Protein-coding gene in the species Homo sapiens
GTF2I Идентификаторы Псевдонимы GTF2I , BAP135, BTKAP1, DIWS, GTFII-I, IB291, SPIN, TFII-I, WBS, WBSCR6, общий фактор транскрипции IIi Внешние идентификаторы Опустить : 601679 ; МГИ : 1202722 ; Гомологен : 7748 ; Генные карты : GTF2I ; ОМА : GTF2I — ортологи показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 5 (mouse)[2] Band 5 G2|5 74.48 cM Start 134,237,834 bp [2] End 134,314,760 bp [2]
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in ganglionic eminence epithelium of colon sural nerve ventricular zone right uterine tube right adrenal cortex right lobe of thyroid gland left lobe of thyroid gland right ovary body of pancreas
Top expressed in utricle spermatocyte molar primitive streak vestibular sensory epithelium superior surface of tongue medullary collecting duct renal corpuscle retinal pigment epithelium ciliary body
More reference expression data
BioGPS
Викиданные
Общий фактор транскрипции II-I представляет собой белок , который у человека кодируется GTF2I геном . [5] [6] [7]
Этот ген кодирует многофункциональный фосфопротеин TFII-I, участвующий в транскрипции и передаче сигналов. Гаплонедостаточность (удаление одной копии) гена GTF2I отмечается при синдроме Вильямса-Бойрена , мультисистемном нарушении развития, вызванном делецией смежных генов на хромосоме 7q11.23. Он дублируется при синдроме дупликации 7q11.23 . [8] Экзон(ы), кодирующий 5'-UTR, полностью не определен, но известно, что этот ген содержит по меньшей мере 34 экзона, и его альтернативный сплайсинг генерирует 4 варианта транскрипта у людей. [7] Единственная точечная мутация GTF2I, обеспечивающая усиление функции, также обнаруживается при некоторых тимомах. Однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в GTF2I коррелирует с аутоиммунными нарушениями.
Было показано, что GTF2I взаимодействует с:
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000263001 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060261 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Перейти обратно: а б Грюнеберг Д.А., Генри Р.В., Брауэр А., Новина К.Д., Черият В., Рой А.Л., Гилман М. (октябрь 1997 г.). «Многофункциональный ДНК-связывающий белок, который способствует образованию комплексов фактора ответа сыворотки/гомеодомена: идентичность TFII-I» . Гены и развитие . 11 (19): 2482–93. дои : 10.1101/gad.11.19.2482 . ПМК 316568 . ПМИД 9334314 . ^ Перейти обратно: а б Ян В., Дезидерио С. (январь 1997 г.). «BAP-135, мишень для тирозинкиназы Брутона в ответ на взаимодействие с рецептором B-клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (2): 604–9. Бибкод : 1997PNAS...94..604Y . дои : 10.1073/pnas.94.2.604 . ЧВК 19560 . ПМИД 9012831 . ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: общий фактор транскрипции GTF2I II, i» . ^ Рой А.Л. (июнь 2017 г.). «Патофизиология TFII-I: старая гвардия в новых шляпах» . Тенденции молекулярной медицины . 23 (6): 501–511. doi : 10.1016/j.molmed.2017.04.002 . ПМК 5504908 . ПМИД 28461154 . ^ Сакристан С., Тусье-Луна М.И., Логан С.М., Рой А.Л. (февраль 2004 г.). «Механизм опосредованного тирозинкиназой Брутона рекрутирования и регуляции TFII-I» . Журнал биологической химии . 279 (8): 7147–58. дои : 10.1074/jbc.M303724200 . ПМИД 14623887 . ^ Новина С.Д., Кумар С., Баджпай У., Черият В., Чжан К., Пиллаи С., Уортис Х.Х., Рой А.Л. (июль 1999 г.). «Регуляция ядерной локализации и транскрипционной активности TFII-I тирозинкиназой Брутона» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5014–24. дои : 10.1128/mcb.19.7.5014 . ПМЦ 84330 . ПМИД 10373551 . ^ Перейти обратно: а б Вэнь Ю.Д., Кресс В.Д., Рой А.Л., Сето Э. (январь 2003 г.). «Гистондеацетилаза 3 связывается с многофункциональным фактором транскрипции TFII-I и регулирует его» . Журнал биологической химии . 278 (3): 1841–7. дои : 10.1074/jbc.M206528200 . ПМИД 12393887 . ^ Тусье-Луна М.И., Баярсайхан Д., Сето Э., Раддл Ф.Х., Рой А.Л. (октябрь 2002 г.). «Физические и функциональные взаимодействия деацетилазы гистонов 3 с белками семейства TFII-I и PIASxbeta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (20): 12807–12. Бибкод : 2002PNAS...9912807T . дои : 10.1073/pnas.192464499 . ПМЦ 130541 . ПМИД 12239342 . ^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат на Х-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–9. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763 . ^ Ким Д.В., Кокран Б.Х. (февраль 2000 г.). «Киназа, регулируемая внеклеточными сигналами, связывается с TFII-I и регулирует его активацию промотора c-fos» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1140–8. дои : 10.1128/mcb.20.4.1140-1148.2000 . ПМЦ 85232 . ПМИД 10648599 . ^ Рой А.Л., Каррутерс К., Гутьяр Т., Редер Р.Г. (сентябрь 1993 г.). «Прямая роль Myc в инициации транскрипции, опосредованная взаимодействием с TFII-I». Природа . 365 (6444): 359–61. Бибкод : 1993Natur.365..359R . дои : 10.1038/365359a0 . ПМИД 8377829 . S2CID 4354157 . ^ Кастил Д.Э., Чжуан С., Гуди Т., Тан Дж., Вуика М., Дезидерио С., Пильц Р.Б. (август 2002 г.). «цГМФ-зависимая протеинкиназа I бета физически и функционально взаимодействует с регулятором транскрипции TFII-I» . Журнал биологической химии . 277 (35): 32003–14. дои : 10.1074/jbc.M112332200 . ПМИД 12082086 . ^ Ким Д.В., Черият В., Рой А.Л., Кокран Б.Х. (июнь 1998 г.). «TFII-I усиливает активацию промотора c-fos посредством взаимодействия с вышестоящими элементами» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (6): 3310–20. дои : 10.1128/mcb.18.6.3310 . ПМЦ 108912 . ПМИД 9584171 . ^ Рой А.Л., Ду Х., Грегор П.Д., Новина К.Д., Мартинес Э., Рёдер Р.Г. (декабрь 1997 г.). «Клонирование inr- и E-бокс-связывающего белка, TFII-I, который физически и функционально взаимодействует с USF1» . Журнал ЭМБО . 16 (23): 7091–104. дои : 10.1093/emboj/16.23.7091 . ПМК 1170311 . ПМИД 9384587 . ^ Рой А.Л., Мейстернст М., Поньонец П., Редер Р.Г. (ноябрь 1991 г.). «Кооперативное взаимодействие фактора инициации транскрипции, связывающего инициатор, и активатора спираль-петля-спираль USF». Природа . 354 (6350): 245–8. Бибкод : 1991Natur.354..245R . дои : 10.1038/354245a0 . ПМИД 1961251 . S2CID 4260885 . Рой А.Л., Мейстернст М., Поньонец П., Редер Р.Г. (ноябрь 1991 г.). «Кооперативное взаимодействие фактора инициации транскрипции, связывающего инициатор, и активатора спираль-петля-спираль USF». Природа . 354 (6350): 245–8. Бибкод : 1991Natur.354..245R . дои : 10.1038/354245a0 . ПМИД 1961251 . S2CID 4260885 . Рой А.Л., Каррутерс К., Гутьяр Т., Редер Р.Г. (сентябрь 1993 г.). «Прямая роль Myc в инициации транскрипции, опосредованная взаимодействием с TFII-I». Природа . 365 (6444): 359–61. Бибкод : 1993Natur.365..359R . дои : 10.1038/365359a0 . ПМИД 8377829 . S2CID 4354157 . Рой А.Л., Ду Х., Грегор П.Д., Новина К.Д., Мартинес Э., Рёдер Р.Г. (декабрь 1997 г.). «Клонирование inr- и E-бокс-связывающего белка, TFII-I, который физически и функционально взаимодействует с USF1» . Журнал ЭМБО . 16 (23): 7091–104. дои : 10.1093/emboj/16.23.7091 . ПМК 1170311 . ПМИД 9384587 . Перес Хурадо Л.А., Ван Ю.К., Пиплс Р., Колома А., Крусес Дж., Франк У (март 1998 г.). «Дублированный ген в областях точки разрыва делеции синдрома Вильямса-Бойрена 7q11.23 кодирует инициатор-связывающий белок TFII-I и BAP-135, мишень фосфорилирования BTK» . Молекулярная генетика человека . 7 (3): 325–34. дои : 10.1093/hmg/7.3.325 . ПМИД 9466987 . Ким Д.В., Черият В., Рой А.Л., Кокран Б.Х. (июнь 1998 г.). «TFII-I усиливает активацию промотора c-fos посредством взаимодействия с вышестоящими элементами» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (6): 3310–20. дои : 10.1128/mcb.18.6.3310 . ПМЦ 108912 . ПМИД 9584171 . Чериат В., Новина С.Д., Рой А.Л. (август 1998 г.). «TFII-I регулирует активность промотора Vbeta через элемент-инициатор» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (8): 4444–54. дои : 10.1128/mcb.18.8.4444 . ПМК 109030 . ПМИД 9671454 . Новина CD, Чериат В., Рой А.Л. (декабрь 1998 г.). «Регуляция активности TFII-I путем фосфорилирования» . Журнал биологической химии . 273 (50): 33443–8. дои : 10.1074/jbc.273.50.33443 . ПМИД 9837922 . Новина С.Д., Кумар С., Баджпай У., Черият В., Чжан К., Пиллаи С., Уортис Х.Х., Рой А.Л. (июль 1999 г.). «Регуляция ядерной локализации и транскрипционной активности TFII-I тирозинкиназой Брутона» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5014–24. дои : 10.1128/mcb.19.7.5014 . ПМЦ 84330 . ПМИД 10373551 . Ким Д.В., Кокран Б.Х. (февраль 2000 г.). «Киназа, регулируемая внеклеточными сигналами, связывается с TFII-I и регулирует его активацию промотора c-fos» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1140–8. дои : 10.1128/MCB.20.4.1140-1148.2000 . ПМЦ 85232 . ПМИД 10648599 . Черият В., Рой А.Л. (август 2000 г.). «Альтернативно сплайсированные изоформы TFII-I. Образование комплекса, ядерная транслокация и дифференциальная регуляция генов» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26300–8. дои : 10.1074/jbc.M002980200 . ПМИД 10854432 . Паркер Р., Фан Т., Баумейстер П., Рой Б., Черият В., Рой А.Л., Ли А.С. (май 2001 г.). «Идентификация TFII-I как фактора связывания элемента ответа на стресс эндоплазматического ретикулума ERSF: его ауторегуляция под действием стресса и взаимодействия с ATF6» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (9): 3220–33. дои : 10.1128/MCB.21.9.3220-3233.2001 . ПМК 86961 . ПМИД 11287625 . Ким Д.В., Кокран Б.Х. (май 2001 г.). «JAK2 активирует TFII-I и регулирует его взаимодействие с киназой, регулируемой внеклеточными сигналами» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (10): 3387–97. дои : 10.1128/MCB.21.10.3387-3397.2000 . ПМК 100260 . ПМИД 11313464 . Эглофф А.М., Дезидерио С. (июль 2001 г.). «Идентификация сайтов фосфорилирования тирозинкиназы Брутона в регуляторе транскрипции BAP/TFII-I» . Журнал биологической химии . 276 (30): 27806–15. дои : 10.1074/jbc.M103692200 . ПМИД 11373296 . Чериат В., Дегранж З.П., Рой А.Л. (июнь 2002 г.). «c-Src-зависимая транскрипционная активация TFII-I» . Журнал биологической химии . 277 (25): 22798–805. дои : 10.1074/jbc.M202956200 . ПМИД 11934902 . Кастил Д.Э., Чжуан С., Гуди Т., Тан Дж., Вуика М., Дезидерио С., Пильц Р.Б. (август 2002 г.). «цГМФ-зависимая протеинкиназа I бета физически и функционально взаимодействует с регулятором транскрипции TFII-I» . Журнал биологической химии . 277 (35): 32003–14. дои : 10.1074/jbc.M112332200 . ПМИД 12082086 . Тусси-Луна М.И., Мишель Б., Хакре С., Рой А.Л. (ноябрь 2002 г.). «Член семейства убиквитин-белковых изопептид-лигаз SUMO Miz1/PIASxbeta/Siz2 является транскрипционным кофактором для TFII-I» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43185–93. дои : 10.1074/jbc.M207635200 . ПМИД 12193603 . Тусье-Луна М.И., Баярсайхан Д., Сето Э., Раддл Ф.Х., Рой А.Л. (октябрь 2002 г.). «Физические и функциональные взаимодействия деацетилазы гистонов 3 с белками семейства TFII-I и PIASxbeta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (20): 12807–12. Бибкод : 2002PNAS...9912807T . дои : 10.1073/pnas.192464499 . ПМЦ 130541 . ПМИД 12239342 . Вэнь Ю.Д., Кресс В.Д., Рой А.Л., Сето Э. (январь 2003 г.). «Гистондеацетилаза 3 связывается с многофункциональным фактором транскрипции TFII-I и регулирует его» . Журнал биологической химии . 278 (3): 1841–7. дои : 10.1074/jbc.M206528200 . ПМИД 12393887 . Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
показывать галерея PDB
1q60 : Solution Structure of RSGI RUH-004, a GTF2I domain in Mouse cDNA
2d9b : Solution Structure of RSGI RUH-052, a GTF2I domain in human cDNA
2dn4 : Solution Structure of RSGI RUH-060, a GTF2I domain in human cDNA
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group C bHLH-PAS Group D Group E Group F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
hide (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors