НОХА3

НОХА3
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXA3 , HOX1, HOX1E, гомеобокс А3
Внешние идентификаторы	Опустить : 142954 ; МГИ : 96175 ; Гомологен : 40725 ; Генные карты : HOXA3 ; OMA : HOXA3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	27,152,581 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	52,190,316 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	caput epididymis; ; corpus epididymis; ; right uterine tube; ; left uterine tube; ; parietal pleura; ; renal medulla; ; tibia; ; Descending thoracic aorta; ; visceral pleura; ; gastric mucosa;
	Top expressed in
	ascending aorta; ; aortic valve; ; tail of embryo; ; tunica albuginea of testis; ; thoracic vertebral column; ; thyroid gland; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; genital tubercle; ; rete testis; ; left lung lobe;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; HMG box domain binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus;
Biological process	embryonic skeletal system morphogenesis; glossopharyngeal nerve morphogenesis; regulation of transcription, DNA-templated; thymus development; transcription, DNA-templated; embryonic skeletal system development; multicellular organism development; animal organ formation; blood vessel remodeling; thyroid gland development; cartilage development; parathyroid gland development; angiogenesis; positive regulation of cell population proliferation; animal organ morphogenesis; specification of animal organ position; anterior/posterior pattern specification; regulation of transcription by RNA polymerase II; calcium ion transport; gene expression; magnesium ion homeostasis; bone mineralization; negative regulation of calcium ion transport; phosphate ion homeostasis; calcium ion homeostasis; positive regulation of receptor binding; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3200
	15400
	ENSG00000105997
	ENSMUSG00000079560
	О43365
	P02831
	НМ_030661 ; НМ_153631 ; НМ_153632
	НМ_010452
	НП_109377 ; НП_705895
	НП_034582
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-A3 — это белок , который у человека кодируется HOXA3 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

У позвоночных гены, кодирующие класс транскрипционных факторов , называемых гомеобоксными генами, обнаружены в кластерах под названиями A, B, C и D на четырех отдельных хромосомах . Экспрессия этих белков пространственно и временно регулируется во время эмбрионального развития . Этот ген является частью кластера А на хромосоме 7 и кодирует ДНК-связывающий фактор транскрипции, который может регулировать экспрессию генов , морфогенез и дифференцировку. Для этого гена обнаружено три варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы. ^[7]

Во время нормального развития плода HoxA3 экспрессируется в мезенхимальных клетках нервного гребня и энтодермальных клетках, обнаруживаемых в третьем глоточном мешке . ^[8] Экспрессия HoxA3 в этих клетках влияет на правильное формирование тимуса , щитовидной и паращитовидных органов . ^[9]^[10] Хотя этот ген, по-видимому, не влияет на пролиферацию или миграцию клеток нервного гребня глотки, он, по-видимому, запускает клеточной дифференцировки, необходимые для формирования этих органов. события ^[9] Нокаут HoxA3 приводит к нарушению формирования тимуса ( атимия ) и паращитовидной железы (апартиреоз). ^[10] Мутант HoxA3 также вызывает уменьшение размера щитовидной железы. Хотя фолликулярные и парафолликулярные клетки еще дифференцируются, их количество сокращается и они неравномерно распределяются по железе. ^[9] Мутантные модели HoxA3 демонстрируют фенотипы, аналогичные тем, которые наблюдаются при синдроме ДиДжорджа , и вполне возможно, что они связаны. ^[9]

Регулирование

Ген HOXA3 репрессируется микроРНК миР - 10а . ^[11]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105997 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079560 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXA3 А3» .
^ Хант П., Гулисано М., Кук М., Шам М.Х., Файелла А., Уилкинсон Д., Бончинелли Э., Крумлауф Р. (октябрь 1991 г.). «Особый Hox-код для жаберной области головы позвоночных». Природа . 353 (6347): 861–4. Бибкод : 1991Natur.353..861H . дои : 10.1038/353861a0 . ПМИД 1682814 . S2CID 4312466 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мэнли Н.Р., Капечки М.Р. (июль 1995 г.). «Роль Hoxa-3 в развитии тимуса и щитовидной железы мышей». Разработка . 121 (7): 1989–2003. дои : 10.1242/dev.121.7.1989 . ПМИД 7635047 .
^ Jump up to: ^а ^б Хойновски Дж.Л., Масуда К., Трау Х.А., Томас К., Капечки М., Мэнли Н.Р. (октябрь 2014 г.). «Множественные роли HOXA3 в регуляции дифференцировки и морфогенеза тимуса и паращитовидной железы у мышей» . Разработка . 141 (19): 3697–708. дои : 10.1242/dev.110833 . ПМЦ 4197593 . ПМИД 25249461 .
^ Хан Л., Уитмер П.Д., Кейси Э., Валле Д., Сукумар С. (август 2007 г.). «Метилирование ДНК регулирует экспрессию микроРНК» . Биология и терапия рака . 6 (8): 1284–8. дои : 10.4161/cbt.6.8.4486 . ПМИД 17660710 .

Дальнейшее чтение

Апиу Ф, Флагиелло Д, Чилло С, Малфой Б, Пупон МФ, Дютрилья Б (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 73 (1–2): 114–5. дои : 10.1159/000134320 . ПМИД 8646877 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Мэнли Н.Р., Капечки М.Р. (март 1998 г.). «Паралоги Hox-группы 3 регулируют развитие и миграцию тимуса, щитовидной и паращитовидных желез» . Биология развития . 195 (1): 1–15. дои : 10.1006/dbio.1997.8827 . ПМИД 9520319 .
Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
Малдер ГБ, Мэнли Н., Маджио-Прайс Л (декабрь 1998 г.). «Аномалии тимуса, вызванные ретиноевой кислотой, у мышей связаны с измененной морфологией глотки, дефектами созревания тимоцитов и измененной экспрессией Hoxa3 и Pax1». Тератология . 58 (6): 263–75. doi : 10.1002/(SICI)1096-9926(199812)58:6<263::AID-TERA8>3.0.CO;2-A . ПМИД 9894676 .
Мансанарес М., Нарделли Х., Джиларди-Хебенстрейт П., Маршалл Х., Джудичелли Ф., Мартинес-Пастор М.Т., Крумлауф Р., Шарнай П. (февраль 2002 г.). «Krox20 и kreisler сотрудничают в транскрипционном контроле сегментарной экспрессии Hoxb3 в развивающемся заднем мозге» . Журнал ЭМБО . 21 (3): 365–76. дои : 10.1093/emboj/21.3.365 . ПМЦ 125344 . ПМИД 11823429 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Ким Дж., Бхинг А.А., Морган XC, Айер В.Р. (январь 2005 г.). «Картирование взаимодействий ДНК-белок в больших геномах с помощью анализа последовательностей геномного обогащения». Природные методы . 2 (1): 47–53. дои : 10.1038/nmeth726 . ПМИД 15782160 . S2CID 6135437 .
Виссмюллер С., Косян Т., Вольф М., Финцш М., Вегнер М. (2006). «Домен группы высокой подвижности белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (6): 1735–44. дои : 10.1093/нар/gkl105 . ПМЦ 1421504 . ПМИД 16582099 .

Внешние ссылки

HOXA3 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105997 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079560 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXA3 А3» .

[Hunt_1991-8] Хант П., Гулисано М., Кук М., Шам М.Х., Файелла А., Уилкинсон Д., Бончинелли Э., Крумлауф Р. (октябрь 1991 г.). «Особый Hox-код для жаберной области головы позвоночных». Природа . 353 (6347): 861–4. Бибкод : 1991Natur.353..861H . дои : 10.1038/353861a0 . ПМИД 1682814 . S2CID 4312466 .

[Manley_1995-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мэнли Н.Р., Капечки М.Р. (июль 1995 г.). «Роль Hoxa-3 в развитии тимуса и щитовидной железы мышей». Разработка . 121 (7): 1989–2003. дои : 10.1242/dev.121.7.1989 . ПМИД 7635047 .

[Chojnowski_2014-10] Jump up to: ^а ^б Хойновски Дж.Л., Масуда К., Трау Х.А., Томас К., Капечки М., Мэнли Н.Р. (октябрь 2014 г.). «Множественные роли HOXA3 в регуляции дифференцировки и морфогенеза тимуса и паращитовидной железы у мышей» . Разработка . 141 (19): 3697–708. дои : 10.1242/dev.110833 . ПМЦ 4197593 . ПМИД 25249461 .

[pmid17660710-11] Хан Л., Уитмер П.Д., Кейси Э., Валле Д., Сукумар С. (август 2007 г.). «Метилирование ДНК регулирует экспрессию микроРНК» . Биология и терапия рака . 6 (8): 1284–8. дои : 10.4161/cbt.6.8.4486 . ПМИД 17660710 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]