БАТФ (ген)

БАТФ
Идентификаторы
Псевдонимы	BATF , B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, основная лейциновая застежка-молния АТФ-подобный транскрипционный фактор
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 612476 ; МГИ : 1859147 ; Гомологен : 4666 ; GeneCards : BATF ; ОМА : БАТФ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	75,546,993 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	85,755,861 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; blood; ; monocyte; ; spleen; ; lymph node; ; appendix; ; palpebral conjunctiva; ; testicle; ; bone marrow; ; olfactory zone of nasal mucosa;
	Top expressed in
	granulocyte; ; embryo; ; spleen; ; embryo; ; lymph node; ; blood; ; mesenteric lymph nodes; ; thymus; ; parotid gland; ; subcutaneous adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; nucleus;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; T-helper 2 cell differentiation; cytokine production; DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; myeloid dendritic cell differentiation; lymphoid progenitor cell differentiation; T-helper 17 cell lineage commitment; cellular response to DNA damage stimulus; hematopoietic stem cell differentiation; isotype switching; T-helper 17 cell differentiation; defense response to protozoan; cytokine-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10538
	53314
	ENSG00000156127
	ENSMUSG00000034266
	Q16520
	О35284
	НМ_006399
	НМ_016767
	НП_006390
	НП_058047
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Основной фактор транскрипции лейциновой молнии, ATF-подобный , также известный как BATF , представляет собой белок , который у человека кодируется BATF геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок ядерной основной лейциновой молнии ( bZIP ), который принадлежит к AP-1 / ATF суперсемейству транскрипционных факторов . Лейциновая застежка этого белка опосредует димеризацию с членами семейства Jun белков . Считается, что этот белок является негативным регулятором событий транскрипции AP-1/ATF. ^[7]

Мыши без гена BATF ( мыши с нокаутом BATF ) не имели воспалительных иммунных клеток ( Th17 ) и были устойчивы к условиям, которые обычно вызывают аутоиммунные состояния, подобные рассеянному склерозу . ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что BATF (ген) взаимодействует с IFI35 . ^[9]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000156127 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034266 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дорси М.Дж., Тае Х.Дж., Солленбергер К.Г., Маскаренхас Н.Т., Йохансен Л.М., Тапаровски Э.Дж. (декабрь 1995 г.). «B-ATF: новый человеческий белок bZIP, который связывается с членами семейства транскрипционных факторов AP-1». Онкоген . 11 (11): 2255–65. ПМИД 8570175 .
^ Хасэгава Х., Уцуномия Ю., Кисимото К., Танге Ю., Ясукава М., Фудзита С. (май 1996 г.). «SFA-2, новый фактор транскрипции bZIP, индуцируемый вирусом Т-клеточного лейкоза человека типа I, высоко экспрессируется в зрелых лимфоцитах». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 222 (1): 164–70. дои : 10.1006/bbrc.1996.0700 . ПМИД 8630063 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: основной фактор транскрипции лейциновой молнии BATF, АТФ-подобный» .
^
Шрамл Б.У., Хилднер К., Исе В., Ли В.Л., Смит В.А., Соломон Б., Сахота Дж., Сим Дж., Мукаса Р., Семерски С., Хаттон Р.Д., Стормо Г.Д., Уивер К.Т., Рассел Дж.Х., Мерфи Т.Л., Мерфи К.М. (июль 2009 г.) ). «Транскрипционный фактор AP-1 Batf контролирует дифференцировку TH17» . Природа . 460 (7253): 405–9. Бибкод : 2009Natur.460..405S . дои : 10.1038/nature08114 . ПМК 2716014 . ПМИД 19578362 .
- «Ген регулирует способность иммунных клеток причинять вред организму» . ЭврекАлерт! (Пресс-релиз). 16 июля 2009 г.
^ Ван X, Йохансен Л.М., Тэ Х.Дж., Тапаровски Э.Дж. (1996). «IFP 35 образует комплексы с B-ATF, членом семейства транскрипционных факторов AP1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 229 (1): 316–22. дои : 10.1006/bbrc.1996.1799 . ПМИД 8954125 .

Дальнейшее чтение

Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Деппманн CD, Торнтон ТМ, Утама Ф.Е., Тапаровски Э.Дж. (2003). «Фосфорилирование BATF регулирует связывание ДНК: новый механизм регуляции AP-1 (белок-активатор-1)» . Биохим. Дж . 374 (Часть 2): 423–31. дои : 10.1042/BJ20030455 . ПМЦ 1223616 . ПМИД 12809553 .
Йохансен Л.М., Деппманн К.Д., Эриксон К.Д., Коффин В.Ф., Торнтон Т.М., Хамфри С.Е., Мартин Дж.М., Тапаровски Э.Дж. (2003). «EBNA2 и активированный Notch индуцируют экспрессию BATF» . Дж. Вирол . 77 (10): 6029–40. doi : 10.1128/JVI.77.10.6029-6040.2003 . ПМК 154003 . ПМИД 12719594 .
Уильямс К.Л., Зулло А.Дж., Каплан М.Х., Бруткевич Р.Р., Деппманн К.Д., Винсон С., Тапаровски Э.Дж. (2003). «Трансгенные мыши BATF обнаруживают роль белка-активатора-1 в развитии NKT-клеток» . Дж. Иммунол . 170 (5): 2417–26. дои : 10.4049/jimmunol.170.5.2417 . ПМИД 12594265 .
Эхлин Д.Р., Тае Х.Дж., Митин Н., Тапаровски Э.Дж. (2000). «B-ATF действует как негативный регулятор транскрипции, опосредованной AP-1, и блокирует клеточную трансформацию с помощью Ras и Fos». Онкоген . 19 (14): 1752–63. дои : 10.1038/sj.onc.1203491 . ПМИД 10777209 . S2CID 21006485 .
Мейер Н.П., Йохансен Л.М., Тэ Х.Дж., Бадде П.П., Уильямс К.Л., Тапаровски Э.Дж. (1998). «Геномная организация человеческого B-ATF, мишени регуляции EBV и HTLV-1». Мамм. Геном . 9 (10): 849–52. дои : 10.1007/s003359900881 . ПМИД 9745044 . S2CID 36362547 .
Ван X, Йохансен Л.М., Тэ Х.Дж., Тапаровски Э.Дж. (1997). «IFP 35 образует комплексы с B-ATF, членом семейства транскрипционных факторов AP1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 229 (1): 316–22. дои : 10.1006/bbrc.1996.1799 . ПМИД 8954125 .
Хасэгава Х, Уцуномия Ю, Кишимото К, Танге Ю, Ясукава М, Фудзита С (1996). «SFA-2, новый фактор транскрипции bZIP, индуцируемый вирусом Т-клеточного лейкоза человека типа I, высоко экспрессируется в зрелых лимфоцитах». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 222 (1): 164–70. дои : 10.1006/bbrc.1996.0700 . ПМИД 8630063 .
Дорси М.Дж., Тае Х.Дж., Солленбергер К.Г., Маскаренхас Н.Т., Йохансен Л.М., Тапаровски Э.Дж. (1996). «B-ATF: новый человеческий белок bZIP, который связывается с членами семейства транскрипционных факторов AP-1». Онкоген . 11 (11): 2255–65. ПМИД 8570175 .

Внешние ссылки

BATF+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук БАТФ
человека Расположение генома BATF и BATF страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 14 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000156127 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034266 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8570175-5] Дорси М.Дж., Тае Х.Дж., Солленбергер К.Г., Маскаренхас Н.Т., Йохансен Л.М., Тапаровски Э.Дж. (декабрь 1995 г.). «B-ATF: новый человеческий белок bZIP, который связывается с членами семейства транскрипционных факторов AP-1». Онкоген . 11 (11): 2255–65. ПМИД 8570175 .

[pmid8630063-6] Хасэгава Х., Уцуномия Ю., Кисимото К., Танге Ю., Ясукава М., Фудзита С. (май 1996 г.). «SFA-2, новый фактор транскрипции bZIP, индуцируемый вирусом Т-клеточного лейкоза человека типа I, высоко экспрессируется в зрелых лимфоцитах». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 222 (1): 164–70. дои : 10.1006/bbrc.1996.0700 . ПМИД 8630063 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: основной фактор транскрипции лейциновой молнии BATF, АТФ-подобный» .

[pmid19578362-8] Шрамл Б.У., Хилднер К., Исе В., Ли В.Л., Смит В.А., Соломон Б., Сахота Дж., Сим Дж., Мукаса Р., Семерски С., Хаттон Р.Д., Стормо Г.Д., Уивер К.Т., Рассел Дж.Х., Мерфи Т.Л., Мерфи К.М. (июль 2009 г.) ). «Транскрипционный фактор AP-1 Batf контролирует дифференцировку TH17» . Природа . 460 (7253): 405–9. Бибкод : 2009Natur.460..405S . дои : 10.1038/nature08114 . ПМК 2716014 . ПМИД 19578362 .
«Ген регулирует способность иммунных клеток причинять вред организму» . ЭврекАлерт! (Пресс-релиз). 16 июля 2009 г.

[9] «Ген регулирует способность иммунных клеток причинять вред организму» . ЭврекАлерт! (Пресс-релиз). 16 июля 2009 г.

[pmid8954125-9] Ван X, Йохансен Л.М., Тэ Х.Дж., Тапаровски Э.Дж. (1996). «IFP 35 образует комплексы с B-ATF, членом семейства транскрипционных факторов AP1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 229 (1): 316–22. дои : 10.1006/bbrc.1996.1799 . ПМИД 8954125 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

v т и Регулом
Inhibits	AP-1, BZLF1