ЛИДЕР 4

ЛИДЕР 4
Идентификаторы
Псевдонимы	DUX4 , DUX4L, двойной гомеобокс 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 606009 ; Генные карты : DUX4 ; ОМА : DUX4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	190,185,942 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; monocyte; ; sural nerve; ; left testis; ; muscle of thigh; ; right testis; ; primary visual cortex; ; smooth muscle tissue; ; duodenum; ; apex of heart;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; transcription cis-regulatory region binding; protein binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific double-stranded DNA binding;
Cellular component	nuclear membrane; nucleus; nucleoplasm; nucleolus; cytosol; Golgi apparatus;
Biological process	negative regulation of G0 to G1 transition; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; negative regulation of cell population proliferation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; apoptotic process; transcription by RNA polymerase II; multicellular organism development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	100288687
	н/д
	ENSG00000260596 ; ENSG00000283949
	н/д
	Q9UBX2
	н/д
	НМ_001205218 ; НМ_001278056 ; НМ_001293798 ; НМ_001306068 ; НМ_001363820
	н/д
	НП_001280727 ; НП_001292997 ; НП_001350749
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Двойной гомеобокс 4, также известный как DUX4, представляет собой белок , который у человека кодируется DUX4 геном . ^{[ 3 ]} Его неправильная выраженность является причиной лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии (ЛЛПД).

Ген

Этот ген расположен в массиве макросателлитных повторов D4Z4 в субтеломерной области хромосомы 4q35 . Массив повторов D4Z4 содержит 11-150 повторов D4Z4 в общей популяции; высоко гомологичный массив повторов D4Z4 был идентифицирован на хромосоме 10. Ген состоит из трех экзонов . Экзоны 1 и 2 присутствуют в каждом повторе D4Z4. Присутствует только одна копия экзона 3, теломерная по отношению к массиву повторов D4Z4. ^{[ 4 ]} Открытая рамка считывания (ORF) полностью содержится внутри экзона 1 и содержит два гомеобокса . ^{[ 4 ]} Экзоны 2 и 3 кодируют три основные нетранслируемые области (3'-UTR). ^{[ 4 ]} В некоторых гаплотипах экзон 3 содержит сигнал полиаденилирования . ^{[ 4 ]} Не было никаких доказательств транскрипции из стандартных библиотек кДНК, однако RT-PCR и эксперименты по экспрессии in vitro показывают, что ORF транскрибируется. ^{[ 5 ]}

Массив повторов и ORF консервативны у других млекопитающих.

Структура

Белок DUX4 состоит из 424 аминокислот . ^{[ 4 ]} Два гомеодомена расположены на N-конце . Домен , активирующий транскрипцию (TAD) , и домен, связывающий р300, расположены на С-конце . TAD включает потенциальный TAD из девяти аминокислот (9aaTAD). ^{[ 4 ]}

Два гомеодомена и TAD имеют четко выраженную третичную структуру. ^{[ 4 ]} Предполагается, что область между вторым гомеодоменом и TAD будет неупорядоченной. ^{[ 4 ]}

Транскрипты DUX4 можно сплайсировать для получения мРНК DUX4-S (короткая) или DUX4-FL (полноразмерная). мРНК DUX4-FL кодирует весь белок DUX4. мРНК DUX4-S кодирует частичный белок DUX4, в котором отсутствует домен, активирующий транскрипцию. ^{[ 4 ]}

Функция

Белок DUX4 является активатором транскрипции многих генов, одним из примеров является парный гомеодоменный транскрипционный фактор 1 ( PITX1 ). ^{[ 5 ]} Вероятно, это стимулирует активацию зиготического генома . ^{[ нужна ссылка ]}

Два гомеодомена позволяют белку DUX4 связываться с ДНК. ^{[ 4 ]} С-концевой домен участвует в активации гена-мишени. ^{[ 4 ]}

DUX обычно экспрессируется в семенниках , тимусе и дробления на стадии эмбрионах . ^{[ 6 ]}

Клиническое значение

Несоответствующая экспрессия DUX4 в мышечных клетках является причиной лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии (ЛЛПД). ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Сверхэкспрессия DUX4 из-за транслокаций может вызвать B-клеточный лейкоз . ^{[ 6 ]} Транслокация, объединяющая DUX4 с CIC, может вызвать агрессивный тип саркомы . ^{[ 9 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000283949 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000260596, ENSG00000283949 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Габриэльс Дж., Беккерс М.К., Дин Х., Де Вриз А., Плезанс С., ван дер Маарель С.М. и др. (август 1999 г.). «Нуклеотидная последовательность частично удаленного локуса D4Z4 у пациента с ЛЛПД идентифицирует предполагаемый ген в каждом элементе размером 3,3 т.п.н.». Джин . 236 (1): 25–32. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00267-X . ПМИД 10433963 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Шецль, Т; Кайзер, Л; Дейнер, HP (12 марта 2021 г.). «Лице-лопаточно-плечевая мышечная дистрофия: генетика, активация генов и последующая передача сигналов в отношении последних терапевтических подходов: обновленная информация» . Сиротский журнал редких заболеваний . 16 (1): 129. дои : 10.1186/s13023-021-01760-1 . ПМЦ 7953708 . ПМИД 33712050 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс двойной DUX4, 4» .
^ Jump up to: ^а ^б Ли Дж.К., Боснаковски Д., Тосо Е.А., Динь Т., Банерджи С., Бол Т.Е. и др. (декабрь 2018 г.). «Кристаллическая структура двойного гомеодомена DUX4 в комплексе с ДНК» . Отчеты по ячейкам . 25 (11): 2955–2962.е3. дои : 10.1016/j.celrep.2018.11.060 . ПМК 6463520 . ПМИД 30540931 .
^ Леммерс Р.Дж., ван дер Влит П.Дж., Клоостер Р., Саккони С., Каманьо П., Дауверсе Дж.Г. и др. (сентябрь 2010 г.). «Объединяющая генетическая модель лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии» . Наука . 329 (5999): 1650–3. Бибкод : 2010Sci...329.1650L . дои : 10.1126/science.1189044 . ПМЦ 4677822 . ПМИД 20724583 .
^ Джонс Т.И., Чен Дж.К., Рахимов Ф., Хомма С., Араширо П., Бирманн М.Л. и др. (октябрь 2012 г.). «Семейные исследования экспрессии DUX4 при лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии: доказательства наличия модификаторов заболевания и количественная модель патогенеза» . Молекулярная генетика человека . 21 (20): 4419–30. дои : 10.1093/hmg/dds284 . ПМЦ 3459465 . ПМИД 22798623 .
^ Вонг Д., Ип С. (апрель 2020 г.). «Орёл или решка – появление капикуа (ЦИК) как важного многофункционального опухолевого супрессора» . Журнал патологии . 250 (5): 532–540. дои : 10.1002/путь.5400 . ПМИД 32073140 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000283949 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000260596, ENSG00000283949 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10433963-3] Габриэльс Дж., Беккерс М.К., Дин Х., Де Вриз А., Плезанс С., ван дер Маарель С.М. и др. (август 1999 г.). «Нуклеотидная последовательность частично удаленного локуса D4Z4 у пациента с ЛЛПД идентифицирует предполагаемый ген в каждом элементе размером 3,3 т.п.н.». Джин . 236 (1): 25–32. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00267-X . ПМИД 10433963 .

[Schatzl2021FSHD_Update-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Шецль, Т; Кайзер, Л; Дейнер, HP (12 марта 2021 г.). «Лице-лопаточно-плечевая мышечная дистрофия: генетика, активация генов и последующая передача сигналов в отношении последних терапевтических подходов: обновленная информация» . Сиротский журнал редких заболеваний . 16 (1): 129. дои : 10.1186/s13023-021-01760-1 . ПМЦ 7953708 . ПМИД 33712050 .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс двойной DUX4, 4» .

[Kyba_2018-6] Jump up to: ^а ^б Ли Дж.К., Боснаковски Д., Тосо Е.А., Динь Т., Банерджи С., Бол Т.Е. и др. (декабрь 2018 г.). «Кристаллическая структура двойного гомеодомена DUX4 в комплексе с ДНК» . Отчеты по ячейкам . 25 (11): 2955–2962.е3. дои : 10.1016/j.celrep.2018.11.060 . ПМК 6463520 . ПМИД 30540931 .

[pmid20724583-7] Леммерс Р.Дж., ван дер Влит П.Дж., Клоостер Р., Саккони С., Каманьо П., Дауверсе Дж.Г. и др. (сентябрь 2010 г.). «Объединяющая генетическая модель лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии» . Наука . 329 (5999): 1650–3. Бибкод : 2010Sci...329.1650L . дои : 10.1126/science.1189044 . ПМЦ 4677822 . ПМИД 20724583 .

[pmid22798623-8] Джонс Т.И., Чен Дж.К., Рахимов Ф., Хомма С., Араширо П., Бирманн М.Л. и др. (октябрь 2012 г.). «Семейные исследования экспрессии DUX4 при лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии: доказательства наличия модификаторов заболевания и количественная модель патогенеза» . Молекулярная генетика человека . 21 (20): 4419–30. дои : 10.1093/hmg/dds284 . ПМЦ 3459465 . ПМИД 22798623 .

[pmid32073140-9] Вонг Д., Ип С. (апрель 2020 г.). «Орёл или решка – появление капикуа (ЦИК) как важного многофункционального опухолевого супрессора» . Журнал патологии . 250 (5): 532–540. дои : 10.1002/путь.5400 . ПМИД 32073140 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

CEN	центромерный конец	ТЕЛ.	теломерный конец
коробка для неразрушающего опыта	неудаленный элемент	НЕТ	полиаденилирования сайт
треугольник	D4Z4 повтор	трапеция	частичный повтор D4Z4
белая коробка	ПЛАМ	серые коробки	DUX4 экзоны 1, 2, 3
стрелки
угол	промоутеры	прямой	Транскрипты РНК
черный	смысл	красный	антисмысловой
синий	ДБЭ-Т	тире	сайты для игры в кости