XCL1
| XCL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | XCL1 , ATAC, LPTN, LTN, SCM-1, SCM-1a, SCM1, SCM1A, SCYC1, мотив XC хемокинового лиганда 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 600250 ; МГИ : 104593 ; Гомологен : 2250 ; Генные карты : XCL1 ; OMA : XCL1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Лиганд хемокина (мотив C) (XCL1) представляет собой небольшой цитокин, C принадлежащий к семейству хемокинов , который также известен как лимфотактин . Хемокины известны своей функцией в воспалительных и иммунологических реакциях. Хемокины этого семейства C отличаются по структуре и функциям от большинства хемокинов. [ 5 ] [ 6 ] В этом семействе только два хемокина, и от других хемокинов их отличает то, что у них есть только два цистеина ; один N-концевой цистеин и один цистеин ниже по течению. Оба они называются лимфотактином, альфа- и бета-формой, и претендуют на особые характеристики, присущие только им. Лимфотактины могут претерпевать обратимые конформационные изменения, которые меняют сдвиги его связывания. [ 7 ]
В нормальных тканях XCL1 обнаруживается в больших количествах в селезенке , тимусе , тонком кишечнике периферической крови и лейкоцитах , а в более низких уровнях - в легких , предстательной железе и яичниках . Секреция XCL1 отвечает за увеличение внутриклеточного кальция в лимфоцитах периферической крови . [ 8 ] Клеточные источники XCL1 включают активированный CD8 тимуса и периферической крови. + Т-клетки . [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] NK-клетки также секретируют XCL1 вместе с другими хемокинами на ранних стадиях инфекции. [ 12 ] (ДК) , экспрессирующие XCR1 Дендритные клетки , являются основной мишенью XCL1. [ 12 ]
У людей XCL1 тесно связан с другим хемокином, называемым XCL2 , ген которого находится в том же локусе на хромосоме 1 . [ 11 ] Оба этих хемокина имеют много генетического и функционального сходства; однако известно, что XCL2 наблюдается только у людей, а не у мышей. [ 12 ] XCL1 индуцирует свою хемотаксическую функцию путем связывания с хемокиновым рецептором, называемым XCR1 . [ 13 ] XCL1 экспрессируется на макрофагах , фибробластах и специфических лимфоцитах . [ 6 ]
XCL1 находится в двух метаморфических состояниях: мономер при 10°C, Ltn10, и димер при 40°C, Ltn40. [ 14 ]
Геномика
[ редактировать ]Ген XCL1 находится на длинном плече хромосомы 1, расположенном на цитогенетическом участке q24.2, как показано в информационном окне. Кодирующий ген состоит из 6017 оснований ДНК и кодирует белок XCL1. [ 15 ] Этот ген содержит три экзона и два интрона, а также несколько сайтов инициации транскрипции. [ 8 ] Этот ген кодирует белок XCL1, состоящий из 114 аминокислот, который похож на другие хемокины, за исключением того, что у него отсутствуют первая и третья характеристики цистеина. Это означает, что XCL1 содержит только один цистеин, образующий дисульфидную связь, вместо двух или трех, как у других хемокинов. [ 5 ]
Генетические различия между XCL1 и XCL2 очень малы. Оба белка принадлежат к одному семейству, содержащему структуру мотива С, содержащую одну дисульфидную связь, и имеют практически идентичную третичную структуру. [ 8 ] Эти C-хемокины также имеют одинаковые фланкирующие области, то есть области гена, включая промотор и другие места связывания белка, которые не вносят вклад в транскрибируемый РНК ген. [ 8 ] Картирование генов этого семейства хемокинов показывает сходство в расположении их интронов и экзонов с одним явным отличием. XCL1 имеет только одно отличие в своем первом интроне, который кодирует большую субъединицу рибосомы, называемую L7a . В XCL2 обрезана кодировка региона для L7a. [ 8 ] Единственное другое генетическое различие между двумя зрелыми белками — это разные аминокислоты в положениях 7 и 8. [ 8 ] [ 12 ] Эта разница в аминокислотах может объяснять некоторые биологические различия. Некоторые трудности при сравнении этих двух хемокинов заключаются в том, что XCL2 никогда не наблюдался у мышей. [ 12 ]
Структура
[ редактировать ]Одна вещь, которая отличает XCL1 от других цитокинов, — это его структура. [ 7 ] В то время как большинство хемокинов имеют две дисульфидные связи, которые соединяют N-конец с ядром структуры, у XCL1 есть только одна. [ 5 ] Это простое различие в дисульфидных связях меняет общую третичную структуру XCL1 по сравнению с другими хемокинами. Белок лимфотактина состоит из двух частей, структур Ltn10 и Ltn40, которые складываются друг в друга, что делает его биологически активным . [ 7 ] Это конформационное изменение изменяет структуры связывания хемокина. Такое понимание взаимоскладывания обеспечивает большую основу для понимания лимфотактина кинетики . [ 7 ]
Биологическое значение
[ редактировать ]Известно, что пара XCL1 и XCR1 участвует в перекрестной презентации , поглощении антигена и индукции врожденного, а также адаптивного цитотоксического иммунитета. [ 12 ] XCR1, рецептор XCL1, экспрессируется исключительно в обычных дендритных клетках. [ 12 ] XCL1 секретируется NK-клетками и антигенспецифическим CD8. + Т-клетки вместе с другими хемокинами, включая ИФН-гамма . [ 12 ] Этот процесс, вероятно, облегчает перекрестную презентацию антигенов дендритными клетками.
Также известно, что XCL1 увеличивает количество Т-клеток в суставах, пораженных ревматоидным артритом . [ 6 ] Они также экспрессируются на синовиальных лимфоцитах RA. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143184 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026573 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б с Ван X, Sharp JS, Handel TM, Престегард JH (2013). «Олигомеризация хемокинов в передаче сигналов и миграции клеток». В Хиральдо Дж., Сируэла Ф. (ред.). Прогресс молекулярной биологии и трансляционной науки . Том. 117. стр. 531–578. дои : 10.1016/B978-0-12-386931-9.00020-9 . ISBN 978-0-12-386931-9 . ПМЦ 3937849 . ПМИД 23663982 .
- ^ Jump up to: а б с д Секанеч З., Кох А.Е. (2017). «Рекрутирование клеток и ангиогенез». Файрстейн Г.С., Бадд Р.К., Габриэль С.Е., Макиннес И.Б., О'Делл-младший (ред.). Учебник ревматологии Келли и Файрстейна . Эльзевир. стр. 384–395. дои : 10.1016/B978-0-323-31696-5.00025-5 . ISBN 978-0-323-31696-5 .
- ^ Jump up to: а б с д Хундайкер М (2009). «[Клиническая картина воздействия радиации на кожу]» . Страленшуц в Forschung und Praxis . 28 : 160–4. дои : 10.1016/S0076-6879(09)05403-2 . ПМЦ 3686570 . ПМИД 19480914 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Ёсида Т., Имаи Т., Такаги С., Нисимура М., Исикава И., Яой Т., Ёси О. (14 октября 1996 г.). «Структура и экспрессия двух очень родственных генов, кодирующих SCM-1/лимфотактин человека» . Письма ФЭБС . 395 (1): 82–88. Бибкод : 1996FEBSL.395...82Y . дои : 10.1016/0014-5793(96)01004-6 . ПМИД 8849694 .
- ^ Келнер Г.С., Кеннеди Дж., Бэкон К.Б., Кляйенштойбер С., Ларгаэспада Д.А., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г., Базан Дж.Ф., Мур К.В., Шалл Т.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Лимфотактин: цитокин, представляющий новый класс хемокинов». Наука . 266 (5189): 1395–9. Бибкод : 1994Sci...266.1395K . дои : 10.1126/science.7973732 . ПМИД 7973732 .
- ^ Кеннеди Дж., Келнер Г.С., Кляйенштойбер С., Шалл Т.Дж., Вайс М.К., Иссел Х., Шнайдер П.В., Кокс Б.Г., Бэкон К.Б., Злотник А. (июль 1995 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика лимфотактина человека» . Журнал иммунологии . 155 (1): 203–9. doi : 10.4049/jimmunol.155.1.203 . ПМИД 7602097 .
- ^ Jump up to: а б Ёсида Т., Имаи Т., Такаги С., Нисимура М., Исикава И., Яой Т., Ёси О. (октябрь 1996 г.). «Структура и экспрессия двух очень родственных генов, кодирующих SCM-1/лимфотактин человека» . Письма ФЭБС . 395 (1): 82–8. Бибкод : 1996FEBSL.395...82Y . дои : 10.1016/0014-5793(96)01004-6 . ПМИД 8849694 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Крочек Р.А., Хенн В. (10 февраля 2012 г.). «Роль XCR1 и его лиганда XCL1 в перекрестной презентации антигена дендритными клетками мыши и человека» . Передний. Иммунол . 3 (14): 14. дои : 10.3389/fimmu.2012.00014 . ПМК 3342032 . ПМИД 22566900 .
- ^ Ёсида Т., Имаи Т., Какизаки М., Нисимура М., Такаги С., Ёси О. (июнь 1998 г.). «Идентификация одного мотива C-1/рецептора лимфотактина XCR1» . Журнал биологической химии . 273 (26): 16551–4. дои : 10.1074/jbc.273.26.16551 . ПМИД 9632725 .
- ^ Тайлер Р.С., Мюррей, Нью-Джерси, Петерсон, Фолькман Б.Ф. (август 2011 г.). «Взаимопревращение метаморфического белка в нативном состоянии требует глобального развертывания» . Биохимия . 50 (33): 7077–9. дои : 10.1021/bi200750k . ПМК 3160782 . ПМИД 21776971 .
- ^ «Ген XCL1 (кодирование белка)» . База данных генов человека GeneCards .