HOXC4

HOXC4
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXC4 , HOX3, HOX3E, cp19, гомеобокс C4
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142974 ; МГИ : 96195 ; Гомологен : 8408 ; Генные карты : HOXC4 ; OMA : HOXC4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	54,056,030 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	102,945,278 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; vena cava; ; renal medulla; ; saphenous vein; ; pons; ; left uterine tube; ; tibial arteries; ; caput epididymis; ; testicle; ; spinal ganglia;
	Top expressed in
	superior cervical ganglion; ; tail of embryo; ; efferent ductule; ; dermis; ; abdominal wall; ; somite; ; esophagus; ; epididymis; ; cumulus cell; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; HMG box domain binding; DNA binding; protein binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleus;
Biological process	multicellular organism development; skeletal system development; cartilage development; regulation of transcription, DNA-templated; embryonic organ morphogenesis; transcription, DNA-templated; anterior/posterior pattern specification; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; embryonic skeletal system morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3221
	15423
	ENSG00000198353
	ENSMUSG00000075394
	P09017 ; Q86TF7
	Q08624
	НМ_153633 ; НМ_014620
	НМ_013553
	НП_055435 ; НП_705897 ; НП_055435.2 ; НП_705897.1
	НП_038581
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-C4 — это белок , который у человека кодируется HOXC4 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов гомеобокса. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство транскрипционных факторов, играющих важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя сходными кластерами гомеобоксных генов: HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9–11 генов, расположенных тандемно. Этот ген, HOXC4, является одним из нескольких гомеобоксных генов HOXC, расположенных в кластере на хромосоме 12. Три гена, HOXC5, HOXC4 и HOXC6, имеют общий 5'-некодирующий экзон. Транскрипты могут включать общий экзон, сращенный с ген-специфичными экзонами, или они могут включать только ген-специфичные экзоны. Для HOXC4 описаны два альтернативно сплайсированных варианта, которые кодируют один и тот же белок. Первый вариант транскрипта включает общий экзон, а второй вариант транскрипта включает только ген-специфичные экзоны. ^[7]

См. также

Гомеобокс

Взаимодействия

Было показано, что HOXC4 взаимодействует с Ku70 . ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198353 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000075394 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С4 HOXC4» .
^ Шилд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж.К., Нгси Дж.К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р.Дж. (май 2001 г.). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию с помощью ДНК-зависимой протеинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 276 (20): 16848–56. дои : 10.1074/jbc.M100768200 . ПМИД 11279128 .

Дальнейшее чтение

Акампора Д, Д'Эспозито М, Файелла А, Паннесе М, Мильяччо Е, Морелли Ф, Сторнаиуоло А, Нигро В, Симеоне А, Бончинелли Э (1989). «Семейство генов HOX человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (24): 10385–402. дои : 10.1093/нар/17.24.10385 . ПМК 335308 . ПМИД 2574852 .
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1989). «Организация генов гомеобокса I класса человека». Геном . 31 (2): 745–56. дои : 10.1139/g89-133 . ПМИД 2576652 .
Рабин М., Фергюсон-Смит А., Харт С.П., Раддл Ф.Х. (1986). «Родственные локусы гомеобокса, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 83 (23): 9104–8. Бибкод : 1986PNAS...83.9104R . дои : 10.1073/pnas.83.23.9104 . ПМЦ 387083 . ПМИД 2878432 .
Симеоне А., Паннесе М., Акампора Д., Д'Эспозито М., Бончинелли Е. (1988). «По крайней мере три человеческих гомеобокса на 12-й хромосоме принадлежат к одной и той же единице транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 16 (12): 5379–90. дои : 10.1093/нар/16.12.5379 . ПМЦ 336773 . ПМИД 2898768 .
Адамс МД, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Балт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Э.Ф., Вайнсток К.Г., Гокейн Дж.Д., Уайт О (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Природа . 377 (6547 Приложение): 3–174. ПМИД 7566098 .
Меацца Р., Файелла А., Корсетти М.Т., Айролди И., Феррини С., Бончинелли Э., Корте Г. (1995). «Экспрессия гомеопротеина HOXC4 в ядре активированных лимфоцитов человека» . Кровь . 85 (8): 2084–90. doi : 10.1182/blood.V85.8.2084.bloodjournal8582084 . ПМИД 7718879 .
Ригер Э., Бийл Дж.Дж., ван Оствеен Дж.В., Сойер Х.П., Оудейанс CB, Джива Н.М., Уолбумерс Дж.М., Мейер С.Дж. (1994). «Экспрессия гомеобоксного гена HOXC4 в кератиноцитах нормальной кожи и эпителиальных опухолях кожи коррелирует с дифференцировкой» . Дж. Инвест. Дерматол . 103 (3): 341–6. дои : 10.1111/1523-1747.ep12394888 . ПМИД 7915745 .
Апиу Ф, Флагиелло Д, Чилло С, Малфой Б, Пупон МФ, Дютрилья Б (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенет. Клеточная генетика . 73 (1–2): 114–5. дои : 10.1159/000134320 . ПМИД 8646877 .
Бийл Дж.Дж., Ригер Э., ван Оствеен Дж.В., Уолбумерс Дж.М., Крайке М., Виллемзе Р., Мейер С.Дж. (1997). «Экспрессия HOXC4, HOXC5 и HOXC6 при первичных кожных лимфоидных поражениях. Высокая экспрессия HOXC5 при анапластических крупноклеточных лимфомах» . Являюсь. Дж. Патол . 151 (4): 1067–74. ПМК 1858029 . ПМИД 9327740 .
Шилд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж.К., Нгси Дж.К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р.Дж. (2001). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию с помощью ДНК-зависимой протеинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 276 (20): 16848–56. дои : 10.1074/jbc.M100768200 . ПМИД 11279128 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (2002). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Шаффер А., Ким Э.К., Ву Х, Зан Х., Тестони Л., Саламон С., Черутти А., Казали П. (2003). «Селективное ингибирование переключения класса на IgG и IgE путем привлечения гомеодоменовых белков HoxC4 и Oct-1 и Ku70/Ku86 к недавно идентифицированным цис-элементам ATTT» . Ж. Биол. Хим . 278 (25): 23141–50. дои : 10.1074/jbc.M212952200 . ПМИД 12672812 .
Ким EC, Эдмонстон CR, Ву X, Шаффер А, Казали П (2004). «Гомеодоменный белок HoxC4 опосредует активацию 3'-энхансера hs1,2 тяжелой цепи иммуноглобулина в В-клетках человека. Актуальность для рекомбинации ДНК с переключением классов» . Ж. Биол. Хим . 279 (40): 42258–69. дои : 10.1074/jbc.M407496200 . ПМЦ 4631311 . ПМИД 15252056 .
Шпелеман Ф, Каувелье Б, Дастюг Н, Кулс Дж, Верхасселт Б, Поппе Б, Ван Рой Н, Вандесомпель Дж, Грау С, Юттебрук А, Бугертс М, Де Мёрлуз Б, Бенуа Ю, Селлеслаг Д, Биллиет Дж, Роберт А, Уге Ф., Ванденберге П., Де Паепе А., Маринен П., Хагемейер А. (2005). «Новая рекуррентная инверсия, inv(7)(p15q34), приводит к активации транскрипции HOXA10 и HOXA11 в подмножестве острых Т-клеточных лимфобластных лейкозов» . Лейкемия . 19 (3): 358–66. дои : 10.1038/sj.leu.2403657 . hdl : 1854/LU-349753 . ПМИД 15674412 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (2006) / Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» Genome Res . 16 (1): 55–65. : 10.1101 gr.4039406 . PMID . . « 16344560 doi
Виссмюллер С., Косян Т., Вольф М., Финцш М., Вегнер М. (2006). «Домен группы высокой подвижности белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (6): 1735–44. дои : 10.1093/нар/gkl105 . ПМЦ 1421504 . ПМИД 16582099 .

Внешние ссылки

HOXC4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198353 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000075394 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С4 HOXC4» .

[pmid11279128-8] Шилд-Поултер С., Поуп Л., Гиффин В., Кочан Дж.К., Нгси Дж.К., Трайкова-Андонова М., Хаче Р.Дж. (май 2001 г.). «Связывание Ku-антигена с гомеодоменными белками способствует их фосфорилированию с помощью ДНК-зависимой протеинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 276 (20): 16848–56. дои : 10.1074/jbc.M100768200 . ПМИД 11279128 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]