Jump to content

Хромосома 4

(Перенаправлено с хромосомы 4 (человека) )
Хромосома 4
Пара хромосом 4 человека после G-бэндинга . Один от матери, другой от отца.
Хромосома 4 пара
в мужской кариограмме человека .
Функции
Длина ( б.п. ) 193 574 945 б.п.
(CHM13)
Количество генов 727 ( ССДС ) [ 1 ]
Тип Аутосома
Положение центромеры Субметацентрический [ 2 ]
(50,0 Мбит/с [ 3 ] )
Полные списки генов
CCDS Список генов
HGNC Список генов
ЮниПрот Список генов
NCBI Список генов
Внешние программы просмотра карт
Вместе Хромосома 4
Входить Хромосома 4
NCBI Хромосома 4
УКСК Хромосома 4
Полные последовательности ДНК
RefSeq NC_000004 ( ИСПРАВЛЕНО )
ГенБанк CM000666 ( ИСПРАВЛЕНО )

Хромосома 4 — одна из 23 пар хромосом у человека . Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. Хромосома 4 охватывает более 193 миллионов пар оснований (строительный материал ДНК ) и составляет от 6 до 6,5 процентов всей ДНК в клетках .

Геномика

[ редактировать ]

Длина хромосомы составляет ~193 мегабаз. В статье 2012 года на этой хромосоме было идентифицировано 775 генов, кодирующих белок. [ 4 ] В 2012 году 211 (27,9%) из этих кодирующих последовательностей не имели каких-либо экспериментальных подтверждений на уровне белков. 271 из них, по-видимому, являются мембранными белками. 54 из них были классифицированы как белки, связанные с раком.

Количество генов

[ редактировать ]

Ниже приведены некоторые оценки количества генов в хромосоме 4 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотированию генома, их прогнозы количества генов в каждой хромосоме различаются (технические подробности см. в разделе «Прогнозирование генов »). Среди различных проектов проект совместного консенсусного кодирования последовательностей ( CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих человеческие белки. [ 5 ]

По оценкам Гены, кодирующие белки Некодирующие гены РНК Псевдогены Источник Дата выпуска
CCDS 727 [ 1 ] 2016-09-08
HGNC 731 277 633 [ 6 ] 2017-05-12
Вместе 746 993 727 [ 7 ] 2017-03-29
ЮниПрот 765 [ 8 ] 2018-02-28
NCBI 769 934 819 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] 2017-05-19

Список генов

[ редактировать ]

Ниже приводится неполный список генов 4-й хромосомы человека. Полный список можно найти по ссылке в информационном окне справа.

Болезни и расстройства

[ редактировать ]

Ниже приведены некоторые заболевания, связанные с генами, расположенными на хромосоме 4:

Цитогенетическая полоса

[ редактировать ]
Идеограммы G-бэндинга хромосомы 4 человека
Идеограмма G-бэндинга хромосомы 4 человека с разрешением 850 ударов в час. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в браузерах генома (например, Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Паттерны G-диапазона 4-й хромосомы человека в трех разных разрешениях (400, [ 13 ] 550 [ 14 ] и 850 [ 3 ] ). Длина полосы на этой диаграмме основана на идеограммах ISCN (2013). [ 15 ] Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты митотического процесса . [ 16 ]
G-диапазоны хромосомы 4 человека с разрешением 850 ударов в час [ 17 ]
Хр. Рука [ 18 ] Группа [ 19 ] ISCN
начинать [ 20 ]
ISCN
останавливаться [ 20 ]
Базовая пара
начинать
Базовая пара
останавливаться
Пятно [ 21 ] Плотность
4 п 16.3 0 220 1 4500000 хороший
4 п 16.2 220 389 4,500,001 6,000,000 GPS 25
4 п 16.1 389 779 6,000,001 11,300,000 хороший
4 п 15.33 779 1066 11,300,001 15,000,000 GPS 50
4 п 15.32 1066 1286 15,000,001 17,700,000 хороший
4 п 15.31 1286 1557 17,700,001 21,300,000 GPS 75
4 п 15.2 1557 1811 21,300,001 27,700,000 хороший
4 п 15.1 1811 2166 27,700,001 35,800,000 GPS 100
4 п 14 2166 2505 35,800,001 41,200,000 хороший
4 п 13 2505 2742 41,200,001 44,600,000 GPS 50
4 п 12 2742 2877 44,600,001 48,200,000 хороший
4 п 11 2877 3046 48,200,001 50,000,000 акцент
4 д 11 3046 3249 50,000,001 51,800,000 акцент
4 д 12 3249 3571 51,800,001 58,500,000 хороший
4 д 13.1 3571 3910 58,500,001 65,500,000 GPS 100
4 д 13.2 3910 4062 65,500,001 69,400,000 хороший
4 д 13.3 4062 4333 69,400,001 75,300,000 GPS 75
4 д 21.1 4333 4502 75,300,001 78,000,000 хороший
4 д 21.21 4502 4671 78,000,001 81,500,000 GPS 50
4 д 21.22 4671 4739 81,500,001 83,200,000 хороший
4 д 21.23 4739 4874 83,200,001 86,000,000 GPS 25
4 д 21.3 4874 5145 86,000,001 87,100,000 хороший
4 д 22.1 5145 5517 87,100,001 92,800,000 GPS 75
4 д 22.2 5517 5636 92,800,001 94,200,000 хороший
4 д 22.3 5636 5890 94,200,001 97,900,000 GPS 75
4 д 23 5890 6059 97,900,001 100,100,000 хороший
4 д 24 6059 6347 100,100,001 106,700,000 GPS 50
4 д 25 6347 6685 106,700,001 113,200,000 хороший
4 д 26 6685 7040 113,200,001 119,900,000 GPS 75
4 д 27 7040 7277 119,900,001 122,800,000 хороший
4 д 28.1 7277 7565 122,800,001 127,900,000 GPS 50
4 д 28.2 7565 7734 127,900,001 130,100,000 хороший
4 д 28.3 7734 8259 130,100,001 138,500,000 GPS 100
4 д 31.1 8259 8581 138,500,001 140,600,000 хороший
4 д 31.21 8581 8733 140,600,001 145,900,000 GPS 25
4 д 31.22 8733 8851 145,900,001 147,500,000 хороший
4 д 31.23 8851 9004 147,500,001 150,200,000 GPS 25
4 д 31.3 9004 9207 150,200,001 154,600,000 хороший
4 д 32.1 9207 9545 154,600,001 160,800,000 GPS 100
4 д 32.2 9545 9681 160,800,001 163,600,000 хороший
4 д 32.3 9681 9985 163,600,001 169,200,000 GPS 100
4 д 33 9985 10087 169,200,001 171,000,000 хороший
4 д 34.1 10087 10341 171,000,001 175,400,000 GPS 75
4 д 34.2 10341 10408 175,400,001 176,600,000 хороший
4 д 34.3 10408 10628 176,600,001 182,300,000 GPS 100
4 д 35.1 10628 10967 182,300,001 186,200,000 хороший
4 д 35.2 10967 11170 186,200,001 190,214,555 GPS 25
  1. ^ Перейти обратно: а б «Результаты поиска — 4[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («имеет ccds»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . CCDS Release 20 для Homo Sapiens . 08.09.2016 . Проверено 28 мая 2017 г.
  2. ^ Том Страчан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека . Гирляндная наука. п. 45. ИСБН  978-1-136-84407-2 .
  3. ^ Перейти обратно: а б Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (850 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 3 июня 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
  4. ^ Чен LC, Лю М.Ю., Сяо Ю.К., Чунг В.К., Ву HY, Сюй В.Л., Ляо ПК, Сун Т.Ю., Цай С.Ф., Ю Дж.С., Чен Ю.Дж. (2012) Расшифровка белков, связанных с заболеванием, закодированных в хромосоме 4 человека. J Протеом Рес
  5. ^ Пертеа М., Зальцберг С.Л. (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества генов человека» . Геном Биол . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . ПМК   2898077 . ПМИД   20441615 .
  6. ^ «Статистика и загрузки для хромосомы 4» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . 12 мая 2017 г. Архивировано из оригинала 29 июня 2017 г. Проверено 19 мая 2017 г.
  7. ^ «Хромосома 4: Сводка хромосом — Homo sapiens» . Ансамбль Выпуск 88 . 2017-03-29 . Проверено 19 мая 2017 г.
  8. ^ «Человеческая хромосома 4: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM» . ЮниПрот . 28 февраля 2018 г. Проверено 16 марта 2018 г.
  9. ^ «Результаты поиска — 4[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («кодирующий белок генотипа»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
  10. ^ "Результаты поиска - 4[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ( ("genetype miscrna"[Свойства] OR "генотип ncrna"[Свойства] OR "генотип rrna"[Свойства] OR "генотип trna"[Свойства] ИЛИ "генотип scrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства]) НЕ "генотип, кодирующий белок"[Свойства] И живой[prop]) - Ген" . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
  11. ^ "Результаты поиска - 4[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("псевдогенный тип"[Свойства] И живой[prop]) - Ген" . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
  12. ^ Леммерс Р.Дж., ван дер Влит П.Дж., Клоостер Р., Саккони С., Каманьо П., Дауверсе Дж.Г., Снайдер Л., Страашейм К.Р., ван Оммен Г.Дж., Падберг Г.В., Миллер Д.Г., Тапскотт С.Дж., Тавил Р., Франц Р.Р., ван дер Маарель С.М. ( сентябрь 2010 г.). «Объединяющая генетическая модель лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии» . Наука . 329 (5999): 1650–3. Бибкод : 2010Sci...329.1650L . дои : 10.1126/science.1189044 . ПМЦ   4677822 . ПМИД   20724583 .
  13. ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (400 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 4 марта 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
  14. ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (550 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 11 августа 2015 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
  15. ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013 г.). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013) . Каргерское медицинское и научное издательство. ISBN  978-3-318-02253-7 .
  16. ^ Сетакулвичай, В.; Манитпорнсут, С.; Вибунрат, М.; Лилакиацакун, В.; Ассавамакин, А.; Тонгсима, С. (2012). «Оценка разрешения на уровне полос изображений хромосом человека» . 2012 Девятая Международная конференция по информатике и программной инженерии (JCSSE) . стр. 276–282. дои : 10.1109/JCSSE.2012.6261965 . ISBN  978-1-4673-1921-8 . S2CID   16666470 .
  17. ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (850 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 3 июня 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
  18. ^ " p ": Короткая рука; « q »: Длинная рука.
  19. ^ Номенклатуру цитогенетических полос см. в статье locus .
  20. ^ Перейти обратно: а б Эти значения (начало/конец ISCN) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN «Международная система цитогенетической номенклатуры человека» (2013). Произвольная единица .
  21. ^ gpos : область, положительно окрашенная G-полосами , обычно богатая АТ и бедная генами; gneg : область, отрицательно окрашенная G-полосами, обычно богатая CG и богатая генами; acen Центромера . var : переменная область; стебель : Стебель.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
  • Голдфранк Д., Шёнбергер Э., Гилберт Ф. (2003). «Гены и хромосомы болезней: карты болезней генома человека. Хромосома 4». Генетический тест . 7 (4): 351–72. дои : 10.1089/109065703322783752 . ПМИД   15000816 .
[ редактировать ]
  • Национальные институты здравоохранения. «Хромосома 4» . Домашний справочник по генетике . Архивировано из оригинала 3 августа 2004 года . Проверено 6 мая 2017 г.
  • «Хромосома 4» . Информационный архив проекта «Геном человека», 1990–2003 гг . Проверено 6 мая 2017 г.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 11bcfed611f3c3a5c4d971b562e73373__1717671180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/11/73/11bcfed611f3c3a5c4d971b562e73373.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Chromosome 4 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)