HOXC5

HOXC5
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXC5 , CP11, HOX3, HOX3D, гомеобокс C5
Внешние идентификаторы	Опустить : 142973 ; МГИ : 96196 ; Гомологен : 41296 ; Генные карты : HOXC5 ; OMA : HOXC5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	54,035,361 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	102,925,861 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; left uterine tube; ; right ovary; ; right uterine tube; ; left ovary; ; fundus; ; body of stomach; ; granulocyte; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	thoracic vertebral column; ; tail of embryo; ; superior cervical ganglion; ; urethra; ; male urethra; ; esophagus; ; genital tubercle; ; neural tube; ; embryo; ; paraxial mesoderm;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Cellular component	cell junction; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; multicellular organism development; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; anterior/posterior pattern specification; embryonic skeletal system development; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3222
	15424
	ENSG00000172789
	ENSMUSG00000022485
	Q00444
	P32043
	НМ_018953
	НМ_175730
	НП_061826
	НП_783857
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок гомеобокса Hox-C5 — это белок , который у человека кодируется HOXC5 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к гомеобокса семейству генов . Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство транскрипционных факторов , играющих важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов . Млекопитающие обладают четырьмя сходными кластерами гомеобоксных генов: HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9–11 генов, расположенных тандемно. Этот ген, HOXC5, является одним из нескольких гомеобоксных генов HOXC, расположенных в кластере на хромосоме 12 . Три гена, HOXC5, HOXC4 и HOXC6 , имеют общий 5'-некодирующий экзон . Транскрипты могут включать общий экзон, сращенный с ген-специфичными экзонами, или они могут включать только ген-специфичные экзоны. Для HOXC5 описаны два варианта альтернативного сплайсинга. Вариант транскрипта, включающий общий экзон, по-видимому, не кодирует белок. Вариант транскрипта, кодирующего белок, содержит только ген-специфичные экзоны. ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000172789 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022485 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С5 HOXC5» .

Дальнейшее чтение

Арчиони Л., Симеоне А., Гуацци С., Заппавинья В., Бончинелли Э., Мавилио Ф. (январь 1992 г.). «Вышестоящая область человеческого гомеобоксного гена HOX3D является мишенью для регуляции ретиноевой кислоты и гомеопротеинов HOX» . Журнал ЭМБО . 11 (1): 265–77. дои : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05049.x . ПМК 556447 . ПМИД 1346761 .
Акампора Д, Д'Эспозито М, Файелла А, Паннесе М, Мильяччо Э, Морелли Ф, Сторнаиуоло А, Нигро В, Симеоне А, Бончинелли Э (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 17 (24): 10385–402. дои : 10.1093/нар/17.24.10385 . ПМК 335308 . ПМИД 2574852 .
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1990). «Организация генов гомеобокса I класса человека». Геном . 31 (2): 745–56. дои : 10.1139/g89-133 . ПМИД 2576652 .
Рабин М., Фергюсон-Смит А., Харт С.П., Раддл Ф.Х. (декабрь 1986 г.). «Родственные локусы гомеобокса, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (23): 9104–8. Бибкод : 1986PNAS...83.9104R . дои : 10.1073/pnas.83.23.9104 . ПМЦ 387083 . ПМИД 2878432 .
Симеоне А., Паннесе М., Акампора Д., Д'Эспозито М., Бончинелли Э. (июнь 1988 г.). «По крайней мере три человеческих гомеобокса на 12-й хромосоме принадлежат к одной и той же единице транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (12): 5379–90. дои : 10.1093/нар/16.12.5379 . ПМЦ 336773 . ПМИД 2898768 .
Гуацци С., Лонигро Р., Пинтонелло Л., Бончинелли Э., Ди Лауро Р., Мавилио Ф. (июль 1994 г.). «Ген фактора транскрипции щитовидной железы-1 является кандидатом на мишень для регуляции с помощью Hox-белков» . Журнал ЭМБО . 13 (14): 3339–47. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06636.x . ПМЦ 395231 . ПМИД 7913891 .
Апиу Ф, Флагиелло Д, Чилло С, Малфой Б, Пупон МФ, Дютрилья Б (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 73 (1–2): 114–5. дои : 10.1159/000134320 . ПМИД 8646877 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .

Внешние ссылки

HOXC5 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000172789 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022485 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С5 HOXC5» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]