CEBPB
CEBPB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | CEBPB , C/EBP-бета, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT/белок, связывающий энхансер бета, бета-белок, связывающий энхансер CCAAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | ОМИМ : 189965 ; МГИ : 88373 ; Гомологен : 3807 ; GeneCards : CEBPB ; OMA : CEBPB – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CCAAT/бета-связывающий энхансер белок представляет собой белок , который у человека кодируется CEBPB геном . [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим безинтронным геном, представляет собой фактор транскрипции bZIP , который может связываться в виде гомодимера с определенными регуляторными областями ДНК. Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-альфа , CEBP-дельта и CEBP-гамма . Кодируемый белок важен для регуляции генов, участвующих в иммунных и воспалительных реакциях, и было показано, что он связывается с элементом ответа IL-1 в гене IL-6 , а также с регуляторными областями нескольких острой фазы и цитокинов генов . . Кроме того, кодируемый белок может связывать промотор и вышестоящий элемент и стимулировать экспрессию коллагена типа I. гена [7]
CEBP-бета имеет решающее значение для нормального функционирования макрофагов , важного иммунных клеток подтипа ; мыши, неспособные экспрессировать CEBP-бета, имеют макрофаги, которые не могут дифференцироваться (специализироваться) и, следовательно, не могут выполнять все свои биологические функции, включая опосредованное макрофагами восстановление мышц. [8] Наблюдательная работа показала, что экспрессия CEBP-бета в лейкоцитах крови положительно связана с мышечной силой у людей . [9] подчеркивая важность иммунной системы и особенно макрофагов в поддержании мышечной функции.
Функцию гена CEBPB можно эффективно исследовать с помощью нокдауна siRNA на основании независимой проверки. [10]
При дальнейшем исследовании было отмечено, что CEBPB имеет около 8600 подобных корреляций с биологическими манипуляциями, начиная от молекул и заканчивая белками или абстрагированными микроРНК. Этот белок обнаруживается в крови, его активность повышается при таких заболеваниях, как острый миелолейкоз, глиома и рак простаты. Эта идея основана на внутриклеточной локализации и точно локализована в нуклеоплазме.
Целевые гены
[ редактировать ]CEBPB способен увеличивать экспрессию нескольких генов-мишеней. Среди них некоторые играют особую роль в нервной системе, например ген препротахикинина-1 , дающий начало веществу Р и нейрокинину А. [11] и холин-ацетилтрансфераза, ответственная за биосинтез важного нейромедиатора ацетилхолина . [12] Другие мишени включают гены, кодирующие цитокины, такие как IL-6 , [13] Ил-4 , [14] Ил-5 , [15] и ФНО-альфа . [16] Было также обнаружено, что гены, кодирующие белки-переносчики, которые придают клеткам множественную лекарственную устойчивость, активируются CEBPB. К таким генам относятся ABCC2 [17] и АВСВ1 . [18]
Усилитель связывания белка
[ редактировать ]Ген CEBPB кодирует фактор транскрипции. Как упоминалось ранее, «он содержит домен лейциновой молнии (bZIP), и кодируемый белок функционирует как гомодимер. Он также может образовывать гетеродимеры с белками, связывающими энхансеры, такими как альфа, дельта и гамма. Активность этого белка важна для регулирующие гены, участвующие в иммунных и воспалительных реакциях, среди других процессов. Старт-кодоны «AUG», что приводит к образованию множества изоформ белка». [19] Было также упомянуто, что каждый из этих кодонов выполняет различную биологическую функцию в организме.
Этот путь обеспечивает пролиферацию, ингибирование и даже выживание. Этот ген является жизненно важной частью пролиферации и сегрегации. Это важно, «поскольку фактор транскрипции регулирует экспрессию генов, которые участвуют в иммунном и воспалительном ответе, он включает глюконеогенный путь и восстановление печени. Он оказывает пробиотическое действие на многие типы клеток, такие как гепатоциты и адипоциты. Однако он оказывает пробиотическое действие на многие типы клеток, такие как гепатоциты и адипоциты. дифференциальное «воздействие на Т-клетки путем ингибирования экспрессии MYC и содействия дифференцировке линии Т-хелперов. Он связывается с регуляторными областями нескольких фазовых и цитокиновых генов». [20]
Рак
[ редактировать ]CEBPB представляет собой тип транскрипта CEBP. CEBPB [21] Ген отмечается в макрофагах при SKCM и обеспечивает благоприятный прогноз при метастатическом раке, являясь биомаркером для стратификации диагноза пациента. Благодаря комплексному анализу наборов данных одноклеточных и объемных последовательностей РНК. Поскольку CEBPB является фактором транскрипции, регулирующим экспрессию генов, пациенты с метастатической меланомой могут получить долгосрочную пользу, блокируя белки, такие как CTLA-4 Other. Любой другой путь иммунной активации, например, нацеливание на CEBPB. Он широко экспрессируется при нескольких различных видах рака.
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что CEBPB взаимодействует с:
- CREB1 , [22]
- CRSP3 [23]
- Транскрипт 3, индуцируемый повреждением ДНК , [24] [25]
- ЭП300 , [26]
- Рецептор эстрогена альфа , [27] [28]
- глюкокортикоидный рецептор , [27]
- ХМГА1 , [29]
- ХСФ1 , [30]
- Ядрышковый фосфопротеин р130 , [31]
- РЕЛА , [32] [33]
- Фактор реакции сыворотки , [34] [35]
- СМАРКА2 , [36]
- Транскрипционный фактор Sp1 , [29] [37]
- ТРИМ28 , [38] [39] и
- Зиф268 . [40]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000172216 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056501 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Шпирер С., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам М.К., Леван Г., Шпирер Дж. (июнь 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C/EBP, DBP и HNF1/LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1 соответственно) и фактора роста гепатоцитов». ген фактора рассеяния (HGF)». Геномика . 13 (2): 293–300. дои : 10.1016/0888-7543(92)90245-N . ПМИД 1535333 .
- ^ Цао З., Умек Р.М., Макнайт С.Л. (сентябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C/EBP во время жировой конверсии клеток 3T3-L1» . Гены и развитие . 5 (9): 1538–1552. дои : 10.1101/gad.5.9.1538 . ПМИД 1840554 .
- ^ «Ген Энтреза: CEBPB CCAAT/белок, связывающий энхансер (C/EBP), бета» .
- ^ Раффелл Д., Муркиоти Ф., Гамбарделла А., Кирстеттер П., Лопес Р.Г., Розенталь Н., Нерлов С. (октябрь 2009 г.). «Каскад CREB-C/EBPbeta индуцирует экспрессию генов, специфичных для макрофагов M2, и способствует восстановлению мышечных повреждений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (41): 17475–17480. Бибкод : 2009PNAS..10617475R . дои : 10.1073/pnas.0908641106 . ПМЦ 2762675 . ПМИД 19805133 .
- ^ Харрис Л.В., Пиллинг Л.С., Эрнандес Л.Д., Брэдли-Смит Р., Хенли В., Синглтон А.Б. и др. (апрель 2012 г.). «Экспрессия бета-связывающего белка CCAAT in vivo связана с мышечной силой» . Стареющая клетка . 11 (2): 262–268. дои : 10.1111/j.1474-9726.2011.00782.x . ПМЦ 3486692 . ПМИД 22152057 .
- ^ Мункачи Г, Штупински З, Герман П, Бан Б, Пенцвалло З, Сарвас Н, Дьерфи Б (сентябрь 2016 г.). «Подтверждение эффективности подавления РНКи с использованием данных генного массива показывает 18,5% частоты неудач в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия. Нуклеиновые кислоты . 5 (9): е366. дои : 10.1038/mtna.2016.66 . ПМК 5056990 . ПМИД 27673562 .
- ^ Ковач К.А., Штайнманн М., Маджистретти П.Дж., Халфон О., Кардино Дж.Р. (сентябрь 2006 г.). «C / EBPbeta связывает передачу сигналов дофамина с экспрессией гена-предшественника вещества P в нейронах полосатого тела». Журнал нейрохимии . 98 (5): 1390–1399. дои : 10.1111/j.1471-4159.2006.03957.x . ПМИД 16771829 . S2CID 36225447 .
- ^ Роберт I, Саттер А, Квирин-Стрикер С (октябрь 2002 г.). «Синергическая активация гена холин-ацетилтрансферазы человека c-Myb и C/EBPbeta». Исследования мозга. Молекулярные исследования мозга . 106 (1–2): 124–135. дои : 10.1016/S0169-328X(02)00419-9 . ПМИД 12393272 .
- ^ Нацука С., Акира С., Нисио Ю., Хашимото С., Сугита Т., Ишики Х., Кишимото Т. (январь 1992 г.). «Специфичная для дифференцировки макрофагов экспрессия NF-IL6, фактора транскрипции интерлейкина-6» . Кровь . 79 (2): 460–466. дои : 10.1182/blood.V79.2.460.460 . ПМИД 1730090 .
- ^ Давыдов И.В., Краммер П.Х., Ли-Вебер М. (декабрь 1995 г.). «Ядерный фактор-IL6 активирует промотор IL-4 человека в Т-клетках». Журнал иммунологии . 155 (11): 5273–5279. doi : 10.4049/jimmunol.155.11.5273 . ПМИД 7594540 . S2CID 22681826 .
- ^ ван Дейк Т.Б., Балтус Б., Рааймакерс Дж.А., Ламмерс Дж.В., Кундерман Л., де Гроот Р.П. (сентябрь 1999 г.). «Композитный сайт связывания C/EBP необходим для активности промотора гена IL-3/IL-5/гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора бета-c» . Журнал иммунологии . 163 (5): 2674–2680. дои : 10.4049/jimmunol.163.5.2674 . ПМИД 10453008 . S2CID 45357917 .
- ^ Гринвел П., Танака С., Пеньков Д., Чжан В., Олив М., Молл Дж. и др. (февраль 2000 г.). «Фактор некроза опухоли альфа ингибирует синтез коллагена I типа посредством репрессивных CCAAT/белков, связывающих энхансеры» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (3): 912–918. дои : 10.1128/MCB.20.3.912-918.2000 . ПМК 85208 . ПМИД 10629048 .
- ^ Танака Т., Учиуми Т., Хиношита Э., Инокучи А., Тох С., Вада М. и др. (декабрь 1999 г.). «Ген белка 2 множественной лекарственной устойчивости человека: функциональная характеристика 5'-фланкирующей области и экспрессия в клетках печени» . Гепатология . 30 (6): 1507–1512. дои : 10.1002/hep.510300617 . ПМИД 10573531 . S2CID 22514353 .
- ^ Чен К.Г., Сале С., Тан Т., Эрмоян Р.П., Сикич Б.И. (апрель 2004 г.). «CCAAT/бета-связывающий энхансер белок (ядерный фактор интерлейкина 6) трансактивирует ген MDR1 человека путем взаимодействия с инвертированным блоком CCAAT в раковых клетках человека». Молекулярная фармакология . 65 (4): 906–916. дои : 10.1124/моль.65.4.906 . ПМИД 15044620 . S2CID 86591291 .
- ^ «Сводка экспрессии белка CEBPB - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 16 мая 2023 г.
- ^ «Ген – CEBPB» . maayanlab.cloud . Проверено 16 мая 2023 г.
- ^ «Бета-связывающий энхансер CEBPB CCAAT [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 16 мая 2023 г.
- ^ Чен Ю, Чжуан С., Кассенер С., Кастил Д.Э., Гуди Т., Босс Г.Р., Пильц Р.Б. (июнь 2003 г.). «Синергизм между кальцием и циклическим GMP в регуляции транскрипции, зависимой от элемента ответа циклического АМФ, требует сотрудничества между CREB и C/EBP-бета» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (12): 4066–4082. дои : 10.1128/mcb.23.12.4066-4082.2003 . ПМК 156132 . ПМИД 12773552 .
- ^ Мо X, Ковенц-Лейц Е, Сюй Х, Лейц А (январь 2004 г.). «Ras вызывает обмен медиаторного комплекса на бета-версии C / EBP» . Молекулярная клетка . 13 (2): 241–250. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00521-5 . ПМИД 14759369 .
- ^ Хаттори Т., Охока Н., Хаяси Х., Онодзаки К. (апрель 2003 г.). «Гомологичный белок C/EBP (CHOP) усиливает транскрипцию IL-6 путем улавливания отрицательно регулирующей изоформы NF-IL6» . Письма ФЭБС . 541 (1–3): 33–39. Бибкод : 2003FEBSL.541...33H . дои : 10.1016/s0014-5793(03)00283-7 . ПМИД 12706815 . S2CID 43792576 .
- ^ Фосетт Т.В., Истман Х.Б., Мартиндейл Дж.Л., Холбрук, Нью-Джерси (июнь 1996 г.). «Физическая и функциональная связь между GADD153 и CCAAT/бета-связывающим энхансером белком во время клеточного стресса» . Журнал биологической химии . 271 (24): 14285–14289. дои : 10.1074/jbc.271.24.14285 . ПМИД 8662954 .
- ^ Минк С., Хениг Б., Клемпнауэр К.Х. (ноябрь 1997 г.). «Взаимодействие и функциональное сотрудничество p300 и C/EBPbeta» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (11): 6609–6617. дои : 10.1128/mcb.17.11.6609 . ПМК 232514 . ПМИД 9343424 .
- ^ Перейти обратно: а б Борук М., Сэвори Дж.Г., Хаче Р.Дж. (ноябрь 1998 г.). «AF-2-зависимое усиление бета-опосредованной транскрипционной активации белка, связывающего энхансер CCAAT, с помощью глюкокортикоидного рецептора» . Молекулярная эндокринология . 12 (11): 1749–1763. дои : 10.1210/mend.12.11.0191 . ПМИД 9817600 .
- ^ Штейн Б., Ян М.Х. (сентябрь 1995 г.). «Репрессия промотора интерлейкина-6 рецептором эстрогена опосредуется NF-каппа B и C/EBP бета» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 4971–4979. дои : 10.1128/mcb.15.9.4971 . ПМК 230744 . ПМИД 7651415 .
- ^ Перейти обратно: а б Фоти Д., Юлиано Р., Чифари Э., Брунетти А. (апрель 2003 г.). «Нуклеопротеиновый комплекс, содержащий Sp1, C/EBP бета и HMGI-Y, контролирует транскрипцию гена инсулинового рецептора человека» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (8): 2720–2732. дои : 10.1128/mcb.23.8.2720-2732.2003 . ПМК 152545 . ПМИД 12665574 .
- ^ Се Ю, Чен С., Стивенсон М.А., Аурон П.Е., Колдервуд С.К. (апрель 2002 г.). «Фактор теплового шока 1 подавляет транскрипцию гена IL-1beta посредством физического взаимодействия с ядерным фактором интерлейкина 6» . Журнал биологической химии . 277 (14): 11802–11810. дои : 10.1074/jbc.M109296200 . ПМИД 11801594 .
- ^ Миау Л.Х., Чанг С.Дж., Шен Б.Дж., Цай В.Х., Ли С.К. (апрель 1998 г.). «Идентификация гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина К (hnRNP K) как репрессора активации гена, опосредованной C / EBPbeta» . Журнал биологической химии . 273 (17): 10784–10791. дои : 10.1074/jbc.273.17.10784 . ПМИД 9553145 .
- ^ Вебер М., Сидлик С., Квирлинг М., Нотдерфтер С., Цвергал А., Хейсс П. и др. (июнь 2003 г.). «Транскрипционное ингибирование экспрессии интерлейкина-8 в клетках, толерантных к фактору некроза опухоли: доказательства участия бета-версии C/EBP» . Журнал биологической химии . 278 (26): 23586–23593. дои : 10.1074/jbc.M211646200 . ПМИД 12707271 .
- ^ Ся С., Чешир Дж. К., Патель Х., Ву П. (декабрь 1997 г.). «Перекрестная связь между факторами транскрипции NF-каппа B и C/EBP в регуляции транскрипции генов». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 29 (12): 1525–1539. дои : 10.1016/s1357-2725(97)00083-6 . ПМИД 9570146 .
- ^ Хэнлон М., Сили Л. (май 1999 г.). «Ras регулирует связь фактора ответа сыворотки и CCAAT/белка, связывающего энхансер бета» . Журнал биологической химии . 274 (20): 14224–14228. дои : 10.1074/jbc.274.20.14224 . ПМИД 10318842 .
- ^ Сили Л., Мэлоун Д., Павлак М. (март 1997 г.). «Регуляция элемента ответа сыворотки cfos с помощью C / EBPbeta» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (3): 1744–1755. дои : 10.1128/mcb.17.3.1744 . ПМК 231899 . ПМИД 9032301 .
- ^ Ковенц-Лейц Е, Лейц А (ноябрь 1999 г.). «Бета-изоформа AC/EBP рекрутирует комплекс SWI/SNF для активации миелоидных генов» . Молекулярная клетка . 4 (5): 735–743. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80384-6 . ПМИД 10619021 .
- ^ Лю Ю.В., Ценг Х.П., Чен Л.К., Чен Б.К., Чанг В.К. (июль 2003 г.). «Функциональное сотрудничество фактора 1 промотора обезьяньего вируса 40 и CCAAT/энхансер-связывающего белка бета и дельта в индуцированной липополисахаридами активации гена IL-10 в мышиных макрофагах» . Журнал иммунологии . 171 (2): 821–828. дои : 10.4049/jimmunol.171.2.821 . ПМИД 12847250 .
- ^ Руни Дж.В., Каламе К.Л. (ноябрь 2001 г.). «TIF1beta действует как коактиватор C/EBPbeta и необходим для индуцированной дифференцировки в линии миеломоноцитарных клеток U937» . Гены и развитие . 15 (22): 3023–3038. дои : 10.1101/gad.937201 . ПМК 312827 . ПМИД 11711437 . (Отозвано, см. Ошибка: указан неправильный DOI! , PMID 12269264 , Часы втягивания )
- ^ Чанг С.Дж., Чен Ю.Л., Ли С.К. (октябрь 1998 г.). «Коактиватор TIF1beta взаимодействует с транскрипционным фактором C/EBPbeta и рецептором глюкокортикоида, индуцируя экспрессию гена альфа1-кислотного гликопротеина» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (10): 5880–5887. дои : 10.1128/mcb.18.10.5880 . ПМК 109174 . ПМИД 9742105 .
- ^ Чжан Ф., Линь М., Абиди П., Тиль Г., Лю Дж. (ноябрь 2003 г.). «Специфическое взаимодействие Egr1 и c/EBPbeta приводит к активации транскрипции гена рецептора липопротеинов низкой плотности человека» . Журнал биологической химии . 278 (45): 44246–44254. дои : 10.1074/jbc.M305564200 . ПМИД 12947119 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- человека Местоположение генома CEBPB и CEBPB страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
- CEBPB+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ФакторБук CEBPB
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .