ГАТА5

ГАТА5
Идентификаторы
Псевдонимы	GATA5 , GATAS, bB379O24.1, GATA-связывающий белок 5, CHTD5
Внешние идентификаторы	Опустить : 611496 ; МГИ : 109497 ; Гомологен : 32031 ; Генные карты : GATA5 ; OMA : GATA5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	62,475,995 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	179,976,492 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; left uterine tube; ; jejunal mucosa; ; duodenum; ; right testis; ; left testis; ; body of stomach; ; right adrenal cortex; ; urinary bladder; ; fundus;
	Top expressed in
	jejunum; ; pyloric antrum; ; epithelium of stomach; ; duodenum; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; ileum; ; mucous cell of stomach; ; vasculature of trunk; ; lung parenchyma; ; intestinal epithelium;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; zinc ion binding; chromatin binding; metal ion binding; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding;
Cellular component	transcription regulator complex; nucleoplasm; nucleus;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; cellular response to BMP stimulus; blood coagulation; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; intestinal epithelial cell differentiation; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; aortic valve morphogenesis; endocardial cushion fusion; negative regulation of cardiac muscle hypertrophy; positive regulation of gene expression; negative regulation of gene expression; positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction; positive regulation of cardiac endothelial to mesenchymal transition; heart development; animal organ morphogenesis; tissue development; cell development; anatomical structure formation involved in morphogenesis; digestive tract development; cardiac muscle tissue development; circulatory system development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	140628
	14464
	ENSG00000130700
	ENSMUSG00000015627
	Q9BWX5
	P97489
	НМ_080473
	НМ_008093
	НП_536721
	НП_032119
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор GATA-5 представляет собой белок , который у человека кодируется GATA5 геном . ^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой фактор транскрипции, содержащий два цинковых пальца GATA-типа. Известно, что кодируемый белок связывается с ядерным фактором-1альфа гепатоцитов (HNF-1альфа), и это взаимодействие важно для совместной активации промотора кишечной лактазно-флоризингидролазы. У других организмов сходные белки могут участвовать в создании разнообразия гладкомышечных клеток сердца. ^[6]

Роль в развитии

Gata5 является фактором транскрипции. Gata5 регулирует правильное развитие сердца. На ранних стадиях развития эмбриона Gata5 помогает убедиться в том, что вырабатывается достаточно клеток-предшественников сердечной мышцы, чтобы дифференцироваться в окончательные клетки миокарда. Он также регулирует другие гены, которые имеют решающее значение для успешного развития сердца. ^[7] По мере развития беременности Gata 5 участвует в формировании сердечной ткани, которая становится желудочками. Проблемы могут возникнуть, когда Gata5 чрезмерно экспрессируется. Эта сверхэкспрессия может привести к эктопическим очагам . Эктопические очаги еще называют эктопическими кардиостимуляторами. Это пучки клеток, которые могут вызывать стимуляцию сердца и расположены в тех местах сердца, где их быть не должно. Эти клетки могут возбудиться раньше, чем должно быть возбуждено сердце. Это заставляет сердце биться и, таким образом, сокращаться раньше, чем должно. Часто это не имеет большого значения, и сердце естественным образом возвращается к нормальному ритму. Однако, если это вызвано проблемами с развитием сердца (если Gata5 не экспрессируется должным образом в эмбрионе), то это может привести к постоянным проблемам с эктопическими очагами. Эти проблемы включают тахикардию (слишком быстрое сердцебиение), брадикардию (слишком медленное сердцебиение) или фибрилляцию желудочков. ^[8] Это серьезное заболевание, при котором желудочки сердца не работают постоянно и не могут доставлять кровь в организм.

См. также

Транскрипционный фактор GATA

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130700 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015627 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гао X, Седжвик Т., Ши Ю.Б., Эванс Т. (май 1998 г.). «Транскрипционные факторы GATA-4, -5 и -6 выполняют различные функции в регуляции дифференцировки эпителиальных клеток кишечника» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2901–11. дои : 10.1128/mcb.18.5.2901 . ПМК 110669 . ПМИД 9566909 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: GATA5 GATA-связывающий белок 5» .
^ Рейтер Дж. Ф., Александр Дж., Родауэй А., Йелон Д., Пациент Р., Холдер Н., Стейнир Д.Ю. (ноябрь 1999 г.). «Gata5 необходим для развития сердца и эндодермы у рыбок данио» . Гены и развитие . 13 (22): 2983–95. дои : 10.1101/gad.13.22.2983 . ПМК 317161 . ПМИД 10580005 .
^ «Фибрилляция желудочков» . Клиника Майо.

Дальнейшее чтение

Какита Т., Хасегава К., Моримото Т., Кабураги С., Вада Х., Сасаяма С. (ноябрь 1999 г.). «Белок p300 как коактиватор GATA-5 в транскрипции гена предсердного натрийуретического фактора, ограниченного сердцем» . Журнал биологической химии . 274 (48): 34096–102. дои : 10.1074/jbc.274.48.34096 . HDL : 2433/150538 . ПМИД 10567378 .
Красински С.Д., Ван Веринг Х.М., Таннемаат М.Р., Гранд Р.Дж. (июль 2001 г.). «Дифференциальная активация промоторов кишечных генов: функциональные взаимодействия между GATA-5 и HNF-1 альфа». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени . 281 (1): G69–84. дои : 10.1152/ajpgi.2001.281.1.g69 . ПМИД 11408257 . S2CID 292507 .
ван Веринг Х.М., Хуибрегце И.Л., ван дер Зван С.М., де Би М.С., Даулинг Л.Н., Будро Ф., Рингс Э.Х., Гранд Р.Дж., Красински С.Д. (август 2002 г.). «Физическое взаимодействие между GATA-5 и ядерным фактором-1 альфа гепатоцитов приводит к синергической активации промотора лактазно-флоризингидролазы человека» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27659–67. дои : 10.1074/jbc.M203645200 . ПМИД 12011060 .
Бенчабане Х., Врана Дж.Л. (сентябрь 2003 г.). «GATA- и Smad1-зависимые энхансеры в гене Smad7 по-разному интерпретируют концентрации костных морфогенетических белков» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (18): 6646–61. дои : 10.1128/MCB.23.18.6646-6661.2003 . ЧВК 193708 . ПМИД 12944489 .
Акияма Ю., Уоткинс Н., Сузуки Х., Джейр К.В., ван Энгеланд М., Эстеллер М., Сакаи Х., Рен С.И., Юаса Ю., Херман Дж.Г. , Бэйлин С.Б. (декабрь 2003 г.). «Гены транскрипционных факторов GATA-4 и GATA-5 и потенциальные нижестоящие противоопухолевые гены-мишени эпигенетически подавляются при колоректальном раке и раке желудка» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (23): 8429–39. дои : 10.1128/MCB.23.23.8429-8439.2003 . ПМЦ 262684 . ПМИД 14612389 .
Дивайн Дж.К., Сталоч Л.Дж., Хавери Х., Якобсен К.М., Уилсон Д.Б., Хейкинхеймо М., Саймон Т.С. (ноябрь 2004 г.). «GATA-4, GATA-5 и GATA-6 активируют ген белка, связывающего жирные кислоты печени крысы, совместно с HNF-1альфа». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени . 287 (5): G1086–99. дои : 10.1152/ajpgi.00421.2003 . ПМИД 14715527 . S2CID 25481694 .
Го М, Акияма Ю, Хаус М.Г., Хукер С.М., Хит Э., Габриэльсон Э., Ян С.К., Хан Ю., Бэйлин С.Б., Герман Дж.Г., Брок М.В. (декабрь 2004 г.). «Гиперметилирование генов GATA при раке легких» . Клинические исследования рака . 10 (23): 7917–24. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-04-1140 . ПМИД 15585625 .
Вакана К., Акияма Ю., Асо Т., Юаса Ю. (сентябрь 2006 г.). «Участие транскрипционных факторов GATA-4/-5 в канцерогенезе яичников». Письма о раке . 241 (2): 281–8. дои : 10.1016/j.canlet.2005.10.039 . ПМИД 16337738 .
Го М., Хаус М.Г., Акияма Ю., Ци Ю., Капанья Д., Хармон Дж., Бэйлин С.Б., Брок М.В., Герман Дж.Г. (ноябрь 2006 г.). «Гиперметилирование семейства генов GATA при раке пищевода» . Международный журнал рака . 119 (9): 2078–83. дои : 10.1002/ijc.22092 . ПМИД 16823849 .

Внешние ссылки

GATA5 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130700 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015627 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9566909-5] Гао X, Седжвик Т., Ши Ю.Б., Эванс Т. (май 1998 г.). «Транскрипционные факторы GATA-4, -5 и -6 выполняют различные функции в регуляции дифференцировки эпителиальных клеток кишечника» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2901–11. дои : 10.1128/mcb.18.5.2901 . ПМК 110669 . ПМИД 9566909 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: GATA5 GATA-связывающий белок 5» .

[7] Рейтер Дж. Ф., Александр Дж., Родауэй А., Йелон Д., Пациент Р., Холдер Н., Стейнир Д.Ю. (ноябрь 1999 г.). «Gata5 необходим для развития сердца и эндодермы у рыбок данио» . Гены и развитие . 13 (22): 2983–95. дои : 10.1101/gad.13.22.2983 . ПМК 317161 . ПМИД 10580005 .

[8] «Фибрилляция желудочков» . Клиника Майо.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]