Транскрипционный фактор Sp8

СП8
Идентификаторы
Псевдонимы	SP8 , BTD, транскрипционный фактор Sp8
Внешние идентификаторы	Опустить : 608306 ; МГИ : 2443471 ; Гомологен : 18548 ; Генные карты : SP8 ; ОМА : SP8 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	20,786,886 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	118,816,311 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; sural nerve; ; testicle; ; ventricular zone; ; gonad; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; ganglionic eminence; ; nasal epithelium; ; mucosa of paranasal sinus; ; muscle of thigh;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; olfactory bulb; ; lateral septal nucleus; ; primitive streak; ; prostate; ; respiratory epithelium; ; olfactory epithelium; ; lobe of prostate; ; tail of embryo; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; metal ion binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	proximal/distal pattern formation; regulation of transcription, DNA-templated; dorsal/ventral pattern formation; embryonic limb morphogenesis; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	221833
	320145
	ENSG00000164651
	ENSMUSG00000048562
	Q8IXZ3
	Q8BMJ8
	НМ_182700 ; НМ_198956
	НМ_177082 ; НМ_001379379 ; НМ_001379380
	НП_874359 ; НП_945194
	НП_796056 ; НП_001366308 ; НП_001366309
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции Sp8, также известный как белок специфичности 8 (SP-8) или транскрипционный фактор Btd (пуговичная головка). ^[5] — белок , который у человека кодируется SP8 геном . ^[6]^[7] Sp8 является транскрипционным фактором семейства Sp/KLF .

Функция

Sp8 опосредует рост конечностей на ранних стадиях развития. ^[5] Делеция Sp8 у мышей привела к тяжелой экзэнцефалии . ^[8] Sp8 представляет собой фактор транскрипции с цинковыми пальцами. Структурное различие между Sp8 и Sp9 составляет всего одну аминокислоту. Эти факторы транскрипции являются специфичными для развития конечностей апикального эктодермального гребня (AER). Передача сигналов апикального эктодермального гребня важна для спецификации дистальных структур конечностей. Sp8 и Sp9 опосредуют передачу сигналов Fgf10, которая, в свою очередь, регулирует экспрессию Fgf8 (Fgf10 → Fgf8). Fgf8 необходим для нормального развития конечностей, и без присутствия Fgf8 на раннем этапе развития будет наблюдаться уменьшение длины зачатка конечности и возможное развитие недостаточности ткани конечности. И Sp8, и Sp9 были обнаружены у позвоночных. Однако пока доказано, что у беспозвоночных присутствует только Sp8. В лабораторных условиях Sp8 заменил btd у дрозофилы, показывая, что Sp8 и btd имеют сходные функции в развитии конечностей как у позвоночных, так и у беспозвоночных. Нокдаун гена у рыбок данио показал, что экспрессия Fgf8 необходима для развития придатков. ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164651 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048562 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Трейхель Д., Шёк Ф., Джекле Х., Грусс П., Мансури А. (ноябрь 2003 г.). «mBtd необходим для поддержания передачи сигналов во время развития конечностей мышей» (PDF) . Гены и развитие . 17 (21): 2630–5. дои : 10.1101/gad.274103 . ПМК 280612 . ПМИД 14597661 .
^ Белл С.М., Шрайнер К.М., Вацлав Р.Р., Кэмпбелл К., Поттер С.С., Скотт У.Дж. (октябрь 2003 г.). «Sp8 имеет решающее значение для роста конечностей и закрытия нейропор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (21): 12195–200. дои : 10.1073/pnas.2134310100 . ПМК 218735 . ПМИД 14526104 .
^ «Ген Энтрез: фактор транскрипции Sp8» .
^ Вацлав Р.Р., Аллен З.Дж., Белл С.М., Эрдели Ф., Сабо Г., Поттер С.С., Кэмпбелл К. (февраль 2006 г.). «Фактор транскрипции цинковых пальцев Sp8 регулирует образование и разнообразие интернейронов обонятельной луковицы» . Нейрон . 49 (4): 503–16. дои : 10.1016/j.neuron.2006.01.018 . ПМИД 16476661 . S2CID 17734218 .
^ Каваками Ю., Эстебан Ч.Р., Мацуи Т., Родригес-Леон Х., Като С., Исписуа Бельмонте Х.К. (октябрь 2004 г.). «Sp8 и Sp9, два близкородственных транскрипционных фактора, подобных пуговичной головке, регулируют экспрессию Fgf8 и рост конечностей у эмбрионов позвоночных». Разработка . 131 (19): 4763–74. дои : 10.1242/dev.01331 . ПМИД 15358670 . S2CID 1959276 .

Дальнейшее чтение

Lee MT, Chen CH, Lee CS, Chen CC, Chong MY, Ouyang WC, Chiu NY, Chuo LJ, Chen CY, Tan HK, Lane HY, Chang TJ, Lin CH, Jou SH, Hou YM, Feng J, Lai TJ , Tung CL, Chen TJ, Chang CJ, Lung FW, Chen CK, Shiah IS, Liu CY, Teng PR, Chen KH, Shen LJ, Cheng CS, Chang TP, Li CF, Chou CH, Chen CY, Wang KH, Fann CS, Ву JY, Чен Ю.Т., Ченг А.Т. (май 2011 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование биполярного расстройства I типа у ханьцев». Молекулярная психиатрия . 16 (5): 548–56. дои : 10.1038/mp.2010.43 . ПМИД 20386566 . S2CID 41746496 .
Милона М.А., Гоф Дж.Э., Эдгар А.Дж. (ноябрь 2004 г.). «Геномная структура и клонирование двух изоформ транскрипта человеческого Sp8» . БМК Геномика . 5:86 . дои : 10.1186/1471-2164-5-86 . ПМК 534095 . ПМИД 15533246 .
Джугессур А., Ши М., Гессинг Х.К., Ли РТ, Уилкокс А.Дж., Вайнберг Ч.Р. , Кристенсен К., Бойлз А.Л., Даак-Хирш С., Нгуен Т.Т., Кристиансен Л., Лидрал А.С., Мюррей Дж.К. (июль 2010 г.). «Материнские гены и расщелины лица у потомства: комплексный поиск генетических ассоциаций в двух популяционных исследованиях расщелин в Скандинавии» . ПЛОС ОДИН . 5 (7): e11493. Бибкод : 2010PLoSO...511493J . дои : 10.1371/journal.pone.0011493 . ПМК 2901336 . ПМИД 20634891 .
Барбер М.Дж., Мангравит Л.М., Хайд К.Л., Чесман Д.И., Смит Дж.Д., Маккарти К.А., Ли Х, Уилке Р.А., Ридер М.Дж., Уильямс П.Т., Ридкер П.М., Чаттерджи А., Роттер Дж.И., Никерсон Д.А., Стивенс М., Краусс Р.М. (март 2010 г.) ). «Общегеномная ассоциация липидоснижающей реакции на статины в объединенных исследуемых популяциях» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): e9763. Бибкод : 2010PLoSO...5.9763B . дои : 10.1371/journal.pone.0009763 . ПМЦ 2842298 . ПМИД 20339536 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» 1 /gr.4039406 16 ) : 55–65 « 10.1101 ( . PMID . . . 16344560 doi
Раваси Т., Сузуки Х., Каннистрачи К.В., Катаяма С., Бажич В.Б., Тан К., Акалин А., Шмайер С., Канамори-Катаяма М., Бертин Н., Карнинчи П., Дауб К.О., Форрест А.Р., Гоф Дж., Гриммонд С., Хан Дж.Х., Хашимото Т, Хиде В, Хофманн О, Камбуров А, Каур М, Каваджи Х, Кубосаки А, Лассманн Т, ван Нимвеген Е, Макферсон ЧР, Огава С, Радованович А, Шварц А, Тисдейл РД, Тегнер Дж, Ленхард Б, Тейхманн С.А., Аракава Т., Ниномия Н., Мураками К., Тагами М., Фукуда С., Имамура К., Кай С., Исихара Р., Китадзуме Ю., Каваи Дж., Хьюм Д.А., Идекер Т., Хаяшизаки Ю. (март 2010 г.). «Атлас комбинаторной регуляции транскрипции у мыши и человека» . Ячейка 140 (5): 744–52. дои : 10.1016/j.cell.2010.01.044 . ПМЦ 2836267 . ПМИД 20211142 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164651 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048562 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid14597661-5] Jump up to: ^а ^б Трейхель Д., Шёк Ф., Джекле Х., Грусс П., Мансури А. (ноябрь 2003 г.). «mBtd необходим для поддержания передачи сигналов во время развития конечностей мышей» (PDF) . Гены и развитие . 17 (21): 2630–5. дои : 10.1101/gad.274103 . ПМК 280612 . ПМИД 14597661 .

[pmid14526104-6] Белл С.М., Шрайнер К.М., Вацлав Р.Р., Кэмпбелл К., Поттер С.С., Скотт У.Дж. (октябрь 2003 г.). «Sp8 имеет решающее значение для роста конечностей и закрытия нейропор» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (21): 12195–200. дои : 10.1073/pnas.2134310100 . ПМК 218735 . ПМИД 14526104 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: фактор транскрипции Sp8» .

[pmid16476661-8] Вацлав Р.Р., Аллен З.Дж., Белл С.М., Эрдели Ф., Сабо Г., Поттер С.С., Кэмпбелл К. (февраль 2006 г.). «Фактор транскрипции цинковых пальцев Sp8 регулирует образование и разнообразие интернейронов обонятельной луковицы» . Нейрон . 49 (4): 503–16. дои : 10.1016/j.neuron.2006.01.018 . ПМИД 16476661 . S2CID 17734218 .

[pmid15358670-9] Каваками Ю., Эстебан Ч.Р., Мацуи Т., Родригес-Леон Х., Като С., Исписуа Бельмонте Х.К. (октябрь 2004 г.). «Sp8 и Sp9, два близкородственных транскрипционных фактора, подобных пуговичной головке, регулируют экспрессию Fgf8 и рост конечностей у эмбрионов позвоночных». Разработка . 131 (19): 4763–74. дои : 10.1242/dev.01331 . ПМИД 15358670 . S2CID 1959276 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]