CX3CL1

CX3CL1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3
Идентификаторы
Псевдонимы	CX3CL1 , ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, фракталкин, нейротактин, хемокиновый лиганд 1 мотива C-X3-C.
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601880 ; МГИ : 1097153 ; Гомологен : 2251 ; Генные карты : CX3CL1 ; OMA : CX3CL1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	57,385,044 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	95,509,055 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lung; ; right coronary artery; ; prefrontal cortex; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; frontal pole; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; right frontal lobe; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; CA3 field; ; visual cortex; ; primary visual cortex; ; olfactory tubercle; ; superior frontal gyrus; ; primary motor cortex; ; prefrontal cortex; ; nucleus accumbens;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cytokine activity; chemokine activity; protein binding; CCR chemokine receptor binding; signaling receptor binding; integrin binding; CX3C chemokine receptor binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; extracellular region; cell surface; extracellular space;
Biological process	G protein-coupled receptor signaling pathway; defense response; positive regulation of inflammatory response; monocyte chemotaxis; cytokine-mediated signaling pathway; chemokine-mediated signaling pathway; angiogenesis involved in wound healing; cellular response to tumor necrosis factor; wound healing; leukocyte chemotaxis; neutrophil chemotaxis; positive regulation of angiogenesis; positive regulation of transforming growth factor beta1 production; positive regulation of GTPase activity; cell adhesion; immune response; cellular response to interleukin-1; leukocyte adhesive activation; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; cellular response to interferon-gamma; cell chemotaxis; lymphocyte chemotaxis; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion; chemotaxis; integrin activation; negative regulation of cell migration; leukocyte migration involved in inflammatory response; macrophage chemotaxis; regulation of signaling receptor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6376
	20312
	ENSG00000006210
	ENSMUSG00000031778
	P78423
	О35188
	НМ_002996 ; НМ_001304392
	НМ_009142
	НП_001291321 ; НП_002987
	НП_033168
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фракталкин , также известный как хемокин (мотив C-X3-C) лиганд 1 , представляет собой белок , который у человека кодируется CX3CL1 геном .

Функция

Фракталкин представляет собой крупный цитокиновый белок, состоящий из 373 аминокислот, который содержит несколько доменов и является единственным известным членом _{CX 3} C. хемокинов семейства Он также широко известен под названиями фракталкин (у людей) и нейротактин (у мышей). ^[5]^[6] Полипептидная структура CX3CL1 отличается от типичной структуры других хемокинов. Например, расстояние между характерными N-концевыми цистеинами различается; Есть три аминокислоты, разделяющие исходную пару цистеинов в CX3CL1, их нет в хемокинах CC и только одна промежуточная аминокислота в хемокинах CXC . CX3CL1 производится в виде длинного белка (содержащего у человека 373 аминокислоты) с удлиненным муциноподобным стеблем и хемокиновым доменом наверху. Муциноподобный стебель позволяет ему связываться с поверхностью определенных клеток. Однако также наблюдалась растворимая (90 кДа) версия этого хемокина. Растворимый CX3CL1 мощно хемоаттрактирует Т-клетки и моноциты , в то время как связанный с клетками хемокин способствует прочной адгезии лейкоцитов к активированным эндотелиальным клеткам, где он преимущественно экспрессируется. ^[6] CX3CL1 выполняет свои адгезивные и миграционные функции путем взаимодействия с хемокиновым рецептором CX3CR1 . ^[7] Его ген расположен на хромосоме 16 человека вместе с некоторыми хемокинами CC, известными как CCL17 и CCL22 . ^[6]^[8]

Фракталкин обычно обнаруживается по всему мозгу, особенно в нервных клетках, а его рецептор, как известно, присутствует на клетках микроглии. Также было обнаружено, что он необходим для миграции микроглиальных клеток. ^[9] CX3CL1 также активируется в гиппокампе в течение короткого временного окна после пространственного обучения , целью которого может быть регулирование тонуса нейротрансмиссии, опосредованного глутаматом. Это указывает на возможную роль хемокина в процессе защитной пластичности синаптического масштабирования . ^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000006210 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031778 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пэн И., Ллойд С., Чжоу Х., Долич С., Дидс Дж., Гонсало Дж. А., Ват Дж., Госселин М., Ма Дж., Дюссо Б., Вульф Е., Альперин Г., Калпеппер Дж., Гутьеррес-Рамос Дж. К., Гиринг Д. (1997). «Нейротактин, мембраносвязанный хемокин, активность которого повышается при воспалении головного мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. Бибкод : 1997Natur.387..611P . дои : 10.1038/42491 . ПМИД 9177350 . S2CID 4307876 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. Бибкод : 1997Natur.385..640B . дои : 10.1038/385640a0 . ПМИД 9024663 . S2CID 4322166 .
^ Имаи Т., Хиэсима К., Хаскелл С., Баба М., Нагира М., Нишимура М., Какидзаки М., Такаги С., Номияма Х., Шалл Т.Дж., Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика фракталкинового рецептора CX3CR1, который опосредует как миграцию, так и адгезию лейкоцитов» . Клетка . 91 (4): 521–530. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80438-9 . ПМИД 9390561 . S2CID 17281691 .
^ Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж., Миура Р., Каллен Д.Ф., Йоши О. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Цитогенет. Клеточная генетика . 81 (1): 10–11. doi : 10.1159/000015000 (неактивен 29 июля 2024 г.). ПМИД 9691168 . S2CID 46851784 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )
^ Мациевски-Ленуар Д., Чен С., Фэн Л., Маки Р., Бэкон К.Б. (1 августа 1999 г.). «Характеристика фракталкина в клетках головного мозга крыс: сигналы миграции и активации микроглии, экспрессирующей CX3CR-1» . Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. дои : 10.4049/jimmunol.163.3.1628 . ISSN 0022-1767 . ПМИД 10415068 .
^ Шеридан Г.К., Вдович А., Пикеринг М., Уоттерс О., Хэлли П., О'Салливан Н.К., Муни С., О'Коннелл DJ, О'Коннор Дж.Дж., Мерфи К.Дж. (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время связанной с памятью синаптической пластичности» . Переднеклеточные нейроны . 8 : 233. дои : 10.3389/fncel.2014.00233 . ПМК 4130185 . ПМИД 25161610 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома CX3CL1 и CX3CL1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–4. Бибкод : 1997Natur.385..640B . дои : 10.1038/385640a0 . ПМИД 9024663 . S2CID 4322166 .
Комбадьер С., Зальцведель К., Смит Э.Д., Тиффани Х.Л., Бергер Э.А., Мерфи П.М. (1998). «Идентификация CX3CR1. Хемотаксический рецептор человеческого хемокина фракталкина CX3C и слитый корецептор ВИЧ-1» . Ж. Биол. Хим . 273 (37): 23799–804. дои : 10.1074/jbc.273.37.23799 . ПМИД 9726990 .
Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Бушелл Т.Дж., Грей П.В., Миллер Р.Дж. (1998). «Хемокины регулируют передачу сигналов нейронами гиппокампа и нейротоксичность gp120» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (24): 14500–5. Бибкод : 1998PNAS...9514500M . дои : 10.1073/pnas.95.24.14500 . ПМК 24402 . ПМИД 9826729 .
Мизуэ Л.С., Базан Дж.Ф., Джонсон ЕС, Гендель ТМ (1999). «Структура раствора и динамика хемокинового домена CX3C фракталкина и его взаимодействие с N-концевым фрагментом CX3CR1». Биохимия . 38 (5): 1402–14. дои : 10.1021/bi9820614 . ПМИД 9931005 .
Пападопулос Э.Дж., Сассетти С., Саеки Х., Ямада Н., Кавамура Т., Фитцхью Дж.Д., Сараф М.А., Шалл Т., Блаувельт А., Розен С.Д., Хван С.Т. (1999). «Фракталкин, хемокин CX3C, экспрессируется дендритными клетками и активируется при созревании дендритных клеток» . Евро. Дж. Иммунол . 29 (8): 2551–9. doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199908)29:08<2551::AID-IMMU2551>3.0.CO;2-T . ПМИД 10458770 .
Лофтус Б.Дж., Ким У.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттс Мэйс А., Цао Ю., Сюй Р.С., Кан Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э.Э., Харрис ПК, Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицинских наук (1999). «Дупликации генома и другие особенности в последовательности ДНК размером 12 МБ из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика . 60 (3): 295–308. дои : 10.1006/geno.1999.5927 . ПМИД 10493829 .
Тонг Н., Перри С.В., Чжан К., Джеймс Х.Дж., Го Х., Брукс А., Бал Х., Киннер С.А., Файн С., Эпштейн Л.Г., Дайраги Д., Шалл Т.Дж., Гендельман Х.Э., Дьюхерст С., Шерер Л.Р., Гелбард Х.А. (2000) . «Нейрональная экспрессия фракталкина при энцефалите ВИЧ-1: роль в рекрутировании макрофагов и нейропротекции в центральной нервной системе» . Дж. Иммунол . 164 (3): 1333–9. дои : 10.4049/jimmunol.164.3.1333 . ПМИД 10640747 . S2CID 20616076 .
Фор С., Мейер Л., Костальола Д., Ванинсберг С., Генен Е., Отран Б., Дельфраси Дж. Ф., МакДермотт Д. Х., Мерфи П. М., Дебре П., Теодору I, Комбадьер С (2000). «Быстрое развитие СПИДа у ВИЧ-положительных людей со структурным вариантом хемокинового рецептора CX3CR1». Наука . 287 (5461): 2274–7. Бибкод : 2000Sci...287.2274F . дои : 10.1126/science.287.5461.2274 . ПМИД 10731151 .
Гувер Д.М., Мизуэ Л.С., Гендель Т.М., Лубковски Дж. (2000). «Кристаллическая структура хемокинового домена фракталкина демонстрирует новое четвертичное расположение» . Ж. Биол. Хим . 275 (30): 23187–93. дои : 10.1074/jbc.M002584200 . ПМИД 10770945 . S2CID 38835823 .
Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Миллер Р.Дж. (2000). «Экспрессия хемокиновых рецепторов CX3CR1 на нейронах и их роль в выживании нейронов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (14): 8075–80. Бибкод : 2000PNAS...97.8075M . дои : 10.1073/pnas.090017497 . ПМК 16672 . ПМИД 10869418 .
Пападопулос Э.Дж., Фицхью Д.Д., Ткачик С., Гилфиллан А.М., Сассетти С., Меткалф Д.Д., Хван С.Т. (2000). «Тучные клетки мигрируют, но не дегранулируют, в ответ на фракталкин, мембраносвязанный хемокин, конститутивно экспрессируемый в различных клетках кожи». Евро. Дж. Иммунол . 30 (8): 2355–61. doi : 10.1002/1521-4141(2000)30:8<2355::AID-IMMU2355>3.0.CO;2-# . ПМИД 10940926 . S2CID 196597758 .
Лукас А.Д., Чедвик Н., Уоррен Б.Ф., Джуэлл Д.П., Гордон С., Паури Ф., Гривз Д.Р. (2001). «Трансмембранная форма фракталкина хемокина CX3CL1 экспрессируется преимущественно эпителиальными клетками in vivo» . Являюсь. Дж. Патол . 158 (3): 855–66. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64034-5 . ПМК 1850344 . ПМИД 11238035 .
Гартон К.Дж., Гоф П.Дж., Блобель С.П., Мерфи Дж., Гривз Д.Р., Демпси П.Дж., Рейнс Э.В. (2001). «Альфа-превращающий фактор некроза опухоли фермент (ADAM17) опосредует расщепление и выделение фракталкина (CX3CL1)» . Ж. Биол. Хим . 276 (41): 37993–8001. дои : 10.1074/jbc.M106434200 . ПМИД 11495925 .
Умехара Х., Блум Э.Т., Оказаки Т., Нагано Ю., Ёси О., Имаи Т. (2004). «Фракталкин в сосудистой биологии: от фундаментальных исследований к клиническому заболеванию» . Артериосклер. Тромб. Васк. Биол . 24 (1): 34–40. дои : 10.1161/01.ATV.0000095360.62479.1F . ПМИД 12969992 . S2CID 6183022 .
Умехара Х, Танака М, Саваки Т, Джин ZX, Хуанг ЧР, Донг Л, Каванами Т, Карасава Х, Масаки Ю, Фукусима Т, Хиросе Ю, Окадзаки Т (2006). «Фракталкин при ревматоидном артрите и родственных ему состояниях». Мод Ревматол . 16 (3): 124–30. дои : 10.1007/s10165-006-0471-9 . ПМИД 16767549 . S2CID 10199059 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000006210 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031778 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Пэн И., Ллойд С., Чжоу Х., Долич С., Дидс Дж., Гонсало Дж. А., Ват Дж., Госселин М., Ма Дж., Дюссо Б., Вульф Е., Альперин Г., Калпеппер Дж., Гутьеррес-Рамос Дж. К., Гиринг Д. (1997). «Нейротактин, мембраносвязанный хемокин, активность которого повышается при воспалении головного мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. Бибкод : 1997Natur.387..611P . дои : 10.1038/42491 . ПМИД 9177350 . S2CID 4307876 .

[bazan-6] Jump up to: ^а ^б ^с Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. Бибкод : 1997Natur.385..640B . дои : 10.1038/385640a0 . ПМИД 9024663 . S2CID 4322166 .

[7] Имаи Т., Хиэсима К., Хаскелл С., Баба М., Нагира М., Нишимура М., Какидзаки М., Такаги С., Номияма Х., Шалл Т.Дж., Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика фракталкинового рецептора CX3CR1, который опосредует как миграцию, так и адгезию лейкоцитов» . Клетка . 91 (4): 521–530. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80438-9 . ПМИД 9390561 . S2CID 17281691 .

[8] Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж., Миура Р., Каллен Д.Ф., Йоши О. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Цитогенет. Клеточная генетика . 81 (1): 10–11. doi : 10.1159/000015000 (неактивен 29 июля 2024 г.). ПМИД 9691168 . S2CID 46851784 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )

[9] Мациевски-Ленуар Д., Чен С., Фэн Л., Маки Р., Бэкон К.Б. (1 августа 1999 г.). «Характеристика фракталкина в клетках головного мозга крыс: сигналы миграции и активации микроглии, экспрессирующей CX3CR-1» . Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. дои : 10.4049/jimmunol.163.3.1628 . ISSN 0022-1767 . ПМИД 10415068 .

[pmid25161610-10] Шеридан Г.К., Вдович А., Пикеринг М., Уоттерс О., Хэлли П., О'Салливан Н.К., Муни С., О'Коннелл DJ, О'Коннор Дж.Дж., Мерфи К.Дж. (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время связанной с памятью синаптической пластичности» . Переднеклеточные нейроны . 8 : 233. дои : 10.3389/fncel.2014.00233 . ПМК 4130185 . ПМИД 25161610 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]