PHF21A

PHF21A
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2PUY, 2YQL
Идентификаторы
Псевдонимы	PHF21A , BHC80, BM-006, белок пальца PHD 21A, NEDMS, IDDBCS
Внешние идентификаторы	Опустить : 608325 ; МГИ : 2384756 ; Гомологен : 9597 ; Генные карты : PHF21A ; ОМА : PHF21A – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	46,121,454 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	92,364,666 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; blood; ; epithelium of colon; ; ganglionic eminence; ; monocyte; ; buccal mucosa cell; ; sural nerve; ; granulocyte; ; ventricular zone; ; Achilles tendon;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; Rostral migratory stream; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; medulla of thymus; ; granulocyte; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; saccule;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; histone binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; chromatin binding; transcription coregulator activity; protein binding; metal ion binding; histone deacetylase activity;
Cellular component	histone deacetylase complex; DNA repair complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	blood coagulation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; histone deacetylation; regulation of transcription, DNA-templated; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51317
	192285
	ENSG00000135365
	ENSMUSG00000058318
	Q96BD5
	Q6ZPK0
showНМ_001101802 ; НМ_016621 ; НМ_001352025 ; НМ_001352026 ; НМ_001352027 ;
	NM_001352028; NM_001352029; NM_001352030; NM_001352031; NM_001352032
showНМ_001109690 ; НМ_001109691 ; НМ_138755 ; НМ_001346704 ; НМ_001362829 ;
	NM_001362830; NM_001362831; NM_001362832; NM_001362833
showНП_001095272 ; НП_057705 ; НП_001338954 ; НП_001338955 ; НП_001338956 ;
	NP_001338957; NP_001338958; NP_001338959; NP_001338960; NP_001338961
showНП_001103160 ; НП_001103161 ; НП_001333633 ; НП_620094 ; НП_001349758 ;
	NP_001349759; NP_001349760; NP_001349761; NP_001349762
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 21А пальца PHD — это белок , который у человека кодируется PHF21A геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

BHC80 является компонентом комплекса BRAF35 (MIM 605535)/гистондеацетилазы (HDAC; см. MIM 601241) (BHC), который опосредует репрессию нейрон-специфичных генов посредством цис-регуляторного элемента, известного как репрессорный элемент-1 (RE1) или нервный элемент. ограничительный глушитель (NRS) (Hakimi et al., 2002). [предоставлено OMIM] ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PHF21A взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135365 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058318 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Кикуно Р., Хаттори А., Кондо Ю., Окумура К., Охара О. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (6): 347–55. дои : 10.1093/dnares/7.6.347 . ПМИД 11214970 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 21А пальца PHF21A PHD» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .
^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .

Дальнейшее чтение

Ши Ю.Дж., Мэтсон С., Лан Ф., Ивасе С., Баба Т., Ши Ю. (2005). «Регуляция активности деметилазы гистонов LSD1 с помощью связанных с ней факторов» . Мол. Клетка . 19 (6): 857–64. doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . ПМИД 16140033 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Хайлеселлассе Сене К., Портер С.Дж., Палидвор Г., Перес-Иратксета С., Муро Э.М., Кэмпбелл П.А., Рудницки М.А., Андраде-Наварро М.А. (2007). «Функция гена при ранней дифференцировке эмбриональных стволовых клеток мыши» . БМК Геномика . 8:85 . дои : 10.1186/1471-2164-8-85 . ПМЦ 1851713 . ПМИД 17394647 .

Внешние ссылки

PHF21A+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135365 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058318 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11214970-5] Нагасе Т., Кикуно Р., Хаттори А., Кондо Ю., Окумура К., Охара О. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (6): 347–55. дои : 10.1093/dnares/7.6.347 . ПМИД 11214970 .

[pmid12032298-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Хакими М.А., Бочар Д.А., Ченовет Дж., Лейн В.С., Мандель Г., Шихаттар Р. (май 2002 г.). «Комплекс ядро-BRAF35, содержащий деацетилазу гистонов, опосредует репрессию нейронально-специфичных генов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (11): 7420–5. Бибкод : 2002PNAS...99.7420H . дои : 10.1073/pnas.112008599 . ПМК 124246 . ПМИД 12032298 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 21А пальца PHF21A PHD» .

[pmid15325272-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 322 (2): 601–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . ПМИД 15325272 .

[pmid12493763-9] Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]