НОХB1

НОХB1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1B72
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXB1 , HCFP3, HOX2, HOX2I, Hox-2.9, гомеобокс B1
Внешние идентификаторы	Опустить : 142968 ; МГИ : 96182 ; Гомологен : 1615 ; Генные карты : HOXB1 ; OMA : HOXB1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	48,531,011 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	96,259,082 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	kidney; ; gonad; ; human kidney; ; renal cortex; ; cervix; ; uterine tube; ; urinary bladder; ; right uterine tube; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; zone of skin;
	Top expressed in
	primitive streak; ; tail of embryo; ; embryo; ; Ileal epithelium; ; embryonic organizer; ; embryo; ; somite; ; neuromere; ; rhombomere; ; pharynx;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; protein domain specific binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	multicellular organism development; pattern specification process; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; anatomical structure morphogenesis; anterior/posterior pattern specification; rhombomere development; rhombomere 4 development; rhombomere 5 development; facial nerve structural organization; facial nucleus development; anatomical structure formation involved in morphogenesis; embryonic skeletal system morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3211
	15407
	ENSG00000120094
	ENSMUSG00000018973
	P14653
	P17919
	НМ_002144
	НМ_008266
	НП_002135
	НП_032292
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-B1 — это белок , который у человека кодируется HOXB1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов гомеобокса. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство транскрипционных факторов, играющих важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя сходными кластерами гомеобоксных генов: HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, расположенными на разных хромосомах и состоящими из 9–11 генов, расположенных тандемно. Этот ген является одним из нескольких гомеобоксных генов HOXB, расположенных в кластере на 17-й хромосоме. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что HOXB1 взаимодействует с PBX1 . ^[8]^[9]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120094 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018973 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гомеобокс HOXB1 B1» .
^ Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . ЭМБО Дж . 17 (5): 1434–45. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .
^ Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–97. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД 10052460 . S2CID 16122785 .

Дальнейшее чтение

Акампора Д, Д'Эспозито М, Файелла А, Паннесе М, Мильяччо Е, Морелли Ф, Сторнаиуоло А, Нигро В, Симеоне А, Бончинелли Э (1989). «Семейство генов HOX человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (24): 10385–402. дои : 10.1093/нар/17.24.10385 . ПМК 335308 . ПМИД 2574852 .
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1989). «Организация генов гомеобокса I класса человека». Геном . 31 (2): 745–56. дои : 10.1139/g89-133 . ПМИД 2576652 .
Гуацци С., Лонигро Р., Пинтонелло Л., Бончинелли Э., Ди Лауро Р., Мавилио Ф. (1994). «Ген фактора транскрипции щитовидной железы-1 является кандидатом на мишень для регуляции с помощью Hox-белков» . ЭМБО Дж . 13 (14): 3339–47. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06636.x . ПМЦ 395231 . ПМИД 7913891 .
Миано Дж.М., Фирулли А.Б., Олсон Э.Н., Хара П., Джачелли С.М., Шварц С.М. (1996). «Ограниченная экспрессия генов гомеобокса отличает гладкомышечные клетки плода от взрослых человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (2): 900–5. Бибкод : 1996ПНАС...93..900М . дои : 10.1073/pnas.93.2.900 . ПМК 40155 . ПМИД 8570656 .
Апиу Ф, Флагиелло Д, Чилло С, Малфой Б, Пупон МФ, Дютрилья Б (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенет. Клеточная генетика . 73 (1–2): 114–5. дои : 10.1159/000134320 . ПМИД 8646877 .
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (1998). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . ЭМБО Дж . 17 (5): 1434–45. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .
Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (1999). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–97. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД 10052460 . S2CID 16122785 .
Юнгблут С., Белл Э., Ламсден А. (1999). «Спецификация различных идентичностей двигательных нейронов с помощью уникальной активности отдельных Hox-генов» . Разработка . 126 (12): 2751–8. дои : 10.1242/dev.126.12.2751 . ПМИД 10331985 .
Джейкобс Ю., Шнабель К.А., Клири М.Л. (1999). «Тримерная ассоциация гомеодоменовых белков Hox и TALE опосредует активность энхансера заднего мозга Hoxb2» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 5134–42. дои : 10.1128/mcb.19.7.5134 . ПМЦ 84356 . ПМИД 10373562 .
Файелла А., Зортеа М., Барбария Е., Альбани Ф., Капра В., Кама А., Бончинелли Е. (1998). «Генетический полиморфизм в гомеобоксном гене человека HOXB1, подразумевающий тандемный повтор длиной 9 п.н. в аминоконцевой кодирующей области. Кратко о мутациях № 200. Онлайн». Хм. Мутат . 12 (5): 363. PMID 10671062 .
Миккола И., Бруун Дж.А., Холм Т., Йохансен Т. (2001). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из парных сайтов связывания доменов путем независимого от ДНК рекрутирования различных гомеодоменовых белков» . Ж. Биол. Хим . 276 (6): 4109–18. дои : 10.1074/jbc.M008882200 . ПМИД 11069920 .
Ингрэм Дж.Л., Стодджелл С.Дж., Хайман С.Л., Фиглевич Д.А., Вейткамп Л.Р., Родье П.М. (2000). «Открытие аллельных вариантов HOXA1 и HOXB1: генетическая предрасположенность к расстройствам аутистического спектра» . Тератология . 62 (6): 393–405. doi : 10.1002/1096-9926(200012)62:6<393::AID-TERA6>3.0.CO;2-V . ПМИД 11091361 .
Ди Рокко Г., Гавалас А., Попперл Х., Крумлауф Р., Мавилио Ф., Заппавинья В. (2001). «Привлечение комплексов SOX/OCT и дифференциальная активность HOXA1 и HOXB1 модулируют функцию энхансера авторегуляции Hoxb1» . Ж. Биол. Хим . 276 (23): 20506–15. дои : 10.1074/jbc.M011175200 . HDL : 11380/303345 . ПМИД 11278854 .
Ли Дж., Табор Х.К., Нгуен Л., Глисон С., Лотспейх Л.Дж., Спайкер Д., Риш Н., Майерс Р.М. (2002). «Отсутствие связи между вариантами генов HoxA1 и HoxB1 и аутизмом в 110 мультиплексных семьях». Являюсь. Дж. Мед. Жене . 114 (1): 24–30. дои : 10.1002/ajmg.1618 . ПМИД 11840501 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (2002). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Фоньяни С., Килструп-Нильсен С., Бертельсен Дж., Ферретти Е., Заппавинья В., Блази Ф. (2002). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство гомеодоменных транскрипционных факторов MEINOX TALE» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (9): 2043–51. дои : 10.1093/нар/30.9.2043 . ПМЦ 113854 . ПМИД 11972344 .
Субраманиам Н., Кампион Дж., Рафтер И., Окрет С. (2003). «Перекрестные помехи между сигналами глюкокортикоида и ретиноевой кислоты, включающие взаимодействие глюкокортикоидного рецептора с гомеодоменным белком Pbx1» . Биохим. Дж . 370 (Часть 3): 1087–95. дои : 10.1042/BJ20020471 . ПМЦ 1223238 . ПМИД 12487626 .

Внешние ссылки

HOXB1+белок,+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P14653 (белок Homeobox Hox-B1) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120094 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018973 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (август 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт член парламента (декабрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: гомеобокс HOXB1 B1» .

[pmid9482740-8] Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . ЭМБО Дж . 17 (5): 1434–45. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .

[pmid10052460-9] Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–97. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД 10052460 . S2CID 16122785 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]