SPDEF

SPDEF
Available structures
PDB	Ortholog search: PDBe RCSB
showList of PDB id codes
	2DKX
Identifiers
Aliases	SPDEF, PDEF, bA375E1.3, SAM pointed domain containing ETS transcription factor
External IDs	OMIM: 608144; MGI: 1353422; HomoloGene: 8231; GeneCards: SPDEF; OMA:SPDEF - orthologs
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	34,556,333 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	27,947,929 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; nasal epithelium; ; mucosa of transverse colon; ; prostate; ; mucosa of ileum; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; buccal mucosa cell; ; trachea; ; mucosa of sigmoid colon; ; lactiferous duct;
	Top expressed in
	crypt of lieberkuhn of small intestine; ; gastric mucosa; ; epithelium of stomach; ; mucous cell of stomach; ; pyloric antrum; ; Paneth cell; ; parotid gland; ; duodenum; ; female urethra; ; seminal vesicula;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	multicellular organism development; cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of cell fate commitment; lung goblet cell differentiation; intestinal epithelial cell development; transcription, DNA-templated; positive regulation of cell fate commitment; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of apoptotic process; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25803
	30051
	ENSG00000124664
	Ensmusg00000024215
	O95238
	Q9WTP3
	NM_001252294 ; NM_012391
	NM_013891 ; NM_001357728
	NP_001239223 ; NP_036523
	NP_038919 ; NP_001344657
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

SAM pointed domain-containing Ets transcription factor is a protein that in humans is encoded by the SPDEF gene.^[5]^[6]^[7]

PDEF is an ETS transcription factor expressed in prostate epithelial cells. It acts as an androgen-independent transactivator of PSA (MIM 176820) expression.[supplied by OMIM]^[7]

Interactions

SPDEF has been shown to interact with NKX3-1.^[8]

References

^ Jump up to: ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124664 – Ensembl, May 2017
^ Jump up to: ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024215 – Ensembl, May 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Oettgen P, Finger E, Sun Z, Akbarali Y, Thamrongsak U, Boltax J, et al. (Январь 2000). «PDEF, новый фактор транскрипции ETS-специфического простаты, взаимодействует с рецептором андрогена и активирует экспрессию гена антигена простат-специфическую экспрессию» . Журнал биологической химии . 275 (2): 1216–1225. doi : 10.1074/jbc.275.2.1216 . PMID 10625666 .
^ Johannessen JV, Finseth I (январь 1983 г.). «Электронные микрофотографии за пять минут». Ультраструктурная патология . 4 (1): 97–100. doi : 10.3109/01913128309140576 . PMID 6857767 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SPDEF SAM заостренный домен, содержащий транскрипционный фактор ETS» .
^ Чен Х, Нанди А.К., Ли Х, Биберих К.Дж. (январь 2002 г.). «NKX-3.1 взаимодействует с фактором ETS простаты и регулирует активность промотора PSA». РАНКА . 62 (2): 338–340. PMID 11809674 .

Дальнейшее чтение

Ланс V (1976). «Исследования ежегодного репродуктивного цикла женской кобры, Наджа Наджа. Сезонные вариации в плазменных неорганических ионах». Сравнительная биохимия и физиология. A, Сравнительная физиология . 53 (3): 285–289. doi : 10.1016/s0300-9629 (76) 80037-0 . PMID 2437 .
Yamada N, Tamai Y, Miyamoto H, Nozaki M (январь 2000 г.). «Клонирование и экспрессия гена PSE мыши, кодирующего нового члена семейства ETS». Ген . 241 (2): 267–274. doi : 10.1016/s0378-1119 (99) 00484-9 . PMID 10675039 .
Чен Х, Нанди А.К., Ли Х, Биберих К.Дж. (январь 2002 г.). «NKX-3.1 взаимодействует с фактором ETS простаты и регулирует активность промотора PSA». РАНКА . 62 (2): 338–340. PMID 11809674 .
Томпсон Х.Г., Харрис Дж.В., Волд Б.Дж., Лин Ф., Броди Дж.П. (апрель 2003 г.). «Сверхэкспрессия P62 в опухолях молочной железы и регуляции с помощью ETS, полученных из простаты, в клетках рака молочной железы» . Онкоген . 22 (15): 2322–2333. doi : 10.1038/sj.onc.1206325 . PMID 12700667 .
Фельдман Р.Дж., Сенченко VI, Гейед М., Фрейг М.М., Уотсон Д.К. (август 2003 г.). «Экспрессия PDEF при раке молочной железы человека коррелирует с инвазивным потенциалом и измененной экспрессией генов». РАНКА . 63 (15): 4626–4631. PMID 12907642 .
Ghadersohi A, Odunsi K, Lele S, Collins Y, Greco WR, Winston J, et al. (Февраль 2004 г.). «Фактор транскрипции ETS, полученный в простате, показывает лучшую ассоциацию опухоли, чем другие молекулы, связанные с раком». Онкологические отчеты . 11 (2): 453–458. doi : 10.3892/или.11.2.453 . PMID 14719083 .
Чен Х, Биберих К.Дж. (январь 2005 г.). «Структурный и функциональный анализ доменов, опосредующего взаимодействия между NKX-3.1 и PDEF». Журнал сотовой биохимии . 94 (1): 168–177. doi : 10.1002/jcb.20297 . PMID 15523673 . S2CID 46494570 .
Wang Y, Feng L, сказал М., Балдерман С., Фаязи З., Лю Й. и др. (Май 2005 г.). «Анализ 2.0 Кристаллическая структура комплекса белка-ДНК человеческого домена PDEF ETS, связанного с специфическим антигеном, специфичным антигеновым антигеном». Биохимия . 44 (19): 7095–7106. doi : 10.1021/bi047352t . PMID 15882048 .
Фаулер М., Боранчи Е., МакГи Л., Пиланнт С.В., Уильямс Б.Дж., Гласс Дж. И др. (Январь 2006 г.). «RUNX1 (AML-1) и RUNX2 (AML-3) сотрудничают с фактором ETS, полученного из простаты, для активации транскрипции из регуляторной области PSA вверх по течению». Журнал сотовой биохимии . 97 (1): 1–17. doi : 10.1002/jcb.20664 . PMID 16237704 . S2CID 20541109 .
Gunawardane RN, Sgroi DC, Wrobel CN, Koh E, Daley GQ, Brugge JS (декабрь 2005 г.). «Новая роль PDEF в миграции и инвазии эпителиальных клеток» . РАНКА . 65 (24): 11572–11580. doi : 10.1158/0008-5472.can-05-1196 . PMC 2919290 . PMID 16357167 .
Rodabaugh KJ, Mhawech-Fauceglia P, Groth J, Lele S, Sood AK (январь 2007 г.). «Фактор ETS, полученный из простаты, сверхэкспрессируется в серозных эпителиальных опухолях яичников». Международный журнал гинекологической патологии . 26 (1): 10–15. doi : 10.1097/01.pgp.0000225386.41244.bd . PMID 17197890 . S2CID 25880565 .
Park KS, Korfhagen TR, Bruno MD, Kitzmiller JA, Wan H, Wert SE, et al. (Апрель 2007 г.). «SPDEF регулирует гиперплазию бокала в эпителии дыхательных путей» . Журнал клинических исследований . 117 (4): 978–988. doi : 10.1172/jci29176 . PMC 1810569 . PMID 17347682 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 6 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124664 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024215 – Ensembl, May 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10625666-5] Oettgen P, Finger E, Sun Z, Akbarali Y, Thamrongsak U, Boltax J, et al. (Январь 2000). «PDEF, новый фактор транскрипции ETS-специфического простаты, взаимодействует с рецептором андрогена и активирует экспрессию гена антигена простат-специфическую экспрессию» . Журнал биологической химии . 275 (2): 1216–1225. doi : 10.1074/jbc.275.2.1216 . PMID 10625666 .

[pmid6857767-6] Johannessen JV, Finseth I (январь 1983 г.). «Электронные микрофотографии за пять минут». Ультраструктурная патология . 4 (1): 97–100. doi : 10.3109/01913128309140576 . PMID 6857767 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SPDEF SAM заостренный домен, содержащий транскрипционный фактор ETS» .

[pmid11809674-8] Чен Х, Нанди А.К., Ли Х, Биберих К.Дж. (январь 2002 г.). «NKX-3.1 взаимодействует с фактором ETS простаты и регулирует активность промотора PSA». РАНКА . 62 (2): 338–340. PMID 11809674 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[5]

[6]

[7]

[8]