ЦЕБПЭ

ЦЕБПЭ
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3T92
Идентификаторы
Псевдонимы	CEBPE , C/EBP-эпсилон, CRP1, CCAAT/энхансер-связывающий белок эпсилон, CCAAT энхансер-связывающий белок эпсилон, c/EBP эпсилон
Внешние идентификаторы	Опустить : 600749 ; МГИ : 103572 ; Гомологен : 1367 ; GeneCards : CEBPE ; ОМА : CEBPE — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 14 (human) Band 14q11.2 Start 23,117,036 bp End 23,120,256 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 14 (mouse) Band 14 C2|14 27.9 cM Start 54,947,817 bp End 54,949,631 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in bone marrow trabecular bone bone marrow cells gonad blood monocyte granulocyte vena cava spleen duodenum Top expressed in granulocyte bone marrow embryo liver jejunum ileum spleen lip quadriceps femoris muscle colon More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein heterodimerization activity DNA-binding transcription factor activity RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific protein homodimerization activity protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Cellular component nucleoplasm nucleus Biological process defense response myeloid cell differentiation positive regulation of gene expression cellular response to lipopolysaccharide regulation of transcription, DNA-templated defense response to bacterium transcription, DNA-templated positive regulation of transcription by RNA polymerase II macrophage differentiation phagocytosis transcription by RNA polymerase II granulocyte differentiation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 1053 110794 Вместе ENSG00000092067 ENSMUSG00000052435 ЮниПрот Q15744 Q6PZD9 RefSeq (мРНК) НМ_001805 НМ_207131 RefSeq (белок) НП_001796 НП_997014 Местоположение (UCSC) Чр 14: 23.12 – 23.12 Мб Чр 14: 54,95 – 54,95 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

CCAAT/энхансер-связывающий белок (C/EBP), эпсилон , также известный как CEBPE и CRP1 , представляет собой тип белка, связывающего ccaat-энхансер . CEBPE – это человеческий ген и является проапоптотическим .

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой bZIP фактор транскрипции , который может связываться в виде гомодимера с определенными регуляторными участками ДНК. Он также может образовывать гетеродимеры с родственным белком CEBP-δ . Кодируемый белок может быть важен для терминальной дифференцировки и функционального созревания коммитированных гранулоцитов клеток-предшественников . Мутации в этом гене связаны со специфическим дефицитом гранул – редким врожденным заболеванием. Описано множество вариантов этого гена, но полноразмерная природа только одного установлена.

Дальнейшее чтение

• Сладек FM, Дарнелл Дж. Э. (апрель 1992 г.). «Механизмы экспрессии генов, специфичных для печени». Текущее мнение в области генетики и развития . 2 (2): 256–9. дои : 10.1016/S0959-437X(05)80282-5 . ПМИД   1638120 .
• Гомбарт А.Ф., Кеффлер Х.П. (январь 2002 г.). «Дефицит специфичных для нейтрофилов гранул и мутации в гене, кодирующем фактор транскрипции C/EBP (эпсилон)». Современное мнение в гематологии . 9 (1): 36–42. дои : 10.1097/00062752-200201000-00007 . ПМИД   11753076 . S2CID   25411864 .
• Уильямс СК, Кантвелл Калифорния, Джонсон ПФ (сентябрь 1991 г.). «Семейство белков, родственных C/EBP, способных образовывать ковалентно связанные димеры лейциновой молнии in vitro» . Гены и развитие . 5 (9): 1553–67. дои : 10.1101/gad.5.9.1553 . ПМИД   1884998 .
• Антонсон П., Стеллан Б., Яманака Р., Ксантопулос К.Г. (июль 1996 г.). «Новый ген человеческого белка, связывающего CCAAT/энхансер, C/EBPepsilon, экспрессируется в клетках лимфоидного и миелоидного происхождения и локализуется на хромосоме 14q11.2 рядом с локусом альфа/дельта рецептора Т-клеток». Геномика . 35 (1): 30–8. дои : 10.1006/geno.1996.0319 . ПМИД   8661101 .
• Чумаков А.М., Грилье И., Чумакова Е., Чих Д., Слейтер Дж., Кеффлер Х.П. (март 1997 г.). «Клонирование нового транскрипционного фактора C/EBP-эпсилон, специфичного для миелоидных клеток человека» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (3): 1375–86. дои : 10.1128/mcb.17.3.1375 . ПМК   231862 . ПМИД   9032264 .
• Яманака Р., Ким Г.Д., Радомска Х.С., Лекстром-Хаймс Дж., Смит Л.Т., Антонсон П., Тенен Д.Г., Ксантопулос К.Г. (июнь 1997 г.). «CCAAT/белок, связывающий энхансер эпсилон, преимущественно регулируется во время гранулоцитарной дифференцировки, и его функциональная универсальность определяется альтернативным использованием промоторов и дифференциальным сплайсингом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (12): 6462–7. дои : 10.1073/pnas.94.12.6462 . ПМК   21072 . ПМИД   9177240 .
• Вербек В., Гомбарт А.Ф., Чумаков А.М., Мюллер С., Фридман А.Д., Кеффлер Х.П. (май 1999 г.). «C/EBPepsilon напрямую взаимодействует с ДНК-связывающим доменом c-myb и совместно активирует транскрипцию миелоидных промоторов» . Кровь . 93 (10): 3327–37. дои : 10.1182/blood.V93.10.3327 . ПМИД   10233885 .
• Лекстром-Хаймс Дж.А., Дорман С.Е., Копар П., Холланд С.М., Галлин Дж.И. (июнь 1999 г.). «Дефицит специфичных для нейтрофилов гранул возникает в результате новой мутации с потерей функции фактора транскрипции CCAAT/белка, связывающего энхансер эпсилон» . Журнал экспериментальной медицины . 189 (11): 1847–52. дои : 10.1084/jem.189.11.1847 . ПМК   2193089 . ПМИД   10359588 .
• Тавор С., Вуонг П.Т., Парк DJ, Гомбарт А.Ф., Коэн А.Х., Кеффлер Х.П. (март 2002 г.). «Функциональное созревание макрофагов и выработка цитокинов нарушены у мышей с дефицитом эпсилон C/EBP» . Кровь . 99 (5): 1794–801. дои : 10.1182/blood.V99.5.1794 . ПМИД   11861297 .
• Чжан П., Нельсон Э., Радомска Х.С., Ивасаки-Арай Дж., Акаши К., Фридман А.Д., Тенен Д.Г. (июнь 2002 г.). «Индукция гранулоцитарной дифференцировки по 2 путям» . Кровь . 99 (12): 4406–12. дои : 10.1182/blood.V99.12.4406 . ПМИД   12036869 .
• Ким Дж., Кэнтуэлл, Калифорния, Джонсон П.Ф., Пфарр СМ, Уильямс СК (октябрь 2002 г.). «Транскрипционная активность CCAAT/белков, связывающих энхансер, контролируется консервативным ингибирующим доменом, который является мишенью для сумойлирования» . Журнал биологической химии . 277 (41): 38037–44. дои : 10.1074/jbc.M207235200 . ПМИД   12161447 .
• Ду Дж, Станкевич М.Дж., Лю Ю, Си Q, Шмитц Дж.Э., Лекстром-Хаймс Дж.А., Акерман С.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Новые комбинаторные взаимодействия изоформ GATA-1, PU.1 и C/EBPepsilon регулируют транскрипцию гена, кодирующего основной основной белок эозинофильных гранул» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43481–94. дои : 10.1074/jbc.M204777200 . ПМИД   12202480 .
• Труонг Б.Т., Ли Ю.Дж., Лоди Т.А., Парк DJ, Перротти Д., Ватанабэ Н., Коффлер Х.П., Накадзима Х., Тенен Д.Г., Коган С.С. (февраль 2003 г.). «Белки, связывающие CCAAT/Enhancer, подавляют лейкемический фенотип острого миелолейкоза». Кровь . 101 (3): 1141–8. дои : 10.1182/blood-2002-05-1374 . ПМИД   12393450 .
• Гомбарт А.Ф., Квок С.Х., Андерсон К.Л., Ямагучи Ю., Торбетт Б.Е., Кеффлер Х.П. (апрель 2003 г.). «Регуляция экспрессии генов вторичных гранул нейтрофилов и эозинофилов с помощью факторов транскрипции C/EBP эпсилон и PU.1» . Кровь . 101 (8): 3265–73. дои : 10.1182/blood-2002-04-1039 . ПМИД   12515729 .
• Ханна-Гупта А., Зибелло Т., Сан Х., Гейнс П., Берлинер Н. (май 2003 г.). «Исследования иммунопреципитации хроматина (ChIP) указывают на роль белков альфа и эпсилон, связывающих энхансер CCAAT (C/EBP альфа и C/EBP эпсилон) и CDP/cut в экспрессии гена лактоферрина, индуцированной созреванием миелоида» . Кровь . 101 (9): 3460–8. дои : 10.1182/кровь-2002-09-2767 . ПМИД   12522000 .
• Гери С., Гомбарт А.Ф., Фунг Ю.К., Кеффлер Х.П. (февраль 2004 г.). «C/EBPepsilon взаимодействует с ретинобластомой и E2F1 во время гранулопоэза». Кровь . 103 (3): 828–35. дои : 10.1182/кровь-2003-01-0159 . ПМИД   12947005 .
• Гери С., Парк DJ, Вуонг П.Т., Чи Д.И., Лемп Н., Кеффлер Х.П. (декабрь 2004 г.). «Ретиноевая кислота регулирует экспрессию гомологичного белка C/EBP (CHOP), что отрицательно регулирует миелоидные гены-мишени» . Кровь . 104 (13): 3911–7. дои : 10.1182/кровь-2003-10-3688 . ПМИД   15308577 .

Внешние ссылки

• Белок CEBPE, человеческий, в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• человека CEBPE Расположение генома и страница сведений о гене CEBPE в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .