АТФ5

АТФ5
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF5 , ATFX, HMFN0395, активирующий фактор транскрипции 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 606398 ; МГИ : 2141857 ; Гомологен : 32142 ; Генные карты : ATF5 ; ОМА : ATF5 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	49,933,935 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	44,466,082 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; right adrenal cortex; ; gastric mucosa; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; left testis; ; vena cava; ; right testis; ; monocyte; ; appendix;
	Top expressed in
	olfactory system; ; olfactory epithelium; ; left lobe of liver; ; lip; ; esophagus; ; molar; ; calvaria; ; ankle; ; plantaris muscle; ; extensor digitorum longus muscle;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	sequence-specific DNA binding; DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription corepressor activity; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; chromatin binding; tubulin binding; kinase binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	centrosome; transcription regulator complex; nucleoplasm; microtubule organizing center; cytoskeleton; nucleus; cytoplasm; cytosol;
Biological process	negative regulation of cell cycle G2/M phase transition; regulation of transcription, DNA-templated; olfactory bulb interneuron differentiation; multicellular organism growth; regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of apoptotic process; post-embryonic development; transcription, DNA-templated; cerebellar granule cell precursor proliferation; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of centrosome cycle; circadian rhythm; olfactory bulb interneuron development; regulation of gene expression; olfactory lobe development; negative regulation of transcription, DNA-templated; fat cell differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell population proliferation; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22809
	107503
	ENSG00000169136
	ENSMUSG00000038539
	Q9Y2D1
	О70191
	НМ_001193646 ; НМ_001290746 ; НМ_012068
	НМ_030693
	НП_001180575 ; НП_001277675 ; НП_036200
	НП_109618
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Активирующий фактор транскрипции 5 , также известный как ATF5 , представляет собой белок , который у человека кодируется ATF5 геном . ^[5]

Функция

Впервые описан Нисидзавой и Нагатой. ^[6] ATF5 был классифицирован как член активирующего транскрипционного фактора ( ATF семейства белков, связывающих ответный элемент )/цАМФ ( CREB ). ^[7]^[8]

Транскрипты и белок ATF5 экспрессируются в самых разных тканях, в частности, высокая экспрессия транскриптов наблюдается в печени. Он также присутствует в различных типах опухолевых клеток.

Экспрессия ATF5 регулируется как на транскрипционном, так и на трансляционном уровне.

ATF5 экспрессируется в VZ и SVZ во время развития мозга.

Белок ATF5 человека состоит из 282 аминокислот.

ATF5 представляет собой фактор транскрипции, содержащий домен bZip.

См. также

Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия

Было показано, что ATF5 взаимодействует с DISC1. ^[9] и ТРИБ3 . ^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169136 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038539 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: фактор транскрипции 5, активирующий ATF5» .
^ Пати Д., Мейстрих М.Л., Плон С.Е. (июль 1999 г.). «Человеческие ферменты, конъюгирующие убиквитин Cdc34 и Rad6B, нацелены на репрессоры циклической АМФ-индуцированной транскрипции для протеолиза» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 5001–13. дои : 10.1128/mcb.19.7.5001 . ПМЦ 84326 . ПМИД 10373550 .
^ Хай Т., Хартман М.Г. (июль 2001 г.). «Молекулярная биология и номенклатура семейства транскрипционных факторов, связывающих активирующий транскрипционный фактор / цАМФ-чувствительный элемент: белки активирующего транскрипционного фактора и гомеостаз». Джин . 273 (1): 1–11. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00551-0 . ПМИД 11483355 .
^ Винсон С., Мякишев М., Ачарья А., Мир А.А., Молл Дж.Р., Бонович М. (сентябрь 2002 г.). «Классификация белков B-ZIP человека на основе свойств димеризации» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6321–6335. дои : 10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002 . ПМЦ 135624 . ПМИД 12192032 .
^ Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (июль 2003 г.). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой белок, связанный с центросомой, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией». Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–1608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .
^ Чжоу Ю, Ли Л, Лю Ц, Син Г, Куай Х, Сунь Дж, Инь Х, Ван Дж, Чжан Л, Хэ Ф (май 2008 г.). «Е3-убиквитинлигаза SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3». Клетка. Сигнал . 20 (5): 942–948. дои : 10.1016/j.cellsig.2008.01.010 . ПМИД 18276110 .

Дальнейшее чтение

Пати Д., Мейстрих М.Л., Плон С.Е. (1999). «Человеческие ферменты, конъюгирующие убиквитин Cdc34 и Rad6B, нацелены на репрессоры циклической АМФ-индуцированной транскрипции для протеолиза» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 5001–13. дои : 10.1128/mcb.19.7.5001 . ПМЦ 84326 . ПМИД 10373550 .
Уайт Дж.Х., Макилхинни Р.А., Уайз А., Сируэла Ф., Чан В.И., Эмсон ПК, Биллинтон А., Маршалл Ф.Х. (2001). «Рецептор GABAB напрямую взаимодействует с родственными факторами транскрипции CREB2 и ATFx» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (25): 13967–13972. Бибкод : 2000PNAS...9713967W . дои : 10.1073/pnas.240452197 . ПМК 17684 . ПМИД 11087824 .
Питерс К.С., Лян Х, Ли С., Каннан С., Пэн Ю., Тауб Р., Даймонд Р.Х. (2001). «ATF-7, новый белок bZIP, взаимодействует с белком PRL-1-тирозинфосфатазой» . Ж. Биол. Хим . 276 (17): 13718–26. дои : 10.1074/jbc.M011562200 . ПМИД 11278933 .
Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (2004). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой белок, связанный с центросомой, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией». Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–1608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .
Ямада С, Охира М, Хорие Х, Андо К, Такаясу Х, Судзуки Ю, Сугано С, Хирата Т, Гото Т, Мацунага Т, Хияма Е, Хаяси Ю, Андо Х, Суита С, Канеко М, Сасаки Ф, Хасидзуме К , Онума Н., Накагавара А. (2004). «Профилирование экспрессии и дифференциальный скрининг гепатобластом и соответствующей нормальной печени: идентификация высокой экспрессии онкогена PLK1 как индикатора плохого прогноза гепатобластом». Онкоген . 23 (35): 5901–5911. дои : 10.1038/sj.onc.1207782 . ПМИД 15221005 . S2CID 3114318 .
Лю В, Сунь М, Цзян Дж, Шэнь Икс, Сунь Ц, Лю В, Шэнь Х, Гу Дж (2004). «Циклин D3 взаимодействует с человеческим активирующим фактором транскрипции 5 и усиливает его транскрипционную активность». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 321 (4): 954–960. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.053 . ПМИД 15358120 .
Форгакс Э., Гупта С.К., Керри Дж.А., Семмес О.Дж. (2005). «Транскрипционный фактор bZIP ATFx связывает Tax вируса Т-клеточного лейкоза человека типа 1 (HTLV-1) и подавляет транскрипцию, опосредованную длинным терминальным повтором HTLV-1» . Дж. Вирол . 79 (11): 6932–6939. doi : 10.1128/JVI.79.11.6932-6939.2005 . ПМК 1112100 . ПМИД 15890932 .
Аль Саррадж Дж., Винсон С., Тиль Дж. (2005). «Регуляция транскрипции гена аспарагинсинтетазы с помощью факторов транскрипции лейциновой молнии основной области ATF5 и CHOP». Биол. Хим . 386 (9): 873–879. дои : 10.1515/BC.2005.102 . ПМИД 16164412 . S2CID 24061972 .
Ангеластро Дж.М., Канолл П.Д., Куо Дж., Вейкер М., Коста А., Брюс Дж.Н., Грин Л.А. (2006). «Селективное разрушение клеток глиобластомы путем вмешательства в активность или экспрессию ATF5». Онкоген . 25 (6): 907–916. дои : 10.1038/sj.onc.1209116 . ПМИД 16170340 . S2CID 19581052 .
Вэй Ю, Цзян Дж, Сунь М, Чен Икс, Ван Х, Гу Дж (2006). «ATF5 увеличивает апоптоз, индуцированный цисплатином, за счет усиления транскрипции циклина D3 в клетках HeLa». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 339 (2): 591–596. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.11.054 . ПМИД 16300731 .
Какиучи С., Ишивата М., Нанко С., Кунуги Х., Минабе Ю., Накамура К., Мори Н., Фуджи К., Ямада К., Ёсикава Т., Като Т. (2007). «Анализ ассоциаций ATF4 и ATF5, генов взаимодействующих белков DISC1, при биполярном расстройстве». Неврология. Летт . 417 (3): 316–321. дои : 10.1016/j.neulet.2007.02.054 . ПМИД 17346882 . S2CID 7488805 .
Вататани Ю., Итикава К., Наканиси Н., Фудзимото М., Такеда Х., Кимура Н., Хиросе Х., Такахаси С., Такахаши Ю. (2008). «Стресс-индуцированная трансляция мРНК ATF5 регулируется 5'-нетранслируемой областью» . Ж. Биол. Хим . 283 (5): 2543–2553. дои : 10.1074/jbc.M707781200 . ПМИД 18055463 .

Внешние ссылки

ATF5 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека Местоположение генома ATF5 и страница сведений о гене ATF5 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000169136 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038539 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: фактор транскрипции 5, активирующий ATF5» .

[pmid10373550-6] Пати Д., Мейстрих М.Л., Плон С.Е. (июль 1999 г.). «Человеческие ферменты, конъюгирующие убиквитин Cdc34 и Rad6B, нацелены на репрессоры циклической АМФ-индуцированной транскрипции для протеолиза» . Мол. Клетка. Биол . 19 (7): 5001–13. дои : 10.1128/mcb.19.7.5001 . ПМЦ 84326 . ПМИД 10373550 .

[pmid11483355-7] Хай Т., Хартман М.Г. (июль 2001 г.). «Молекулярная биология и номенклатура семейства транскрипционных факторов, связывающих активирующий транскрипционный фактор / цАМФ-чувствительный элемент: белки активирующего транскрипционного фактора и гомеостаз». Джин . 273 (1): 1–11. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00551-0 . ПМИД 11483355 .

[pmid12192032-8] Винсон С., Мякишев М., Ачарья А., Мир А.А., Молл Дж.Р., Бонович М. (сентябрь 2002 г.). «Классификация белков B-ZIP человека на основе свойств димеризации» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6321–6335. дои : 10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002 . ПМЦ 135624 . ПМИД 12192032 .

[pmid12812986-9] Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (июль 2003 г.). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой белок, связанный с центросомой, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией». Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–1608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .

[pmid18276110-10] Чжоу Ю, Ли Л, Лю Ц, Син Г, Куай Х, Сунь Дж, Инь Х, Ван Дж, Чжан Л, Хэ Ф (май 2008 г.). «Е3-убиквитинлигаза SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3». Клетка. Сигнал . 20 (5): 942–948. дои : 10.1016/j.cellsig.2008.01.010 . ПМИД 18276110 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

v т и Регулом
Inhibits	NGF