CXCL13

CXCL13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4ZAI, 5CBA, 5CBE
Идентификаторы
Псевдонимы	CXCL13 , ANGIE, ANGIE2, BCA-1, BCA1, BLC, BLR1L, SCYB13, хемокиновый лиганд 13 мотива CXC
Внешние идентификаторы	Опустить : 605149 ; МГИ : 1888499 ; Гомологен : 48431 ; Генные карты : CXCL13 ; OMA : CXCL13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	77,611,834 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	96,108,927 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	spleen; ; lymph node; ; appendix; ; mucosa of ileum; ; epithelium of nasopharynx; ; rectum; ; periodontal fiber; ; tonsil; ; superficial temporal artery; ; decidua;
	Top expressed in
	spleen; ; mesenteric lymph nodes; ; migratory enteric neural crest cell; ; morula; ; submandibular gland; ; tunica adventitia of aorta; ; subcutaneous adipose tissue; ; Paneth cell; ; white adipose tissue; ; external carotid artery;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	receptor ligand activity; CCR10 chemokine receptor binding; cytokine activity; heparin binding; CXCR3 chemokine receptor binding; chemokine activity; protein heterodimerization activity; fibroblast growth factor binding; CXCR5 chemokine receptor binding;
Cellular component	extracellular region; extracellular space;
Biological process	chemokine-mediated signaling pathway; positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; cell-cell signaling; germinal center formation; regulation of angiogenesis; chemotaxis; endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor; regulation of humoral immune response; cell surface receptor signaling pathway; response to lipopolysaccharide; regulation of cell population proliferation; defense response to bacterium; negative regulation of endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor; positive regulation of T cell chemotaxis; immune response; inflammatory response; chronic inflammatory response; defense response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; regulation of signaling receptor activity; G protein-coupled receptor signaling pathway; lymphocyte chemotaxis across high endothelial venule; positive regulation of integrin activation; positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin; B cell chemotaxis; activation of GTPase activity; neutrophil chemotaxis; leukocyte chemotaxis; cellular response to lipopolysaccharide;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10563
	55985
	ENSG00000156234
	ENSMUSG00000023078
	О43927
	О55038
	НМ_006419 ; НМ_001371558
	НМ_018866
	НП_006410 ; НП_001358487
	НП_061354
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

хемокина ( мотив CXC ) Лиганд 13 ( CXCL13 ), также известный как хемоаттрактант B-лимфоцитов ( BLC ) или хемокин 1, привлекающий B-клетки ( BCA-1 ), представляет собой белок- лиганд , который у людей кодируется CXCL13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

CXCL13 представляет собой небольшой хемокин, принадлежащий семейству хемокинов CXC . Как следует из других его названий, этот хемокин избирательно хемотаксичен для B-клеток, принадлежащих как к подгруппам B-1 , так и к B-2 , и вызывает свои эффекты путем взаимодействия с хемокиновым рецептором CXCR5 . ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]} CXCL13 и его рецептор CXCR5 контролируют организацию В-клеток в фолликулах лимфоидной ткани. ^{[ 8 ]} и экспрессируется в высокой степени в , селезенке , лимфатических узлах и кишечнике человека печени . ^{[ 5 ]} Ген . CXCL13 расположен на хромосоме 4 человека в кластере других хемокинов CXC ^{[ 6 ]}

Считается, что в Т-лимфоцитах экспрессия CXCL13 отражает происхождение Т-клеток из зародышевого центра, особенно подмножества Т-клеток, называемых фолликулярными В-хелперными Т-клетками (или Т- _FH- клетками). Следовательно, считается, что экспрессия CXCL13 в Т-клеточных лимфомах, таких как ангиоиммунобластная Т-клеточная лимфома, отражает происхождение неопластических Т-клеток из зародышевого центра. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000156234 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023078 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Леглер Д.Ф., Лётшер М., Роос Р.С., Кларк-Льюис И., Баджолини М., Мозер Б. (февраль 1998 г.). «Хемокин 1, привлекающий B-клетки, человеческий хемокин CXC, экспрессируемый в лимфоидных тканях, избирательно привлекает B-лимфоциты через BLR1/CXCR5» . Дж. Эксп. Мед . 187 (4): 655–60. дои : 10.1084/jem.187.4.655 . ПМК 2212150 . ПМИД 9463416 .
^ Jump up to: ^а ^б Ганн, доктор медицинских наук, Нго В.Н., Ансель К.М., Экланд Э.Х., Цистер Дж.Г., Уильямс Л.Т. (февраль 1998 г.). «Хемокин, возвращающий B-клетки, вырабатываемый в лимфоидных фолликулах, активирует рецептор лимфомы Беркитта-1». Природа . 391 (6669): 799–803. Бибкод : 1998Natur.391..799G . дои : 10.1038/35876 . ПМИД 9486651 . S2CID 4373691 .
^ Ансель К.М., Харрис Р.Б., Цистер Дж.Г. (январь 2002 г.). «CXCL13 необходим для самонаведения клеток B1, производства естественных антител и иммунитета полостей тела» . Иммунитет . 16 (1): 67–76. дои : 10.1016/S1074-7613(01)00257-6 . ПМИД 11825566 .
^ Ансель К.М., Нго В.Н., Хайман П.Л., Лютер С.А., Ферстер Р., Седжвик Дж.Д., Браунинг Дж.Л., Липп М., Цистер Дж.Г. (июль 2000 г.). «Петля положительной обратной связи, управляемая хемокинами, организует лимфоидные фолликулы». Природа . 406 (6793): 309–14. дои : 10.1038/35018581 . ПМИД 10917533 . S2CID 4369622 .
^ де Леваль Л., Рикман Д.С., Тилен С., Рейнис А., Хуанг Ю.Л., Дельсол Г., Ламант Л., Лерой К., Бриер Дж., Молина Т., Бергер Ф., Гиссельбрехт К., Ксерри Л., Голар П. (июнь 2007 г.). «Профиль экспрессии генов узловой периферической Т-клеточной лимфомы демонстрирует молекулярную связь между ангиоиммунобластной Т-клеточной лимфомой (AITL) и фолликулярными Т-хелперными клетками (TFH)» . Кровь . 109 (11): 4952–63. дои : 10.1182/blood-2006-10-055145 . ПМИД 17284527 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома CXCL13 и CXCL13 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43927 (хемокин 13 мотива CXC) в PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000156234 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023078 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9463416-5] Jump up to: ^а ^б ^с Леглер Д.Ф., Лётшер М., Роос Р.С., Кларк-Льюис И., Баджолини М., Мозер Б. (февраль 1998 г.). «Хемокин 1, привлекающий B-клетки, человеческий хемокин CXC, экспрессируемый в лимфоидных тканях, избирательно привлекает B-лимфоциты через BLR1/CXCR5» . Дж. Эксп. Мед . 187 (4): 655–60. дои : 10.1084/jem.187.4.655 . ПМК 2212150 . ПМИД 9463416 .

[pmid9486651-6] Jump up to: ^а ^б Ганн, доктор медицинских наук, Нго В.Н., Ансель К.М., Экланд Э.Х., Цистер Дж.Г., Уильямс Л.Т. (февраль 1998 г.). «Хемокин, возвращающий B-клетки, вырабатываемый в лимфоидных фолликулах, активирует рецептор лимфомы Беркитта-1». Природа . 391 (6669): 799–803. Бибкод : 1998Natur.391..799G . дои : 10.1038/35876 . ПМИД 9486651 . S2CID 4373691 .

[pmid11825566-7] Ансель К.М., Харрис Р.Б., Цистер Дж.Г. (январь 2002 г.). «CXCL13 необходим для самонаведения клеток B1, производства естественных антител и иммунитета полостей тела» . Иммунитет . 16 (1): 67–76. дои : 10.1016/S1074-7613(01)00257-6 . ПМИД 11825566 .

[pmid10917533-8] Ансель К.М., Нго В.Н., Хайман П.Л., Лютер С.А., Ферстер Р., Седжвик Дж.Д., Браунинг Дж.Л., Липп М., Цистер Дж.Г. (июль 2000 г.). «Петля положительной обратной связи, управляемая хемокинами, организует лимфоидные фолликулы». Природа . 406 (6793): 309–14. дои : 10.1038/35018581 . ПМИД 10917533 . S2CID 4369622 .

[pmid17284527-9] де Леваль Л., Рикман Д.С., Тилен С., Рейнис А., Хуанг Ю.Л., Дельсол Г., Ламант Л., Лерой К., Бриер Дж., Молина Т., Бергер Ф., Гиссельбрехт К., Ксерри Л., Голар П. (июнь 2007 г.). «Профиль экспрессии генов узловой периферической Т-клеточной лимфомы демонстрирует молекулярную связь между ангиоиммунобластной Т-клеточной лимфомой (AITL) и фолликулярными Т-хелперными клетками (TFH)» . Кровь . 109 (11): 4952–63. дои : 10.1182/blood-2006-10-055145 . ПМИД 17284527 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]