НОХB13

НОХB13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2CRA
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXB13 , PSGD, гомеобокс B13, HPC9
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604607 ; МГИ : 107730 ; Гомологен : 4640 ; Генные карты : HOXB13 ; ОМА : HOXB13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	48,728,750 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	rectum; ; mucosa of sigmoid colon; ; prostate; ; mucosa of transverse colon; ; gonad; ; vagina; ; epithelium of colon; ; muscle layer of sigmoid colon; ; urinary bladder; ; muscle tissue;
	n/a
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; methyl-CpG binding;
Cellular component	nucleus; transcription regulator complex; nucleoplasm;
Biological process	response to testosterone; morphogenesis of an epithelium; multicellular organism development; regulation of growth; regulation of transcription, DNA-templated; response to wounding; prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis; angiogenesis; transcription, DNA-templated; epithelial cell maturation involved in prostate gland development; epidermis development; prostate gland development; negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10481
	15408
	ENSG00000159184
	ENSMUSG00000049604
	Q92826
	P70321
	НМ_006361
	НМ_008267
	НП_006352
	НП_032293
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-B13 — это белок , который у человека кодируется HOXB13 геном . ^[4]^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует транскрипционный фактор, принадлежащий к семейству генов гомеобокса. Гены этого семейства высококонсервативны среди позвоночных и необходимы для эмбрионального развития позвоночных. Этот ген участвует в развитии кожи плода и регенерации кожи. У мышей было показано, что сходный ген демонстрирует временную и пространственную колинеарность в основной оси тела эмбриона, но не экспрессируется во вторичных осях, что указывает на функции в формировании паттерна тела вдоль этой оси. Этот ген и другие гены HOXB образуют кластер генов на хромосоме 17 в районе 17q21-22. ^[6]Мужчины, унаследовавшие редкий (<0,1% в выбранной группе пациентов без клинических признаков рака простаты) генетический вариант HOXB13 (G84E или rs138213197), имеют в 10–20 раз повышенный риск развития рака простаты. ^[7]^[8]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159184 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Зельцер Л., Десплан С., Хайнц Н. (август 1996 г.). «Hoxb-13: новый ген Hox в отдаленной области кластера HOXB сохраняет коллинеарность». Разработка . 122 (8): 2475–84. дои : 10.1242/dev.122.8.2475 . ПМИД 8756292 .
^ Стельницки Э.Дж., Арбайт Дж., Касс Д.Л., Санер С., Харрисон М., Ларгман С. (июль 1998 г.). «Модуляция генов гомеобокса человека PRX-2 и HOXB13 в бесрубцовых ранах плода» . Журнал исследовательской дерматологии . 111 (1): 57–63. дои : 10.1046/j.1523-1747.1998.00238.x . ПМИД 9665387 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомеобокс HOXB13 B13» .
^ Юинг CM, Рэй AM, Ланге EM, Зульке К.А., Роббинс CM, Тембе В.Д., Уайли К.Э., Исаакс С.Д., Джонг Д., Ван Й., Бизон С., Ян Г., Гилзак М., Партин А.В., Шанмугам В., Изатт Т., Синари С. , Крейг Д.В., Чжэн С.Л., Уолш ПК, Монти Дж.Э., Сюй Дж., Карптен Дж.Д., Исаакс В.Б., Куни К.А. (январь 2012 г.). «Зародышевые мутации HOXB13 и риск рака простаты» . Медицинский журнал Новой Англии . 366 (2): 141–9. дои : 10.1056/NEJMoa1110000 . ПМЦ 3779870 . ПМИД 22236224 .
^ Дюпон В.Д., Брейер Дж., Джонсон С.Х., Пламмер В.Д., Смит-младший (май 2021 г.). «Варианты риска рака простаты генетического локуса HOXB» . Научные отчеты . 11 (1): 11385. Бибкод : 2021NatSR..1111385D . дои : 10.1038/s41598-021-89399-7 . ПМК 8167119 . ПМИД 34059701 . S2CID 235269663 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Шен В.Ф., Монтгомери Дж.К., Розенфельд С., Москва Дж.Дж., Лоуренс Х.Дж., Бухберг А.М., Ларгман С. (ноябрь 1997 г.). «AbdB-подобные Hox-белки стабилизируют связывание ДНК с помощью гомеодоменовых белков Meis1» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (11): 6448–58. дои : 10.1128/MCB.17.11.6448 . ПМК 232497 . ПМИД 9343407 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Кёмювес Л.Г., Ма Х.К., Стельницки Е., Розенфельд С., Ода Ю., Ларгман С. (июнь 2003 г.). «Гомеодоменный белок HOXB13 является цитоплазматическим на протяжении всего развития кожи плода». Динамика развития . 227 (2): 192–202. дои : 10.1002/dvdy.10290 . ПМИД 12761847 . S2CID 42243036 .
Юнг С., Ким Р.С., Ли С.Дж., Ван С., Дженг М.Х. (май 2004 г.). «Гомеодоменный белок HOXB13 подавляет рост клеток рака простаты за счет негативной регуляции Т-клеточного фактора 4» . Исследования рака . 64 (9): 3046–51. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-03-2614 . ПМИД 15126340 .
Юнг С., Ким Р.С., Чжан Х.Дж., Ли С.Дж., Дженг М.Х. (декабрь 2004 г.). «HOXB13 вызывает подавление роста клеток рака простаты в качестве репрессора гормон-активируемой передачи сигналов андрогенных рецепторов» . Исследования рака . 64 (24): 9185–92. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-1330 . ПМИД 15604291 .
Чжао Ю., Ямасита Т., Исикава М. (апрель 2005 г.). «Регуляция опухолевой инвазии с помощью гена HOXB13, сверхэкспрессируемого при раке эндометрия человека» . Отчеты онкологии . 13 (4): 721–6. дои : 10.3892/или.13.4.721 . ПМИД 15756448 .
Юнг С., Ким Р.С., Чжан Х., Ли С.Дж., Шэн Х., Лёрер П.Дж. , Гарднер Т.А., Дженг М.Х., Као С. (июнь 2005 г.). «При колоректальном раке снижается активность HOXB13, что приводит к TCF4-опосредованной трансактивации» . Британский журнал рака . 92 (12): 2233–9. дои : 10.1038/sj.bjc.6602631 . ПМК 2361828 . ПМИД 15928669 .
Symmans WF (апрель 2006 г.). «Геномное тестирование чувствительности рака молочной железы к гормональной терапии» . Клинические исследования рака . 12 (7, ч. 1): 1954–5. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-06-0289 . ПМИД 16609001 .
Гетц М.П., Суман В.Дж., Ингл Дж.Н., Ниббе А.М., Вишер Д.В., Рейнольдс К.А., Лингл В.Л., Эрландер М., Ма XJ, Сгрой Д.С., Перес Э.А., Коуч Ф.Дж. (апрель 2006 г.). «Соотношение экспрессии двух генов гомеобокса 13 и рецептора интерлейкина-17B для прогнозирования рецидива и выживаемости у женщин, получающих адъювантный тамоксифен». Клинические исследования рака . 12 (7, ч. 1): 2080–7. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-05-1263 . ПМИД 16609019 . S2CID 9930864 .
Казаль С, Собрал А.П., де Алмейда, дас Грасас Силва-Валенсуэла М, Дураццо М.Д., Нуньес Ф.Д. (июль 2006 г.). «Гомеобокс HOXB13 экспрессируется в малой слюнной железе человека». Заболевания полости рта . 12 (4): 424–7. дои : 10.1111/j.1601-0825.2005.01218.x . ПМИД 16792730 .
Ма XJ, Хильзенбек С.Г. , Ван В., Дин Л., Сгрой Д.К., Бендер Р.А., Осборн С.К., Оллред Д.К., Эрландер М.Г. (октябрь 2006 г.). «Индекс экспрессии HOXB13:IL17BR является прогностическим фактором при раке молочной железы на ранней стадии» . Журнал клинической онкологии . 24 (28): 4611–9. дои : 10.1200/JCO.2006.06.6944 . ПМИД 17008703 .
Мутусами В., Дурайсами С., Брэдбери С.М., Хоббс С., Керли Д.П., Нельсон Б., Бозенберг М. (декабрь 2006 г.). «Эпигенетическое подавление новых супрессоров опухоли при злокачественной меланоме» . Исследования рака . 66 (23): 11187–93. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-1274 . ПМИД 17145863 .
Мяо Дж., Ван З., Провенчер Х., Мьюир Б., Дахия С., Карни Э., Леонг Кол.О., Сгрой Д.К., Орсулич С. (октябрь 2007 г.). «HOXB13 способствует прогрессированию рака яичников» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (43): 17093–8. Бибкод : 2007PNAS..10417093M . дои : 10.1073/pnas.0707938104 . ПМК 2040435 . ПМИД 17942676 .
Юинг CM, Рэй AM, Ланге EM, Зульке К.А., Роббинс CM, Тембе В.Д., Уайли К.Э., Исаакс С.Д., Джонг Д., Ван Й., Бизон С., Ян Г., Гилзак М., Партин А.В., Шанмугам В., Изатт Т., Синари С. , Крейг Д.В., Чжэн С.Л., Уолш ПК, Монти Дж.Э., Сюй Дж., Карптен Дж.Д., Исаакс В.Б., Куни К.А. (январь 2012 г.). «Зародышевые мутации HOXB13 и риск рака простаты» . Медицинский журнал Новой Англии . 366 (2): 141–9. дои : 10.1056/NEJMoa1110000 . ПМЦ 3779870 . ПМИД 22236224 .

Внешние ссылки

HOXB13+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q92826 (белок Homeobox Hox-B13) на PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159184 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8756292-4] Зельцер Л., Десплан С., Хайнц Н. (август 1996 г.). «Hoxb-13: новый ген Hox в отдаленной области кластера HOXB сохраняет коллинеарность». Разработка . 122 (8): 2475–84. дои : 10.1242/dev.122.8.2475 . ПМИД 8756292 .

[pmid9665387-5] Стельницки Э.Дж., Арбайт Дж., Касс Д.Л., Санер С., Харрисон М., Ларгман С. (июль 1998 г.). «Модуляция генов гомеобокса человека PRX-2 и HOXB13 в бесрубцовых ранах плода» . Журнал исследовательской дерматологии . 111 (1): 57–63. дои : 10.1046/j.1523-1747.1998.00238.x . ПМИД 9665387 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомеобокс HOXB13 B13» .

[pmid22236224-7] Юинг CM, Рэй AM, Ланге EM, Зульке К.А., Роббинс CM, Тембе В.Д., Уайли К.Э., Исаакс С.Д., Джонг Д., Ван Й., Бизон С., Ян Г., Гилзак М., Партин А.В., Шанмугам В., Изатт Т., Синари С. , Крейг Д.В., Чжэн С.Л., Уолш ПК, Монти Дж.Э., Сюй Дж., Карптен Дж.Д., Исаакс В.Б., Куни К.А. (январь 2012 г.). «Зародышевые мутации HOXB13 и риск рака простаты» . Медицинский журнал Новой Англии . 366 (2): 141–9. дои : 10.1056/NEJMoa1110000 . ПМЦ 3779870 . ПМИД 22236224 .

[8] Дюпон В.Д., Брейер Дж., Джонсон С.Х., Пламмер В.Д., Смит-младший (май 2021 г.). «Варианты риска рака простаты генетического локуса HOXB» . Научные отчеты . 11 (1): 11385. Бибкод : 2021NatSR..1111385D . дои : 10.1038/s41598-021-89399-7 . ПМК 8167119 . ПМИД 34059701 . S2CID 235269663 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]