TCF4

TCF4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2KWF
Идентификаторы
Псевдонимы	TCF4 , E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, фактор транскрипции 4, CDG2T
Внешние идентификаторы	Опустить : 602272 ; МГИ : 98506 ; Гомологен : 2407 ; Генные карты : TCF4 ; OMA : TCF4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 18 (human)
End	55,664,787 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	69,689,079 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; skin of hip; ; pericardium; ; entorhinal cortex; ; parietal lobe; ; Achilles tendon; ; postcentral gyrus; ; Brodmann area 23; ; synovial joint; ; ganglionic eminence;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; ganglionic eminence; ; medial ganglionic eminence; ; subiculum; ; ventricular zone; ; barrel cortex; ; lobe of cerebellum; ; dermis; ; internal carotid artery; ; hippocampus proper;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein dimerization activity; protein homodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; bHLH transcription factor binding; E-box binding; protein C-terminus binding; protein binding; identical protein binding; TFIIB-class transcription factor binding; protein heterodimerization activity; DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	transcription regulator complex; nucleus; beta-catenin-TCF complex; beta-catenin-TCF7L2 complex;
Biological process	cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; protein-DNA complex assembly; transcription, DNA-templated; nervous system development; positive regulation of transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, initiation; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of neuron differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6925
	21413
	ENSG00000196628
	ENSMUSG00000053477
	P15884
	Q60722
showНМ_001083962 ; НМ_001243226 ; НМ_001243227 ; НМ_001243228 ; НМ_001243230 ;
	NM_001243231; NM_001243232; NM_001243233; NM_001243234; NM_001243235; NM_001243236; NM_001306207; NM_001306208; NM_003199; NM_001330604; NM_001330605; NM_001348211; NM_001348212; NM_001348213; NM_001348214; NM_001348215; NM_001348216; NM_001348217; NM_001348218; NM_001348219; NM_001348220; NM_001369572; NM_001369573; NM_001369574; NM_001369575; NM_001369576; NM_001369577; NM_001369578; NM_001369579; NM_001369580; NM_001369581; NM_001369582; NM_001369583; NM_001369584; NM_001369585; NM_001369586; NM_001369567; NM_001369568; NM_001369569; NM_001369570; NM_001369571
showНМ_001083967 ; НМ_013685 ; НМ_001361126 ; НМ_001361127 ; НМ_001361128 ;
	NM_001361129
showНП_001077431 ; НП_001230155 ; НП_001230156 ; НП_001230157 ; НП_001230159 ;
	NP_001230160; NP_001230161; NP_001230162; NP_001230163; NP_001230164; NP_001230165; NP_001293136; NP_001293137; NP_001317533; NP_001317534; NP_003190; NP_001335140; NP_001335141; NP_001335142; NP_001335143; NP_001335144; NP_001335145; NP_001335146; NP_001335147; NP_001335148; NP_001335149; NP_001356501; NP_001356502; NP_001356503; NP_001356504; NP_001356505; NP_001356506; NP_001356507; NP_001356508; NP_001356509; NP_001356510; NP_001356511; NP_001356512; NP_001356513; NP_001356514; NP_001356515; NP_001356496; NP_001356497; NP_001356498; NP_001356499; NP_001356500
showНП_001077436 ; НП_038713 ; НП_001348055 ; НП_001348056 ; НП_001348057 ;
	NP_001348058
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции 4 (TCF-4), также известный как фактор транскрипции иммуноглобулина 2 (ITF-2), представляет собой белок , который у человека кодируется геном TCF4, расположенным на хромосоме 18q 21.2. ^[5]

Функция

Белки TCF4 действуют как факторы транскрипции , которые связываются с мотивом энхансера иммуноглобулина mu-E5/каппа-E2. TCF4 активирует транскрипцию путем связывания с E-боксом (5'-CANNTG-3'), который обычно находится на SSTR2 -INR или элементе-инициаторе рецептора 2 соматостатина. TCF4 в первую очередь участвует в неврологическом развитии плода во время беременности, инициируя нервную дифференцировку путем связывания с ДНК. Он обнаруживается в центральной нервной системе, сомитах и гонадном гребне на ранних стадиях развития. На более позднем этапе развития он будет обнаружен в щитовидной железе, тимусе и почках, тогда как во взрослом возрасте TCF4 обнаруживается в лимфоцитах , мышцах, зрелых нейронах и желудочно-кишечной системе. ^[6]^[7]^[8]

Клиническое значение

Мутации в TCF4 вызывают синдром Питта-Хопкинса (PTHS). Эти мутации приводят к тому, что белки TCF4 не связываются должным образом с ДНК и не контролируют дифференцировку нервной системы. Было высказано предположение, что потеря функции TCF4 приводит к снижению передачи сигналов Wnt и, следовательно, к снижению пролиферации нейрональных предшественников. ^[9] В большинстве изученных случаев мутации возникли de novo , то есть это была новая мутация, не обнаруженная у других членов семьи пациента. Общие симптомы синдрома Питта-Хопкинса включают широкий рот, проблемы с желудочно-кишечным трактом, задержку развития мелкой моторики, проблемы с речью и дыханием, эпилепсию и другие дефекты головного мозга. ^[10]^[11]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196628 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053477 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хентхорн П., МакКэррик-Уолмсли Р., Кадеш Т. (февраль 1990 г.). «Последовательность кДНК, кодирующей ITF-2, фактор транскрипции положительного действия» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (3): 678. doi : 10.1093/nar/18.3.678 . ПМК 333500 . ПМИД 2308860 .
^ де Понтуаль Л., Матье И., Гольцио С., Рио М., Малан В., Боддарт Н. и др. (апрель 2009 г.). «Мутационные, функциональные и экспрессионные исследования гена TCF4 при синдроме Питта-Хопкинса» . Человеческая мутация . 30 (4): 669–676. дои : 10.1002/humu.20935 . ПМИД 19235238 . S2CID 25375730 .
^ Пшерер А, Дорфлингер У, Кирфель Дж, Гавлас К, Рюшофф Дж, Бюттнер Р, Шюле Р (декабрь 1996 г.). «Фактор транскрипции спираль-петля-спираль SEF-2 регулирует активность нового инициирующего элемента в промоторе гена рецептора II соматостатина человека» . Журнал ЭМБО . 15 (23): 6680–6690. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x . ПМК 452492 . ПМИД 8978694 .
^ Д'Розарио М., Чжан Т., Уодделл Э.А., Чжан Ю., Шахин С., Шарони М. и др. (апрель 2016 г.). «Белки bHLH типа I без дочерних клеток и Tcf4 ограничивают ветвление нейритов и образование синапсов путем репрессии нейрексина в постмитотических нейронах» . Отчеты по ячейкам . 15 (2): 386–397. дои : 10.1016/j.celrep.2016.03.034 . ПМЦ 4946342 . ПМИД 27050508 .
^ Папес Ф., Камарго А.П., де Соуза Ж.С., Карвальо В.М., Сето Р.А., Ламонтань Э. и др. (май 2022 г.). «Потеря функции фактора транскрипции 4 связана с дефицитом пролиферации предшественников и содержания корковых нейронов» . Природные коммуникации . 13 (1): 2387. doi : 10.1038/s41467-022-29942-w . ПМК 9061776 . ПМИД 35501322 .
^ Амиэль Дж., Рио М., де Понтуаль Л., Редон Р., Малан В., Боддарт Н. и др. (май 2007 г.). «Мутации в TCF4, кодирующем базовый фактор транскрипции спираль-петля-спираль класса I, ответственны за синдром Питта-Хопкинса, тяжелую эпилептическую энцефалопатию, связанную с вегетативной дисфункцией» . Американский журнал генетики человека . 80 (5): 988–993. дои : 10.1086/515582 . ПМЦ 1852736 . ПМИД 17436254 .
^ Цвайер С., Пейппо М.М., Хойер Дж., Соуза С., Боттани А., Клейтон-Смит Дж. и др. (май 2007 г.). «Гаплонедостаточность TCF4 вызывает синдромальную умственную отсталость с перемежающейся гипервентиляцией (синдром Питта-Хопкинса)» . Американский журнал генетики человека . 80 (5): 994–1001. дои : 10.1086/515583 . ПМЦ 1852727 . ПМИД 17436255 .

Дальнейшее чтение

Хербст А., Хелферих С., Беренс А., Гёке Б., Коллигс Ф.Т. (октябрь 2009 г.). «Транскрипционный фактор ITF-2A индуцирует остановку клеточного цикла через p21 (Cip1)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 387 (4): 736–740. дои : 10.1016/j.bbrc.2009.07.102 . ПМИД 19635457 .
Сиссе Б., Катон М.Л., Ленер М., Маэда Т., Шой С., Локсли Р. и др. (октябрь 2008 г.). «Фактор транскрипции E2-2 является важным и специфическим регулятором развития плазмацитоидных дендритных клеток» . Клетка . 135 (1): 37–48. дои : 10.1016/j.cell.2008.09.016 . ПМК 2631034 . ПМИД 18854153 .
Бэйн Дж., Мурре С. (апрель 1998 г.). «Роль Е-белков в развитии В- и Т-лимфоцитов». Семинары по иммунологии . 10 (2): 143–153. дои : 10.1006/smim.1998.0116 . ПМИД 9618760 .
Йергес Л.М., Клей Л., Коли Дж.А., Родер К., Каммерер С.М., Моффетт С.П. и др. (декабрь 2009 г.). «Исследование ассоциаций высокой плотности 383 генов-кандидатов для определения объемной МПК шейки бедра и поясничного отдела позвоночника среди пожилых мужчин» . Журнал исследований костей и минералов . 24 (12): 2039–2049. дои : 10.1359/jbmr.090524 . ПМК 2791518 . ПМИД 19453261 .
Перселл С.М., Рэй Н.Р., Стоун Дж.Л., Вишер П.М., О'Донован М.К., Салливан П.Ф., Склар П. (август 2009 г.). «Общая полигенная изменчивость способствует риску развития шизофрении и биполярного расстройства» . Природа . 460 (7256): 748–752. Бибкод : 2009Natur.460..748P . дои : 10.1038/nature08185 . ПМЦ 3912837 . ПМИД 19571811 .
Калшойер В.М., Фенстра И., Ван Равенсваайдж-Артс СМ, Смитс Д.Ф., Мензель С., Ульманн Р. и др. (август 2008 г.). «Нарушение гена TCF4 у девочки с умственной отсталостью, но без классического синдрома Питта-Хопкинса». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 146А (16): 2053–2059. дои : 10.1002/ajmg.a.32419 . ПМИД 18627065 . S2CID 205309738 .
Хербст А., Боммер Г.Т., Кригл Л., Юнг А., Беренс А., Чанади Э. и др. (август 2009 г.). «ITF-2 разрушается из-за аллельной потери хромосомы 18q21, а экспрессия ITF-2B теряется при переходе аденома-карцинома». Гастроэнтерология . 137 (2): 639–48, 648.e1–9. дои : 10.1053/j.gastro.2009.04.049 . ПМИД 19394332 .
Нагасава М., Шмидлин Х., Хазекамп М.Г., Шотте Р., Блом Б. (сентябрь 2008 г.). «Развитие плазмоцитоидных дендритных клеток человека зависит от совместного действия основного фактора спираль-петля-спираль E2-2 и фактора Ets Spi-B». Европейский журнал иммунологии . 38 (9): 2389–2400. дои : 10.1002/eji.200838470 . ПМИД 18792017 . S2CID 205784742 .
Розенфельд Дж.А., Леппиг К., Баллиф BC, Тиз Х., Эрди-Лалена С., Боул Э. и др. (ноябрь 2009 г.). «Анализ генотипа-фенотипа мутаций TCF4, вызывающих синдром Питта-Хопкинса, показывает повышенную судорожную активность при миссенс-мутациях» . Генетика в медицине . 11 (11): 797–805. дои : 10.1097/GIM.0b013e3181bd38a9 . ПМИД 19938247 .
Стефанссон Х., Офофф Р.А., Стейнберг С., Андреассен О.А., Цишон С., Руеску Д. и др. (август 2009 г.). «Распространенные варианты, повышающие риск шизофрении» . Природа . 460 (7256): 744–747. Бибкод : 2009Natur.460..744S . дои : 10.1038/nature08186 . ПМК 3077530 . ПМИД 19571808 .

Внешние ссылки

TCF4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук TCF4

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 18 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196628 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053477 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2308860-5] Хентхорн П., МакКэррик-Уолмсли Р., Кадеш Т. (февраль 1990 г.). «Последовательность кДНК, кодирующей ITF-2, фактор транскрипции положительного действия» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (3): 678. doi : 10.1093/nar/18.3.678 . ПМК 333500 . ПМИД 2308860 .

[pmid19235238-6] де Понтуаль Л., Матье И., Гольцио С., Рио М., Малан В., Боддарт Н. и др. (апрель 2009 г.). «Мутационные, функциональные и экспрессионные исследования гена TCF4 при синдроме Питта-Хопкинса» . Человеческая мутация . 30 (4): 669–676. дои : 10.1002/humu.20935 . ПМИД 19235238 . S2CID 25375730 .

[pmid8978694-7] Пшерер А, Дорфлингер У, Кирфель Дж, Гавлас К, Рюшофф Дж, Бюттнер Р, Шюле Р (декабрь 1996 г.). «Фактор транскрипции спираль-петля-спираль SEF-2 регулирует активность нового инициирующего элемента в промоторе гена рецептора II соматостатина человека» . Журнал ЭМБО . 15 (23): 6680–6690. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x . ПМК 452492 . ПМИД 8978694 .

[8] Д'Розарио М., Чжан Т., Уодделл Э.А., Чжан Ю., Шахин С., Шарони М. и др. (апрель 2016 г.). «Белки bHLH типа I без дочерних клеток и Tcf4 ограничивают ветвление нейритов и образование синапсов путем репрессии нейрексина в постмитотических нейронах» . Отчеты по ячейкам . 15 (2): 386–397. дои : 10.1016/j.celrep.2016.03.034 . ПМЦ 4946342 . ПМИД 27050508 .

[9] Папес Ф., Камарго А.П., де Соуза Ж.С., Карвальо В.М., Сето Р.А., Ламонтань Э. и др. (май 2022 г.). «Потеря функции фактора транскрипции 4 связана с дефицитом пролиферации предшественников и содержания корковых нейронов» . Природные коммуникации . 13 (1): 2387. doi : 10.1038/s41467-022-29942-w . ПМК 9061776 . ПМИД 35501322 .

[pmid17436254-10] Амиэль Дж., Рио М., де Понтуаль Л., Редон Р., Малан В., Боддарт Н. и др. (май 2007 г.). «Мутации в TCF4, кодирующем базовый фактор транскрипции спираль-петля-спираль класса I, ответственны за синдром Питта-Хопкинса, тяжелую эпилептическую энцефалопатию, связанную с вегетативной дисфункцией» . Американский журнал генетики человека . 80 (5): 988–993. дои : 10.1086/515582 . ПМЦ 1852736 . ПМИД 17436254 .

[pmid17436255-11] Цвайер С., Пейппо М.М., Хойер Дж., Соуза С., Боттани А., Клейтон-Смит Дж. и др. (май 2007 г.). «Гаплонедостаточность TCF4 вызывает синдромальную умственную отсталость с перемежающейся гипервентиляцией (синдром Питта-Хопкинса)» . Американский журнал генетики человека . 80 (5): 994–1001. дои : 10.1086/515583 . ПМЦ 1852727 . ПМИД 17436255 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]