Лимфотоксин бета

ЛТБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4MXW
Идентификаторы
Псевдонимы	LTB , TNFC, TNFSF3, p33, лимфотоксин бета, TNLG1C
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600978 ; МГИ : 104796 ; Гомологен : 1752 ; GeneCards : LTB ; ОМА : LTB – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	31,582,522 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	35,415,296 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; spleen; ; lymph node; ; blood; ; appendix; ; mucosa of transverse colon; ; monocyte; ; testicle; ; bone marrow; ; bone marrow cells;
	Top expressed in
	spleen; ; granulocyte; ; thymus; ; bone marrow; ; white pulp; ; embryo; ; jejunum; ; colon; ; ileum; ; embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	tumor necrosis factor receptor binding; cytokine activity; signaling receptor binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; membrane; extracellular space; cellular component;
Biological process	cell-cell signaling; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; lymph node development; gene expression; immune response; signal transduction; skin development; regulation of signaling receptor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4050
	16994
showENSG00000223448 ; ENSG00000238114 ; ENSG00000236925 ; ENSG00000231314 ; ENSG00000204487 ;
	ENSG00000236237; ENSG00000227507; ENSG00000206437
	ENSMUSG00000024399
	Q06643
	P41155
	НМ_009588 ; НМ_002341
	НМ_008518
	НП_002332 ; НП_033666
	НП_032544
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лимфотоксин-бета (LT-бета), также известный как фактор некроза опухоли C (TNF-C), представляет собой белок , который у человека кодируется LTB геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Лимфотоксин бета представляет собой мембранный белок типа II семейства TNF . Он закрепляет лимфотоксин-альфа на поверхности клетки посредством образования гетеротримера. Преобладающей формой на поверхности лимфоцитов является комплекс лимфотоксин-альфа 1/бета 2 (например, 1 молекула альфа/2 молекулы бета), и этот комплекс является первичным лигандом для рецептора лимфотоксина-бета. Минорный комплекс представляет собой лимфотоксин-альфа 2/бета 1. LTB является индуктором системы воспалительного ответа и участвует в нормальном развитии лимфоидной ткани. Изоформа b лимфотоксина-бета не способна образовывать комплекс с лимфотоксином-альфа, что позволяет предположить, что функция лимфотоксина-бета не зависит от лимфотоксина-альфа. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^[7]

Про-опухолевая функция мембранного LT четко установлена: у мышей со сверхэкспрессией LTα или LTβ наблюдался повышенный рост опухоли и метастазирование в нескольких моделях рака. Однако в этих исследованиях использовались мыши с полной недостаточностью гена LTα, что не позволяло различить эффекты растворимого и мембраносвязанного LT. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что LTB взаимодействует с лимфотоксином альфа . ^[9]^[10]^[11]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 GRCh38: Версия ансамбля 89: 0000223448, ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 – ансамбль , май 2017 год
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024399 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Браунинг Дж.Л., Нгам-ек А., Лоутон П., ДеМаринис Дж., Тизард Р., Чоу Э.П., Хессион С., О'Брин-Греко Б., Фоли С.Ф., Уэр К.Ф. (март 1993 г.). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Клетка . 72 (6): 847–56. дои : 10.1016/0092-8674(93)90574-А . ПМИД 7916655 . S2CID 28961163 .
^ Браунинг Дж.Л., Андролевич М.Дж., Ware CF (август 1991 г.). «Лимфотоксин и связанный с ним гликопротеин массой 33 кДа экспрессируются на поверхности активированной гибридомы Т-клеток человека» . Журнал иммунологии . 147 (4): 1230–7. дои : 10.4049/jimmunol.147.4.1230 . ПМИД 1714477 . S2CID 6160376 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бета-лимфотоксин LTB (суперсемейство TNF, член 3)» .
^ Корнеев К.В.; Атретханы, КН; Друцкая, М.С.; Гривенников С.И.; Купраш, Д.В.; Недоспасов С.А. (январь 2017 г.). «Передача сигналов TLR и провоспалительные цитокины как движущие силы онкогенеза». Цитокин . 89 : 127–135. дои : 10.1016/j.cyto.2016.01.021 . ПМИД 26854213 .
^ Уильямс-Эбботт Л., Уолтер Б.Н., Чунг Т.С., Гох С.Р., Портер А.Г., Ware CF (август 1997 г.). «Субъединица лимфотоксина-альфа (LTalpha) необходима для сборки, но не для специфичности рецептора, заякоренного в мембране гетеротримерного лиганда LTalpha1beta2» . Журнал биологической химии . 272 (31): 19451–6. дои : 10.1074/jbc.272.31.19451 . ПМИД 9235946 .
^ Браунинг Дж.Л., Сайзинг И.Д., Лоутон П., Бурдон П.Р., Реннерт П.Д., Мажо Г.Р., Амброуз К.М., Хессион С., Миатковски К., Гриффитс Д.А., Нгам-ек А., Мейер В., Бенджамин К.Д., Хохман П.С. (октябрь 1997 г.). «Характеристика комплексов лимфотоксин-альфа-бета на поверхности лимфоцитов мыши» . Журнал иммунологии . 159 (7): 3288–98. дои : 10.4049/jimmunol.159.7.3288 . ПМИД 9317127 . S2CID 25608697 .
^ Браунинг Дж.Л., Дугас И., Нгам-ек А., Бурдон П.Р., Эренфельс Б.Н., Миатковски К., Зафари М., Ямпалья А.М., Лоутон П., Мейер В. (январь 1995 г.). «Характеристика поверхностных форм лимфотоксина. Использование специфических моноклональных антител и растворимых рецепторов» . Журнал иммунологии . 154 (1): 33–46. дои : 10.4049/jimmunol.154.1.33 . ПМИД 7995952 . S2CID 22313274 .

Дальнейшее чтение

Мессер Г., Шпенглер У., Юнг М.К., Хонольд Г., Блёмер К., Папе Г.Р., Ритмюллер Г., Вайс Э.Х. (январь 1991 г.). «Полиморфная структура локуса фактора некроза опухоли (TNF): полиморфизм NcoI в первом интроне человеческого гена TNF-бета коррелирует с вариантом аминокислоты в положении 26 и сниженным уровнем продукции TNF-бета» . Журнал экспериментальной медицины . 173 (1): 209–19. дои : 10.1084/jem.173.1.209 . ПМК 2118757 . ПМИД 1670638 .
Авраам Л.Дж., Ду Д.К., Захеди К., Докинз Р.Л., Уайтхед А.С. (1991). «Гаплотипические полиморфизмы гена TNFB». Иммуногенетика . 33 (1): 50–3. дои : 10.1007/BF00211695 . ПМИД 1671667 . S2CID 38756894 .
Недвин Дж.Э., Нейлор С.Л., Сакагути А.Ю., Смит Д., Джарретт-Недвин Дж., Пенника Д., Гёддел Д.В., Грей П.В. (сентябрь 1985 г.). «Гены лимфотоксина человека и фактора некроза опухолей: структура, гомология и хромосомная локализация» . Исследования нуклеиновых кислот . 13 (17): 6361–73. дои : 10.1093/нар/13.17.6361 . ПМК 321958 . ПМИД 2995927 .
Хольцингер И., де Бэй А., Мессер Г., Кик Г., Зверзина Х., Вайс Э.Х. (1995). «Клонирование и геномная характеристика LST1: новый ген в области TNF человека». Иммуногенетика . 42 (5): 315–22. дои : 10.1007/BF00179392 . ПМИД 7590964 . S2CID 19916860 .
Пилман Л.Дж., Шардон П., Нуньес М., Ренард С., Джеффротин С., Вайман М., Ван Зеверен А., Коппитерс В., ван де Веге А., Буке Y (март 1995 г.). «Ген BAT1 в MHC кодирует эволюционно консервативную предполагаемую ядерную РНК-хеликазу семейства DEAD». Геномика . 26 (2): 210–8. дои : 10.1016/0888-7543(95)80203-X . ПМИД 7601445 .
Браунинг Дж.Л., Дугас И., Нгам-ек А., Бурдон П.Р., Эренфельс Б.Н., Миатковски К., Зафари М., Ямпалья А.М., Лоутон П., Мейер В. (январь 1995 г.). «Характеристика поверхностных форм лимфотоксина. Использование специфических моноклональных антител и растворимых рецепторов» . Журнал иммунологии . 154 (1): 33–46. дои : 10.4049/jimmunol.154.1.33 . ПМИД 7995952 . S2CID 22313274 .
Альбертелла М.Р., Кэмпбелл Р.Д. (май 1994 г.). «Характеристика нового гена в главном комплексе гистосовместимости человека, который кодирует потенциального нового члена семейства белков I каппа B». Молекулярная генетика человека . 3 (5): 793–9. дои : 10.1093/hmg/3.5.793 . ПМИД 8081366 .
Ирис Ф.Дж., Бугелере Л., Приер С., Катерина Д., Примас Дж., Перро В., Юрка Дж., Родригес-Томе П., Клавери Ж.М., Дауссе Дж. (февраль 1993 г.). «Плотная кластеризация Alu и потенциальный новый член семейства NF каппа B в сегменте HLA класса III длиной 90 тысяч оснований». Природная генетика . 3 (2): 137–45. дои : 10.1038/ng0293-137 . ПМИД 8499947 . S2CID 33041319 .
Накамура Т., Таширо К., Назареа М., Накано Т., Сасаяма С., Хондзё Т. (ноябрь 1995 г.). «КДНК мышиного рецептора бета-лимфотоксина: выделение с помощью ловушки сигнальной последовательности и хромосомное картирование». Геномика . 30 (2): 312–9. дои : 10.1006/geno.1995.9872 . HDL : 2433/202166 . PMID 8586432 .
Утанс Ю, Квист В.К., Макманус Б.М., Уилсон Дж.Э., Арсечи Р.Дж., Уоллес А.Ф., Рассел М.Э. (май 1996 г.). «Аллотрансплантатная воспалительная фабрика-1. Цитокин-чувствительная молекула макрофага, экспрессируемая в трансплантированных человеческих сердцах» . Трансплантация . 61 (9): 1387–92. дои : 10.1097/00007890-199605150-00018 . ПМИД 8629302 .
Налаболу С.Р., Шукла Х., Наллур Дж., Паримоо С., Вайсман С.М. (январь 1996 г.). «Гены в области размером 220 т.п.н., охватывающей кластер TNF в MHC человека» . Геномика . 31 (2): 215–22. дои : 10.1006/geno.1996.0034 . ПМИД 8824804 .
Лахам Н., Ван Данне Ф., Абрахам Л.Дж., Фарруджа В., Бендцен К., Бреннеке С.П., Райс Дж.Е. (апрель 1997 г.). «Фактор некроза опухоли-бета при беременности и родах у человека». Журнал репродуктивной иммунологии . 33 (1): 53–69. дои : 10.1016/S0165-0378(97)01012-7 . ПМИД 9185077 .
Варзоча К., Ренар Н., Шарло С., Бьенвеню Дж., Койффье Б., Саллес Дж. (сентябрь 1997 г.). «Идентификация двух бета-изоформ лимфотоксина, экспрессируемых в линиях лимфоидных клеток человека и неходжкинских лимфомах». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 238 (2): 273–6. дои : 10.1006/bbrc.1997.7277 . ПМИД 9299492 .
Браунинг Дж.Л., Сайзинг И.Д., Лоутон П., Бурдон П.Р., Реннерт П.Д., Мажо Г.Р., Амброуз К.М., Хессион С., Миатковски К., Гриффитс Д.А., Нгам-ек А., Мейер В., Бенджамин К.Д., Хохман П.С. (октябрь 1997 г.). «Характеристика комплексов лимфотоксин-альфа-бета на поверхности лимфоцитов мыши» . Журнал иммунологии . 159 (7): 3288–98. дои : 10.4049/jimmunol.159.7.3288 . ПМИД 9317127 . S2CID 25608697 .
де Бэй А., Феллерхофф Б., Майер С., Мартиноцци С., Вейдл Ю., Вайс Э.Х. (ноябрь 1997 г.). «Сложная картина экспрессии гена LST1 региона TNF посредством дифференциальной регуляции, инициации и альтернативного сплайсинга». Геномика . 45 (3): 591–600. дои : 10.1006/geno.1997.4963 . ПМИД 9367684 .
Шиина Т, Тамия Г, Ока А, Ямагата Т, Ямагата Н, Киккава Е, Гото К, Мизуки Н, Ватанабе К, Фукузуми Ю, Тагучи С, Сугавара С, Оно А, Чен Л, Ямазаки М, Таширо Х, Андо А , Икемура Т., Кимура М., Иноко Х. (февраль 1998 г.). «Анализ нуклеотидного секвенирования сегмента длиной 146 килобаз вокруг генов IkBL и MICA на центромерном конце области HLA класса I». Геномика . 47 (3): 372–82. дои : 10.1006/geno.1997.5114 . ПМИД 9480751 .
Бодор Дж., Хабенер Дж. Ф. (апрель 1998 г.). «Роль репрессора транскрипции ICER в опосредованном циклическим АМФ ослаблении экспрессии генов цитокинов в тимоцитах человека» . Журнал биологической химии . 273 (16): 9544–51. дои : 10.1074/jbc.273.16.9544 . ПМИД 9545284 .
Невилл М.Дж., Кэмпбелл Р.Д. (апрель 1999 г.). «Новый член суперсемейства Ig и субъединица V-АТФазы G входят в число предсказанных продуктов новых генов, близких к локусу TNF в MHC человека» . Журнал иммунологии . 162 (8): 4745–54. дои : 10.4049/jimmunol.162.8.4745 . ПМИД 10202016 . S2CID 46517924 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 GRCh38: Версия ансамбля 89: 0000223448, ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 – ансамбль , май 2017 год

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024399 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7916655-5] Браунинг Дж.Л., Нгам-ек А., Лоутон П., ДеМаринис Дж., Тизард Р., Чоу Э.П., Хессион С., О'Брин-Греко Б., Фоли С.Ф., Уэр К.Ф. (март 1993 г.). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Клетка . 72 (6): 847–56. дои : 10.1016/0092-8674(93)90574-А . ПМИД 7916655 . S2CID 28961163 .

[pmid1714477-6] Браунинг Дж.Л., Андролевич М.Дж., Ware CF (август 1991 г.). «Лимфотоксин и связанный с ним гликопротеин массой 33 кДа экспрессируются на поверхности активированной гибридомы Т-клеток человека» . Журнал иммунологии . 147 (4): 1230–7. дои : 10.4049/jimmunol.147.4.1230 . ПМИД 1714477 . S2CID 6160376 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бета-лимфотоксин LTB (суперсемейство TNF, член 3)» .

[8] Корнеев К.В.; Атретханы, КН; Друцкая, М.С.; Гривенников С.И.; Купраш, Д.В.; Недоспасов С.А. (январь 2017 г.). «Передача сигналов TLR и провоспалительные цитокины как движущие силы онкогенеза». Цитокин . 89 : 127–135. дои : 10.1016/j.cyto.2016.01.021 . ПМИД 26854213 .

[pmid9235946-9] Уильямс-Эбботт Л., Уолтер Б.Н., Чунг Т.С., Гох С.Р., Портер А.Г., Ware CF (август 1997 г.). «Субъединица лимфотоксина-альфа (LTalpha) необходима для сборки, но не для специфичности рецептора, заякоренного в мембране гетеротримерного лиганда LTalpha1beta2» . Журнал биологической химии . 272 (31): 19451–6. дои : 10.1074/jbc.272.31.19451 . ПМИД 9235946 .

[pmid9317127-10] Браунинг Дж.Л., Сайзинг И.Д., Лоутон П., Бурдон П.Р., Реннерт П.Д., Мажо Г.Р., Амброуз К.М., Хессион С., Миатковски К., Гриффитс Д.А., Нгам-ек А., Мейер В., Бенджамин К.Д., Хохман П.С. (октябрь 1997 г.). «Характеристика комплексов лимфотоксин-альфа-бета на поверхности лимфоцитов мыши» . Журнал иммунологии . 159 (7): 3288–98. дои : 10.4049/jimmunol.159.7.3288 . ПМИД 9317127 . S2CID 25608697 .

[pmid7995952-11] Браунинг Дж.Л., Дугас И., Нгам-ек А., Бурдон П.Р., Эренфельс Б.Н., Миатковски К., Зафари М., Ямпалья А.М., Лоутон П., Мейер В. (январь 1995 г.). «Характеристика поверхностных форм лимфотоксина. Использование специфических моноклональных антител и растворимых рецепторов» . Журнал иммунологии . 154 (1): 33–46. дои : 10.4049/jimmunol.154.1.33 . ПМИД 7995952 . S2CID 22313274 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]