ХОПХ

ХОПХ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1UHS, 2HI3
Идентификаторы
Псевдонимы	HOPX , CAMEO, HOD, HOP, LAGY, NECC1, OB1, SMAP31, TOTO, гомеобокс HOP
Внешние идентификаторы	Опустить : 607275 ; МГИ : 1916782 ; Гомологен : 15859 ; Генные карты : HOPX ; ОМА : HOPX — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	56,681,899 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	77,262,968 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of thigh; ; corpus epididymis; ; skin of hip; ; mucosa of pharynx; ; human penis; ; oral cavity; ; skin of abdomen; ; vulva; ; right lung; ; upper lobe of left lung;
	Top expressed in
	right lung lobe; ; left lung; ; superior surface of tongue; ; right ventricle; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; left lung lobe; ; gastrula; ; esophagus; ; interventricular septum; ; transitional epithelium of urinary bladder;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell differentiation; multicellular organism development; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; trophectodermal cell differentiation; chaperone-mediated protein complex assembly; cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84525
	74318
	ENSG00000171476
	ENSMUSG00000059325
	Q9BPY8
	Q8R1H0
	НМ_001145459 ; НМ_001145460 ; НМ_032495 ; НМ_139211 ; НМ_139212
	НМ_001159900 ; НМ_001159901 ; НМ_175606
	НП_001138931 ; НП_001138932 ; НП_115884 ; НП_631957 ; НП_631958
	НП_001153372 ; НП_001153373 ; НП_783199
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок, содержащий только гомеодомен, представляет собой белок , который у человека кодируется HOPX геном . ^[5] Это важный регулятор сердечного развития. ^[6] и маркер нейральных гиппокампа стволовых клеток . ^[7]^[8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой гомеодоменный белок, в котором отсутствуют определенные консервативные остатки, необходимые для связывания с ДНК. Сообщалось, что клеточные линии и ткани хориокарциномы не экспрессируют этот ген, что позволяет предположить возможное участие этого гена в злокачественном преобразовании плацентарных трофобластов. Исследования на мышах показали, что этот белок может взаимодействовать с фактором ответа сыворотки (SRF) и модулировать SRF-зависимую экспрессию специфичных для сердца генов и развитие сердца. ^[6] Наблюдалось множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих один и тот же белок, полноразмерная природа только некоторых из них была определена. ^[5]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171476 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059325 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок, содержащий только гомеодомен HOP» .
^ Jump up to: ^а ^б Чен Ф., Кук Х., Милевски Р., Гитлер А.Д., Лу ММ, Ли Дж., Назарян Р., Шнепп Р., Джен К., Бибен С., Ранке Дж., Маккей Дж.П., Новотный Дж., Шварц Р.Дж., Харви Р.П., Маллинз М.К., Эпштейн Дж.А. (сентябрь 2002 г.). «Хмель — необычный гомеобоксный ген, который модулирует развитие сердца» . Клетка . 110 (6): 713–723. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00932-7 . ПМИД 12297045 . S2CID 12189105 .
^ Ли Д., Такеда Н., Джайн Р., Мандерфилд Л.Дж., Лю Ф., Ли Л., Андерсон С.А., Эпштейн Дж.А. (ноябрь 2015 г.). «Hopx отличает гиппокамп от нервных стволовых клеток бокового желудочка» . Исследования стволовых клеток . 15 (3): 522–529. дои : 10.1016/j.scr.2015.09.015 . ПМК 4704104 . ПМИД 26451648 .
^ Берг Д.А., Су Ю, Хименес-Сайрус Д., Патель А., Хуанг Н., Моризет Д., Ли С., Шах Р., Рингелинг Ф.Р., Джайн Р., Эпштейн Дж.А., Ву Ч.Ф., Канзар С., Мин Г.Л., Сонг Х., Бонд А.М. ( апрель 2019). «Общее эмбриональное происхождение стволовых клеток стимулирует нейрогенез развития и взрослого человека» . Клетка . 177 (3): 654–668.e15. дои : 10.1016/j.cell.2019.02.010 . ПМК 6496946 . ПМИД 30929900 .

Дальнейшее чтение

Кук Х., Эпштейн Дж. А. (октябрь 2003 г.). «Прыжки в такт. Хопковая регуляция экспрессии сердечных генов». Тенденции сердечно-сосудистой медицины . 13 (7): 261–4. дои : 10.1016/S1050-1738(03)00107-5 . ПМИД 14522464 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Асанома К., Мацуда Т., Кондо Х., Като К., Кишино Т., Ниикава Н., Уэйк Н., Като Х. (январь 2003 г.). «NECC1, кандидатный ген-супрессор хориокарциномы, который кодирует консенсусный мотив гомеодомена». Геномика . 81 (1): 15–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00011-3 . ПМИД 12573257 .
Чен Ю, Петерсен С, Пацина-Генгельбах М, Пиетас А, Петерсен I (2003). «Идентификация нового гомеобокс-содержащего гена LAGY, активность которого снижается при раке легких». Онкология . 64 (4): 450–8. дои : 10.1159/000070306 . ПМИД 12759545 . S2CID 3205741 .
Кук Х., Лепор Дж.Дж., Гитлер А.Д., Лу М.М., Винг-Мэн Юнг В., Маккей Дж., Чжоу Р., Феррари В., Грубер П., Эпштейн Дж.А. (сентябрь 2003 г.). «Сердечная гипертрофия и зависимая от гистондеацетилазы репрессия транскрипции, опосредованная атипичным гомеодоменным белком Hop» . Журнал клинических исследований . 112 (6): 863–71. дои : 10.1172/JCI19137 . ЧВК 193673 . ПМИД 12975471 .
Аду Дж., Леонг Ф.Т., Смит Н.Р., Лик Дж.П., Маркхэм А.Ф., Робинсон П.А., Майгелл А.Дж. (декабрь 2002 г.). «Экспрессия mOb1, нового атипичного белка K50-гомеодомена из 73 аминокислот, во время развития мышей» . Механизмы развития . 119. 119 (Приложение 1): С43-7. дои : 10.1016/S0925-4773(03)00090-X . ПМИД 14516659 . S2CID 11648378 .
Лемэр Ф., Миллон Р., Мюллер Д., Рабуэль Ю., Бракко Л., Абекассис Дж., Василик Б. (июль 2004 г.). «Потеря экспрессии опухолевого супрессора HOP при плоскоклеточном раке головы и шеи» . Британский журнал рака . 91 (2): 258–61. дои : 10.1038/sj.bjc.6601952 . ПМК 2409811 . ПМИД 15213722 .
Паувс Э., Сеймонс Г.Г., Яка С., Рис-Сталперс С. (июль 2004 г.). «Новый гомеобоксный ген, сверхэкспрессирующийся при раке щитовидной железы». Щитовидная железа . 14 (7): 500–5. дои : 10.1089/1050725041517020 . ПМИД 15307938 .
Торунер Г.А., Ульгер С., Алкан М., Галанте А.Т., Ринаджио Дж., Уилк Р., Тиан Б., Сотеропулос П., Хамид М.Р., Швальб М.Н., Дермоди Дж.Дж. (октябрь 2004 г.). «Связь между профилем экспрессии генов и инвазией опухоли при плоскоклеточном раке полости рта». Генетика рака и цитогенетика . 154 (1): 27–35. doi : 10.1016/j.cancergencyto.2004.01.026 . ПМИД 15381369 .
Асанома К., Като Х., Иноуэ Т., Мацуда Т., Уэйк Н. (август 2004 г.). «Анализ гена-кандидата, связанного с подавлением роста хориокарциномы и дифференцировкой трофобластов». Журнал репродуктивной медицины . 49 (8): 617–26. ПМИД 15457851 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Кук Х., Юнг В.В., Симпсон Р.Дж., Ки Х.Дж., Шин С., Лоури Дж.А., Лафлин Ф.Е., Инь З., Эпштейн Дж.А., Маккей Дж.П. (сентябрь 2006 г.). «Анализ структуры и функции корегулятора транскрипции HOP». Биохимия . 45 (35): 10584–90. дои : 10.1021/bi060641s . ПМИД 16939210 .
Ки Х.Дж., Ким-младший, Нам КИ, Пак ХИ, Шин С., Ким Дж.С., Симоно Ю., Такахаши М., Чон М.Х., Ким Н., Ким К.К., Кук Х. (март 2007 г.). «Усилитель Polycomb1, нового партнера, связывающего только гомеодомен с белком, индуцирует дифференцировку скелетных мышц» . Журнал биологической химии . 282 (10): 7700–9. дои : 10.1074/jbc.M611198200 . ПМИД 17192267 .
Америко Т.А., Кьярини Л.Б., Линден Р. (июнь 2007 г.). «Передача сигналов, индуцированная прыжком / STI-1, зависит от эндоцитоза». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 358 (2): 620–5. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.04.202 . ПМИД 17498662 .

Внешние ссылки

HOPX+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171476 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059325 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок, содержащий только гомеодомен HOP» .

[Chen-6] Jump up to: ^а ^б Чен Ф., Кук Х., Милевски Р., Гитлер А.Д., Лу ММ, Ли Дж., Назарян Р., Шнепп Р., Джен К., Бибен С., Ранке Дж., Маккей Дж.П., Новотный Дж., Шварц Р.Дж., Харви Р.П., Маллинз М.К., Эпштейн Дж.А. (сентябрь 2002 г.). «Хмель — необычный гомеобоксный ген, который модулирует развитие сердца» . Клетка . 110 (6): 713–723. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00932-7 . ПМИД 12297045 . S2CID 12189105 .

[7] Ли Д., Такеда Н., Джайн Р., Мандерфилд Л.Дж., Лю Ф., Ли Л., Андерсон С.А., Эпштейн Дж.А. (ноябрь 2015 г.). «Hopx отличает гиппокамп от нервных стволовых клеток бокового желудочка» . Исследования стволовых клеток . 15 (3): 522–529. дои : 10.1016/j.scr.2015.09.015 . ПМК 4704104 . ПМИД 26451648 .

[8] Берг Д.А., Су Ю, Хименес-Сайрус Д., Патель А., Хуанг Н., Моризет Д., Ли С., Шах Р., Рингелинг Ф.Р., Джайн Р., Эпштейн Дж.А., Ву Ч.Ф., Канзар С., Мин Г.Л., Сонг Х., Бонд А.М. ( апрель 2019). «Общее эмбриональное происхождение стволовых клеток стимулирует нейрогенез развития и взрослого человека» . Клетка . 177 (3): 654–668.e15. дои : 10.1016/j.cell.2019.02.010 . ПМК 6496946 . ПМИД 30929900 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]