercle; ; subdivision of hippocampus; ; Region I of hippocampus proper;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; metal ion binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; protein heterodimerization activity; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity; protein kinase binding; sequence-specific DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; nucleus; postsynaptic density;
Biological process	negative regulation of protein homooligomerization; negative regulation of neuron projection development; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of dendrite development; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of collateral sprouting; protein sumoylation; transcription, DNA-templated; negative regulation of collateral sprouting; positive regulation of neuron projection development; negative regulation of axon extension; signal transduction; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; neurogenesis; negative regulation of dendrite development; positive regulation of gene expression; negative regulation of dendrite extension; negative regulation of neuron remodeling; cellular response to L-glutamate; negative regulation of branching morphogenesis of a nerve;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	53335
	14025
	ENSG00000119866
	ENSMUSG00000000861
	Q9H165
	Q9QYE3
showНМ_018014 ; НМ_022893 ; НМ_138553 ; НМ_138559 ; НМ_001363864 ;
	NM_001365609
	НМ_001159289 ; НМ_001159290 ; НМ_001242934 ; НМ_016707
	НП_060484 ; НП_075044 ; НП_612569 ; НП_001350793 ; НП_001352538
	НП_001152761 ; НП_001152762 ; НП_001229863 ; НП_057916
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

В-клеточная лимфома/лейкемия 11А — это белок , который у человека кодируется BCL11A геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Ген BCL11A кодирует регуляторный белок цинкового пальца типа C2H2, который может связываться с ДНК. Сообщалось о пяти альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют различные изоформы. ^[7] Белок связывается с комплексом SWI/SNF , который регулирует экспрессию генов посредством ремоделирования хроматина. ^[8]

BCL11A высоко экспрессируется в нескольких гемопоэтических линиях и играет роль в переключении с экспрессии γ- на β-глобин от плода к взрослому во время перехода эритропоэза . ^[9]

Кроме того, BCL11A экспрессируется в мозге, где он образует белковый комплекс с CASK, регулирующий рост и ветвление аксонов. ^[10] В неокортексе BCL11A связывается с регуляторной областью TBR1 и ингибирует экспрессию TBR1 . ^[11]

Клиническое значение

Соответствующий мышиный ген Bcl11a является распространенным местом интеграции ретровирусов при миелоидном лейкозе и может функционировать как ген заболевания лейкемией, частично за счет его взаимодействия с BCL6. Во время дифференцировки гемопоэтических клеток активность этого гена снижается. Возможно, он участвует в патогенезе лимфомы, поскольку транслокации, связанные со злокачественными новообразованиями В-клеток, также нарушают его экспрессию. Кроме того, было обнаружено, что BCL11A играет роль в подавлении выработки фетального гемоглобина. терапевтические стратегии, направленные на увеличение выработки фетального гемоглобина при таких заболеваниях, как бета-талассемия и серповидно-клеточная анемия, путем ингибирования BCL11A. В настоящее время изучаются ^[12]^[13]

Кроме того, гетерозиготные мутации de novo в BCL11A были идентифицированы при расстройстве умственной отсталости , сопровождающемся глобальной задержкой развития и расстройством аутистического спектра . ^[14] Эти мутации нарушают гомодимеризацию BCL11A и регуляцию транскрипции.

BCL11A также был идентифицирован как важный ген, представляющий интерес для диабета 2 типа. Было высказано предположение, что метилирование BCl11A способствует риску диабета 2 типа, в то время как было показано, что потеря BCL11a на модели островков человека приводит к увеличению секреции инсулина. ^[15]^[16]

Взаимодействия

Было показано, что BCL11A взаимодействует с рядом белков. BCL11A был первоначально обнаружен как белок, взаимодействующий с COUP-TFI . ^[17] В ядре BCL11A образует параспеклы, которые локализуются совместно с NONO . ^[14] В нейронах BCL11A взаимодействует с CASK , регулируя гены-мишени. ^[10] Кроме того, BCL11A взаимодействует с нейрон-специфичным белком TBR1 , который также участвует в умственной отсталости и расстройствах аутистического спектра. ^[18]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000119866 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000861 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Саттеруайт Э., Соноки Т., Уиллис Т.Г., Хардер Л., Новак Р., Арриола Э.Л. и др. (декабрь 2001 г.). «Семейство генов BCL11: участие BCL11A в лимфоидных злокачественных новообразованиях» . Кровь . 98 (12): 3413–20. дои : 10.1182/blood.V98.12.3413 . ПМИД 11719382 .
^ Уда М., Галанелло Р., Санна С., Леттре Дж., Санкаран В.Г., Чен В. и др. (февраль 2008 г.). «Полногеномное исследование ассоциации показывает, что BCL11A связан с персистирующим гемоглобином плода и улучшением фенотипа бета-талассемии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (5): 1620–5. Бибкод : 2008PNAS..105.1620U . дои : 10.1073/pnas.0711566105 . ПМК 2234194 . ПМИД 18245381 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: BCL11A B-клеточный ХЛЛ/лимфома 11А (белок цинковых пальцев)» .
^ Кадоч С., Харгривз Д.С., Ходжес С., Элиас Л., Хо Л., Раниш Дж. и др. (июнь 2013 г.). «Протеомный и биоинформатический анализ комплексов SWI/SNF млекопитающих определяет значительную роль в злокачественных новообразованиях человека» . Природная генетика . 45 (6): 592–601. дои : 10.1038/ng.2628 . ПМК 3667980 . ПМИД 23644491 .
^ Смит Э.К., Люк С., Крони Д.М., Вудворт М.Б., Грейг Л.К., Фудзивара И. и др. (ноябрь 2016 г.). «Усилитель эритроида Bcl11a» . Кровь . 128 (19): 2338–2342. дои : 10.1182/blood-2016-08-736249 . ПМК 5106112 . ПМИД 27707736 .
^ Jump up to: ^а ^б Куо Т., Хун С.Дж., Чиен Х.Л., Сюэ Ю.П. (август 2010 г.). «X-сцепленный ген умственной отсталости CASK взаимодействует с Bcl11A/CTIP1 и регулирует ветвление и рост аксонов». Журнал нейронаучных исследований (на немецком языке). 88 (11): 2364–73. дои : 10.1002/jnr.22407 . ПМИД 20623620 . S2CID 19810502 .
^ Кановас Дж., Берндт Ф.А., Сепульведа Х., Агилар Р., Велосо Ф.А., Монтечино М. и др. (май 2015 г.). «Спецификация корковых субцеребральных проекционных нейронов зависит от прямой репрессии TBR1 с помощью CTIP1/BCL11a» . Журнал неврологии . 35 (19): 7552–64. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0169-15.2015 . ПМК 6705430 . ПМИД 25972180 .
^ Зипкин М. (декабрь 2019 г.). «Великолепный момент CRISPR в клинике». Природная биотехнология . дои : 10.1038/d41587-019-00035-2 . ПМИД 33277639 . S2CID 213060203 .
^ «Серповидная клетка: «Революционное лечение генного редактирования, которое дало мне новую жизнь» » . Новости Би-би-си . 20 февраля 2022 г. Проверено 27 марта 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б Диас С., Эструх С.Б., Грэм С.А., Макрей Дж., Савиак С.Дж., Херст Дж.А. и др. (август 2016 г.). «Гаплонедостаточность BCL11A вызывает синдром умственной отсталости и нарушает регуляцию транскрипции» . Американский журнал генетики человека . 99 (2): 253–74. дои : 10.1016/j.ajhg.2016.05.030 . ПМЦ 4974071 . ПМИД 27453576 .
^ Пейрис Х., Парк С., Луи С., Гу Х., Лам Дж.Ю., Асплунд О. и др. (сентябрь 2018 г.). «Обнаружение функции человеческих генов риска диабета с помощью генетических и физиологических анализов» . Природные коммуникации . 9 (1): 3855. Бибкод : 2018NatCo...9.3855P . дои : 10.1038/s41467-018-06249-3 . ПМК 6155000 . ПМИД 30242153 .
^ Тан Л., Ван Л., Йе Х., Сюй Икс, Хун Ц., Ван Х. и др. (август 2014 г.). «Метилирование ДНК гена BCL11A способствует риску развития диабета 2 типа у мужчин» . Экспериментальная и терапевтическая медицина . 8 (2): 459–463. дои : 10.3892/etm.2014.1783 . ПМК 4079426 . ПМИД 25009601 .
^ Аврам Д., Филдс А., Сенавонг Т., Топарк-Нгарм А., Лейд М. (декабрь 2002 г.). «Белок 1, взаимодействующий с COUP-TF (фактором транскрипции промотора куриного овальбумина) (CTIP1), является специфичным для последовательности ДНК-связывающим белком» . Биохимический журнал . 368 (Часть 2): 555–63. дои : 10.1042/bj20020496 . ПМК 1223006 . ПМИД 12196208 .
^ ден Хоед Дж., Соллис Э., Венселаар Х., Эструх С.Б., Дерициотис П., Фишер С.Е. (сентябрь 2018 г.). «Функциональная характеристика вариантов TBR1 при нарушениях нервного развития» . Научные отчеты . 8 (1): 14279. Бибкод : 2018NatSR...814279D . дои : 10.1038/s41598-018-32053-6 . ПМК 6155134 . ПМИД 30250039 .

Дальнейшее чтение

Центр Сэнгера, Центр секвенирования генома Вашингтонского университета (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
Аврам Д., Филдс А., Pretty On Top K, Невриви DJ, Измаил Дж. Э., Лейд М. (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной орфанными ядерными рецепторами фактора транскрипции промотора куриного овальбумина (COUP-TF)» . Журнал биологической химии . 275 (14): 10315–22. дои : 10.1074/jbc.275.14.10315 . ПМК 2819356 . ПМИД 10744719 .
Накамура Т., Ямазаки Ю., Сайки Ю., Морияма М., Ларгаэспада Д.А., Дженкинс Н.А. и др. (май 2000 г.). «Evi9 кодирует новый белок цинковых пальцев, который физически взаимодействует с BCL6, известным протоонкогенным продуктом B-клеток человека» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (9): 3178–86. дои : 10.1128/MCB.20.9.3178-3186.2000 . ПМК 85612 . ПМИД 10757802 .
Сайки Ю., Ямадзаки Ю., Ёсида М., Като О., Накамура Т. (декабрь 2000 г.). «Человеческий EVI9, гомолог гена мышиного миелоидного лейкоза, экспрессируется в гематопоэтических предшественниках и подавляется во время миелоидной дифференцировки клеток HL60». Геномика . 70 (3): 387–91. дои : 10.1006/geno.2000.6385 . ПМИД 11161790 .
Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О. (апрель 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . Исследование ДНК . 8 (2): 85–95. дои : 10.1093/dnares/8.2.85 . ПМИД 11347906 .
Мартин-Суберо Дж.И., Геск С., Хардер Л., Соноки Т., Такер П.В., Шлегельбергер Б. и др. (февраль 2002 г.). «Рецидивирующее поражение локусов REL и BCL11A при классической лимфоме Ходжкина» . Кровь . 99 (4): 1474–7. дои : 10.1182/blood.V99.4.1474 . ПМИД 11830502 .
Кюпперс Р., Соноки Т., Саттервайт Е., Геск С., Хардер Л., Осьер Д.Г. и др. (май 2002 г.). «Отсутствие соматической гипермутации генов IG V(H) при лимфоидных злокачественных новообразованиях с транслокацией t(2;14)(p13;q32) с участием гена BCL11A» . Лейкемия . 16 (5): 937–9. дои : 10.1038/sj.leu.2402480 . ПМИД 11986957 .
Сенавонг Т., Петерсон В.Дж., Лейд М. (февраль 2005 г.). «BCL11A-зависимое привлечение SIRT1 к матрице промотора в клетках млекопитающих приводит к деацетилированию гистонов и репрессии транскрипции» . Архив биохимии и биофизики . 434 (2): 316–25. дои : 10.1016/j.abb.2004.10.028 . ПМЦ 2819353 . ПМИД 15639232 .
Лю Х., Ипполито Г.К., Уолл Дж.К., Ню Т., Пробст Л., Ли Б.С. и др. (май 2006 г.). «Функциональные исследования BCL11A: характеристика консервативного варианта сплайсинга BCL11A-XL и его взаимодействия с BCL6 в ядерных параспеклах B-клеток зародышевого центра» . Молекулярный рак . 5:18 . дои : 10.1186/1476-4598-5-18 . ПМК 1526750 . ПМИД 16704730 .
Венигер М.А., Пулфорд К., Геск С., Эрлих С., Банэм А.Х., Лайн Л. и др. (октябрь 2006 г.). «Прирост протоонкогена BCL11A и ядерное накопление белка BCL11A(XL) часто наблюдаются при первичной медиастинальной В-клеточной лимфоме» . Лейкемия . 20 (10): 1880–2. дои : 10.1038/sj.leu.2404324 . ПМИД 16871282 .
Шафрански К., Шиндлер С., Тауден С., Хиллер М., Хьюз К., Ян Н. и др. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах» . Геномная биология . 8 (8): 154 р. дои : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . ПМК 2374985 . ПМИД 17672918 .

Внешние ссылки

BCL11A+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук BCL11A
человека Местоположение генома BCL11A и BCL11A страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000119866 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000861 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11719382-5] Саттеруайт Э., Соноки Т., Уиллис Т.Г., Хардер Л., Новак Р., Арриола Э.Л. и др. (декабрь 2001 г.). «Семейство генов BCL11: участие BCL11A в лимфоидных злокачественных новообразованиях» . Кровь . 98 (12): 3413–20. дои : 10.1182/blood.V98.12.3413 . ПМИД 11719382 .

[pmid18245381-6] Уда М., Галанелло Р., Санна С., Леттре Дж., Санкаран В.Г., Чен В. и др. (февраль 2008 г.). «Полногеномное исследование ассоциации показывает, что BCL11A связан с персистирующим гемоглобином плода и улучшением фенотипа бета-талассемии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (5): 1620–5. Бибкод : 2008PNAS..105.1620U . дои : 10.1073/pnas.0711566105 . ПМК 2234194 . ПМИД 18245381 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: BCL11A B-клеточный ХЛЛ/лимфома 11А (белок цинковых пальцев)» .

[8] Кадоч С., Харгривз Д.С., Ходжес С., Элиас Л., Хо Л., Раниш Дж. и др. (июнь 2013 г.). «Протеомный и биоинформатический анализ комплексов SWI/SNF млекопитающих определяет значительную роль в злокачественных новообразованиях человека» . Природная генетика . 45 (6): 592–601. дои : 10.1038/ng.2628 . ПМК 3667980 . ПМИД 23644491 .

[9] Смит Э.К., Люк С., Крони Д.М., Вудворт М.Б., Грейг Л.К., Фудзивара И. и др. (ноябрь 2016 г.). «Усилитель эритроида Bcl11a» . Кровь . 128 (19): 2338–2342. дои : 10.1182/blood-2016-08-736249 . ПМК 5106112 . ПМИД 27707736 .

[:0-10] Jump up to: ^а ^б Куо Т., Хун С.Дж., Чиен Х.Л., Сюэ Ю.П. (август 2010 г.). «X-сцепленный ген умственной отсталости CASK взаимодействует с Bcl11A/CTIP1 и регулирует ветвление и рост аксонов». Журнал нейронаучных исследований (на немецком языке). 88 (11): 2364–73. дои : 10.1002/jnr.22407 . ПМИД 20623620 . S2CID 19810502 .

[11] Кановас Дж., Берндт Ф.А., Сепульведа Х., Агилар Р., Велосо Ф.А., Монтечино М. и др. (май 2015 г.). «Спецификация корковых субцеребральных проекционных нейронов зависит от прямой репрессии TBR1 с помощью CTIP1/BCL11a» . Журнал неврологии . 35 (19): 7552–64. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0169-15.2015 . ПМК 6705430 . ПМИД 25972180 .

[12] Зипкин М. (декабрь 2019 г.). «Великолепный момент CRISPR в клинике». Природная биотехнология . дои : 10.1038/d41587-019-00035-2 . ПМИД 33277639 . S2CID 213060203 .

[13] «Серповидная клетка: «Революционное лечение генного редактирования, которое дало мне новую жизнь» » . Новости Би-би-си . 20 февраля 2022 г. Проверено 27 марта 2023 г.

[:1-14] Jump up to: ^а ^б Диас С., Эструх С.Б., Грэм С.А., Макрей Дж., Савиак С.Дж., Херст Дж.А. и др. (август 2016 г.). «Гаплонедостаточность BCL11A вызывает синдром умственной отсталости и нарушает регуляцию транскрипции» . Американский журнал генетики человека . 99 (2): 253–74. дои : 10.1016/j.ajhg.2016.05.030 . ПМЦ 4974071 . ПМИД 27453576 .

[15] Пейрис Х., Парк С., Луи С., Гу Х., Лам Дж.Ю., Асплунд О. и др. (сентябрь 2018 г.). «Обнаружение функции человеческих генов риска диабета с помощью генетических и физиологических анализов» . Природные коммуникации . 9 (1): 3855. Бибкод : 2018NatCo...9.3855P . дои : 10.1038/s41467-018-06249-3 . ПМК 6155000 . ПМИД 30242153 .

[16] Тан Л., Ван Л., Йе Х., Сюй Икс, Хун Ц., Ван Х. и др. (август 2014 г.). «Метилирование ДНК гена BCL11A способствует риску развития диабета 2 типа у мужчин» . Экспериментальная и терапевтическая медицина . 8 (2): 459–463. дои : 10.3892/etm.2014.1783 . ПМК 4079426 . ПМИД 25009601 .

[17] Аврам Д., Филдс А., Сенавонг Т., Топарк-Нгарм А., Лейд М. (декабрь 2002 г.). «Белок 1, взаимодействующий с COUP-TF (фактором транскрипции промотора куриного овальбумина) (CTIP1), является специфичным для последовательности ДНК-связывающим белком» . Биохимический журнал . 368 (Часть 2): 555–63. дои : 10.1042/bj20020496 . ПМК 1223006 . ПМИД 12196208 .

[18] ден Хоед Дж., Соллис Э., Венселаар Х., Эструх С.Б., Дерициотис П., Фишер С.Е. (сентябрь 2018 г.). «Функциональная характеристика вариантов TBR1 при нарушениях нервного развития» . Научные отчеты . 8 (1): 14279. Бибкод : 2018NatSR...814279D . дои : 10.1038/s41598-018-32053-6 . ПМК 6155134 . ПМИД 30250039 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]