Апетала 2
| Домен AP2 | |||
|---|---|---|---|
 Структура связывающего домена GCC-бокса в комплексе с ДНК. [1] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | АП2 | ||
| Пфам | PF00847 | ||
| Пфам Клан | CL0081 | ||
| ИнтерПро | ИПР001471 | ||
| УМНЫЙ | SM00380 | ||
| PROSITE | PS51032 | ||
| СКОП2 | 3gcc / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
| Апетала 2 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | АП2 | ||
| ген NCBI | 829845 | ||
| ЮниПрот | P47927 | ||
| |||
Apetala 2 (AP2) — это ген, член большого семейства транскрипционных факторов, семейства AP2/ ERBP . У Arabidopsis thaliana AP2 играет роль в модели развития цветка ABC . [2] Первоначально считалось, что это семейство белков специфично для растений; однако недавние исследования показали, что апикомплексаны , включая возбудителя малярии Plasmodium falciparum, кодируют родственный набор транскрипционных факторов, называемый семейством ApiAP2. [3]
В A. thaliana транскрипционном факторе RAV 1 N-концевой домен AP2 связывает последовательность 5'- CAACA -3' , тогда как C-концевой высококонсервативный домен B3 связывает последовательность 5'- CACCTG -3' . [4]
Структура и биологическое содержание AP2
[ редактировать ]Недавние исследования показали, что Apetala 2 играет важную роль в регуляции гормонов, особенно в цветах и растениях, таких как AGAMOUS. [5] Исследование, которое определило это, проведенное Огавой, было создано для выяснения связи между Apetala 2 и AtEBP в экспрессии генов. Результаты показали, что сверхэкспрессия AtEBP вызывает усиление экспрессии AP2 в листьях, что позволяет предположить, что N-концевая область не требуется для образования AP2-подобных фенотипов. [6] AP2 также образует другое соединение, называемое ANT, которое состоит из двух доменов AP2, гомологичных ДНК-связывающему домену белков, связывающих элемент ответа на этилен. [7] В другом исследовании Мэйса Т. под названием «Ар2-подобные гены петунии и их роль в развитии цветов и семян » были обнаружены три AP2-подобных белка из петунии и путем изучения моделей их экспрессии при гибридизации in situ: PhAP2A, PhAP2B и PhAP2C. Было обнаружено, что PhAP2A имеет чрезвычайно схожие функции с AP2 у A. thaliana и имеет почти точную последовательность генов. PhAP2B и PhAP2C кодируют AP2-подобные белки, которые принадлежат к другой подгруппе транскрипционных факторов семейства AP2 и демонстрируют совершенно разные паттерны экспрессии во время развития цветка по сравнению с PhAP2A. [8]
Ассоциации AP2 с химическими соединениями
[ редактировать ]Мутации Apetala 2 вызывают изменения в соотношении гексозы и сахарозы во время развития семян, открывая возможность того, что AP2 может контролировать массу семян посредством влияния на метаболизм сахара. [9] Как белок, он регулирует количество сахаров в системе и участвует в транспортировке, формировании и передаче сигналов. Другое исследование показало, что анализировали функциональность DBF1 в ответах на абиотический стресс и обнаружили, что растения Arabidopsis, сверхэкспрессирующие DBF1, были более устойчивы к осмотическому стрессу, чем контрольные растения. [10] DBF1 является связывающим фактором, который помогает Apetala 2 осуществлять транскрипционные факторы.
Болезни
[ редактировать ]ДНК постоянно подвергается мутациям, которые могут вызвать полное изменение функции белка из-за деформированного белка, вызывая в некоторых случаях заболевания. Например, в исследовании AP2 транскрипционный фактор типа ERF/AP2 был выделен с помощью ПЦР с обратной транскрипцией с дифференциальным отображением, которая вызывала гиперчувствительную реакцию в листьях. [11] Семейство генов CBF Arabidopsis состоит из трех генов, кодирующих белки, содержащие домен AP2, все из которых регулируются низкой температурой, чтобы обеспечить экспрессию генов, но не абсцизовой кислотой или обезвоживанием. [12]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Аллен, доктор медицинских наук, Ямасаки К., Оме-Такаги М., Татено М., Сузуки М. (сентябрь 1998 г.). «Новый способ распознавания ДНК с помощью бета-листа, выявленный с помощью структуры раствора связывающего домена GCC-бокса в комплексе с ДНК» . ЭМБО Дж . 17 (18): 5484–96. дои : 10.1093/emboj/17.18.5484 . ПМЦ 1170874 . ПМИД 9736626 .
- ^ Рихманн Дж.Л., Мейеровиц Э.М. (1998). «Семейство растительных транскрипционных факторов AP2/EREBP» . Биол. Хим . 379 (6): 633–46. дои : 10.1515/bchm.1998.379.6.633 . ПМИД 9687012 .
- ^ Баладжи С., Бабу М.М., Айер Л.М., Аравинд Л. (2005). «Открытие основных специфических факторов транскрипции Apicomplexa и их значение для эволюции ДНК-связывающих доменов AP2-интегразы» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (13): 3994–4006. дои : 10.1093/nar/gki709 . ПМК 1178005 . ПМИД 16040597 .
- ^ Кагая Ю, Омия К, Хаттори Т (1999). «RAV1, новый ДНК-связывающий белок, связывается с двудольной последовательностью распознавания посредством двух отдельных ДНК-связывающих доменов, уникально обнаруженных у высших растений» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (2): 470–8. дои : 10.1093/нар/27.2.470 . ПМК 148202 . ПМИД 9862967 .
- ^ Взаимное регулирование белка, связывающего этилен-чувствительный элемент Arabidopsis thaliana, и гомеотического гена растений и цветов, APETALA2. Огава Т., Учимия Х., Каваи-Ямада М. Энн. Бот. (2007)
- ^ Функциональные домены цветочного регулятора AGAMOUS: характеристика ДНК-связывающего домена и анализ доминантно-негативных мутаций. Мизуками Ю., Хуанг Х., Тюдор М., Ху Ю., Ма, Х. Растительная клетка (1996)
- ^ Ген AINTEGUMENTA арабидопсиса, необходимый для развития семяпочки и женского гаметофита, связан с цветочным гомеозисным геном APETALA2. Ключер К.М., Чоу Х., Райзер Л., Фишер Р.Л. Растительная клетка (1996)
- ^ Ар2-подобные гены петунии и их роль в развитии цветов и семян. Маес Т., Ван де Стин Н., Зетхоф Дж., Карими М., Д'Хау М., Марес Г., Ван Монтегю М., Гератс Т. Растительная клетка (2001)
- ^ Контроль массы семян с помощью APETALA2. Ото, М.А., Фишер, Р.Л., Голдберг, Р.Б., Накамура, К., Харада, Дж.Дж. Proc. Натл. акад. наук. США (2005)
- ^ Белок-интерактор DBF1 кукурузы 1, содержащий домен R3H, является потенциальным регулятором активности DBF1 при реакциях на стресс. Салех А., Лумбрерас В., Лопес К., Кизис Э.Д., Пажес М. Плант Дж. (2006)
- ^ Фактор транскрипции перца CaPF1 придает арабидопсису устойчивость к патогенам и заморозкам. Йи, С.И., Ким, Дж.Х., Йонг, Ю.Х., Ли, С., Ким, В.Т., Ю, Ш., Чой, Д. Физиол растений. (2004)
- ^ Семейство генов CBF Arabidopsis состоит из трех генов, кодирующих белки, содержащие домен AP2, экспрессия которых регулируется низкой температурой, но не абсцизовой кислотой или обезвоживанием. Медина Дж., Барг М., Терол Дж., Перес-Алонсо М., Салинас Дж. Физиол растений. (1999)
Внешние ссылки
[ редактировать ]- APETALA2 + белок, + Arabidopsis в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- Семейство AP2 , семейство ERF , семейство RAV в PlantTFDB: база данных факторов транскрипции растений.