Рецептор бета-лимфотоксина

ЛТБР
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1RF3, 4MXW
Идентификаторы
Псевдонимы	LTBR , CD18, D12S370, LT-BETA-R, TNF-R-III, TNFCR, TNFR-RP, TNFR2-RP, TNFR3, TNFRSF3, рецептор бета-лимфотоксина
Внешние идентификаторы	Опустить : 600979 ; МГИ : 104875 ; Гомологен : 1753 ; GeneCards : LTBR ; ОМА : LTBR — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	6,391,571 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	125,290,848 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; minor salivary glands; ; body of pancreas; ; body of stomach; ; upper lobe of left lung; ; muscle layer of sigmoid colon; ; right lobe of liver; ; left uterine tube; ; skin of abdomen;
	Top expressed in
	granulocyte; ; duodenum; ; gastric mucosa; ; epithelium of stomach; ; yolk sac; ; mucous cell of stomach; ; right kidney; ; saccule; ; membranous bone; ; left lobe of liver;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; tumor necrosis factor-activated receptor activity; identical protein binding; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; Golgi apparatus;
Biological process	myeloid dendritic cell differentiation; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; positive regulation of JNK cascade; multicellular organism development; cellular response to mechanical stimulus; response to lipopolysaccharide; regulation of cell population proliferation; positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; inflammatory response; viral process; signal transduction; apoptotic process; immune response; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; hematopoietic or lymphoid organ development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4055
	17000
	ENSG00000111321
	ENSMUSG00000030339
	P36941
	P50284
	НМ_001270987 ; НМ_002342
	НМ_010736
	НП_001257916 ; НП_002333
	НП_034866
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор бета-лимфотоксина ( LTBR ), также известный как член суперсемейства 3 рецепторов фактора некроза опухоли ( TNFRSF3 ), представляет собой рецептор клеточной поверхности для лимфотоксина , участвующий в апоптозе и высвобождении цитокинов . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Он является членом суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом фактора некроза опухоли семейства рецепторов (TNF). Он экспрессируется на поверхности большинства типов клеток, включая клетки эпителиального и миелоидного ряда, но не на Т- и В- лимфоцитах . Белок специфически связывает мембранную форму лимфотоксина (комплекс лимфотоксина-альфа и лимфотоксина-бета). Кодируемый белок и его лиганд играют роль в развитии и организации лимфоидной ткани и трансформированных клеток. Активация кодируемого белка может вызвать апоптоз. ^{[ 5 ]}

LTBR не только помогает запустить апоптоз, но и может привести к высвобождению цитокина интерлейкина 8 . Сверхэкспрессия LTBR в клетках HEK293 увеличивает активность промотора IL-8 и приводит к высвобождению IL-8. LTBR также важен для развития и организации вторичных лимфоидных органов и высвобождения хемокинов. ^{[ 8 ]}

Структура

Графики Рамачандрана показывают, что 64,6% всех остатков находились в предпочтительном регионе. Эта структура была обнаружена с помощью рентгеновской дифракции. Разрешение составляет 3,50 ангстрем. Углы альфа и бета составляют 90 градусов, а угол гамма — 120 градусов. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что рецептор бета-лимфотоксина взаимодействует с гомологом Диабло. ^{[ 10 ]} и ТРАФ3 . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111321 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030339 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бета-рецептор лимфотоксина LTBR (суперсемейство TNFR, член 3)» .
^ Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж.Дж., ван ден Берге Х., Маринен П. (апрель 1993 г.). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибируемых последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика . 16 (1): 214–8. дои : 10.1006/geno.1993.1161 . PMID 8486360 .
^ Кроу П.Д., ВанАрсдейл Т.Л., Уолтер Б.Н., Уэр К.Ф., Хессион С., Эренфельс Б., Браунинг Дж.Л., Дин В.С., Гудвин Р.Г., Смит К.А. (апрель 1994 г.). «Рецептор, специфический для бета-лимфотоксина». Наука . 264 (5159): 707–10. Бибкод : 1994Sci...264..707C . дои : 10.1126/science.8171323 . ПМИД 8171323 .
^ Чанг Ю.Х., Се С.Л., Чен М.К., Линь В.В. (август 2002 г.). «Рецептор бета-лимфотоксина индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Эксп. Сотовый Res . 278 (2): 166–74. дои : 10.1006/excr.2002.5573 . ПМИД 12169272 .
^ «Анализ MolProbity Рамачандрана» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 12 октября 2012 г.
^ Куай, Джун; Никбарг Эллиотт; Вутерс Джо; Цю Юнчан; Ван Джек; Линь Ли-Линг (апрель 2003 г.). «Эндогенная ассоциация TRAF2, TRAF3, cIAP1 и Smac с бета-рецептором лимфотоксина раскрывает новый механизм апоптоза» . Ж. Биол. Хим . 278 (16). США: 14363–9. дои : 10.1074/jbc.M208672200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12571250 .
^ ВанАрсдейл, TL; ВанАрсдейл СЛ; Форсировать WR; Уолтер Б.Н.; Мосиалос Г; Киев Э ; Рид Дж.К.; Ware CF (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс лимфотоксин-бета-рецептор: роль рекрутирования фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора каппаB» . Учеб. Натл. акад. наук. США 94 (6). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 2460–5. Бибкод : 1997PNAS...94.2460V . дои : 10.1073/pnas.94.6.2460 . ISSN 0027-8424 . ЧВК 20110 . ПМИД 9122217 .
^ Ву, МОЙ; Ван ПЯ; Хан Ш.; Се С.Л. (апрель 1999 г.). «Цитоплазматический домен рецептора бета-лимфотоксина опосредует гибель клеток в клетках HeLa» . Ж. Биол. Хим . 274 (17). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 11868–73. дои : 10.1074/jbc.274.17.11868 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10207006 .
^ Марстерс, ЮАР; Айрес ТМ; Скубач М; Серый CL; Роте М; Ашкенази А (май 1997 г.). «Медиатор входа герпесвируса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства TNFR-ассоциированных факторов и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1» . Ж. Биол. Хим . 272 (22). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 14029–32. дои : 10.1074/jbc.272.22.14029 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9162022 .

Дальнейшее чтение

Элеваут Д., Ware CF (2007). «Нетрадиционная роль LT альфа-бета в дифференцировке Т-клеток». Тенденции Иммунол . 28 (4): 169–75. дои : 10.1016/j.it.2007.02.005 . ПМИД 17336158 .
Браунинг Дж.Л., Нгам-ек А., Лоутон П. и др. (1993). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Клетка . 72 (6): 847–56. дои : 10.1016/0092-8674(93)90574-А . ПМИД 7916655 . S2CID 28961163 .
Кроу П.Д., ВанАрсдейл Т.Л., Уолтер Б.Н. и др. (1994). «Рецептор, специфический для бета-лимфотоксина». Наука . 264 (5159): 707–10. Бибкод : 1994Sci...264..707C . дои : 10.1126/science.8171323 . ПМИД 8171323 .
Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж.Дж. и др. (1993). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибируемых последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика . 16 (1): 214–8. дои : 10.1006/geno.1993.1161 . PMID 8486360 .
Баенс М., Аерсенс Дж., ван Занд К. и др. (1996). «Выделение и региональное распределение кДНК хромосомы 12p человека». Геномика . 29 (1): 44–52. дои : 10.1006/geno.1995.1213 . ПМИД 8530100 .
Ван X, Борнслагер Е.А., Хауб О и др. (1996). «Ген-кандидат на мутацию мышиной стадии безамниальной гаструляции кодирует TRAF-родственный белок» . Дев. Биол . 177 (1): 274–90. дои : 10.1006/dbio.1996.0162 . ПМИД 8660894 .
Накано Х., Осима Х., Чунг В. и др. (1996). «TRAF5, активатор NF-kappaB и предполагаемый преобразователь сигнала для рецептора бета-лимфотоксина» . Ж. Биол. Хим . 271 (25): 14661–4. дои : 10.1074/jbc.271.25.14661 . ПМИД 8663299 .
Мацумото М., Се Т.Ю., Чжу Н. и др. (1997). «Коровой белок вируса гепатита С взаимодействует с цитоплазматическим хвостом рецептора бета-лимфотоксина» . Дж. Вирол . 71 (2): 1301–9. doi : 10.1128/JVI.71.2.1301-1309.1997 . ЧВК 191185 . ПМИД 8995654 .
ВанАрсдейл Т.Л., ВанАрсдейл С.Л., Форс В.Р. и др. (1997). «Сигнальный комплекс лимфотоксин-бета-рецептор: роль рекрутирования фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора каппаB» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (6): 2460–5. Бибкод : 1997PNAS...94.2460V . дои : 10.1073/pnas.94.6.2460 . ЧВК 20110 . ПМИД 9122217 .
Ву М.И., Сюй Т.Л., Лин В.В. и др. (1997). «Активность серин/треонин киназы, связанная с цитоплазматическим доменом рецептора бета-лимфотоксина в клетках HepG2» . Ж. Биол. Хим . 272 (27): 17154–9. дои : 10.1074/jbc.272.27.17154 . ПМИД 9202035 .
Чен СМ, Ю ЛР, Хван ЛХ, Ли Ю (1997). «Прямое взаимодействие основного белка вируса гепатита С с клеточным рецептором бета-лимфотоксина модулирует сигнальный путь рецептора бета-лимфотоксина» . Дж. Вирол . 71 (12): 9417–26. doi : 10.1128/JVI.71.12.9417-9426.1997 . ПМК 230246 . ПМИД 9371602 .
Мизушима С., Фудзита М., Исида Т. и др. (1998). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей человеческий гомолог фактора 5, связанного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF5)». Джин . 207 (2): 135–40. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00616-1 . ПМИД 9511754 .
Краевска М., Краевски С., Сапата Дж.М. и др. (1998). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого человека, плода и опухоли» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (6): 1549–61. ПМК 1858434 . ПМИД 9626059 .
Буссо В., Солер П., Моро Дж. и др. (1999). «Экспрессия трех членов семейства рецепторов TNF-R (4-1BB, рецептор бета-лимфотоксина и Fas) в легких человека» . Евро. Дыхание. Дж . 12 (4): 926–31. дои : 10.1183/09031936.98.12040926 . ПМИД 9817170 .
Мерфи М., Уолтер Б.Н., Пайк-Нобил Л. и др. (1999). «Экспрессия рецептора бета-лимфотоксина на фолликулярных стромальных клетках лимфоидных тканей человека» . Гибель клеток отличается . 5 (6): 497–505. дои : 10.1038/sj.cdd.4400374 . ПМИД 10200501 .
Ву М.И., Ван П.Ю., Хан Ш., Се С.Л. (1999). «Цитоплазматический домен рецептора бета-лимфотоксина опосредует гибель клеток в клетках HeLa» . Ж. Биол. Хим . 274 (17): 11868–73. дои : 10.1074/jbc.274.17.11868 . ПМИД 10207006 .
Ю К.Ю., Квон Б., Ни Дж. и др. (1999). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз» . Ж. Биол. Хим . 274 (20): 13733–6. дои : 10.1074/jbc.274.20.13733 . ПМИД 10318773 .
Руни И.А., Бутрович К.Д., Гласс А.А. и др. (2000). «Рецептор бета-лимфотоксина необходим и достаточен для LIGHT-опосредованного апоптоза опухолевых клеток» . Ж. Биол. Хим . 275 (19): 14307–15. дои : 10.1074/jbc.275.19.14307 . ПМИД 10799510 .
Лангегген Х., Берге К.Е., Джонсон Э., Хетланд Г. (2003). «Эндотелиальные клетки пупочной вены человека экспрессируют рецептор комплемента 1 (CD35) и рецептор комплемента 4 (CD11c/CD18) in vitro». Воспаление . 26 (3): 103–10. дои : 10.1023/А:1015585530204 . ПМИД 12083416 . S2CID 54700 .
Чанг Ю.Х., Се С.Л., Чен М.К., Линь В.В. (2002). «Бета-рецептор лимфотоксина индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Эксп. Сотовый Res . 278 (2): 166–74. дои : 10.1006/excr.2002.5573 . ПМИД 12169272 .

Внешние ссылки

Лимфотоксин + бета + рецептор в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111321 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030339 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: бета-рецептор лимфотоксина LTBR (суперсемейство TNFR, член 3)» .

[pmid8486360-6] Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж.Дж., ван ден Берге Х., Маринен П. (апрель 1993 г.). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибируемых последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика . 16 (1): 214–8. дои : 10.1006/geno.1993.1161 . PMID 8486360 .

[pmid8171323-7] Кроу П.Д., ВанАрсдейл Т.Л., Уолтер Б.Н., Уэр К.Ф., Хессион С., Эренфельс Б., Браунинг Дж.Л., Дин В.С., Гудвин Р.Г., Смит К.А. (апрель 1994 г.). «Рецептор, специфический для бета-лимфотоксина». Наука . 264 (5159): 707–10. Бибкод : 1994Sci...264..707C . дои : 10.1126/science.8171323 . ПМИД 8171323 .

[pmid12169272-8] Чанг Ю.Х., Се С.Л., Чен М.К., Линь В.В. (август 2002 г.). «Рецептор бета-лимфотоксина индуцирует экспрессию гена интерлейкина 8 посредством активации NF-kappaB и AP-1». Эксп. Сотовый Res . 278 (2): 166–74. дои : 10.1006/excr.2002.5573 . ПМИД 12169272 .

[9] «Анализ MolProbity Рамачандрана» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 12 октября 2012 г.

[pmid12571250-10] Куай, Джун; Никбарг Эллиотт; Вутерс Джо; Цю Юнчан; Ван Джек; Линь Ли-Линг (апрель 2003 г.). «Эндогенная ассоциация TRAF2, TRAF3, cIAP1 и Smac с бета-рецептором лимфотоксина раскрывает новый механизм апоптоза» . Ж. Биол. Хим . 278 (16). США: 14363–9. дои : 10.1074/jbc.M208672200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12571250 .

[pmid9122217-11] ВанАрсдейл, TL; ВанАрсдейл СЛ; Форсировать WR; Уолтер Б.Н.; Мосиалос Г; Киев Э ; Рид Дж.К.; Ware CF (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс лимфотоксин-бета-рецептор: роль рекрутирования фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора каппаB» . Учеб. Натл. акад. наук. США 94 (6). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 2460–5. Бибкод : 1997PNAS...94.2460V . дои : 10.1073/pnas.94.6.2460 . ISSN 0027-8424 . ЧВК 20110 . ПМИД 9122217 .

[pmid10207006-12] Ву, МОЙ; Ван ПЯ; Хан Ш.; Се С.Л. (апрель 1999 г.). «Цитоплазматический домен рецептора бета-лимфотоксина опосредует гибель клеток в клетках HeLa» . Ж. Биол. Хим . 274 (17). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 11868–73. дои : 10.1074/jbc.274.17.11868 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 10207006 .

[pmid9162022-13] Марстерс, ЮАР; Айрес ТМ; Скубач М; Серый CL; Роте М; Ашкенази А (май 1997 г.). «Медиатор входа герпесвируса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства TNFR-ассоциированных факторов и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1» . Ж. Биол. Хим . 272 (22). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 14029–32. дои : 10.1074/jbc.272.22.14029 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9162022 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]