ПАКС3
ПАКС3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | PAX3 , CDHS, HUP2, WS1, WS3, Pax3, спаренный ящик 3, PAX-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 606597 ; МГИ : 97487 ; Гомологен : 22494 ; Генные карты : PAX3 ; ОМА : PAX3 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Ген PAX3 3 парного бокса) ( ген кодирует члена парного бокса или PAX семейства транскрипционных факторов . [5] Семейство PAX состоит из девяти членов человека (PAX1-PAX9) и девяти мышей (Pax1-Pax9), объединенных в четыре подсемейства. Человеческий PAX3 и мышиный Pax3 присутствуют в подсемействе наряду с высоко гомологичными генами PAX7 человека и Pax7 мыши. Ген PAX3 человека расположен в хромосомной области 2q36.1 и содержит 10 экзонов в области размером 100 т.п.н.
Сплайсинг транскрипта
[ редактировать ]Альтернативный сплайсинг и процессинг создают множество изоформ PAX3 , которые были обнаружены на уровне мРНК. [6] PAX3e является самой длинной изоформой и состоит из 10 экзонов, кодирующих белок из 505 аминокислот. У других видов млекопитающих, включая мышь, самые длинные мРНК соответствуют изоформам PAX3c и PAX3d человека, которые состоят из первых 8 или 9 экзонов гена PAX3 соответственно. Более короткие изоформы PAX3 включают мРНК, пропускающие экзон 8 (PAX3g и PAX3h), и мРНК, содержащие 4 или 5 экзонов (PAX3a и PAX3b). В ограниченных исследованиях, сравнивающих экспрессию изоформ, PAX3d экспрессируется на самых высоких уровнях. С функциональной точки зрения PAX3c, PAX3d и PAX3h стимулируют такие действия, как рост клеток, тогда как PAX3e и PAX3g ингибируют эту активность, а PAX3a и PAX3b не проявляют активности или ингибируют эти конечные точки.
Обычный альтернативный сплайсинг, влияющий на мРНК PAX3, включает последовательность CAG на 5'-конце экзона 3. [7] Этот сплайс либо включает, либо исключает эти три основания, что приводит к присутствию или отсутствию остатка глутамина в мотиве парного бокса. Ограниченные исследования по секвенированию полноразмерных кДНК человека идентифицировали это событие сплайсинга как вариант изоформы PAX3d, и эта сплайсированная изоформа была названа отдельно изоформой PAX3i. Изоформы Q+ и Q- PAX3 обычно совместно экспрессируются в клетках. На функциональном уровне изоформа Q+ демонстрирует такое же или меньшее связывание ДНК и активацию транскрипции, чем изоформа Q-.
Структура и функции белка
[ редактировать ]PAX3 кодирует фактор транскрипции с N-концевым ДНК-связывающим доменом, состоящим из парного бокса (PD), кодируемого экзонами 2, 3 и 4, и октапептида и полного гомеодомена (HD), кодируемого экзонами 5 и 6. [8] Кроме того, белок PAX3 имеет С-концевой домен активации транскрипции, кодируемый экзонами 7 и 8. Высококонсервативный PD состоит из участка из 128 аминокислот, который связывается с последовательностями ДНК, связанными с мотивом TCACGC/G. [9] Мотив HD обычно состоит из 60 аминокислот и связывается с последовательностями, содержащими основной мотив ТААТ. [10] Комбинация этих двух ДНК-связывающих доменов позволяет белку PAX3 распознавать более длинные последовательности, содержащие сайты связывания PD и HD. [11] На С-конце PAX3 имеется область, богатая пролином, серином и треонином (PST), состоящая из 78 аминокислот, которая стимулирует транскрипционную активность. [12] Существуют также домены репрессии транскрипции в HD и N-концевой области (включая первую половину PD), которые репрессируют C-концевой домен активации транскрипции. [13]
PAX3 действует как активатор транскрипции для большинства генов-мишеней, но также может подавлять меньшую подгруппу генов-мишеней. [14] Эти изменения экспрессии происходят за счет связывания PAX3 со специфическими сайтами узнавания, которые расположены в различных местах генома. [15] Некоторые сайты связывания расположены внутри генов-мишеней или рядом с ними, например, 5'-промотор, первый интрон и 3'-нетранслируемая область. Значительное количество сайтов связывания PAX3 расположено на больших расстояниях выше и ниже генов-мишеней. Среди генов-мишеней PAX3 есть одна группа, связанная с развитием мышц, и вторая группа, связанная с развитием нервов и меланоцитов. Белки, кодируемые этими генами-мишенями, регулируют различные функциональные активности в этих линиях, включая дифференцировку, пролиферацию, миграцию, адгезию и апоптоз.
PAX3 взаимодействует с другими ядерными белками, которые модулируют транскрипционную активность PAX3. Димеризация PAX3 с другой молекулой PAX3 или молекулой PAX7 обеспечивает связывание с палиндромным сайтом связывания HD (TAATCAATTA). [16] Взаимодействие PAX3 с другими факторами транскрипции (такими как SOX10) или факторами хроматина (такими как PAX3/7BP) обеспечивает синергетическую активацию генов-мишеней PAX3. [17] [18] Напротив, связывание PAX3 с ко-репрессорами, такими как кальмирин, ингибирует активацию генов-мишеней PAX3. [19] Эти корепрессоры могут функционировать, изменяя структуру хроматина в генах-мишенях, ингибируя узнавание PAX3 его сайта связывания с ДНК или напрямую изменяя транскрипционную активность PAX3.
Наконец, экспрессия и функция белка PAX3 могут модулироваться посттрансляционными модификациями. PAX3 может фосфорилироваться по серинам 201, 205 и 209 с помощью киназ, таких как GSK3b, что в некоторых случаях увеличивает стабильность белка PAX3. [20] [21] Кроме того, PAX3 также может подвергаться убиквитинированию и ацетилированию по лизинам 437 и 475, что регулирует стабильность и функцию белка. [22] [23]
Таблица 1. Репрезентативные гены-мишени транскрипции PAX3.
Категория белка | Имя | Фенотипическая активность |
Молекула клеточной адгезии | НРКАМ | Межклеточная адгезия |
Хемокиновый рецептор | CXCR4 | Подвижность |
Рецептор тирозинкиназы | ФГФР4 | Пролиферация, дифференциация, миграция |
ИЗ | Распространение, миграция, выживание | |
ВЕРНО | Пролиферация, миграция, дифференциация | |
Транскрипционный фактор | МИТФ | Дифференциация, пролиферация, выживание |
MYF5 | Дифференциация | |
МИОД1 | Дифференциация |
Выражение во время разработки
[ редактировать ]Во время развития одной из основных линий, экспрессирующих Pax3, является линия скелетных мышц. [24] Экспрессия Pax3 сначала наблюдается в пресомитной параксиальной мезодерме, а затем в конечном итоге ограничивается дермомиотомом , который формируется из дорсальной области сомитов. Чтобы сформировать скелетные мышцы в центральных сегментах тела, клетки, экспрессирующие PAX3, отделяются от дермомиотома, а затем экспрессия Pax3 отключается, поскольку активируется экспрессия Myf5 и MyoD1. Для формирования других скелетных мышц клетки, экспрессирующие Pax3, отделяются от дермомиотома и мигрируют в более отдаленные места, такие как конечности и диафрагма. Подмножество этих экспрессирующих Pax3 клеток, полученных из дермомиотома, также служит постоянным пулом предшественников для роста скелетных мышц во время развития плода. На более поздних стадиях развития миогенные предшественники, экспрессирующие Pax3 и/или Pax7, образуют сателлитные клетки внутри скелетных мышц, которые способствуют постнатальному росту мышц и регенерации мышц. Эти взрослые сателлитные клетки остаются в состоянии покоя до тех пор, пока не произойдет травма, а затем стимулируются к делению и регенерации поврежденной мышцы.
Pax3 также участвует в развитии нервной системы. [25] Экспрессия Pax3 впервые обнаруживается в дорсальной области нервной борозды, и по мере того, как эта нервная борозда углубляется, образуя нервную трубку, Pax3 экспрессируется в дорсальной части нервной трубки. По мере увеличения нервной трубки экспрессия Pax3 локализуется в пролиферативных клетках во внутренней зоне желудочков, а затем эта экспрессия отключается, поскольку эти клетки мигрируют в более поверхностные области. Pax3 экспрессируется по всей длине нервной трубки и на большей части развивающегося мозга, и эта экспрессия впоследствии отключается на более поздних стадиях развития в ростральном и каудальном направлении.
Во время раннего развития экспрессия Pax3 также происходит на латеральном и заднем краях нервной пластинки, которая является областью, из которой возникает нервный гребень . [26] Pax3 позже экспрессируется различными типами клеток и структурами, возникающими из нервного гребня, такими как меланобласты, предшественники шванновских клеток и ганглии дорсальных корешков. Кроме того, клетки, экспрессирующие Pax3, происходящие из нервного гребня, способствуют формированию других структур, таких как внутреннее ухо, нижняя и верхняя челюсти. [27]
Pax3 контролирует расположение назиона ( черты лица между глазами и верхней части носа) и связан с наличием моноброви . [28]
Зародышевые мутации при заболеваниях
[ редактировать ]Зародышевые мутации гена Pax3 вызывают фенотип пятен у мышей. [29] [30] На молекулярном уровне этот фенотип вызван точечными мутациями или делециями, которые изменяют или отменяют транскрипционную функцию Pax3. В гетерозиготном состоянии фенотип пятен характеризуется белыми пятнами на животе, хвосте и лапах. Эти белые пятна объясняются локализованным дефицитом пигментообразующих меланоцитов, возникающим в результате дефектов клеток нервного гребня. В гомозиготном состоянии эти мутации Pax3 вызывают эмбриональную летальность, которая связана с выраженными дефектами закрытия нервной трубки и аномалиями структур нервного гребня, таких как меланоциты, ганглии дорсальных корешков и энтеральные ганглии. Пороки развития сердца также возникают в результате потери клеток нервного гребня сердца, которые обычно участвуют в выносящих путях сердца и иннервации сердца. Наконец, у гомозигот не развивается мускулатура конечностей, а в осевой мускулатуре наблюдаются различные аномалии. Эти миогенные эффекты вызваны повышенной гибелью клеток миогенных предшественников в дермомиотоме и уменьшением миграции из дермомиотома.
Зародышевые мутации гена PAX3 встречаются при заболевании человека синдромом Ваарденбурга . [31] который состоит из четырех аутосомно-доминантных генетических нарушений (WS1, WS2, WS3 и WS4). [32] Из четырех подтипов WS1 и WS3 обычно вызываются мутациями PAX3. Для всех четырех подтипов характерны потеря слуха, аномалии глаз и нарушения пигментации. Кроме того, WS1 часто связан с изменением средней части лица, называемым дистопией кантора, тогда как WS3 (синдром Кляйна-Ваарденбурга) часто отличается скелетно-мышечными аномалиями, поражающими верхние конечности. Большинство случаев WS1 вызваны гетерозиготными мутациями PAX3, тогда как WS3 вызван частичной или полной делецией PAX3 и смежных генов или меньшими мутациями PAX3 в гетерозиготном или гомозиготном состоянии. Эти мутации PAX3 в WS1 и WS3 включают миссенс-, нонсенс-мутации и мутации сплайсинга; небольшие вставки; и небольшие или грубые делеции. Хотя эти изменения обычно не рецидивируют, мутации обычно возникают в экзонах со 2 по 6, причем наиболее распространены мутации экзона 2. Поскольку эти экзоны кодируют парный бокс и гомеодомен, эти мутации часто влияют на функцию связывания ДНК.
Мутации при раке человека
[ редактировать ]Этот раздел нуждается в более надежных медицинских справках для проверки или слишком сильно полагается на первоисточники . ( январь 2018 г. ) |
Альвеолярная рабдомиосаркома (ARMS) — агрессивная саркома мягких тканей, возникающая у детей и обычно характеризующаяся рецидивирующей хромосомной транслокацией t(2;13)(q35;q14). [33] [34] Эта транслокация 2;13 разрывает и воссоединяет части генов PAX3 и FOXO1 с образованием слитого гена PAX3-FOXO1, который экспрессирует слитый транскрипт PAX3-FOXO1, кодирующий слитый белок PAX3-FOXO1. [35] PAX3 и FOXO1 кодируют факторы транскрипции, и в результате транслокации образуется слитый фактор транскрипции, содержащий N-концевой ДНК-связывающий домен PAX3 и C-концевой домен трансактивации FOXO1. Меньшая группа случаев ARMS связана с менее частыми слияниями PAX7 с FOXO1 или редкими слияниями PAX3 с другими факторами транскрипции, такими как NCOA1. [36] [37] По сравнению с белком PAX3 дикого типа, слитый белок PAX3-FOXO1 более эффективно активирует гены-мишени PAX3. [13] В клетках ARMS PAX3-FOXO1 обычно действует как активатор транскрипции и чрезмерно увеличивает экспрессию нижестоящих генов-мишеней. [38] [39] Кроме того, PAX3-FOXO1 связывается вместе с MYOD1, MYOG и MYCN, а также со структурными белками хроматина, такими как CHD4 и BRD4, способствуя образованию суперэнхансеров вблизи подмножества этих генов-мишеней. [40] Эти нерегулируемые гены-мишени способствуют онкогенезу, изменяя сигнальные пути, которые влияют на пролиферацию, гибель клеток, миогенную дифференцировку и миграцию.
Хромосомная транслокация t(2;4)(q35;q31.1), которая объединяет гены PAX3 и MAML3, встречается при бифенотипической синоназальной саркоме (BSNS), злокачественном новообразовании у взрослых низкой степени злокачественности, связанном как с миогенной, так и с нейральной дифференцировкой. [41] MAML3 кодирует коактиватор транскрипции, участвующий в передаче сигналов Notch. Слияние PAX3-MAML3 совмещает N-концевой ДНК-связывающий домен PAX3 с C-концевым доменом трансактивации MAML3 для создания еще одного мощного активатора генов-мишеней с сайтами связывания PAX3. Следует отметить, что PAX3 перестраивается без участия MAML3 в меньшей подгруппе случаев BSNS, и некоторые из этих вариантов случаев содержат слияние PAX3-NCOA1 или PAX3-FOXO1. [42] [43] Хотя слияния PAX3-FOXO1 и PAX3-NCOA1 могут образовываться как в ARMS, так и в BSNS, существуют различия в паттерне активированных нижестоящих генов-мишеней, что позволяет предположить, что клеточная среда играет важную роль в модуляции продукции этих слитых транскрипционных факторов.
Помимо опухолей со слитыми генами, связанными с PAX3, существует несколько других категорий опухолей, которые экспрессируют ген PAX3 дикого типа. Присутствие экспрессии PAX3 в некоторых опухолях можно объяснить их происхождением от линий развития, обычно экспрессирующих PAX3 дикого типа. Например, PAX3 экспрессируется при раке, связанном с линиями, происходящими из нервной трубки (например, глиобластома), линиями, происходящими из нервного гребня (например, меланома) и миогенными линиями (например, эмбриональная рабдомиосаркома). [44] [45] [46] [47] Однако PAX3 также экспрессируется при других типах рака, не имеющих четкой связи с линиями развития, экспрессирующими PAX3, такими как карцинома молочной железы и остеосаркома. [48] [49] При этих видах рака, экспрессирующих PAX3 дикого типа, функция PAX3 влияет на контроль пролиферации, апоптоза, дифференцировки и подвижности. [44] [45] Следовательно, PAX3 дикого типа играет регуляторную роль в онкогенезе и прогрессировании опухоли, что может быть связано с его ролью в нормальном развитии.
Примечания
[ редактировать ]Версия этой статьи 2018 года была обновлена внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая академическая рецензируемая статья была опубликована в журнале Gene и может цитироваться как: Салах Буджади, Бишванат Чаттерджи, Венюэ Сан, Прашантха Вему, Фредерик Дж. Барр (5 августа 2018 г.). «Экспрессия и функция PAX3 в развитии и заболевании» . Джин . Серия обзоров Gene Wiki. 666 : 145–157. дои : 10.1016/J.GENE.2018.04.087 . ISSN 0378-1119 . ПМК 6624083 . ПМИД 29730428 . Викиданные Q65666079 . |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135903 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004872 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Стюарт Э.Т., Киусси С., Грусс П. (1994). «Гены Pax млекопитающих». обзор. Ежегодный обзор генетики . 28 : 219–36. дои : 10.1146/annurev.ge.28.120194.001251 . ПМИД 7893124 .
- ^ Ван Кью, Фанг В.Х., Крупински Дж., Кумар С., Слевин М., Кумар П. (декабрь 2008 г.). «Гены Pax в эмбриогенезе и онкогенезе» . обзор. Журнал клеточной и молекулярной медицины . 12 (6А): 2281–94. дои : 10.1111/j.1582-4934.2008.00427.x . ПМЦ 4514106 . ПМИД 18627422 .
- ^ Воган К.Дж., Андерхилл Д.А., Грос П. (декабрь 1996 г.). «Альтернативное событие сплайсинга в парном домене Pax-3 идентифицирует линкерную область как ключевой детерминант активности связывания ДНК парного домена» . начальный. Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6677–86. дои : 10.1128/mcb.16.12.6677 . ПМК 231670 . ПМИД 8943322 .
- ^ Болдуин К.Т., Хот К.Ф., Мачина Р.А., Милунски А. (август 1995 г.). «Мутации в PAX3, вызывающие синдром Ваарденбурга I типа: десять новых мутаций и обзор литературы». обзор. Американский журнал медицинской генетики . 58 (2): 115–22. дои : 10.1002/ajmg.1320580205 . ПМИД 8533800 .
- ^ Джун С., Десплан С (сентябрь 1996 г.). «Кооперативные взаимодействия между парным доменом и гомеодоменом». начальный. Разработка . 122 (9): 2639–50. дои : 10.1242/dev.122.9.2639 . ПМИД 8787739 .
- ^ Уилсон Д., Шэн Г., Лекуит Т., Достатни Н., Десплан С. (ноябрь 1993 г.). «Кооперативная димеризация парных гомеодоменов класса ДНК» . начальный. Гены и развитие . 7 (11): 2120–34. дои : 10.1101/gad.7.11.2120 . ПМИД 7901121 .
- ^ Фелан С.А., Локен М.Р. (июль 1998 г.). «Идентификация нового мотива связывания для парного домена Pax-3 и необычных характеристик расположения двудольных элементов распознавания при связывании и активации транскрипции» . начальный. Журнал биологической химии . 273 (30): 19153–9. дои : 10.1074/jbc.273.30.19153 . ПМИД 9668101 .
- ^ Бенничелли Дж.Л., Фредерикс В.Дж., Уилсон Р.Б., Раушер Ф.Дж., Барр Ф.Г. (июль 1995 г.). «Белок PAX3 дикого типа и слитый белок PAX3-FKHR альвеолярной рабдомиосаркомы содержат мощные, структурно различные домены активации транскрипции». начальный. Онкоген . 11 (1): 119–30. ПМИД 7624119 .
- ^ Перейти обратно: а б Бенничелли Дж.Л., Эдвардс Р.Х., Барр Ф.Г. (май 1996 г.). «Механизм транскрипционного усиления функции в результате хромосомной транслокации при альвеолярной рабдомиосаркоме» . начальный. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5455–9. Бибкод : 1996PNAS...93.5455B . дои : 10.1073/pnas.93.11.5455 . ПМК 39267 . ПМИД 8643596 .
- ^ Майанил К.С., Джордж Д., Фрейлих Л., Мильян Э.Дж., Мания-Фарнелл Б., МакЛон Д.Г. и др. (декабрь 2001 г.). «Микрочиповый анализ обнаруживает новые гены-мишени, расположенные ниже Pax3» . начальный. Журнал биологической химии . 276 (52): 49299–309. дои : 10.1074/jbc.M107933200 . ПМИД 11590174 .
- ^ Сулеймани В.Д., Панч В.Г., Кавабе Й., Джонс А.Е., Палидвор Г.А., Портер С.Дж. и др. (июнь 2012 г.). «Транскрипционное доминирование Pax7 во взрослом миогенезе обусловлено распознаванием гомеодоменовых мотивов с высоким сродством» . начальный. Развивающая клетка . 22 (6): 1208–20. дои : 10.1016/j.devcel.2012.03.014 . ПМК 3376216 . ПМИД 22609161 .
- ^ Шефер Б.В., Черни Т., Бернаскони М., Дженини М., Бусслингер М. (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика кДНК человека PAX-7, экспрессируемой в нормальных и неопластических миоцитах» . начальный. Исследования нуклеиновых кислот . 22 (22): 4574–82. дои : 10.1093/нар/22.22.4574 . ПМК 308503 . ПМИД 7527137 .
- ^ Ланг Д., Эпштейн Дж. А. (апрель 2003 г.). «Sox10 и Pax3 физически взаимодействуют, опосредуя активацию консервативного энхансера c-RET» . начальный. Молекулярная генетика человека . 12 (8): 937–45. дои : 10.1093/hmg/ddg107 . ПМИД 12668617 .
- ^ Дяо Ю, Го Х, Ли Ю, Сунь К, Лу Л, Цзян Л и др. (август 2012 г.). «Pax3/7BP представляет собой Pax7- и Pax3-связывающий белок, который регулирует пролиферацию мышечных клеток-предшественников с помощью эпигенетического механизма» . начальный. Клеточная стволовая клетка . 11 (2): 231–41. дои : 10.1016/j.stem.2012.05.022 . ПМИД 22862948 .
- ^ Холленбах А.Д., Макферсон С.Дж., Лагутина И., Гросвельд Г. (апрель 2002 г.). «Кальмирин, связывающий кальций белок EF-hand, ингибирует транскрипционную и ДНК-связывающую активность Pax3». начальный. Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1574 (3): 321–8. дои : 10.1016/s0167-4781(02)00230-0 . ПМИД 11997098 .
- ^ Дитц К.Н., Миллер П.Дж., Айенгар А.С., Лупе Дж.М., Холленбах А.Д. (июнь 2011 г.). «Идентификация серинов 201 и 209 как сайтов фосфорилирования Pax3 и измененного статуса фосфорилирования Pax3-FOXO1 во время ранней миогенной дифференцировки» . начальный. Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 43 (6): 936–45. дои : 10.1016/j.biocel.2011.03.010 . ПМК 3095663 . ПМИД 21440083 .
- ^ Кубич Дж.Д., Маскаренхас Ж.Б., Иизука Т., Вольфгехер Д., Ланг Д. (август 2012 г.). «GSK-3 способствует выживанию, росту и повышению уровня PAX3 в клетках меланомы человека» . начальный. Молекулярные исследования рака . 10 (8): 1065–76. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-11-0387 . ПМЦ 3422428 . ПМИД 22679108 .
- ^ Буте С.К., Дисатник М.Х., Чан Л.С., Иори К., Рандо Т.А. (июль 2007 г.). «Регуляция Pax3 путем протеасомной деградации моноубиквитинированного белка в предшественниках скелетных мышц» . начальный. Клетка . 130 (2): 349–62. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.044 . ПМИД 17662948 .
- ^ Ичи С., Бошняку В., Шен Ю.В., Мания-Фарнелл Б., Альгрен С., Сапру С. и др. (февраль 2011 г.). «Роль ацетилирования Pax3 в регуляции Hes1 и Neurog2» . начальный. Молекулярная биология клетки . 22 (4): 503–12. doi : 10.1091/mbc.E10-06-0541 . ПМК 3038648 . ПМИД 21169561 .
- ^ Букингем М., Реле Ф (2007). «Роль генов Pax в развитии тканей и органов: Pax3 и Pax7 регулируют функции мышечных клеток-предшественников». обзор. Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 23 : 645–73. doi : 10.1146/annurev.cellbio.23.090506.123438 . ПМИД 17506689 .
- ^ Гулдинг, доктор медицинских наук, Чалепакис Г., Дойч У., Эрселиус-младший, Грусс П. (май 1991 г.). «Pax-3, новый мышиный ДНК-связывающий белок, экспрессируемый во время раннего нейрогенеза» . начальный. Журнал ЭМБО . 10 (5): 1135–47. дои : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb08054.x . ПМК 452767 . ПМИД 2022185 .
- ^ Монсоро-Бурк AH (август 2015 г.). «Факторы транскрипции PAX в развитии нервного гребня». обзор. Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 87–96. дои : 10.1016/j.semcdb.2015.09.015 . ПМИД 26410165 .
- ^ Ву М., Ли Дж., Энглека К.А., Чжоу Б., Лу М.М., Плоткин Дж.Б. и др. (июнь 2008 г.). «Постоянная экспрессия Pax3 в нервном гребне вызывает расщелину неба и дефектный остеогенез у мышей» . начальный. Журнал клинических исследований . 118 (6): 2076–87. дои : 10.1172/JCI33715 . ПМК 2381747 . ПМИД 18483623 .
- ^ Адхикари К. «Как мы открыли генетическое происхождение монобровий и других особенностей волос» . Разговор . Проверено 27 августа 2018 г.
- ^ Эпштейн DJ, Векеманс М, Грос П (ноябрь 1991 г.). «Splotch (Sp2H), мутация, влияющая на развитие нервной трубки мыши, демонстрирует делецию в парном гомеодомене Pax-3». начальный. Клетка . 67 (4): 767–74. дои : 10.1016/0092-8674(91)90071-6 . ПМИД 1682057 . S2CID 25966319 .
- ^ Трембле П., Грусс П. (1994). «Пакс: гены мышей и людей». обзор. Фармакология и терапия . 61 (1–2): 205–26. дои : 10.1016/0163-7258(94)90063-9 . ПМИД 7938171 .
- ^ Болдуин К.Т., Хот К.Ф., Амос Дж.А., да-Сильва Э.О., Милунски А. (февраль 1992 г.). «Экзонная мутация в гене парного домена HuP2 вызывает синдром Ваарденбурга». начальный. Природа . 355 (6361): 637–8. Бибкод : 1992Natur.355..637B . дои : 10.1038/355637a0 . ПМИД 1347149 . S2CID 4319436 .
- ^ Пинго В., Энте Д., Дасто-Ле Моал Ф., Гуссенс М., Марлин С., Бондюран Н. (апрель 2010 г.). «Обзор и обновление мутаций, вызывающих синдром Ваарденбурга» . обзор. Человеческая мутация . 31 (4): 391–406. дои : 10.1002/humu.21211 . ПМИД 20127975 . S2CID 12278025 .
- ^ Барр Ф.Г. (сентябрь 2001 г.). «Слияние генов с участием членов семейств PAX и FOX при альвеолярной рабдомиосаркоме» . обзор. Онкоген . 20 (40): 5736–46. дои : 10.1038/sj.onc.1204599 . ПМИД 11607823 .
- ^ Арндт Калифорния, Крист В.М. (июль 1999 г.). «Распространенные опухоли опорно-двигательного аппарата детского и подросткового возраста». Медицинский журнал Новой Англии . 341 (5): 342–352. дои : 10.1056/NEJM199907293410507 . ПМИД 10423470 .
- ^ Галили Н., Дэвис Р.Дж., Фредерикс В.Дж., Мухопадьяй С., Раушер Ф.Дж., Эмануэль Б.С. и др. (ноябрь 1993 г.). «Слияние гена домена вилочной головки с PAX3 в альвеолярной рабдомиосаркоме солидной опухоли». начальный. Природная генетика . 5 (3): 230–5. дои : 10.1038/ng1193-230 . ПМИД 8275086 . S2CID 12374322 .
- ^ Шерн Дж. Ф., Чен Л., Хмелецкий Дж., Вэй Дж. С., Патидар Р., Розенберг М. и др. (февраль 2014 г.). «Комплексный геномный анализ рабдомиосаркомы выявляет целый ряд изменений, затрагивающих общую генетическую ось в слиятельно-позитивных и слиятельно-негативных опухолях» . начальный. Открытие рака . 4 (2): 216–31. дои : 10.1158/2159-8290.CD-13-0639 . ПМЦ 4462130 . ПМИД 24436047 .
- ^ Барр Ф.Г., Чаттен Дж., Д'Круз С.М., Уилсон А.Е., Наута Л.Е., Никум Л.М. и др. (февраль 1995 г.). «Молекулярные анализы хромосомных транслокаций в диагностике сарком мягких тканей у детей». ДЖАМА . 273 (7): 553–557. дои : 10.1001/jama.1995.03520310051029 . ПМИД 7530783 .
- ^ Давичиони Э., Финкенштейн Ф.Г., Шахбазиан В., Бакли Дж.Д., Триш Т.Дж., Андерсон М.Дж. (июль 2006 г.). «Идентификация сигнатуры экспрессии гена PAX-FKHR, которая определяет молекулярные классы и определяет прогноз альвеолярных рабдомиосарком» . начальный. Исследования рака . 66 (14): 6936–46. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-4578 . ПМИД 16849537 .
- ^ Цао Л., Ю Ю., Билке С., Уокер Р.Л., Майенуддин Л.Х., Азорса Д.О. и др. (август 2010 г.). «Полногеномная идентификация сайтов связывания PAX3-FKHR при рабдомиосаркоме выявляет гены-кандидаты-мишени, важные для развития и рака» . начальный. Исследования рака . 70 (16): 6497–508. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-0582 . ПМЦ 2922412 . ПМИД 20663909 .
- ^ Грайдер Б.Е., Йохе М.Э., Чжоу Х.К., Чжан Х., Маркес Дж., Вахтель М. и др. (август 2017 г.). «PAX3-FOXO1 создает миогенные суперэнхансеры и придает уязвимость бромодомену BET» . начальный. Открытие рака . 7 (8): 884–899. дои : 10.1158/2159-8290.CD-16-1297 . ПМЦ 7802885 . ПМИД 28446439 .
- ^ Ван X, Бледсо К.Л., Грэм Р.П., Асманн Ю.В., Вишванатха Д.С., Льюис Дж.Е. и др. (июль 2014 г.). «Рецидивирующее слияние PAX3-MAML3 при бифенотипической синоназальной саркоме» . начальный. Природная генетика . 46 (7): 666–8. дои : 10.1038/ng.2989 . ПМК 4236026 . ПМИД 24859338 .
- ^ Фритчи К.Дж., Джин Л., Ван Х., Грэм Р.П., Торбенсон М.С., Льюис Дж.Е. и др. (декабрь 2016 г.). «Профиль слитых генов бифенотипической синоназальной саркомы: анализ 44 случаев». начальный. Гистопатология . 69 (6): 930–936. дои : 10.1111/его.13045 . ПМИД 27454570 . S2CID 9521589 .
- ^ Хуан С.К., Госсейн Р.А., Бишоп Дж.А., Чжан Л., Чен Т.К., Хуан Х.И. и др. (январь 2016 г.). «Новые слияния PAX3-NCOA1 при бифенотипической синоназальной саркоме с фокальной рабдомиобластной дифференцировкой» . Американский журнал хирургической патологии . 40 (1): 51–9. doi : 10.1097/PAS.0000000000000492 . ПМК 4679641 . ПМИД 26371783 .
- ^ Перейти обратно: а б Ся Л., Хуан Ц., Не Д., Ши Дж., Гун М., Ву Б. и др. (июль 2013 г.). «PAX3 сверхэкспрессируется в глиобластомах человека и критически регулирует туморогенность клеток глиомы». начальный. Исследования мозга . 1521 : 68–78. дои : 10.1016/j.brainres.2013.05.021 . ПМИД 23701726 . S2CID 11206561 .
- ^ Перейти обратно: а б Шолль Ф.А., Камарашев Дж., Мурманн О.В., Герцен Р., Даммер Р., Шефер Б.В. (февраль 2001 г.). «PAX3 экспрессируется в меланомах человека и способствует выживанию опухолевых клеток». начальный. Исследования рака . 61 (3): 823–6. ПМИД 11221862 .
- ^ Барр Ф.Г., Фицджеральд Дж.К., Гинзберг Дж.П., Ванелла М.Л., Дэвис Р.Дж., Бенничелли Дж.Л. (ноябрь 1999 г.). «Преимущественная экспрессия альтернативных форм PAX3 и PAX7 в клеточных линиях миогенных и нервных опухолей». начальный. Исследования рака . 59 (21): 5443–8. ПМИД 10554014 .
- ^ Пламмер Р.С., Ши С.Р., Нельсон М., Пауэлл С.К., Фриман Д.М., Дэн С.П. и др. (май 2008 г.). «Экспрессия PAX3 при первичных меланомах и невусах» . Современная патология . 21 (5): 525–30. дои : 10.1038/modpathol.3801019 . ПМЦ 2987639 . ПМИД 18327212 .
- ^ Джонс А.М., Миттер Р., Поулсом Р., Джиллетт С., Хэнби А.М., Томлинсон И.П. и др. (декабрь 2008 г.). «Профилирование экспрессии мРНК листовидных опухолей молочной железы: идентификация генов, важных в развитии пограничных и злокачественных листовидных опухолей». начальный. Журнал патологии . 216 (4): 408–17. дои : 10.1002/путь.2439 . ПМИД 18937276 . S2CID 5294598 .
- ^ Лю Ц, Ян Г, Цянь Ю (апрель 2017 г.). «Потеря микроРНК-489-3p способствует метастазированию остеосаркомы за счет активации пути PAX3-MET». начальный. Молекулярный канцерогенез . 56 (4): 1312–1321. дои : 10.1002/mc.22593 . ПМИД 27859625 . S2CID 4439256 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Вахтель М., Шефер Б.В. (2017). «PAX3-FOXO1: Увеличение масштаба «неуязвимой» цели» . обзор. Семинары по биологии рака . 50 : 115–123. дои : 10.1016/j.semcancer.2017.11.006 . ПМИД 29146205 .
- Кубо Т., Симосе С., Фухимори Дж., Фурута Т., Очи М. (2015). «Прогностическая ценность статуса слияния PAX3/7-FOXO1 при альвеолярной рабдомиосаркоме: систематический обзор и метаанализ». обзор. Критические обзоры по онкологии/гематологии . 96 (1): 46–53. дои : 10.1016/j.critrevonc.2015.04.012 . ПМИД 26008753 .
- Букингем М., Реле Ф (2015). «PAX3 и PAX7 как вышестоящие регуляторы миогенеза». обзор. Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 115–25. дои : 10.1016/j.semcdb.2015.09.017 . ПМИД 26424495 .
- Экклс М.Р., Хе С., Ан А., Слоббе Л.Дж., Джеффс А.Р., Юн Х.С. и др. (2013). «MITF и PAX3 играют разные роли в миграции клеток меланомы; очерк теории «генетического переключения», включающей MITF и PAX3 в пролиферативные и инвазивные фенотипы меланомы» . обзор. Границы онкологии . 3 : 229. doi : 10.3389/fonc.2013.00229 . ПМЦ 3769631 . ПМИД 24062982 .
- Оланич М.Е., Барр Ф.Г. (2013). «Призыв к ARMS: воздействие на ген PAX3-FOXO1 при альвеолярной рабдомиосаркоме» . обзор. Мнение экспертов о терапевтических целях . 17 (5): 607–23. дои : 10.1517/14728222.2013.772136 . ПМК 6699745 . ПМИД 23432728 .
- Медик С., Зиман М. (2009). «PAX3 по всему спектру: от меланобласта до меланомы». обзор. Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 44 (2–3): 85–97. дои : 10.1080/10409230902755056 . ПМИД 19401874 . S2CID 20634846 .
- Кубич Дж.Д., Янг К.П., Пламмер Р.С., Людвик А.Е., Ланг Д. (2008). «Пигментация PAX-пути: роль Pax3 в меланогенезе, поддержании стволовых клеток меланоцитов и заболеваниях» . обзор. Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 627–45. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00514.x . ПМЦ 2979299 . ПМИД 18983540 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- PAX3 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P23760 (белок спаренного бокса Pax-3) в PDBe-KB .