ФОКСА3

ФОКСА3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1VTN
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXA3 , FKHH3, HNF3G, TCF3G, коробка с вилкой A3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602295 ; МГИ : 1347477 ; Гомологен : 3308 ; Генные карты : FOXA3 ; ОМА : FOXA3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	45,873,797 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	18,757,463 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; right lobe of liver; ; pancreatic ductal cell; ; mucosa of transverse colon; ; body of pancreas; ; mucosa of sigmoid colon; ; rectum; ; cartilage tissue; ; islet of Langerhans; ; palpebral conjunctiva;
	Top expressed in
	mucous cell of stomach; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; epithelium of stomach; ; pyloric antrum; ; liver; ; left lobe of liver; ; large intestine; ; left colon; ; yolk sac; ; Hindgut;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; transcription factor binding; protein domain specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleoplasm; actin cytoskeleton; nucleus;
Biological process	cellular glucose homeostasis; regulation of transcription by RNA polymerase II; cellular response to starvation; multicellular organism development; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; spermatogenesis; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; anatomical structure morphogenesis; cell differentiation; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3171
	15377
	ENSG00000170608
	ENSMUSG00000040891
	P55318
	P35584
	НМ_004497
	НМ_008260
	НП_004488
	НП_032286
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ядерный фактор гепатоцитов 3-гамма (HNF-3G), также известный как белок A3 forkhead box (FOXA3) или фактор транскрипции 3G (TCF-3G), представляет собой белок , который у людей кодируется FOXA3 геном . ^[5]^[6]

Функция

HNF-3G является представителем класса ДНК-связывающих белков. Эти ядерные факторы гепатоцитов являются активаторами транскрипции специфичных для печени транскриптов, таких как альбумин и транстиретин , а также взаимодействуют с хроматином . Сходные члены семейства у мышей играют роль в регуляции метаболизма и дифференцировке поджелудочной железы и печени. ^[5]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170608 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040891 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б "Энтрез Гена: Коробка вилочная А3" .
^ Минчева А., Лихтер П., Шютц Г., Кестнер К.Х. (февраль 1997 г.). «Присвоение человеческих генов ядерного фактора 3-альфа, -бета и -гамма гепатоцитов (HNF3A, HNF3B, HNF3G) к 14q12-q13, 20p11 и 19q13.2-q13.4». Геномика . 39 (3): 417–9. дои : 10.1006/geno.1996.4477 . ПМИД 9119385 .

Дальнейшее чтение

Коррошер Р., Тедеско Ф., Рабузин П., Де Сандре Г. (1975). «Влияние стромы эритроцитов человека на активацию комплемента». Бр. Дж. Гематол . 29 (2): 235–41. дои : 10.1111/j.1365-2141.1975.tb01817.x . ПМИД 33 . S2CID 45491647 .
Вершуур М., де Йонг М., Фелида Л. и др. (2005). «Участок ядерного фактора-3 гепатоцитов в промоторе бета-фибриногена важен для экспрессии, индуцированной интерлейкином 6, и на его активность влияет соседний полиморфизм -148C/T» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 280 (17): 16763–71. дои : 10.1074/jbc.M501973200 . ПМИД 15737987 .
Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (1993). «Сокристаллическая структура мотива распознавания ДНК HNF-3/головки вилки напоминает гистон H5». Природа . 364 (6436): 412–20. Бибкод : 1993Natur.364..412C . дои : 10.1038/364412a0 . ПМИД 8332212 . S2CID 4363526 .
Цянь X, Коста Р.Х. (1995). «Анализ доменов бета-белка ядерного фактора-3 гепатоцитов, необходимых для активации транскрипции и ядерного нацеливания» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (7): 1184–91. дои : 10.1093/нар/23.7.1184 . ПМК 306829 . ПМИД 7739897 .
Родригес-Антона С., Борт Р., Ховер Р. и др. (2003). «Транскрипционная регуляция базовой экспрессии CYP3A4 человека с помощью белка альфа, связывающего энхансер CCAAT, и ядерного фактора гепатоцитов-3 гамма». Мол. Фармакол . 63 (5): 1180–9. дои : 10.1124/моль.63.5.1180 . ПМИД 12695546 . S2CID 34628968 .
Ламба В., Панетта Дж.К., Стром С., Шуец Э.Г. (2010). «Генетические предикторы межиндивидуальной изменчивости экспрессии CYP3A4 в печени» . Дж. Фармакол. Эксп. Там . 332 (3): 1088–99. дои : 10.1124/jpet.109.160804 . ПМЦ 2835441 . ПМИД 19934400 .
Хори Ю, Гу Х, Се Х, Ким СК (2005). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток из нервных клеток-предшественников человека» . ПЛОС Мед . 2 (4): е103. doi : 10.1371/journal.pmed.0020103 . ПМК 1087208 . ПМИД 15839736 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Моталлебипур М., Амер А., Редди Бисани М.С. и др. (2009). «Дифференциальный характер связывания и совместного связывания FOXA1 и FOXA3 и их связь с H3K4me3 в клетках HepG2, выявленный с помощью ChIP-seq» . Геном Биол . 10 (11): 129 рандов. дои : 10.1186/gb-2009-10-11-r129 . ПМК 3091322 . ПМИД 19919681 .
Чжоу Б., Чжун К., Мину П. и др. (2008). «Foxp2 ингибирует Nkx2.1-опосредованную транскрипцию SP-C посредством взаимодействия с гомеодоменом Nkx2.1» . Являюсь. Дж. Респир. Клетка Мол. Биол . 38 (6): 750–8. дои : 10.1165/rcmb.2007-0350OC . ПМК 2396252 . ПМИД 18239190 .
Навас М.А., Вайс С., Богер С. и др. (2000). «Гены HNF-3 человека: клонирование, частичная последовательность и скрининг мутаций у пациентов с нарушениями гомеостаза глюкозы». Хм. Херед . 50 (6): 370–81. дои : 10.1159/000022943 . ПМИД 10899756 . S2CID 24745151 .
Кестнер К.Х. (2000). «Семейство ядерного фактора 3 гепатоцитов (HNF3 или FOXA) в метаболизме». Тенденции Эндокринол. Метаб . 11 (7): 281–5. дои : 10.1016/S1043-2760(00)00271-X . ПМИД 10920385 . S2CID 40600315 .
Лин Б., Моррис Д.В., Чоу Дж.И. (1997). «Роль HNF1альфа, HNF3гамма и циклического АМФ в активации гена глюкозо-6-фосфатазы». Биохимия . 36 (46): 14096–106. дои : 10.1021/bi9703249 . ПМИД 9369482 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Динтильяк А., Бернюес Дж. (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими явно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» . Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7021–8. дои : 10.1074/jbc.M108417200 . hdl : 10261/112516 . ПМИД 11748221 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Кестнер К.Х., Химиш Х., Шютц Г. (1998). «Направленное разрушение гена, кодирующего ядерный фактор гепатоцитов 3гамма, приводит к снижению транскрипции генов, специфичных для гепатоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 18 (7): 4245–51. дои : 10.1128/mcb.18.7.4245 . ПМК 109008 . ПМИД 9632808 .
Хромас Р., Мур Дж., Джонстон Т. и др. (1993). «Гомологи дрозофилы вилкоголовки экспрессируются ограниченным по клону образом в гемопоэтических клетках человека» . Кровь . 81 (11): 2854–9. дои : 10.1182/blood.V81.11.2854.2854 . ПМИД 8499623 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P55318 (ядерный фактор гепатоцитов 3-гамма) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170608 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040891 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б "Энтрез Гена: Коробка вилочная А3" .

[pmid9119385-6] Минчева А., Лихтер П., Шютц Г., Кестнер К.Х. (февраль 1997 г.). «Присвоение человеческих генов ядерного фактора 3-альфа, -бета и -гамма гепатоцитов (HNF3A, HNF3B, HNF3G) к 14q12-q13, 20p11 и 19q13.2-q13.4». Геномика . 39 (3): 417–9. дои : 10.1006/geno.1996.4477 . ПМИД 9119385 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]