РУНХ3

РУНХ3
Идентификаторы
Псевдонимы	RUNX3 , AML2, CBFA3, PEBP2aC, фактор транскрипции 3, связанный с рантом, фактор транскрипции 3 семейства RUNX
Внешние идентификаторы	Опустить : 600210 ; МГИ : 102672 ; Гомологен : 37914 ; Генные карты : RUNX3 ; OMA : RUNX3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	24,965,121 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	134,905,301 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; buccal mucosa cell; ; lymph node; ; blood; ; appendix; ; mononuclear cell; ; tibia; ; spleen; ; monocyte; ; bone marrow cells;
	Top expressed in
	membranous bone; ; Dermatocranium; ; mandible; ; spleen; ; mesenteric lymph nodes; ; clavicle; ; blood; ; tongue; ; urethra; ; maxilla;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; protein binding; ATP binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleolus; intracellular membrane-bounded organelle; nucleoplasm; cytosol; core-binding factor complex;
Biological process	peripheral nervous system neuron development; regulation of transcription, DNA-templated; chondrocyte differentiation; ossification; regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell cycle; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; protein phosphorylation; negative regulation of epithelial cell proliferation; regulation of cell differentiation; response to transforming growth factor beta; hemopoiesis; negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; neuron differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	864
	12399
	ENSG00000020633
	ENSMUSG00000070691
	Q13761
	Q3U1Q3
	НМ_001031680 ; НМ_004350 ; НМ_001320672
	НМ_019732 ; НМ_001369050
	НП_001026850 ; НП_001307601 ; НП_004341
	НП_062706 ; НП_001355979
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор 3, связанный с Runt, представляет собой белок , который у человека кодируется RUNX3 геном . ^[5]

Функция

Этот ген кодирует член семейства факторов транскрипции, содержащего домен runt . Гетеродимер этого белка и бета-субъединица образуют комплекс, который связывается с основной последовательностью ДНК 5'-YGYGGT-3', обнаруженной в ряде энхансеров и промоторов. ^[6] и может либо активировать, либо подавлять транскрипцию. Он также взаимодействует с другими факторами транскрипции. Он действует как супрессор опухоли, и при раке этот ген часто удаляется или транскрипционно подавляется. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. ^[7]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена RUNX3 может регулироваться MITF . ^[8]

RUNX3 играет фундаментальную роль в защите от раннего образования опухолей. В ответ на факторы роста RUNX3 ацетилируется с помощью p300 с образованием комплекса с белком 2, содержащим бромодомен (BRD2; член семейства корегуляторов транскрипции BET). ^[9] и последующей временной индукции CDKN1A и ARF. ^[10] CDKN1A (также известный как CIP1 или p21) ингибирует клеточный цикл, а ARF ингибирует MDM2, повышая стабильность гена p53, подавляющего рак. ^[10]

Экспрессия CDKN1A и ARF в клеточных циклах дикого типа является временной, что является результатом RUNX3 замены комплекса -BRD2 комплекса RUNX3 -cyclinD1. Однако онкогенные сигналы митогенов, такие как KRAS ^G12D вызывают RUNX3 постоянное поддержание комплекса -BRD2, что приводит к непрерывной экспрессии p21, ARF и p53. Следовательно, RUNX3 может функционировать как сенсор нерегулируемых митогенных сигналов, а его инактивация может в конечном итоге привести к раку из-за потери сенсорной функции. ^[10]

Нокаутирующая мышь

Runx3 Слизистая оболочка желудка мыши с нулевым демонстрирует гиперплазию вследствие стимулированной пролиферации и подавления апоптоза в эпителиальных клетках, и клетки устойчивы к стимуляции TGF-бета. ^[11]

Споры и разрешение RUNX3

В 2011 году были высказаны сомнения относительно функции Runx3 по супрессированию опухолей, возникшей из более ранней публикации Ли и его коллег. ^[12] На основании оригинального исследования Ли и соавторов (2002), в большинстве более поздних публикаций, цитирующих Ли и соавторов (2002), предполагалось, что RUNX3 экспрессируется в нормальном эпителии кишечника и, следовательно, может действовать как супрессор опухоли при конкретном исследуемом эпителиальном раке. В большей части этой литературы статус метилирования промотора RUNX3 при различных видах рака использовался в качестве показателя его экспрессии. Однако известно, что довольно много генов метилированы в геномах опухолевых клеток, и большинство этих генов не экспрессируются в нормальной ткани, вызывающей эти виды рака. Другие использовали плохо охарактеризованные (или полностью признанные недействительными) антитела для обнаружения белка RUNX3 или использовали RT-PCR или проверенные антитела и не смогли обнаружить RUNX3 в эпителии кишечника, но все же не поставили под сомнение первоначальное открытие Ли и соавторов (2002). . Эти факты недавно обсуждались в книге Юло Майвяли. ^[13]

В конце 2009 года отчет, написанный Косеи Ито и его коллегами, разрешил противоречие, подтвердив, что RUNX3 действительно экспрессируется в эпителии желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) человека и мыши и действует как супрессор опухоли в тканях желудка и толстой кишки. ^[14] Авторы статьи предположили, что предыдущее противоречивое сообщение могло быть вызвано использованием специфического антитела, известного как G-поли. Ито и его команда создали множество моноклональных антител против RUNX3 , распознающих N-концевую область RUNX3 (остатки 1-234). Исследователи обнаружили, что антитела реагируют с RUNX3 в эпителиальных клетках желудка, тогда как антитела, распознающие С-концевую область, этого не делают. G-poly в первую очередь распознает область за пределами 234 и, следовательно, не может обнаружить Runx3 в этой ткани.

Взаимодействия

Было показано, что RUNX3 взаимодействует с TLE1 . ^[15]

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000020633 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070691 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Леванон Д., Негреану В., Бернштейн Ю., Бар-Ам И., Авиви Л., Гронер Ю. (сентябрь 1994 г.). «AML1, AML2 и AML3, человеческие члены семейства генов домена коротышки: структура кДНК, экспрессия и хромосомная локализация». Геномика . 23 (2): 425–432. дои : 10.1006/geno.1994.1519 . ПМИД 7835892 .
^ Леванон Д., Эйзенштейн М., Гронер Ю. (апрель 1998 г.). «Сайт-направленный мутагенез поддерживает трехмерную модель короткого домена». Журнал молекулярной биологии . 277 (3): 509–512. дои : 10.1006/jmbi.1998.1633 . ПМИД 9533875 . S2CID 13139512 .
^ «Ген Энтреза: фактор транскрипции 3, связанный с RUNX3» .
^ Хук К.С., Шлегель Н.К., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О. и др. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–676. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 .
^ Ли Ю.С., Ли Дж.В., Чан Дж.В., Чи XZ, Ким Дж.Х., Ли Ю.Х. и др. (ноябрь 2013 г.). «Инактивация Runx3 является решающим ранним событием в развитии аденокарциномы легких» . Раковая клетка . 24 (5): 603–616. дои : 10.1016/j.ccr.2013.10.003 . ПМИД 24229708 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ли Дж.В., Ким Д.М., Чан Дж.В., Пак Т.Г., Сон Ш., Ли Ю.С. и др. (апрель 2019 г.). «RUNX3 регулирует зависимую от клеточного цикла динамику хроматина, действуя в качестве пионерского фактора точки рестрикции» . Природные коммуникации . 10 (1): 1897. Бибкод : 2019NatCo..10.1897L . дои : 10.1038/s41467-019-09810-w . ПМК 6479060 . ПМИД 31015486 .
^ Ли К.Л., Ито К., Сакакура С., Фукамати Х., Иноуэ К., Чи XZ и др. (апрель 2002 г.). «Причинно-следственная связь между потерей экспрессии RUNX3 и раком желудка» . Клетка . 109 (1): 113–124. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00690-6 . ПМИД 11955451 . S2CID 11362226 .
^ Леванон Д., Бернштейн Ю., Негреану В., Боун К.Р., Познер А., Эйлам Р. и др. (октябрь 2011 г.). «Отсутствие экспрессии Runx3 в нормальном эпителии желудочно-кишечного тракта ставит под сомнение его функцию супрессора опухолей» . ЭМБО Молекулярная медицина . 3 (10): 593–604. дои : 10.1002/emmm.201100168 . ПМЦ 3258485 . ПМИД 21786422 .
^ Майвяли Ю (2015). Интерпретация биомедицинской науки . Академическая пресса. стр. 44–45. ISBN 9780124186897 .
^ Ито К., Иноуэ К.И., Бэ С.К., Ито Й. (март 2009 г.). «Экспрессия Runx3 в эпителии желудочно-кишечного тракта: разрешение спора». Онкоген . 28 (10): 1379–1384. дои : 10.1038/onc.2008.496 . ПМИД 19169278 .
^ Леванон Д., Гольдштейн Р.Э., Бернштейн Ю., Тан Х., Гольденберг Д., Стифани С. и др. (сентябрь 1998 г.). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE/Groucho» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11590–11595. Бибкод : 1998PNAS...9511590L . дои : 10.1073/pnas.95.20.11590 . ПМК 21685 . ПМИД 9751710 .

Дальнейшее чтение

Воджиаци П., Де Фалько Дж., Клаудио П.П., Джордано А. (апрель 2006 г.). «Как человеческий ген RUNX3 индуцирует апоптоз при раке желудка? Последние данные, размышления и реакции» . Биология и терапия рака . 5 (4): 371–374. дои : 10.4161/cbt.5.4.2748 . ПМИД 16627973 .
Вейменга С., Спек Н.А., Дракополи Н.К., Хофкер М.Х., Лю П., Коллинз Ф.С. (апрель 1995 г.). «Идентификация нового мышиного гена, содержащего домен коротышки, Cbfa3, и локализация человеческого гомолога, CBFA3, на хромосоме 1p35-pter» . Геномика . 26 (3): 611–614. дои : 10.1016/0888-7543(95)80185-О . ПМИД 7607690 .
Бае С.К., Такахаши Э., Чжан Ю.В., Огава Э., Шигесада К., Намба Ю. и др. (июль 1995 г.). «Клонирование, картирование и экспрессия PEBP2 альфа C, третьего гена, кодирующего домен Runt млекопитающих». Джин . 159 (2): 245–248. дои : 10.1016/0378-1119(95)00060-J . ПМИД 7622058 .
Бае С.К., Ямагути-Иваи Ю., Огава Э., Маруяма М., Инузука М., Кагошима Х. и др. (март 1993 г.). «Выделение кДНК PEBP2 альфа B, представляющей мышиный гомолог гена острого миелоидного лейкоза человека, AML1». Онкоген . 8 (3): 809–814. ПМИД 8437866 .
Леванон Д., Гольдштейн Р.Э., Бернштейн Ю., Тан Х., Гольденберг Д., Стифани С. и др. (сентябрь 1998 г.). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE/Groucho» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11590–11595. Бибкод : 1998PNAS...9511590L . дои : 10.1073/pnas.95.20.11590 . ПМК 21685 . ПМИД 9751710 .
Бангсоу С., Рубинс Н., Глусман Г., Бернштейн Ю., Негреану В., Гольденберг Д. и др. (ноябрь 2001 г.). «Ген RUNX3 - последовательность, структура и регулируемая экспрессия». Джин . 279 (2): 221–232. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00760-0 . ПМИД 11733147 .
Ваки Т., Тамура Г., Сато М., Терашима М., Нисидзука С., Мотояма Т. (апрель 2003 г.). «Статус промотора метилирования генов DAP-киназы и RUNX3 в неопластическом и неопухолевом эпителии желудка» . Раковая наука . 94 (4): 360–364. дои : 10.1111/j.1349-7006.2003.tb01447.x . ПМК 11160204 . ПМИД 12824905 . S2CID 22030810 .
Пуиг-Крегер А., Санчес-Эльснер Т., Руис Н., Андреу Э.Дж., Проспер Ф., Йенсен У.Б. и др. (ноябрь 2003 г.). «Факторы RUNX/AML и C/EBP регулируют экспрессию интегрина CD11a в миелоидных клетках посредством перекрывающихся регуляторных элементов» . Кровь . 102 (9): 3252–3261. дои : 10.1182/кровь-2003-02-0618 . hdl : 10171/18733 . ПМИД 12855590 .
Като Н., Тамура Г., Фукасе М., Сибуя Х., Мотояма Т. (август 2003 г.). «Гиперметилирование промотора гена RUNX3 при опухоли яичка желточного мешка младенцев» . Американский журнал патологии . 163 (2): 387–391. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63668-1 . ПМЦ 1868235 . ПМИД 12875960 .
Ян Н., Чжан Л., Чжан Ю, Казазян Х.Х. (август 2003 г.). «Важная роль RUNX3 в транскрипции и ретротранспозиции L1 человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (16): 4929–4940. дои : 10.1093/нар/gkg663 . ПМК 169909 . ПМИД 12907736 .
Ли К.Л., Ким Х.Р., Ким В.Дж., Чой Дж.К., Ли Ю.Х., Ким Х.М. и др. (январь 2004 г.). «Транскрипционное молчание гена RUNX3 за счет гиперметилирования CpG связано с раком легких». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 314 (1): 223–228. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.12.079 . ПМИД 14715269 .
Сяо WH, Лю WW (февраль 2004 г.). «Гемизиготная делеция и гиперметилирование гена RUNX3 при гепатоцеллюлярной карциноме» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 10 (3): 376–380. дои : 10.3748/wjg.v10.i3.376 . ПМЦ 4724901 . ПМИД 14760761 .
Осимо Ю., Оуэ Н., Митани Ю., Накаяма Х., Китадай Ю., Ёсида К. и др. (2004). «Частая потеря экспрессии RUNX3 из-за гиперметилирования промотора при раке желудка». Патобиология . 71 (3): 137–143. дои : 10.1159/000076468 . ПМИД 15051926 . S2CID 25618007 .
Джин Й.Х., Чон Э.Дж., Ли К.Л., Ли Й.Х., Чхве Дж.К., Ким В.Дж. и др. (июль 2004 г.). «Трансформирующий фактор роста-бета стимулирует p300-зависимое ацетилирование RUNX3, которое ингибирует деградацию, опосредованную убиквитинированием» . Журнал биологической химии . 279 (28): 29409–29417. дои : 10.1074/jbc.M313120200 . ПМИД 15138260 .
Ку Дж.Л., Кан С.Б., Шин Ю.К., Кан Х.К., Хонг Ш., Ким И.Дж. и др. (сентябрь 2004 г.). «Гиперметилирование промотора подавляет экспрессию гена RUNX3 в клеточных линиях колоректального рака». Онкоген . 23 (40): 6736–6742. дои : 10.1038/sj.onc.1207731 . ПМИД 15273736 . S2CID 28548483 .
Сакакура С., Хагивара А., Миягава К., Накашима С., Ёсикава Т., Кин С. и др. (январь 2005 г.). «Частое подавление факторов транскрипции домена runt RUNX1, RUNX3 и их кофактора CBFB при раке желудка» . Международный журнал рака . 113 (2): 221–228. дои : 10.1002/ijc.20551 . ПМИД 15386419 . S2CID 34944735 .