СПИ1

СПИ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1PUE
Идентификаторы
Псевдонимы	SPI1 , OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, протоонкоген Spi-1, AGM10
Внешние идентификаторы	Опустить : 165170 ; МГИ : 98282 ; Гомологен : 2346 ; Генные карты : SPI1 ; OMA : SPI1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	47,378,547 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	90,946,101 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; monocyte; ; right lung; ; upper lobe of left lung; ; spleen; ; blood; ; bone marrow cells; ; appendix; ; right coronary artery; ; lymph node;
	Top expressed in
	granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; mesenteric lymph nodes; ; stroma of bone marrow; ; spleen; ; blood; ; medulla of thymus; ; embryo; ; lip; ; ankle joint;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; RNA binding; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity; NFAT protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; transcription regulator complex;
Biological process	myeloid leukocyte differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; cellular response to ethanol; somatic stem cell population maintenance; lymphocyte differentiation; regulation of erythrocyte differentiation; myeloid dendritic cell differentiation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of MHC class II biosynthetic process; lymphoid progenitor cell differentiation; transcription, DNA-templated; macrophage differentiation; anatomical structure regression; negative regulation of histone H4 acetylation; negative regulation of gene expression, epigenetic; vasculature development; granulocyte differentiation; apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis; histone H3 acetylation; erythrocyte differentiation; hypermethylation of CpG island; positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; cell differentiation; interleukin-6-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6688
	20375
	ENSG00000066336
	ENSMUSG00000002111
	P17947
	P17433
	НМ_001080547 ; НМ_003120
	НМ_011355 ; НМ_001378898 ; НМ_001378899
	НП_001074016 ; НП_003111
	НП_035485 ; НП_001365827 ; НП_001365828
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции PU.1 представляет собой белок , который у человека кодируется SPI1 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует транскрипционный фактор ETS-домена, который активирует экспрессию генов во время развития миелоидных и B-лимфоидных клеток. ^{[ 6 ]} Ядерный белок связывается с богатой пуринами последовательностью, известной как PU-бокс, обнаруженной на энхансерах генов-мишеней, и регулирует их экспрессию в координации с другими факторами транскрипции и кофакторами. Белок также может регулировать альтернативный сплайсинг генов-мишеней. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Транскрипционный фактор PU.1 важен для кроветворения и принятия решений о судьбе клеток . PU.1 может физически взаимодействовать с различными регулирующими факторами, такими как SWI/SNF , ^{[ 8 ]} TFIID , GATA-2 , GATA-1 и c-июнь . Белково-белковые взаимодействия между этими факторами могут регулировать PU.1-зависимые решения о судьбе клеток. PU.1 может модулировать экспрессию 3000 генов в гемопоэтических клетках, включая цитокины . Он экспрессируется в моноцитах , гранулоцитах , В- и NK-клетках , но отсутствует в Т-клетках , ретикулоцитах и мегакариоцитах . Его транскрипция регулируется различными механизмами. ^{[ 9 ]}

PU.1 является важным регулятором профиброзной системы. При фиброзных состояниях экспрессия PU.1 нарушается при фиброзных заболеваниях, что приводит к усилению регуляции набора генов, связанных с фиброзом, в фибробластах . Нарушение PU.1 в фиброзных фибробластах приводит к их возвращению в состояние покоя из профиброзных фибробластов. Видно, что PU.1 высоко экспрессируется во внеклеточном матриксе, продуцирующем фиброзные фибробласты, в то время как его уровень подавлен в воспалительных /деградирующих ЕСМ и покоящихся фибробластах. Большинство клеток, экспрессирующих PU.1 при фиброзных состояниях, остаются фибробластами с небольшим количеством инфильтрирующих лимфоцитов . PU.1 индуцирует поляризацию покоящихся и воспалительных фибробластов в фиброзные фибробласты. ^{[ 10 ]}

Структура

Домен ETS представляет собой ДНК-связывающий модуль PU.1 и других факторов транскрипции семейства ETS.

Взаимодействия

Было показано, что SPI1 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000066336 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002111 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рэй Д., Кулин С., Тавитэн А., Моро-Гашлен Ф. (май 1990 г.). «Человеческий гомолог предполагаемого протоонкогена Spi-1: характеристика и экспрессия в опухолях». Онкоген . 5 (5): 663–668. ПМИД 1693183 .
^ Оикава Т., Ямада Т., Кихара-Негиши Ф., Ямамото Х., Кондо Н., Хитоми Ю. и др. (июль 1999 г.). «Роль транскрипционного фактора PU.1 семейства Ets в дифференцировке, пролиферации и апоптозе гемопоэтических клеток» . Смерть клеток и дифференцировка . 6 (7): 599–608. дои : 10.1038/sj.cdd.4400534 . ПМИД 10453070 .
^ «Ген Энтрез: SPI1, образующий фокус селезенки, вирус интеграции (SFFV) с провирусной интеграцией онкогена spi1» .
^ Чемберс С., Чермакова К., Чан Ю.С., Курц К., Волан К., Льюис А.Х. и др. (апрель 2023 г.). «Блокада SWI/SNF нарушает программы энхансеров, направленных на PU.1, в нормальных кроветворных клетках и остром миелоидном лейкозе» . Исследования рака . 83 (7): 983–996. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-22-2129 . ПМЦ 10071820 . ПМИД 36662812 .
^ Бурда П., Ласло П., Стопка Т. (июль 2010 г.). «Роль факторов транскрипции PU.1 и GATA-1 при нормальном и лейкемогенном кроветворении». Лейкемия . 24 (7): 1249–1257. дои : 10.1038/leu.2010.104 . ПМИД 20520638 . S2CID 1941766 .
^ Вольфарт Т., Раубер С., Уэбе С., Любер М., Соаре А., Экичи А. и др. (февраль 2019 г.). «PU.1 контролирует поляризацию фибробластов и фиброз тканей» . Природа . 566 (7744): 344–349. Бибкод : 2019Natur.566..344W . дои : 10.1038/s41586-019-0896-x . ПМК 6526281 . ПМИД 30700907 .
^ Халлиер М., Лерга А., Барнаш С., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–4842. дои : 10.1074/jbc.273.9.4838 . ПМИД 9478924 .
^ Чжан П., Бере Г., Пан Дж., Ивама А., Вара-Асвапати Н., Радомска Х.С. и др. (июль 1999 г.). «Отрицательные перекрестные помехи между регуляторами кроветворения: белки GATA подавляют PU.1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (15): 8705–8710. Бибкод : 1999PNAS...96.8705Z . дои : 10.1073/pnas.96.15.8705 . ПМК 17580 . ПМИД 10411939 .
^ Брасс А.Л., Чжу А.К., Сингх Х (февраль 1999 г.). «Требования к сборке активаторных комплексов PU.1-Pip (IRF-4): ингибирующая функция in vivo с использованием слитых димеров» . Журнал ЭМБО . 18 (4): 977–991. дои : 10.1093/emboj/18.4.977 . ПМЦ 1171190 . ПМИД 10022840 .
^ Эскаланте Ч.Р., Шен Л., Эскаланте М.К., Брасс А.Л., Эдвардс Т.А., Сингх Х. и др. (июль 2002 г.). «Кристаллизация и характеристика тройного комплекса PU.1/IRF-4/ДНК». Журнал структурной биологии . 139 (1): 55–59. дои : 10.1016/s1047-8477(02)00514-2 . ПМИД 12372320 .
^ Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Транскрипционный фактор Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–11181. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД 8626664 .

Дальнейшее чтение

Клемс М.Ю., МакКерчер С.Р., Селада А., Ван Беверен С., Маки Р.А. (апрель 1990 г.). «Специфический для макрофагов и В-клеток фактор транскрипции PU.1 связан с онкогеном ets». Клетка . 61 (1): 113–124. дои : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . ПМИД 2180582 . S2CID 27819155 .
Нгуен В.К., Рэй Д., Гросс М.С., де Танд М.Ф., Фрезал Дж., Моро-Гашлен Ф. (май 1990 г.). «Локализация онкогена человека SPI1 на хромосоме 11, область p11.22». Генетика человека . 84 (6): 542–546. дои : 10.1007/bf00210807 . ПМИД 2338340 . S2CID 22337200 .
Чен Х., Рэй-Галлет Д., Чжан П., Хетерингтон С.Дж., Гонсалес Д.А., Чжан Д.Э. и др. (октябрь 1995 г.). «PU.1 (Spi-1) автоматически регулирует свою экспрессию в миелоидных клетках». Онкоген . 11 (8): 1549–1560. ПМИД 7478579 .
Нагулапалли С., Понгубала Дж.М., Атчисон М.Л. (ноябрь 1995 г.). «Несколько белков физически взаимодействуют с PU.1. Транскрипционная синергия с NF-IL6 бета (C/EBP дельта, CRP3)» . Журнал иммунологии . 155 (9): 4330–4338. дои : 10.4049/jimmunol.155.9.4330 . ПМИД 7594592 .
Понгубала Дж. М., Атчисон М. Л. (апрель 1995 г.). «Активация фактора транскрипции 1 и модулятора элемента ответа циклического АМФ может модулировать активность энхансера каппа-3' иммуноглобулина» . Журнал биологической химии . 270 (17): 10304–10313. дои : 10.1074/jbc.270.17.10304 . ПМИД 7730336 .
Хромас Р., Орази А., Нейман Р.С., Маки Р., Ван Беверан С., Мур Дж. и др. (ноябрь 1993 г.). «Гематопоэтическая экспрессия члена семейства онкогенов ETS PU.1, ограниченная по линии и стадии» . Кровь . 82 (10): 2998–3004. дои : 10.1182/blood.V82.10.2998.2998 . ПМИД 8219191 .
Хагемайер С., Баннистер А.Дж., Кук А., Кузаридес Т. (февраль 1993 г.). «Домен активации транскрипционного фактора PU.1 связывает белок ретинобластомы (RB) и транскрипционный фактор TFIID in vitro: RB демонстрирует сходство последовательностей с TFIID и TFIIB» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (4): 1580–1584. Бибкод : 1993PNAS...90.1580H . дои : 10.1073/pnas.90.4.1580 . ПМК 45918 . ПМИД 8434021 .
Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Транскрипционный фактор Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–11181. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД 8626664 .
Бассук А.Г., Анандаппа Р.Т., Лейден Дж.М. (май 1997 г.). «Физические взаимодействия между Ets и белками NF-kappaB/NFAT играют важную роль в их совместной активации энхансера вируса иммунодефицита человека в Т-клетках» . Журнал вирусологии . 71 (5): 3563–3573. doi : 10.1128/JVI.71.5.3563-3573.1997 . ЧВК 191503 . ПМИД 9094628 .
Ли С.Л., Валенте А.Дж., Чжао С.Дж., Кларк Р.А. (июль 1997 г.). «PU.1 необходим для активности промотора p47(phox) в миелоидных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (28): 17802–17809. дои : 10.1074/jbc.272.28.17802 . ПМИД 9211934 .
Цукада Дж., Мисаго М., Серино Ю., Огава Р., Мураками С., Наканиси М. и др. (октябрь 1997 г.). «Вирус Т-клеточного лейкоза человека типа I Tax трансактивирует промотор человеческого гена проинтерлейкина-1бета посредством ассоциации с двумя факторами транскрипции, ядерным фактором-интерлейкином-6 и Spi-1» . Кровь . 90 (8): 3142–3153. дои : 10.1182/blood.V90.8.3142 . ПМИД 9376596 .
Халлиер М., Лерга А., Барнаш С., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–4842. дои : 10.1074/jbc.273.9.4838 . ПМИД 9478924 .
Сузуки С., Куматори А., Хааген И.А., Фуджи Й., Садат М.А., Джун Х.Л. и др. (май 1998 г.). «PU.1 как важный активатор экспрессии гена gp91(phox) в периферических нейтрофилах, моноцитах и B-лимфоцитах человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (11): 6085–6090. Бибкод : 1998PNAS...95.6085S . дои : 10.1073/pnas.95.11.6085 . ПМК 27589 . ПМИД 9600921 .
Каррер С., Верже А., Флуранс А., Стелен Д., Дутерк-Кокийо М. (июнь 1998 г.). «Белки Erg, транскрипционные факторы семейства Ets, образуют гомо-, гетеродимеры и тройные комплексы через два разных домена». Онкоген . 16 (25): 3261–3268. дои : 10.1038/sj.onc.1201868 . ПМИД 9681824 . S2CID 26807714 .
Сато М., Мории Э., Такебаяши-Сузуки К., Ясуи Н., Очи Т., Китамура Ю. и др. (январь 1999 г.). «Связанный с микрофтальмией фактор транскрипции взаимодействует с PU.1 и c-Fos: определение их субклеточной локализации». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 254 (2): 384–387. дои : 10.1006/bbrc.1998.9918 . ПМИД 9918847 .
Брасс А.Л., Чжу А.К., Сингх Х (февраль 1999 г.). «Требования к сборке активаторных комплексов PU.1-Pip (IRF-4): ингибирующая функция in vivo с использованием слитых димеров» . Журнал ЭМБО . 18 (4): 977–991. дои : 10.1093/emboj/18.4.977 . ПМЦ 1171190 . ПМИД 10022840 .
Ямамото Х., Кихара-Негиси Ф., Ямада Т., Хасимото Ю., Оикава Т. (февраль 1999 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между фактором транскрипции PU.1 и коактиватором CBP» . Онкоген . 18 (7): 1495–1501. дои : 10.1038/sj.onc.1202427 . ПМИД 10050886 .
Рао С., Мацумура А., Юн Дж., Саймон MC (апрель 1999 г.). «SPI-B активирует транскрипцию посредством уникального домена пролина, серина и треонина и демонстрирует различия в аффинности связывания ДНК с PU.1» . Журнал биологической химии . 274 (16): 11115–11124. дои : 10.1074/jbc.274.16.11115 . ПМИД 10196196 .
Мао С., Фрэнк Р.К., Чжан Дж., Миядзаки Ю., Нимер С.Д. (май 1999 г.). «Функциональные и физические взаимодействия между белками AML1 и белком ETS, MEF: значение для патогенеза t(8;21)-положительных лейкозов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3635–3644. дои : 10.1128/mcb.19.5.3635 . ПМЦ 84165 . ПМИД 10207087 .

Внешние ссылки

ФакторБук ПУ.1

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000066336 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002111 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1693183-5] Рэй Д., Кулин С., Тавитэн А., Моро-Гашлен Ф. (май 1990 г.). «Человеческий гомолог предполагаемого протоонкогена Spi-1: характеристика и экспрессия в опухолях». Онкоген . 5 (5): 663–668. ПМИД 1693183 .

[6] Оикава Т., Ямада Т., Кихара-Негиши Ф., Ямамото Х., Кондо Н., Хитоми Ю. и др. (июль 1999 г.). «Роль транскрипционного фактора PU.1 семейства Ets в дифференцировке, пролиферации и апоптозе гемопоэтических клеток» . Смерть клеток и дифференцировка . 6 (7): 599–608. дои : 10.1038/sj.cdd.4400534 . ПМИД 10453070 .

[7] «Ген Энтрез: SPI1, образующий фокус селезенки, вирус интеграции (SFFV) с провирусной интеграцией онкогена spi1» .

[8] Чемберс С., Чермакова К., Чан Ю.С., Курц К., Волан К., Льюис А.Х. и др. (апрель 2023 г.). «Блокада SWI/SNF нарушает программы энхансеров, направленных на PU.1, в нормальных кроветворных клетках и остром миелоидном лейкозе» . Исследования рака . 83 (7): 983–996. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-22-2129 . ПМЦ 10071820 . ПМИД 36662812 .

[9] Бурда П., Ласло П., Стопка Т. (июль 2010 г.). «Роль факторов транскрипции PU.1 и GATA-1 при нормальном и лейкемогенном кроветворении». Лейкемия . 24 (7): 1249–1257. дои : 10.1038/leu.2010.104 . ПМИД 20520638 . S2CID 1941766 .

[10] Вольфарт Т., Раубер С., Уэбе С., Любер М., Соаре А., Экичи А. и др. (февраль 2019 г.). «PU.1 контролирует поляризацию фибробластов и фиброз тканей» . Природа . 566 (7744): 344–349. Бибкод : 2019Natur.566..344W . дои : 10.1038/s41586-019-0896-x . ПМК 6526281 . ПМИД 30700907 .

[pmid9478924-11] Халлиер М., Лерга А., Барнаш С., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–4842. дои : 10.1074/jbc.273.9.4838 . ПМИД 9478924 .

[pmid10411939-12] Чжан П., Бере Г., Пан Дж., Ивама А., Вара-Асвапати Н., Радомска Х.С. и др. (июль 1999 г.). «Отрицательные перекрестные помехи между регуляторами кроветворения: белки GATA подавляют PU.1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (15): 8705–8710. Бибкод : 1999PNAS...96.8705Z . дои : 10.1073/pnas.96.15.8705 . ПМК 17580 . ПМИД 10411939 .

[pmid10022840-13] Брасс А.Л., Чжу А.К., Сингх Х (февраль 1999 г.). «Требования к сборке активаторных комплексов PU.1-Pip (IRF-4): ингибирующая функция in vivo с использованием слитых димеров» . Журнал ЭМБО . 18 (4): 977–991. дои : 10.1093/emboj/18.4.977 . ПМЦ 1171190 . ПМИД 10022840 .

[pmid12372320-14] Эскаланте Ч.Р., Шен Л., Эскаланте М.К., Брасс А.Л., Эдвардс Т.А., Сингх Х. и др. (июль 2002 г.). «Кристаллизация и характеристика тройного комплекса PU.1/IRF-4/ДНК». Журнал структурной биологии . 139 (1): 55–59. дои : 10.1016/s1047-8477(02)00514-2 . ПМИД 12372320 .

[pmid8626664-15] Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Транскрипционный фактор Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–11181. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД 8626664 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]