SOX13

SOX13
Идентификаторы
Псевдонимы	SOX13 , ICA12, Sox-13, SRY-бокс 13, транскрипционный фактор 13 SRY-бокс
Внешние идентификаторы	Опустить : 604748 ; МГИ : 98361 ; Гомологен : 4159 ; Генные карты : SOX13 ; OMA : SOX13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	204,127,743 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	133,352,115 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; right lung; ; body of uterus; ; canal of the cervix; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; left uterine tube; ; right uterine tube; ; upper lobe of left lung; ; ectocervix;
	Top expressed in
	saccule; ; otic placode; ; otic vesicle; ; tail of embryo; ; intestinal villus; ; Ileal epithelium; ; lactiferous gland; ; ventricular zone; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; lens;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	anatomical structure morphogenesis; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of gamma-delta T cell differentiation; regulation of transcription by RNA polymerase II; cell fate commitment; negative regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9580
	20668
	ENSG00000143842
	ENSMUSG00000070643
	Q9UN79
	Q04891
	НМ_005686
	НМ_011439
	НП_005677
	НП_035569
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор SOX-13 представляет собой белок , который у человека кодируется SOX13 геном . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов SOX (SRY-родственный HMG-box), участвующих в регуляции эмбрионального развития и определении судьбы клеток. Кодируемый белок может действовать как регулятор транскрипции после образования белкового комплекса с другими белками. Также было установлено, что это аутоантиген диабета 1 типа, также известный как антитело 12 к островковым клеткам. ^[6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена SOX13 может регулироваться с помощью MITF . ^[7]

См. также

SOX-гены

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143842 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070643 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Руз Дж., Корвер В., де Бур Р., Койперс Дж., Хюренкамп Дж., Клеверс Х. (апрель 1999 г.). «Ген Sox-13: структура, характеристика промотора и хромосомная локализация». Геномика . 57 (2): 301–5. дои : 10.1006/geno.1999.5779 . ПМИД 10198172 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: SOX13 SRY (область Y, определяющая пол)-бокс 13» .
^ Хук К.С., Шлегель Н.К., Айххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергштейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 .

Дальнейшее чтение

Уилсон М., Купман П. (август 2002 г.). «Соответствие SOX: партнерские белки и кофакторы семейства регуляторов транскрипции SOX». Текущее мнение в области генетики и развития . 12 (4): 441–6. дои : 10.1016/S0959-437X(02)00323-4 . ПМИД 12100890 .
Шеперс Г.Е., Тисдейл Р.Д., Купман П. (август 2002 г.). «Двадцать пар sox: степень, гомология и номенклатура семейств генов транскрипционных факторов sox мыши и человека» . Развивающая клетка . 3 (2): 167–70. дои : 10.1016/S1534-5807(02)00223-X . ПМИД 12194848 .
Руз Дж., Корвер В., Овинг Э., Уилсон А., Вагенаар Г., Маркман М., Ламерс В., Клеверс Х. (январь 1998 г.). «Высокая экспрессия фактора sox-13 HMG box в стенках артерий во время эмбрионального развития» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (2): 469–76. дои : 10.1093/нар/26.2.469 . ПМК 147262 . ПМИД 9421502 .
Арджентаро А., Олссон Дж., Кричер Р., Макдауэлл С.Г., Харли В.Р. (май 2000 г.). «Геномная характеристика и точное картирование человеческого гена SOX13». Джин . 250 (1–2): 181–9. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00157-8 . ПМИД 10854791 .
Касимиотис Х., Майерс М.А., Арджентаро А., Мертин С., Фида С., Ферраро Т., Олссон Дж., Роули М.Дж., Харли В.Р. (апрель 2000 г.). «Белок SOX13, определяющий пол области Y, представляет собой аутоантиген диабета, экспрессируемый в островках поджелудочной железы» . Диабет . 49 (4): 555–61. дои : 10.2337/диабет.49.4.555 . ПМИД 10871192 .
Штайнбреннер Х., Ломанн Т., Остендорф Б., Шербаум В.А., Зейсслер Дж. (ноябрь 2000 г.). «Аутоантитела к ICA12 (SOX-13) неспецифичны для диабета I типа» . Диабетология . 43 (11): 1381–4. дои : 10.1007/s001250051542 . ПМИД 11126406 .
Касимиотис Х., Фида С., Роули М.Дж., Маккей И.Р., Зиммет П.З., Глисон С., Рабин Д.У., Майерс М.А. (2001). «Антитела к SOX13 (ICA12) связаны с диабетом 1 типа». Аутоиммунитет . 33 (2): 95–101. дои : 10.3109/08916930108995994 . ПМИД 11264788 . S2CID 43867785 .
Лампасона В., Скирполи М., Боси Э., Бонифачо Э. (февраль 2001 г.). «Аутоантитела ICA12(SOX13) вряд ли будут полезным маркером доклинического диабета I типа» . Диабетология . 44 (2): 267. doi : 10.1007/s001250051610 . ПМИД 11270687 .
Арджентаро А, Вапельхорст Б, Конкэннон П, Харли ВР (апрель 2001 г.). «Исследование сцепления SOX13, гена аутоантигена ICA12, в семьях с диабетом 1 типа». Молекулярная генетика и обмен веществ . 72 (4): 356–9. дои : 10.1006/mgme.2000.3136 . ПМИД 11286511 .
Фида С., Майерс М., Маккей И.Р., Зиммет П.З., Мохан В., Дипа Р., Роули М.Дж. (июнь 2001 г.). «Антитела к аутоантигенам, связанным с диабетом, у индийских пациентов с диабетом 1 типа: распространенность анти-ICA512/IA2 и анти-SOX13». Исследования диабета и клиническая практика . 52 (3): 205–11. дои : 10.1016/S0168-8227(01)00230-3 . ПМИД 11323090 .
Тандон Н., Штаувере-Брамеус А., Хагопян В.А., Сандживи CB (апрель 2002 г.). «Распространенность ICA-12 и других аутоантител у пациентов из Северной Индии с ранним диабетом». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 958 (1): 214–7. Бибкод : 2002NYASA.958..214T . дои : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02972.x . ПМИД 12021109 . S2CID 39609924 .
Торн С., Штаувере-Брамеус А., Сандживи С.Б., Ландин-Олссон М. (апрель 2002 г.). «Повышение аутоантител к SOX13 у шведских пациентов с диабетом 1 типа». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 958 (1): 218–23. Бибкод : 2002NYASA.958..218T . дои : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02973.x . ПМИД 12021110 . S2CID 38116575 .
Штаувере-Брамеус А., Агопян В., Румба И., Сандживи CB (апрель 2002 г.). «Антитела к новому бета-клеточному антигену ICA12 у латвийских больных диабетом». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 958 (1): 297–304. Бибкод : 2002NYASA.958..297S . дои : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02991.x . ПМИД 12021128 . S2CID 26701600 .
Гупта М., Тандон Н., Штаувере-Брамеус А., Сандживи CB (апрель 2002 г.). «Аутоантитела ICA12 связаны с не-DR3/не-DR4 у пациентов со латентным аутоиммунным диабетом у взрослых из северной Индии». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 958 (1): 329–32. Бибкод : 2002NYASA.958..329G . дои : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02998.x . ПМИД 12021135 . S2CID 32027653 .
Фида С., Майерс М.А., Уиттингем С., Роули М.Дж., Озаки С., Маккей И.Р. (декабрь 2002 г.). «Аутоантитела к транскрипционному фактору SOX13 при первичном билиарном циррозе печени по сравнению с другими заболеваниями». Журнал аутоиммунитета . 19 (4): 251–7. дои : 10.1006/jaut.2002.0622 . ПМИД 12473246 .
Пак Й, Пак Х, Ю Э, Ким Д (ноябрь 2003 г.). «Аутоантитела к SOX13, вероятно, будут дополнительным маркером диабета 1 типа в Корее». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1005 (1): 253–8. Бибкод : 2003NYASA1005..253P . дои : 10.1196/анналы.1288.038 . ПМИД 14679071 . S2CID 11552139 .

Внешние ссылки

SOX13 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000143842 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070643 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10198172-5] Руз Дж., Корвер В., де Бур Р., Койперс Дж., Хюренкамп Дж., Клеверс Х. (апрель 1999 г.). «Ген Sox-13: структура, характеристика промотора и хромосомная локализация». Геномика . 57 (2): 301–5. дои : 10.1006/geno.1999.5779 . ПМИД 10198172 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: SOX13 SRY (область Y, определяющая пол)-бокс 13» .

[pmid19067971-7] Хук К.С., Шлегель Н.К., Айххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергштейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]