КЛФ13

КЛФ13
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF13 , BTEB3, FKLF2, NSLP1, RFLAT-1, RFLAT1, Круппель-подобный фактор 13, Круппель-подобный фактор 13
Внешние идентификаторы	Опустить : 605328 ; МГИ : 1354948 ; Гомологен : 32288 ; Генные карты : KLF13 ; ОМА : KLF13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	31,435,665 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	63,588,663 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; granulocyte; ; right lung; ; mucosa of transverse colon; ; right frontal lobe; ; left lobe of thyroid gland; ; body of pancreas; ; right lobe of thyroid gland; ; monocyte; ; ganglionic eminence;
	Top expressed in
	Rostral migratory stream; ; molar; ; thymus; ; granulocyte; ; blood; ; ankle; ; hair follicle; ; mesenteric lymph nodes; ; external carotid artery; ; Region I of hippocampus proper;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell population proliferation; negative regulation of erythrocyte differentiation; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51621
	50794
	ENSG00000169926 ; ENSG00000275746
	ENSMUSG00000052040
	Q9Y2Y9
	Q9JJZ6
	НМ_001302461 ; НМ_015995
	НМ_021366
	НП_001289390 ; НП_057079
	НП_067341
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Круппель-подобный фактор 13 , также известный как KLF13 , представляет собой белок , который у человека кодируется KLF13 геном . ^[5]^[6]^[7]

Есть некоторые доказательства того, что KLF13 играет роль в ожирении. в первом интроне KLF13 Сайт метилирования cg07814318 связан с ожирением и орексигенными процессами. ^[8] Уровни грелина также положительно коррелировали с уровнями метилирования cg07814318. ^[8] Более того, уровни экспрессии KLF13 были снижены и повышены в мозге голодающих и страдающих ожирением мышей соответственно. ^[8]

Функция

KLF13 принадлежит к семейству факторов транскрипции , которые содержат 3 классических ДНК-связывающих домена с цинковыми пальцами , состоящих из атома цинка, тетраэдрически координированного 2 цистеинами и 2 гистидинами (мотив C2H2). Эти факторы транскрипции связываются с последовательностями, богатыми GC, и соответствующими блоками GT и CACCC. ^[5]^[9]

KLF13 был впервые описан как фактор RANTES поздно активированных Т-лимфоцитов (RFLAT)-1. ^[7] Он регулирует экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах. Он действует как стержень, вызывая большую энхансомому. У мышей с нокаутом KLF13 наблюдается нарушение выживаемости лимфоцитов, поскольку KLF13 является регулятором экспрессии Bcl-xL . ^[7]^[10]^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]

Взаимодействия

Было показано, что KLF13 взаимодействует с CREB-связывающим белком . ^[16] Белок теплового шока 47 ^[16] и ПКАФ . ^[16]

См. также

Факторы Круппеля

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000275746 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000169926, ENSG00000275746 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052040 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: KLF13 Круппель-подобный фактор 13» .
^ Кук Т., Гебелейн Б., Уррутиа Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные предсказания растущего семейства факторов транскрипции цинковых пальцев» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 880 (1 КЛЕТКА И МОЛЬ): 94–102. Бибкод : 1999NYASA.880...94C . дои : 10.1111/j.1749-6632.1999.tb09513.x . ПМИД 10415854 . S2CID 7618847 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сонг А, Чен Ю.Ф., Таматракольн К., Сторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинковых пальцев, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах» . Иммунитет . 10 (1): 93–103. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80010-2 . ПМИД 10023774 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Вимерслаге Л., Ислам Р., ван дер Камп С., Као Х., Оливо Г., Энце-Эрикссон Ф., Кастильо С., Ларсен А.Л., Бандштайн М., Дальберг Л.С., Перланд Э., Густавссон В., Нильссон Дж., Фогель Х., Шюрманн А., Ларссон. Э.М., Раск-Андерсен М., Бенедикт С., Шиот Х.Б. (14 февраля 2017 г.). «Участок метилирования ДНК в гене KLF13 связан с орексигенными процессами, основанными на нервных реакциях и уровнях грелина». Инт Дж. Обес (Лондон) . 43 (6): 990–994. дои : 10.1038/ijo.2017.43 . ПМИД 28194012 . S2CID 52835570 .
^ Скои С., Габант П., Ван Рит Т., Хертвельдт В., Дрез П.Л., Ван Вурен П., Ривьер М., Шпирер Дж., Шпирер С. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства транскрипционных факторов SP/XKLF». Геномика . 70 (1): 93–101. дои : 10.1006/geno.2000.6362 . ПМИД 11087666 .
^ Песня А, Николчева Т, Кренский А.М. (октябрь 2000). «Транкрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунологические обзоры . 177 (1): 236–45. дои : 10.1034/j.1600-065X.2000.17610.x . ПМИД 11138780 . S2CID 30184294 .
^ Николчева Т., Пироннет С., Чоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А., Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах» . Журнал клинических исследований . 110 (1): 119–26. дои : 10.1172/JCI15336 . ПМК 151028 . ПМИД 12093895 .
^ Сонг А, Патель А, Таматракольн К, Лю С, Фэн Д, Клейбергер С, Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1/KLF13, круппелеподобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30055–65. дои : 10.1074/jbc.M204278200 . ПМИД 12050170 .
^ Чжоу М., Макферсон Л., Фэн Д., Сонг А., Донг С., Лю С.К., Чжоу Л., Ши X, Ан Ю.Т., Ван Д., Клейбергер С., Кренский А.М. (май 2007 г.). «Крюпелеподобный фактор транскрипции 13 регулирует выживаемость Т-лимфоцитов in vivo» . Журнал иммунологии . 178 (9): 5496–504. дои : 10.4049/jimmunol.178.9.5496 . ПМК 2664650 . ПМИД 17442931 .
^ Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Круппель-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Журнал иммунологии . 178 (11): 7081–7. doi : 10.4049/jimmunol.178.11.7081 . ПМЦ 2674583 . ПМИД 17513757 .
^ Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует «позднюю» экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 253–66. дои : 10.1128/MCB.01071-06 . ПМК 1800668 . ПМИД 17074812 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сонг Ч.З., Келлер К., Мурата К., Асано Х., Стаматояннопулос Г. (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP/p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7029–36. дои : 10.1074/jbc.M108826200 . ПМК 2808425 . ПМИД 11748222 .

Дальнейшее чтение

Кук Т., Гебелейн Б., Уррутиа Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные предсказания растущего семейства факторов транскрипции цинковых пальцев» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 880 (1 КЛЕТКА И МОЛЬ): 94–102. Бибкод : 1999NYASA.880...94C . дои : 10.1111/j.1749-6632.1999.tb09513.x . ПМИД 10415854 . S2CID 7618847 .
Сонг А, Чен Ю.Ф., Таматракольн К., Сторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинковых пальцев, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах» . Иммунитет . 10 (1): 93–103. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80010-2 . ПМИД 10023774 .
Асано Х., Ли XS, Стаматояннопулос Г (июнь 2000 г.). «FKLF-2: новый транскрипционный фактор, подобный Круппелю, который активирует глобин и другие гены эритроидного происхождения». Кровь . 95 (11): 3578–84. дои : 10.1182/blood.V95.11.3578 . ПМИД 10828046 .
Скои С., Габант П., Ван Рит Т., Хертвельдт В., Дрез П.Л., Ван Вурен П., Ривьер М., Шпирер Дж., Шпирер С. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства транскрипционных факторов SP/XKLF». Геномика . 70 (1): 93–101. дои : 10.1006/geno.2000.6362 . ПМИД 11087666 .
Качиньски Дж., Чжан Дж.С., Элленридер В., Конли А., Дуэнс Т., Кестер Х., ван Дер Бург Б., Уррутиа Р. (сентябрь 2001 г.). «Sp1-подобный белок BTEB3 ингибирует транскрипцию через блок основных элементов транскрипции, взаимодействуя с ко-репрессорами mSin3A и HDAC-1 и конкурируя с Sp1» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36749–56. дои : 10.1074/jbc.M105831200 . ПМИД 11477107 .
Сонг Ч.З., Келлер К., Мурата К., Асано Х., Стаматояннопулос Г. (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP/p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7029–36. дои : 10.1074/jbc.M108826200 . ПМК 2808425 . ПМИД 11748222 .
Качиньский Дж.А., Конли А.А., Фернандес Сапико М., Дельгадо С.М., Чжан Дж.С., Уррутиа Р. (сентябрь 2002 г.). «Функциональный анализ белка, связывающего основной транскрипционный элемент (BTE) (BTEB) 3, и BTEB4, нового Sp1-подобного белка, выявляет подсемейство репрессоров транскрипции для сайта BTE промотора гена цитохрома P4501A1» . Биохимический журнал . 366 (Часть 3): 873–82. дои : 10.1042/BJ20020388 . ПМК 1222816 . ПМИД 12036432 .
Сонг А, Патель А, Таматракольн К, Лю С, Фэн Д, Клейбергер С, Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1/KLF13, круппелеподобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30055–65. дои : 10.1074/jbc.M204278200 . ПМИД 12050170 .
Николчева Т., Пироннет С., Чоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А., Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах» . Журнал клинических исследований . 110 (1): 119–26. дои : 10.1172/JCI15336 . ПМК 151028 . ПМИД 12093895 .
Мицума А., Асано Х., Киносита Т., Мурате Т., Сайто Х., Стаматояннопулос Г., Наоэ Т. (февраль 2005 г.). «Регуляция транскрипции гена FKLF-2 (KLF13) в эритроидных клетках» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1727 (2): 125–33. дои : 10.1016/j.bbaexp.2004.12.007 . ПМК 2808416 . ПМИД 15716005 .
Чжан П., Басу П., Редмонд Л.К., Моррис П.Е., Рупон Дж.В., Гиндер Г.Д., Ллойд Дж.А. (2006). «Функциональный скрининг Круппелеподобных факторов, которые регулируют ген гамма-глобина человека через элемент промотора CACCC». Клетки крови, молекулы и болезни . 35 (2): 227–35. дои : 10.1016/j.bcmd.2005.04.009 . ПМИД 16023392 .
Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует «позднюю» экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 253–66. дои : 10.1128/MCB.01071-06 . ПМК 1800668 . ПМИД 17074812 .
Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Круппель-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Журнал иммунологии . 178 (11): 7081–7. doi : 10.4049/jimmunol.178.11.7081 . ПМЦ 2674583 . ПМИД 17513757 .

Внешние ссылки

KLF13 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000275746 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000169926, ENSG00000275746 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052040 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: KLF13 Круппель-подобный фактор 13» .

[pmid10415854-6] Кук Т., Гебелейн Б., Уррутиа Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные предсказания растущего семейства факторов транскрипции цинковых пальцев» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 880 (1 КЛЕТКА И МОЛЬ): 94–102. Бибкод : 1999NYASA.880...94C . дои : 10.1111/j.1749-6632.1999.tb09513.x . ПМИД 10415854 . S2CID 7618847 .

[pmid10023774-7] Jump up to: ^а ^б ^с Сонг А, Чен Ю.Ф., Таматракольн К., Сторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинковых пальцев, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах» . Иммунитет . 10 (1): 93–103. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80010-2 . ПМИД 10023774 .

[pmid28194012-8] Jump up to: ^а ^б ^с Вимерслаге Л., Ислам Р., ван дер Камп С., Као Х., Оливо Г., Энце-Эрикссон Ф., Кастильо С., Ларсен А.Л., Бандштайн М., Дальберг Л.С., Перланд Э., Густавссон В., Нильссон Дж., Фогель Х., Шюрманн А., Ларссон. Э.М., Раск-Андерсен М., Бенедикт С., Шиот Х.Б. (14 февраля 2017 г.). «Участок метилирования ДНК в гене KLF13 связан с орексигенными процессами, основанными на нервных реакциях и уровнях грелина». Инт Дж. Обес (Лондон) . 43 (6): 990–994. дои : 10.1038/ijo.2017.43 . ПМИД 28194012 . S2CID 52835570 .

[pmid11087666-9] Скои С., Габант П., Ван Рит Т., Хертвельдт В., Дрез П.Л., Ван Вурен П., Ривьер М., Шпирер Дж., Шпирер С. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства транскрипционных факторов SP/XKLF». Геномика . 70 (1): 93–101. дои : 10.1006/geno.2000.6362 . ПМИД 11087666 .

[pmid11138780-10] Песня А, Николчева Т, Кренский А.М. (октябрь 2000). «Транкрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунологические обзоры . 177 (1): 236–45. дои : 10.1034/j.1600-065X.2000.17610.x . ПМИД 11138780 . S2CID 30184294 .

[pmid12093895-11] Николчева Т., Пироннет С., Чоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А., Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах» . Журнал клинических исследований . 110 (1): 119–26. дои : 10.1172/JCI15336 . ПМК 151028 . ПМИД 12093895 .

[pmid12050170-12] Сонг А, Патель А, Таматракольн К, Лю С, Фэн Д, Клейбергер С, Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1/KLF13, круппелеподобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30055–65. дои : 10.1074/jbc.M204278200 . ПМИД 12050170 .

[pmid17442931-13] Чжоу М., Макферсон Л., Фэн Д., Сонг А., Донг С., Лю С.К., Чжоу Л., Ши X, Ан Ю.Т., Ван Д., Клейбергер С., Кренский А.М. (май 2007 г.). «Крюпелеподобный фактор транскрипции 13 регулирует выживаемость Т-лимфоцитов in vivo» . Журнал иммунологии . 178 (9): 5496–504. дои : 10.4049/jimmunol.178.9.5496 . ПМК 2664650 . ПМИД 17442931 .

[pmid17513757-14] Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Круппель-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Журнал иммунологии . 178 (11): 7081–7. doi : 10.4049/jimmunol.178.11.7081 . ПМЦ 2674583 . ПМИД 17513757 .

[pmid17074812-15] Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренский А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует «позднюю» экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 253–66. дои : 10.1128/MCB.01071-06 . ПМК 1800668 . ПМИД 17074812 .

[pmid11748222-16] Jump up to: ^а ^б ^с Сонг Ч.З., Келлер К., Мурата К., Асано Х., Стаматояннопулос Г. (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP/p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7029–36. дои : 10.1074/jbc.M108826200 . ПМК 2808425 . ПМИД 11748222 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]