Семейство транскрипционных факторов ETS
| Ets-домен | |||
|---|---|---|---|
 Структура автоингибирования связывания ДНК Ets-1. [1] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Этс | ||
| Пфам | PF00178 | ||
| Пфам Клан | CL0123 | ||
| ИнтерПро | IPR000418 | ||
| УМНЫЙ | SM00413 | ||
| PROSITE | PDOC00374 | ||
| СКОП2 | 1р36 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
В области молекулярной биологии ETS ) ( специфическая трансформация E26 [2] или Е-двадцать шесть. (специфическая трансформация эритробластов) [3] транскрипционных Семейство факторов является одним из крупнейших семейств факторов транскрипции и уникально для животных . 28 генов У человека [4] , 27 у мышей, 10 у Caenorhabditis elegans и 9 у дрозофилы . Член-основатель этого семейства был идентифицирован как ген, трансдуцированный вирусом лейкемии E26. Члены семейства вовлечены в развитие различных тканей, а также в прогрессирование рака.
Подсемейства
[ редактировать ]Семейство ETS (специфическая трансформация эритробластов) разделено на 12 подсемейств, которые перечислены ниже: [5]
| Подсемейство | Члены семьи млекопитающих | Ортологи беспозвоночных |
|---|---|---|
| ЭЛЬФ | ELF1 , ELF2 (НЕРФ), ELF4 (MEF) | |
| ЛОСЬ | ГАБПα | ЛОСЬ |
| УЖАСНО | ЭРГ , FLI1 , ОФВ | |
| НАСЛЕДОВАТЬ | ЭРФ (PE2), ETV3 (PE1), ETV3L | |
| ЧТО | ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF) | |
| ETS | ЭТС1 , ЭТС2 | ЗАКОНЧЕННЫЙ |
| PDF-файл | СПДФ (PDEF/PSE) | |
| ПЭА3 | ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81) | |
| ЭР71 | ЭТВ2 (ER71) | |
| СПИ | СПИ1 (ПУ.1), СПИБ , СПИК | |
| ФТС | ELK1 , ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2) | ЛИН |
| ТЕЛ. | ETV6 (ТЕЛ), ETV7 (ТЕЛ2) | ЯНЬ |
Структура
[ редактировать ]Все члены семейства ETS (специфические для трансформации эритробластов) идентифицируются по высококонсервативному ДНК-связывающему домену , домену ETS , который представляет собой крылатую структуру спираль-поворот-спираль , которая связывается с участками ДНК с центральной последовательностью ДНК GGA(A/T) . Данные свидетельствуют о том, что помимо ДНК-связывающих функций домен ETS также участвует в белок-белковых взаимодействиях .За пределами ДНК-связывающего домена ETS сходство ограничено.
Другие домены также присутствуют и различаются от члена ETS к члену ETS, включая домен Pointed, подкласс семейства доменов SAM.
Функция
[ редактировать ]Семейство ETS присутствует во всем организме и участвует в широком спектре функций, включая регуляцию клеточной дифференцировки , клеточного цикла контроль , миграцию клеток , пролиферацию клеток , апоптоз (запрограммированную гибель клеток) и ангиогенез .
Было обнаружено, что несколько факторов ETS связаны с раком, например, посредством слияния генов . Например, транскрипционный фактор ERG ETS сливается с геном EWS , что приводит к состоянию, называемому саркомой Юинга . [6] Слияние TEL с белком JAK2 приводит к раннему острому лимфоидному лейкозу pre-B. [7] ERG и ETV1 — известные слияния генов, обнаруженные при раке простаты . [8]
Кроме того, было показано, что факторы ETS, например, Etv1 позвоночных и Ast-1 беспозвоночных, играют важную роль в спецификации и дифференцировке нейронов как у C. elegans , так и у обонятельных луковиц мышей дофаминергических . [9]
Способ действия
[ редактировать ]Среди членов семейства ETS наблюдается значительная консервативность ДНК-связывающего домена ETS и, следовательно, значительная избыточность в связывании ДНК. Считается, что взаимодействие с другими белками (например, модулятором активности Ets, называемым Mae) является одним из способов достижения специфического связывания с ДНК. Фактор транскрипции Ets является местом конвергенции сигналов. [10] Факторы ETS действуют как репрессоры транскрипции , активаторы транскрипции или и то, и другое. [11]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ли Г.М., Дональдсон Л.В., Пуфалл М.А. и др. (февраль 2005 г.). «Структурная и динамическая основа автоингибирования связывания ДНК Ets-1» . Ж. Биол. Хим . 280 (8): 7088–99. дои : 10.1074/jbc.M410722200 . ПМИД 15591056 .
- ^ Нанн, МФ; Сибург, штат Пенсильвания; Московичи, К.; Дюсберг, PH (1983). «Трехчастная структура гена, трансформирующего E26 вируса эритробластоза птиц». Природа . 306 (5941): 391–395. Бибкод : 1983Natur.306..391N . дои : 10.1038/306391a0 . ПМИД 6316155 . S2CID 4302399 .
- ^ Лепринс, Д.; Гегонн, А.; Колл, Дж.; Де Тэн, К.; Шнебергер, А.; Лагру, К.; Стехелин, Д. (1983). «Предполагаемый второй онкоген клеточного происхождения ретровируса птичьего лейкоза E26». Природа . 306 (5941): 395–397. Бибкод : 1983Natur.306..395L . дои : 10.1038/306395a0 . ПМИД 6316156 . S2CID 4318034 .
- ^ Сайзмор, Джина М.; Питарреси, Джейсон Р.; Балакришнан, Субхастри; Островски, Майкл К. (июнь 2017 г.). «Семейство онкогенных транскрипционных факторов ETS в солидных опухолях» . Обзоры природы Рак . 17 (6): 337–351. дои : 10.1038/nrc.2017.20 . ISSN 1474-1768 . ПМИД 28450705 .
- ^ Гутьеррес-Хартман А., Дюваль Д.Л., Брэдфорд А.П. (2007). «Факторы транскрипции ETS в эндокринной системе». Тенденции Метаб. эндокринолов . 18 (4): 150–8. дои : 10.1016/j.tem.2007.03.002 . ПМИД 17387021 . S2CID 24617218 .
- ^ Ида К, Кобаяши С, Таки Т, Ханада Р, Бесшо Ф, Ямамори С, Сугимото Т, Оки М, Хаяши Ю (1995). «Химерные мРНК EWS-FLI-1 и EWS-ERG в саркоме Юинга и примитивной нейроэктодермальной опухоли». Инт Дж Рак . 63 (4): 500–4. дои : 10.1002/ijc.2910630407 . ПМИД 7591257 . S2CID 24841690 .
- ^ Петерс П., Рейно С.Д., Кулс Дж., Влодарска И., Гросджордж Дж., Филип П., Монпу Ф., Ван Ромпай Л., Баенс М., Ван ден Берге Х., Маринен П. (1997). «Слияние TEL, гена 6 варианта ETS (ETV6) с рецептор-ассоциированной киназой JAK2 в результате t(9;12) при лимфоидном и t(9;15;12) при миелолейкозе» . Кровь . 90 (7): 2535–40. дои : 10.1182/blood.V90.7.2535 . ПМИД 9326218 .
- ^ Томлинс С.А., Роудс Д.Р., Пернер С., Дханасекаран С.М., Мехра Р., Сан XW, Варамбалли С., Цао X, Чинда Дж., Куэфер Р., Ли С., Монти Дж.Э., Шах Р.Б., Пиента К.Дж., Рубин М.А., Чиннайян А.М. (октябрь 2005 г.) ). «Рекуррентное слияние генов транскрипционных факторов TMPRSS2 и ETS при раке простаты». Наука . 310 (5748): 644–8. Бибкод : 2005Sci...310..644T . дои : 10.1126/science.1117679 . ПМИД 16254181 . S2CID 85788789 .
- ^ Пламя Н., Хоберт О. (2009). «Генная регуляторная логика дифференцировки дофаминергических нейронов» . Природа . 458 (7240): 885–890. дои : 10.1038/nature07929 . ПМЦ 2671564 . ПМИД 19287374 .
- ^ Верже А., Дутерк-Кокийо М. (2002). «Когда факторы транскрипции Ets встречаются со своими партнерами». Биоэссе . 24 (4): 362–70. дои : 10.1002/bies.10068 . ПМИД 11948622 .
- ^ Шаррокс А.Д. (2001). «Семейство транскрипционных факторов ETS-домена». Nat Rev Mol Cell Biol . 2 (11): 827–37. дои : 10.1038/35099076 . ПМИД 11715049 . S2CID 5407789 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Блэр Д.Г., Атанасиу М. (2000). «Ets и ретровирусы – трансдукция и активация членов семейства онкогенов Ets при вирусном онкогенезе» . Онкоген . 19 (55): 6472–81. дои : 10.1038/sj.onc.1204046 . ПМИД 11175363 .
- Ли Р., Пей Х., Уотсон Д.К. (2000). «Регуляция функции Ets посредством белок-белковых взаимодействий» . Онкоген . 19 (55): 6514–23. дои : 10.1038/sj.onc.1204035 . ПМИД 11175367 .
- Мимо М (2000). «Структурно-функциональные исследования факторов транскрипции ETS». Крит Рев Онког . 11 (3–4): 227–53. дои : 10.1615/critrevoncog.v11.i34.20 . ПМИД 11358268 .
- Оикава Т., Ямада Т. (2003). «Молекулярная биология транскрипционных факторов семейства Ets». Джин . 303 : 11–34. дои : 10.1016/S0378-1119(02)01156-3 . ПМИД 12559563 .
- Семенченко В.И., Ватсон Д.К. (2000). «Гены-мишени Ets: прошлое, настоящее и будущее» . Онкоген . 19 (55): 6533–48. дои : 10.1038/sj.onc.1204034 . ПМИД 11175369 .
- Верже А., Дутерк-Кокийо М. (2002). «Когда факторы транскрипции Ets встречаются со своими партнерами». Биоэссе . 24 (4): 362–70. дои : 10.1002/bies.10068 . ПМИД 11948622 .
- Нанн М., Зеебург П., Московичи С., Дюсберг П. (1983). «Трехчастная структура гена, трансформирующего E26 вируса эритробластоза птиц». Природа . 306 (5941): 391–95. Бибкод : 1983Natur.306..391N . дои : 10.1038/306391a0 . ПМИД 6316155 . S2CID 4302399 .