CXCL10

CXCL10
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1O80, 1LV9, 1O7Y, 1O7Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CXCL10 , C7, IFI10, INP10, IP-10, SCYB10, crg-2, gIP-10, mob-1, хемокин-лиганд 10 с мотивом CXC, хемокин 10 с мотивом CXC
Внешние идентификаторы	Опустить : 147310 ; МГИ : 1352450 ; Гомологен : 1203 ; Генные карты : CXCL10 ; OMA : CXCL10 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	76,023,497 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	92,496,748 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	appendix; ; testicle; ; decidua; ; lymph node; ; rectum; ; monocyte; ; granulocyte; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; smooth muscle tissue; ; epithelium of nasopharynx;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; thymus; ; spleen; ; spermatocyte; ; optic nerve; ; embryo; ; right kidney; ; subcutaneous adipose tissue; ; embryo; ; granulocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cytokine activity; heparin binding; CXCR3 chemokine receptor binding; chemokine activity; protein binding; cAMP-dependent protein kinase regulator activity; signaling receptor binding; chemoattractant activity;
Cellular component	extracellular region; external side of plasma membrane; extracellular space; intracellular anatomical structure;
Biological process	regulation of endothelial tube morphogenesis; negative regulation of myoblast differentiation; cellular response to heat; response to vitamin D; positive regulation of cell migration; T cell chemotaxis; chemokine-mediated signaling pathway; cell-cell signaling; response to virus; muscle organ development; positive regulation of monocyte chemotaxis; positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; endothelial cell activation; positive regulation of cAMP-mediated signaling; regulation of T cell chemotaxis; blood circulation; chemotaxis; positive regulation of leukocyte chemotaxis; cell surface receptor signaling pathway; response to lipopolysaccharide; negative regulation of myoblast fusion; defense response to virus; regulation of cell population proliferation; immune response; positive regulation of cell population proliferation; response to auditory stimulus; negative regulation of angiogenesis; response to cold; cellular response to lipopolysaccharide; response to gamma radiation; positive regulation of T cell migration; signal transduction; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of protein kinase activity; defense response; inflammatory response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; regulation of signaling receptor activity; G protein-coupled receptor signaling pathway; cytokine-mediated signaling pathway; adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; response to bacterium; neutrophil chemotaxis; leukocyte chemotaxis; positive chemotaxis; regulation of apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3627
	15945
	ENSG00000169245
	ENSMUSG00000034855
	P02778
	P17515
	НМ_001565
	НМ_021274
	НП_001556
	НП_067249
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Хемокин-лиганд 10 мотива CXC (CXCL10), также известный как белок 10, индуцируемый гамма-интерфероном (IP-10), или малоиндуцируемый цитокин B10, 8,7 кДа представляет собой белок массой , который у людей кодируется CXCL10 геном . ^[5]^[6] Хемокин 10 мотива CXC представляет собой небольшой цитокин, принадлежащий семейству хемокинов CXC .

Ген

Ген CXCL10 расположен на хромосоме 4 человека. ^[7] в кластере среди нескольких других хемокинов СХС. ^[8]

Функция

CXCL10 секретируется несколькими типами клеток в ответ на IFN-γ . Эти типы клеток включают моноциты , эндотелиальные клетки и фибробласты . ^[5] CXCL10 приписывают несколько ролей, таких как хемоаттракция моноцитов / макрофагов , Т-клеток , NK-клеток и дендритных клеток , стимулирование Т-клеток адгезии к эндотелиальным клеткам , противоопухолевая активность и ингибирование костного мозга образования колоний и ангиогенеза . ^[9]^[10]

на клеточной поверхности Этот хемокин оказывает свое действие путем связывания с хемокиновым рецептором CXCR3 . ^[11]

Структура

Трехмерная кристаллическая структура этого хемокина была определена в трех различных условиях с разрешением до 1,92 Å. ^[12] Коды доступа Protein Data Bank для структур CXCL10: 1lv9 , 1o7y и 1o80 .

Биомаркеры

CXCL9, CXCL10 и CXCL11 оказались действительными биомаркерами развития сердечной недостаточности и дисфункции левого желудочка, что указывает на подчеркивающую патофизиологическую связь между уровнями этих хемокинов и развитием неблагоприятного ремоделирования сердца. ^[13]^[14]

Клиническое значение

Исходные уровни CXCL10 в плазме перед лечением повышены у пациентов, хронически инфицированных вирусом гепатита С (ВГС) генотипов 1 или 4, у которых не достигается устойчивый вирусный ответ (УВО) после завершения противовирусной терапии. ^[15]^[16] CXCL10 в плазме отражается внутрипеченочной мРНК CXCL10, и обе они поразительно предсказывают первые дни элиминации РНК ВГС («первая фаза снижения») во время терапии интерфероном/рибавирином для всех генотипов ВГС. ^[17] Это также применимо к пациентам, коинфицированным ВИЧ, у которых уровни IP-10 до начала лечения ниже 150 пг/мл являются предикторами благоприятного ответа и, таким образом, могут быть полезны для поощрения этих пациентов, которых иначе трудно лечить, к началу терапии. ^[18] Патоген Leishmania major использует протеазу GP63, которая расщепляет CXCL10, вовлекая CXCL10 в механизмы защиты хозяина от некоторых внутриклеточных патогенов, таких как Leishmania . ^[19]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169245 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034855 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Ластер А.Д., Ункелесс Дж.К., Равеч Дж.В. (1985). «Гамма-интерферон транскрипционно регулирует ген раннего ответа, имеющий гомологию с белками тромбоцитов». Природа . 315 (6021): 672–6. Бибкод : 1985Natur.315..672L . дои : 10.1038/315672a0 . ПМИД 3925348 . S2CID 4358066 .
^ Ластер А.Д., Джанвар С.С., Чаганти Р.С., Керси Дж.Х., Равеч Дж.В. (май 1987 г.). «Ген, индуцируемый интерфероном, отображается на хромосомной полосе, связанной с транслокацией (4;11) в клетках острого лейкоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (9): 2868–71. Бибкод : 1987PNAS...84.2868L . дои : 10.1073/pnas.84.9.2868 . ПМК 304761 . ПМИД 2437586 .
^ «CXCL10 CXC-мотив хемокинового лиганда 10 [Homo sapiens (Человек)] - Ген - NCBI» .
^ О'Донован Н., Гэлвин М., Морган Дж.Г. (1999). «Физическое картирование локуса хемокинов CXC на хромосоме 4 человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (1–2): 39–42. дои : 10.1159/000015209 . ПМИД 10343098 . S2CID 8087808 .
^ Дюфур Дж.Х., Дзейман М., Лю М.Т., Люнг Дж.Х., Лейн Т.Э., Ластер А.Д. (апрель 2002 г.). «Мыши с дефицитом IFN-гамма-индуцируемого белка 10 (IP-10; CXCL10) обнаруживают роль IP-10 в генерации и транспортировке эффекторных Т-клеток» . Журнал иммунологии . 168 (7): 3195–204. дои : 10.4049/jimmunol.168.7.3195 . ПМИД 11907072 .
^ Анджиолилло А.Л., Сгадари С., Тауб Д.Д., Ляо Ф., Фарбер Дж.М., Махешвари С. и др. (июль 1995 г.). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок 10 является мощным ингибитором ангиогенеза in vivo» . Журнал экспериментальной медицины . 182 (1): 155–62. дои : 10.1084/jem.182.1.155 . ПМК 2192108 . ПМИД 7540647 .
^ Бут В., Кейзер Д.В., Камфуис М.Б., Кларк-Льюис И., Сайкс Б.Д. (август 2002 г.). «Хемокин, связывающий CXCR3 IP-10/CXCL10: структура и взаимодействие с рецепторами». Биохимия . 41 (33): 10418–25. дои : 10.1021/bi026020q . ПМИД 12173928 .
^ Сваминатан Г.Дж., Холлоуэй Д.Е., Колвин Р.А., Кампанелла Г.К., Папагеоргиу А.С., Ластер А.Д., Ачарья К.Р. (май 2003 г.). «Кристаллические структуры олигомерных форм хемокина IP-10/CXCL10» . Структура . 11 (5): 521–32. дои : 10.1016/S0969-2126(03)00070-4 . ПМИД 12737818 .
^ Альтара Р., Гу Ю.М., Стрейкер-Будье Х.А., Тийс Л., Стаессен Дж.А., Бланкестейн В.М. (2015). «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 при гипертонии: от экспериментов на животных к пилотному популяционному исследованию» . ПЛОС ОДИН . 10 (10): e0141394. Бибкод : 2015PLoSO..1041394A . дои : 10.1371/journal.pone.0141394 . ПМЦ 4624781 . ПМИД 26506526 .
^ Альтара Р., Манка М., Хессель М.Х., Гу Ю., ван Варк Л.К., Аккерхейс К.М. и др. (август 2016 г.). «CXCL10 является циркулирующим воспалительным маркером у пациентов с прогрессирующей сердечной недостаточностью: пилотное исследование» . Журнал сердечно-сосудистых трансляционных исследований . 9 (4): 302–14. дои : 10.1007/s12265-016-9703-3 . ПМИД 27271043 . S2CID 41188765 .
^ Ромеро А.И., Лаггинг М., Вестин Дж., Диллон А.П., Дастин Л.Б., Павлоцкий Дж.М. и др. (октябрь 2006 г.). «Интерферон (ИФН)-гамма-индуцируемый белок-10: связь с гистологическими результатами, вирусной кинетикой и исходом лечения пегилированным ИФН-альфа 2а и рибавирином при хронической инфекции, вызванной вирусом гепатита С» . Журнал инфекционных болезней . 194 (7): 895–903. дои : 10.1086/507307 . ПМИД 16960776 .
^ Лаггинг М., Ромеро А.И., Вестин Дж., Норкранс Г., Диллон А.П., Павлоцкий Дж.М. и др. (декабрь 2006 г.). «IP-10 предсказывает вирусный ответ и терапевтический результат у трудно поддающихся лечению пациентов с инфекцией ВГС генотипа 1» . Гепатология . 44 (6): 1617–25. дои : 10.1002/hep.21407 . ПМИД 17133471 . S2CID 27733803 .
^ Аскари Г., Алсио А., Пуньяле П., Негро Ф., Феррари С., Нейманн А.У. и др. (май 2010 г.). «Системный и внутрипеченочный белок 10 кДа, индуцируемый гамма-интерфероном, предсказывает снижение первой фазы РНК вируса гепатита С и общий вирусный ответ на терапию при хроническом гепатите С» . Гепатология . 51 (5): 1523–30. дои : 10.1002/hep.23509 . ПМИД 20186843 . S2CID 205873437 .
^ Фальконер К., Аскари Г., Вейс Н., Хеллстранд К., Алеус А., Лаггинг М. (декабрь 2010 г.). «IP-10 предсказывает первую фазу снижения уровня РНК ВГС и общий вирусный ответ на терапию у пациентов, одновременно инфицированных хроническим вирусом гепатита С и ВИЧ». Скандинавский журнал инфекционных заболеваний . 42 (11–12): 896–901. дои : 10.3109/00365548.2010.498019 . ПМИД 20608766 . S2CID 28542340 .
^ Антония А.Л., Гиббс К.Д., Трэхейр Э.Д., Питтман К.Дж., Мартин А.Т., Шотт Б.Х. и др. (2019). «Уклонение патогенов от хемокинового ответа посредством подавления CXCL10» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 9 : 280. дои : 10.3389/fcimb.2019.00280 . ПМК 6693555 . ПМИД 31440475 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома C7 и страница сведений о гене C7 в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома CXCL10 и CXCL10 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P02778 (хемокин 10 мотива CXC) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Фарбер Дж. М. (март 1997 г.). «Mig и IP-10: хемокины CXC, нацеленные на лимфоциты» . Журнал биологии лейкоцитов . 61 (3): 246–57. дои : 10.1002/jlb.61.3.246 . ПМИД 9060447 . S2CID 14935171 .
Невилл Л.Ф., Матиак Дж., Багасра О. (сентябрь 1997 г.). «Иммунобиология индуцируемого гамма-интерфероном белка 10 кДа (IP-10): новый плейотропный член суперсемейства хемокинов CXC». Обзоры цитокинов и факторов роста . 8 (3): 207–19. дои : 10.1016/S1359-6101(97)00015-4 . ПМИД 9462486 .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169245 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034855 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3925348-5] Jump up to: ^а ^б Ластер А.Д., Ункелесс Дж.К., Равеч Дж.В. (1985). «Гамма-интерферон транскрипционно регулирует ген раннего ответа, имеющий гомологию с белками тромбоцитов». Природа . 315 (6021): 672–6. Бибкод : 1985Natur.315..672L . дои : 10.1038/315672a0 . ПМИД 3925348 . S2CID 4358066 .

[pmid2437586-6] Ластер А.Д., Джанвар С.С., Чаганти Р.С., Керси Дж.Х., Равеч Дж.В. (май 1987 г.). «Ген, индуцируемый интерфероном, отображается на хромосомной полосе, связанной с транслокацией (4;11) в клетках острого лейкоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (9): 2868–71. Бибкод : 1987PNAS...84.2868L . дои : 10.1073/pnas.84.9.2868 . ПМК 304761 . ПМИД 2437586 .

[7] «CXCL10 CXC-мотив хемокинового лиганда 10 [Homo sapiens (Человек)] - Ген - NCBI» .

[pmid10343098-8] О'Донован Н., Гэлвин М., Морган Дж.Г. (1999). «Физическое картирование локуса хемокинов CXC на хромосоме 4 человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (1–2): 39–42. дои : 10.1159/000015209 . ПМИД 10343098 . S2CID 8087808 .

[pmid11907072-9] Дюфур Дж.Х., Дзейман М., Лю М.Т., Люнг Дж.Х., Лейн Т.Э., Ластер А.Д. (апрель 2002 г.). «Мыши с дефицитом IFN-гамма-индуцируемого белка 10 (IP-10; CXCL10) обнаруживают роль IP-10 в генерации и транспортировке эффекторных Т-клеток» . Журнал иммунологии . 168 (7): 3195–204. дои : 10.4049/jimmunol.168.7.3195 . ПМИД 11907072 .

[pmid7540647-10] Анджиолилло А.Л., Сгадари С., Тауб Д.Д., Ляо Ф., Фарбер Дж.М., Махешвари С. и др. (июль 1995 г.). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок 10 является мощным ингибитором ангиогенеза in vivo» . Журнал экспериментальной медицины . 182 (1): 155–62. дои : 10.1084/jem.182.1.155 . ПМК 2192108 . ПМИД 7540647 .

[pmid12173928-11] Бут В., Кейзер Д.В., Камфуис М.Б., Кларк-Льюис И., Сайкс Б.Д. (август 2002 г.). «Хемокин, связывающий CXCR3 IP-10/CXCL10: структура и взаимодействие с рецепторами». Биохимия . 41 (33): 10418–25. дои : 10.1021/bi026020q . ПМИД 12173928 .

[pmid12737818-12] Сваминатан Г.Дж., Холлоуэй Д.Е., Колвин Р.А., Кампанелла Г.К., Папагеоргиу А.С., Ластер А.Д., Ачарья К.Р. (май 2003 г.). «Кристаллические структуры олигомерных форм хемокина IP-10/CXCL10» . Структура . 11 (5): 521–32. дои : 10.1016/S0969-2126(03)00070-4 . ПМИД 12737818 .

[13] Альтара Р., Гу Ю.М., Стрейкер-Будье Х.А., Тийс Л., Стаессен Дж.А., Бланкестейн В.М. (2015). «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 при гипертонии: от экспериментов на животных к пилотному популяционному исследованию» . ПЛОС ОДИН . 10 (10): e0141394. Бибкод : 2015PLoSO..1041394A . дои : 10.1371/journal.pone.0141394 . ПМЦ 4624781 . ПМИД 26506526 .

[14] Альтара Р., Манка М., Хессель М.Х., Гу Ю., ван Варк Л.К., Аккерхейс К.М. и др. (август 2016 г.). «CXCL10 является циркулирующим воспалительным маркером у пациентов с прогрессирующей сердечной недостаточностью: пилотное исследование» . Журнал сердечно-сосудистых трансляционных исследований . 9 (4): 302–14. дои : 10.1007/s12265-016-9703-3 . ПМИД 27271043 . S2CID 41188765 .

[pmid16960776-15] Ромеро А.И., Лаггинг М., Вестин Дж., Диллон А.П., Дастин Л.Б., Павлоцкий Дж.М. и др. (октябрь 2006 г.). «Интерферон (ИФН)-гамма-индуцируемый белок-10: связь с гистологическими результатами, вирусной кинетикой и исходом лечения пегилированным ИФН-альфа 2а и рибавирином при хронической инфекции, вызванной вирусом гепатита С» . Журнал инфекционных болезней . 194 (7): 895–903. дои : 10.1086/507307 . ПМИД 16960776 .

[pmid17133471-16] Лаггинг М., Ромеро А.И., Вестин Дж., Норкранс Г., Диллон А.П., Павлоцкий Дж.М. и др. (декабрь 2006 г.). «IP-10 предсказывает вирусный ответ и терапевтический результат у трудно поддающихся лечению пациентов с инфекцией ВГС генотипа 1» . Гепатология . 44 (6): 1617–25. дои : 10.1002/hep.21407 . ПМИД 17133471 . S2CID 27733803 .

[pmid20186843-17] Аскари Г., Алсио А., Пуньяле П., Негро Ф., Феррари С., Нейманн А.У. и др. (май 2010 г.). «Системный и внутрипеченочный белок 10 кДа, индуцируемый гамма-интерфероном, предсказывает снижение первой фазы РНК вируса гепатита С и общий вирусный ответ на терапию при хроническом гепатите С» . Гепатология . 51 (5): 1523–30. дои : 10.1002/hep.23509 . ПМИД 20186843 . S2CID 205873437 .

[pmid20608766-18] Фальконер К., Аскари Г., Вейс Н., Хеллстранд К., Алеус А., Лаггинг М. (декабрь 2010 г.). «IP-10 предсказывает первую фазу снижения уровня РНК ВГС и общий вирусный ответ на терапию у пациентов, одновременно инфицированных хроническим вирусом гепатита С и ВИЧ». Скандинавский журнал инфекционных заболеваний . 42 (11–12): 896–901. дои : 10.3109/00365548.2010.498019 . ПМИД 20608766 . S2CID 28542340 .

[19] Антония А.Л., Гиббс К.Д., Трэхейр Э.Д., Питтман К.Дж., Мартин А.Т., Шотт Б.Х. и др. (2019). «Уклонение патогенов от хемокинового ответа посредством подавления CXCL10» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 9 : 280. дои : 10.3389/fcimb.2019.00280 . ПМК 6693555 . ПМИД 31440475 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]