НФЕ2L3
| НФЕ2L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | NFE2L3 , NRF3, ядерный фактор, эритроидный 2-подобный 3, NFE2-подобный транскрипционный фактор 3 bZIP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 604135 ; МГИ : 1339958 ; Гомологен : 3168 ; Генные карты : NFE2L3 ; OMA : NFE2L3 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Фактор 3, подобный ядерному фактору (эритроиду 2) , также известный как NFE2L3 или « NRF3» , представляет собой фактор транскрипции , который у людей кодируется Nfe2l3 геном . [5] [6]
базовой лейциновой молнии ( bZIP ) Nrf3 представляет собой фактор транскрипции , принадлежащий к семейству белков Cap 'n' Collar (CNC). [7] первый фактор транскрипции CNC NFE2L2 В 1989 году был идентифицирован . Впоследствии несколько родственных белков было идентифицировано , включая NFE2L1 и NFE2L3, в различных организмах, таких как люди, мыши и рыбки данио . [8] Эти белки специфически кодируются у человека генами Nfe2l1 и Nfe2l3 соответственно. [9] [10]
Ген
[ редактировать ]Ген Nfe2l3 был картирован в хромосомном положении 7p15-p14 с помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH). [9] Он покрывает 34,93 КБ от основания 26191830 до 26226754 на прямой цепи ДНК с числом экзонов 4. Ген находится рядом с кластером генов HOXA , аналогично кластеризации p45 NF-E2 , NFE2L1 и NFE2L2 рядом с HOXC, HOXB, и гены HOXD соответственно. [7] [9] Это означает, что все четыре гена, вероятно, произошли от одного предкового гена, который дублировался вместе с предковым кластером НОХ, дивергируя, давая начало четырем тесно связанным факторам транскрипции. [9]
человека Ген Nfe2l3 кодирует последовательность из 694 аминокислотных остатков. [7] [9] В результате биоинформатического анализа было замечено, что белок NRF3 демонстрирует высокую степень консервативности на протяжении своего эволюционного пути от рыбок данио к человеку. Ключевые консервативные домены, такие как N-концевой блок гомологии 1 (NHB1), N-концевой блок гомологии 2 (NHB2) и домен CNC, указывают на консервативные функциональные свойства этого транскрипционного фактора. [11]
Субклеточное расположение
[ редактировать ]NRF3 представляет собой гликопротеин мембраносвязанный , который может быть специфически нацелен на эндоплазматический ретикулум (ЭР) и ядерную мембрану . [9] Биохимические исследования выявили три мигрирующие эндогенные формы белка NRF3 – A, B и C – которые конститутивно деградируют за счет нескольких протеолитических механизмов. [9] [12] Известно, что форма «А» гликозилирована , тогда как форма «В» негликозилирована, а форма «С» образуется в результате расщепления «В». [7] [9] Всего обнаружено семь потенциальных сайтов N-связанного гликозилирования. [7] наблюдался в центральной части белка NRF3. Однако дальнейшие подробности расположения, регуляции и функций трех форм в каждом клеточном компартменте остаются неизвестными.
Уровни экспрессии белка
[ редактировать ]Уровни экспрессии белков NRF3 самые высокие в плаценте . [13] более конкретно в ворсинках хориона (на 12 неделе беременности ) [14] Экспрессия, по-видимому, специфична для первичных плацентарных цитотрофобластов , а не для плацентарных фибробластов . Наряду с плацентой экспрессия этого белка также наблюдалась в клеточных линиях хориокарциномы человека , полученных из трофобластических опухолей плаценты. NFE2L2 также был обнаружен в сердце , головном мозге , легких , почках , поджелудочной железе , толстой кишке , тимусе , лейкоцитах и селезенке . [15] Очень низкие уровни экспрессии были обнаружены в мегакариоцитах и эритроцитах человека , а экспрессия NRF3 не наблюдалась в репродуктивных органах любого пола. [9] [16]
Функция
[ редактировать ]Специфические функции белка NRF3 до сих пор неизвестны, но некоторые предполагаемые функциональные свойства были выведены из свойств NFE2L1 из-за их структурного сходства. Известно, что NRF3 может гетеродимеризоваться с небольшими факторами мышечно-апоневротической фибросаркомы ( гены MAF ) для связывания антиоксидантного элементов ответа в генах-мишенях. [17]
Сопутствующие заболевания
[ редактировать ]Данные микрочипов РНК показали участие NRF3 в различных злокачественных новообразованиях , при этом сверхэкспрессия наблюдается при лимфоме Ходжкина , неходжкинской лимфоме и лимфоме мантийных клеток . [18] Экспрессия NRF3 также повышена в клетках рака молочной железы человека и карциномы яичек , что означает, что NRF3 может играть роль в индукции канцерогенеза . [19]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000050344 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029832 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: ядерный фактор (эритроидного происхождения 2)-подобный 3» .
- ^ Кобаяши А, Ито Э, Токи Т, Когаме К, Такахаши С, Игараси К, Хаяси Н, Ямамото М (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика нового транскрипционного фактора Nrf3 семейства Cap'n' Collar» . Журнал биологической химии . 274 (10): 6443–52. дои : 10.1074/jbc.274.10.6443 . ПМИД 10037736 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Ландшульц В.Х., Джонсон П.Ф., Макнайт С.Л. (июнь 1988 г.). «Лейциновая молния: гипотетическая структура, общая для нового класса ДНК-связывающих белков». Наука . 240 (4860): 1759–64. Бибкод : 1988Sci...240.1759L . дои : 10.1126/science.3289117 . JSTOR 1701639 . ПМИД 3289117 .
- ^ Дерджуга А., Горли Т.С., Холм Т.М., Хенг Х.Х., Шивдасани Р.А., Ахмед Р., Эндрюс Н.С., Бланк В. (апрель 2004 г.). «Сложность факторов транскрипции CNC, выявленная путем нацеливания на ген локуса Nrf3» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (8): 3286–94. дои : 10.1128/mcb.24.8.3286-3294.2004 . ПМК 381672 . ПМИД 15060151 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я Шевиллард Дж., Бланк В. (октябрь 2011 г.). «NFE2L3 (NRF3): Золушка транскрипционных факторов Cap'n'Collar» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 68 (20): 3337–48. дои : 10.1007/s00018-011-0747-x . ПМЦ 11114735 . ПМИД 21687990 . S2CID 25006101 .
- ^ Катерина Джей Джей, Донзе Д., Сан CW, Чиаватта DJ, Townes TM (июнь 1994 г.). «Клонирование и функциональная характеристика LCR-F1: фактор транскрипции bZIP, который активирует экспрессию эритроид-специфического человеческого глобина» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (12): 2383–91. дои : 10.1093/нар/22.12.2383 . ПМК 523699 . ПМИД 8036168 .
- ^ Сяо Ц, Пепе А.Э., Ван Г, Луо З, Чжан Л, Цзэн Л, Чжан З, Ху Ю, Йе С, Сюй Ц (март 2012 г.). «Взаимодействие Nrf3-Pla2g7 играет важную роль в дифференцировке гладких мышц из стволовых клеток» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 32 (3): 730–44. дои : 10.1161/ATVBAHA.111.243188 . ПМИД 22247257 .
- ^ Чоудхури АММА, Като Х., Хатанака А., Иванари Х., Накамура Н., Хамакубо Т., Нацуме Т., Ваку Т., Кобаяши А. (2017). «Множественные регуляторные механизмы биологической функции NRF3 (NFE2L3) контролируют пролиферацию раковых клеток» . Научный представитель . 7 (1): 12494. Бибкод : 2017NatSR...712494C . дои : 10.1038/s41598-017-12675-y . ПМЦ 5624902 . ПМИД 28970512 .
- ^ Шене Б., Дерьюга А., Массри В., Ред-Хорс К., Беллингард В., Фишер С.Дж., Бланк В. (январь 2005 г.). «Функциональный и плацентарный анализ экспрессии фактора транскрипции NRF3 человека» . Молекулярная эндокринология . 19 (1): 125–37. дои : 10.1210/me.2003-0379 . ПМИД 15388789 .
- ^ Шевиллар Дж., Паке М., Бланк В. (февраль 2011 г.). «Дефицит Nfe2l3 (Nrf3) предрасполагает мышей к Т-клеточной лимфобластной лимфоме» . Кровь . 117 (6): 2005–8. doi : 10.1182/blood-2010-02-271460 . ПМИД 21148084 .
- ^ Мартин-Монтальво А., Вильяльба Х.М., Навас П., де Кабо Р. (февраль 2011 г.). «NRF2, рак и ограничение калорий» . Онкоген . 30 (5): 505–520. дои : 10.1038/onc.2010.492 . ПМЦ 4684645 . ПМИД 21057541 .
- ^ Венугопал Р., Джайсвал А.К. (декабрь 1998 г.). «Nrf2 и Nrf1 в сочетании с белками Jun регулируют экспрессию, опосредованную элементами антиоксидантного ответа, и скоординированную индукцию генов, кодирующих детоксифицирующие ферменты» . Онкоген . 17 (24): 3145–56. дои : 10.1038/sj.onc.1202237 . ПМИД 9872330 .
- ^ Бланк В., Эндрюс, Северная Каролина (ноябрь 1997 г.). «Факторы транскрипции Maf: регуляторы дифференцировки». Тенденции биохимических наук . 22 (11): 437–41. дои : 10.1016/s0968-0004(97)01105-5 . ПМИД 9397686 .
- ^ Вилленброк К., Купперс Р., Ренне С., Брюн В., Эккерле С., Вайдманн Е., Браунингер А., Хансманн М.Л. (май 2006 г.). «Общие особенности и различия в транскриптоме крупноклеточной анапластической лимфомы и классической лимфомы Ходжкина». Гематологическая . 91 (5): 596–604. ПМИД 16670065 .
- ^ Хейс Дж. Д., МакМахон М. (декабрь 2001 г.). «Молекулярные основы вклада антиоксидантно-чувствительного элемента в химиопрофилактику рака». Письма о раке . 174 (2): 103–13. дои : 10.1016/s0304-3835(01)00695-4 . ПМИД 11689285 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Давила С., Фрёлинг Ф.Е., Тан А., Боннард С., Боланд Г.Дж., Сниппе Х., Хибберд М.Л., Зейлстад М. (апрель 2010 г.). «Новые генетические ассоциации обнаружены в исследовании реакции организма на вакцину против гепатита В» . Гены и иммунитет . 11 (3): 232–8. дои : 10.1038/gen.2010.1 . ПМИД 20237496 .
- Шанкаранарайанан К., Джайсвал А.К. (декабрь 2004 г.). «Nrf3 отрицательно регулирует опосредованную элементом антиоксидантного ответа экспрессию и антиоксидантную индукцию гена NAD(P)H:хиноноксидоредуктазы1» . Журнал биологической химии . 279 (49): 50810–7. дои : 10.1074/jbc.M404984200 . ПМИД 15385560 .
- Шене Б., Дерьюга А., Массри В., Ред-Хорс К., Беллингард В., Фишер С.Дж., Бланк В. (январь 2005 г.). «Функциональный и плацентарный анализ экспрессии фактора транскрипции NRF3 человека» . Молекулярная эндокринология . 19 (1): 125–37. дои : 10.1210/me.2003-0379 . ПМИД 15388789 .
- Ноухи З., Шевиллард Г., Дерджуга А., Бланк В. (ноябрь 2007 г.). «Ассоциация эндоплазматического ретикулума и N-связанное гликозилирование фактора транскрипции Nrf3 человека» . Письма ФЭБС . 581 (28): 5401–6. дои : 10.1016/j.febslet.2007.10.041 . ПМИД 17976382 . S2CID 2876177 .
- Теруи К., Такахаши Ю., Китазава Дж., Токи Т., Ёкояма М., Ито Э. (декабрь 2000 г.). «Экспрессия факторов транскрипции во время мегакариоцитарной дифференцировки клеток CD34+ из пуповинной крови человека, индуцированной тромбопоэтином» . Журнал экспериментальной медицины Тохоку . 192 (4): 259–73. дои : 10.1620/tjem.192.259 . ПМИД 11286316 .
- Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
- Чжан Ю., Кобаяши А., Ямамото М., Хейс Дж.Д. (январь 2009 г.). «Фактор транскрипции Nrf3 представляет собой мембраносвязанный гликопротеин, нацеленный на эндоплазматический ретикулум через его N-концевую последовательность гомологического бокса 1» . Журнал биологической химии . 284 (5): 3195–210. дои : 10.1074/jbc.M805337200 . ПМИД 19047052 .
- Ваку Т., Кобаяши А. (ноябрь 2021 г.). «Патофизиологические потенциалы NRF3-регулируемых транскрипционных осей в белковом и липидном гомеостазе» . Международный журнал молекулярных наук . 22 (23): 12686. doi : 10.3390/ijms222312686 . ПМЦ 8657584 . PMID 34884489 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .