Транскрипционный фактор II А

общий фактор транскрипции IIA, 2, 12 кДа
общий фактор транскрипции IIA, 2, 12 кДа
Идентификаторы
Символ	GTF2A2
ген NCBI	2958
HGNC	4647
МОЙ БОГ	600519
RefSeq	НМ_004492
ЮниПрот	P52657
Другие данные
Локус	Хр. 15 q21.3
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

общий фактор транскрипции IIA, 1, 19/37 кДа
общий фактор транскрипции IIA, 1, 19/37 кДа
Идентификаторы
Символ	GTF2A1
ген NCBI	2957
HGNC	4646
МОЙ БОГ	600520
RefSeq	НМ_201595
ЮниПрот	P52655
Другие данные
Локус	Хр. 14 q31
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

транскрипции TF _II A — ядерный белок , участвующий в РНК-полимеразы II зависимой от транскрипции ДНК Фактор . ^[1] TF _II A является одним из нескольких общих (базальных) факторов транскрипции ( GTF ), которые необходимы для всех событий транскрипции, в которых используется РНК-полимераза II. Другие GTF включают TF _II D , комплекс, состоящий из ТАТА-связывающего белка -ассоциированных факторов (TAF), а также факторов TF _II B , TF _II E , TF _II F и TF _II H. TBP и TBP Вместе эти факторы ответственны за узнавание промотора и образование комплекса преинициации транскрипции (PIC), способного инициировать синтез РНК из матрицы ДНК.

Функции

TF _II A взаимодействует с TBP субъединицей TF _II D и способствует связыванию TBP с ТАТА-бокс , содержащей ДНК промотора . ^[2]^[3] Взаимодействие ТФ _II А с ТБФ облегчает образование и стабилизирует преинициаторный комплекс . Взаимодействие ТФ _II А с ТБФ также приводит к исключению негативных (репрессивных) факторов, которые в противном случае могли бы связываться с ТБФ и мешать образованию PIC. TF _II A также действует как коактиватор для некоторых активаторов транскрипции , способствуя их способности увеличивать или активировать транскрипцию. Потребность в транскрипционных системах TF _II A in vitro варьируется, и его можно рассматривать либо как GTF, либо как слабо ассоциированный TAF-подобный коактиватор. Генетический анализ дрожжей показал, что TF _II A необходим для жизнеспособности.

Структура

TF _II A представляет собой гетеродимер с двумя субъединицами : одной большой непроцессированной (субъединица 1 или альфа/бета; название гена GTF2A1 ) и одной маленькой (субъединица 2 или гамма; название гена GTF2A2 ). ^[4]^[5] Первоначально считалось, что это гетеротример альфа (p35), бета (p19) и гамма-субъединицы (p12). У человека размеры кодируемых белков составляют примерно 55 кДа и 12 кДа. Оба гена присутствуют у различных видов, от человека до дрожжей, и их белковые продукты взаимодействуют, образуя комплекс, состоящий из бета-цилиндра домена и домена альфа-спирального пучка . Именно N-концевые и С-концевые участки большой субъединицы участвуют во взаимодействиях с малой субъединицей. Эти области разделены другим доменом, последовательность которого всегда присутствует в крупных субъединицах разных видов, но размер которого варьируется и последовательность которого плохо консервативна . Второй ген, кодирующий большую субъединицу TF _II A, был обнаружен у некоторых высших эукариот . Этот ген, ALF/TFIAtau (название гена GTF2A1LF ), экспрессируется только в ооцитах и сперматоцитах TF _II , что позволяет предположить, что он играет подобную A регуляторную роль в экспрессии генов только в зародышевых клетках .

Ссылки

^ Хойби Т., Чжоу Х., Митсиу Дж., Станненберг Х.Г. (2007). «Подтяжка лица для общего фактора транскрипции TFIIA». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1769 (7–8): 429–36. дои : 10.1016/j.bbaexp.2007.04.008 . hdl : 2066/34866 . ПМИД 17560669 .
^ Тан Х, Сунь Х, Рейнберг Д., Эбрайт Р.Х. (февраль 1996 г.). «Белко-белковые взаимодействия при инициации транскрипции эукариот: структура преинициаторного комплекса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (3): 1119–24. Бибкод : 1996PNAS...93.1119T . дои : 10.1073/pnas.93.3.1119 . ПМК 40041 . ПМИД 8577725 .
^ Громче Р.К., Хе Ю., Лопес-Бланко-младший, Фанг Дж., Чакон П., Ногалес Э. (март 2016 г.). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки прединициаторного комплекса человека» . Природа . 531 (7596): 604–9. Бибкод : 2016Natur.531..604L . дои : 10.1038/nature17394 . ПМЦ 4856295 . ПМИД 27007846 .
^ ДеДжонг Дж., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1993 г.). «Одна кДНК, hTFIIA/альфа, кодирует субъединицы p35 и p19 человеческого TFIIA» . Гены и развитие . 7 (11): 2220–34. дои : 10.1101/gad.7.11.2220 . ПМИД 8224848 .
^ Озер Дж., Мур П.А., Болден А.Х., Ли А., Розен К.А., Либерман П.М. (октябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование малой (гамма) субъединицы человеческого TFIIA выявляет функции, критически важные для активации транскрипции» . Гены и развитие . 8 (19): 2324–35. дои : 10.1101/gad.8.19.2324 . ПМИД 7958899 .

Внешние ссылки

Транскрипция + Фактор + TFIIA в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[pmid17560669-1] Хойби Т., Чжоу Х., Митсиу Дж., Станненберг Х.Г. (2007). «Подтяжка лица для общего фактора транскрипции TFIIA». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1769 (7–8): 429–36. дои : 10.1016/j.bbaexp.2007.04.008 . hdl : 2066/34866 . ПМИД 17560669 .

[2] Тан Х, Сунь Х, Рейнберг Д., Эбрайт Р.Х. (февраль 1996 г.). «Белко-белковые взаимодействия при инициации транскрипции эукариот: структура преинициаторного комплекса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (3): 1119–24. Бибкод : 1996PNAS...93.1119T . дои : 10.1073/pnas.93.3.1119 . ПМК 40041 . ПМИД 8577725 .

[3] Громче Р.К., Хе Ю., Лопес-Бланко-младший, Фанг Дж., Чакон П., Ногалес Э. (март 2016 г.). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки прединициаторного комплекса человека» . Природа . 531 (7596): 604–9. Бибкод : 2016Natur.531..604L . дои : 10.1038/nature17394 . ПМЦ 4856295 . ПМИД 27007846 .

[pmid8224848-4] ДеДжонг Дж., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1993 г.). «Одна кДНК, hTFIIA/альфа, кодирует субъединицы p35 и p19 человеческого TFIIA» . Гены и развитие . 7 (11): 2220–34. дои : 10.1101/gad.7.11.2220 . ПМИД 8224848 .

[pmid7958899-5] Озер Дж., Мур П.А., Болден А.Х., Ли А., Розен К.А., Либерман П.М. (октябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование малой (гамма) субъединицы человеческого TFIIA выявляет функции, критически важные для активации транскрипции» . Гены и развитие . 8 (19): 2324–35. дои : 10.1101/gad.8.19.2324 . ПМИД 7958899 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]