HOXC6

HOXC6
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXC6 , CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, гомеобокс C6
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 142972 ; МГИ : 96197 ; Гомологен : 19533 ; Генные карты : HOXC6 ; OMA : HOXC6 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	54,030,823 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	102,920,313 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	renal medulla; ; caput epididymis; ; germinal epithelium; ; nipple; ; saphenous vein; ; corpus epididymis; ; skin of hip; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; spinal ganglia; ; lactiferous duct;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; thoracic vertebral column; ; efferent ductule; ; muscle of thigh; ; genital tubercle; ; female urethra; ; adrenal gland; ; male urethra; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; yolk sac;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; transcription corepressor activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; anterior/posterior pattern specification; embryonic skeletal system development; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; multicellular organism development; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3223
	15425
	ENSG00000197757
	ENSMUSG00000001661
	P09630
	P10629
	НМ_153693 ; НМ_004503
	НМ_010465
	НП_004494 ; НП_710160
	НП_034595
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-C6 — это белок , который у человека кодируется HOXC6 геном . ^[5]^[6]^[7] Экспрессия Hox-C6 наиболее высока в фаллопиевой трубе и яичнике. ^[8] HoxC6 высоко экспрессируется при многих типах рака, включая рак простаты, молочной железы и плоскоклеточный рак пищевода. ^[9]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству гомеобоксов, члены которого кодируют высококонсервативное семейство транскрипционных факторов, играющих важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя сходными кластерами гомеобоксных генов: HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9–11 генов, расположенных тандемно. Этот ген, HOXC6, является одним из нескольких генов HOXC, расположенных в кластере на хромосоме 12. Три гена, HOXC5, HOXC4 и HOXC6, имеют общий 5'-некодирующий экзон. Транскрипты могут включать общий экзон, сращенный с ген-специфичными экзонами, или они могут включать только ген-специфичные экзоны. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы, были идентифицированы для HOXC6. Второй вариант транскрипта включает общий экзон, а первый вариант транскрипта включает только ген-специфичные экзоны. ^[7] HOXC6 играет роль в лимфоме. Изоформа HOXC6, HOXC6-2, является активным канцерогеном рака желудка. Он стимулирует пролиферацию клеток рака желудка, действуя как онкоген. Снижение уровня регуляции изоформ этого гена потенциально может привести к уменьшению пролиферации некоторых раковых клеток. При использовании изоформы HOXC6-1 не было статистически значимого воздействия на миграцию, инвазию, апоптоз или пролиферацию, когда ее регуляция была снижена. ^[10] Согласно исследованию Cancer Cell International, подавление гена HOXC6 играет роль в блокировании каскада TGF-β/SMAD. Это приводит к ослаблению эпителиально-мезенхимального перехода при карциноме шейки матки. ^[11]

Модель с нокаутом

Модель нокаута с использованием малой интерферирующей РНК показала, что нокаут HOXC6 связан с апоптозом. Кроме того, присутствие HOXC6 было связано с ингибированием апоптоза, индуцированного паклитакселом. Таким образом, было продемонстрировано, что HOXC6 индуцирует пролиферативную активность. ^[12]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197757 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001661 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–553. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С6 HOXC6» .
^ «Тканевая экспрессия HOXC6 - Резюме - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 11 апреля 2022 г.
^ Тан Л., Цао Ю, Сун Х, Ван Х, Ли Ю, Ю М и др. (14 марта 2019 г.). « HOXC6 способствует миграции, инвазии и пролиферации клеток плоскоклеточного рака пищевода посредством модуляции экспрессии генов, участвующих в злокачественных фенотипах» . ПерДж . 7 : е6607. дои : 10.7717/peerj.6607 . ПМК 6421064 . ПМИД 30886783 .
^ Линь Дж., Хэ Дж., Хэ Х., Ван Л., Сюэ М., Чжо В. и др. (октябрь 2020 г.). «Функции HoxC6 как онкогена и изоформы HoxC6-2 могут играть основную роль в канцерогенезе желудка». Пищеварительные заболевания и науки . 65 (10): 2896–2906. дои : 10.1007/s10620-019-06013-7 . ПМИД 31900716 . S2CID 209541406 .
^ Чжан Ф, Жэнь CC, Лю Л, Чен Юнь, Ян Л, Чжан Ся (декабрь 2018 г.). «Замалчивание гена HOXC6 ингибирует эпителиально-мезенхимальный переход и жизнеспособность клеток посредством сигнального пути TGF-β/smad в клетках карциномы шейки матки» . Международная организация раковых клеток . 18 (1): 204. дои : 10.1186/s12935-018-0680-2 . ПМК 6290547 . ПМИД 30559605 .
^ Мун С.М., Ким С.А., Юн Дж.Х., Ан С.Г. (октябрь 2012 г.). «HOXC6 дерегулируется при плоскоклеточном раке головы и шеи человека и модулирует экспрессию Bcl-2» . Журнал биологической химии . 287 (42): 35678–35688. дои : 10.1074/jbc.M112.361675 . ПМЦ 3471680 . ПМИД 22896703 .

Дальнейшее чтение

Акампора Д., Д'Эспозито М., Файелла А., Паннесе М., Мильяччо Э., Морелли Ф. и др. (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 17 (24): 10385–10402. дои : 10.1093/нар/17.24.10385 . ПМК 335308 . ПМИД 2574852 .
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г. и др. (1990). «Организация генов гомеобокса I класса человека». Геном . 31 (2): 745–756. дои : 10.1139/g89-133 . ПМИД 2576652 .
Рабин М., Фергюсон-Смит А., Харт С.П., Раддл Ф.Х. (декабрь 1986 г.). «Родственные локусы гомеобокса, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (23): 9104–9108. Бибкод : 1986PNAS...83.9104R . дои : 10.1073/pnas.83.23.9104 . ПМЦ 387083 . ПМИД 2878432 .
Симеоне А., Мавилио Ф., Акампора Д., Джампаоло А., Файелла А., Заппавинья В. и др. (июль 1987 г.). «Два гена гомеобокса человека, c1 и c8: анализ структуры и экспрессия в эмбриональном развитии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (14): 4914–4918. Бибкод : 1987PNAS...84.4914S . дои : 10.1073/pnas.84.14.4914 . ПМК 305217 . ПМИД 2885844 .
Симеоне А., Паннесе М., Акампора Д., Д'Эспозито М., Бончинелли Е. (июнь 1988 г.). «По крайней мере три человеческих гомеобокса на 12-й хромосоме принадлежат к одной и той же единице транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (12): 5379–5390. дои : 10.1093/нар/16.12.5379 . ПМК 336773 . ПМИД 2898768 .
Corsetti MT, Levi G, Lancia F, Sanseverino L, Ferrini S, Boncinelli E, Corte G (январь 1995 г.). «Ядрышковая локализация трех гомеопротеинов Hox» . Журнал клеточной науки . 108 (Часть 1) (1): 187–193. дои : 10.1242/jcs.108.1.187 . ПМИД 7738096 .
Апиу Ф, Флагиелло Д, Чилло С, Малфой Б, Пупон МФ, Дютрилья Б (1996). «Точное картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 73 (1–2): 114–115. дои : 10.1159/000134320 . ПМИД 8646877 .
Колесница А, Кастроново В, Ле П, Жилле С, Собель МЭ, Гилен Дж (октябрь 1996 г.). «Клонирование и экспрессия нового транскрипта HOXC6, кодирующего репрессирующий белок» . Биохимический журнал . 319 (Часть 1) (1): 91–97. дои : 10.1042/bj3190091 . ПМЦ 1217739 . ПМИД 8870653 .
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёшихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К. и др. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология . 65 (2): 50–62. дои : 10.1002/тера.10009 . ПМИД 11857506 .
Рамачандран С., Лю П., Янг А.Н., Инь-Гоэн К., Лим С.Д., Лэйкок Н. и др. (январь 2005 г.). «Потеря экспрессии HOXC6 вызывает апоптоз в клетках рака простаты» . Онкоген . 24 (1): 188–198. дои : 10.1038/sj.onc.1207906 . ПМИД 15637592 .
Хори Ю, Гу Х, Се Х, Ким С.К. (апрель 2005 г.). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток из нервных клеток-предшественников человека» . ПЛОС Медицина . 2 (4): е103. doi : 10.1371/journal.pmed.0020103 . ПМК 1087208 . ПМИД 15839736 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Й., Ота Т., Нишикава Т., Ямашита Р. и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Чжан X, Хамада Дж, Нисимото А, Такахаши Ю, Мурай Т, Тада М, Мориучи Т (2007). «HOXC6 и HOXC11 увеличивают транскрипцию гена S100beta при BrdU-индуцированной дифференцировке in vitro клеток нейробластомы GOTO в шванновские клетки» . Журнал клеточной и молекулярной медицины . 11 (2): 299–306. дои : 10.1111/j.1582-4934.2007.00020.x . ПМЦ 3822828 . ПМИД 17488478 .

Внешние ссылки

HOXC6 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197757 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001661 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–553. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Энтрез Ген: гомеобокс С6 HOXC6» .

[8] «Тканевая экспрессия HOXC6 - Резюме - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 11 апреля 2022 г.

[9] Тан Л., Цао Ю, Сун Х, Ван Х, Ли Ю, Ю М и др. (14 марта 2019 г.). « HOXC6 способствует миграции, инвазии и пролиферации клеток плоскоклеточного рака пищевода посредством модуляции экспрессии генов, участвующих в злокачественных фенотипах» . ПерДж . 7 : е6607. дои : 10.7717/peerj.6607 . ПМК 6421064 . ПМИД 30886783 .

[10] Линь Дж., Хэ Дж., Хэ Х., Ван Л., Сюэ М., Чжо В. и др. (октябрь 2020 г.). «Функции HoxC6 как онкогена и изоформы HoxC6-2 могут играть основную роль в канцерогенезе желудка». Пищеварительные заболевания и науки . 65 (10): 2896–2906. дои : 10.1007/s10620-019-06013-7 . ПМИД 31900716 . S2CID 209541406 .

[11] Чжан Ф, Жэнь CC, Лю Л, Чен Юнь, Ян Л, Чжан Ся (декабрь 2018 г.). «Замалчивание гена HOXC6 ингибирует эпителиально-мезенхимальный переход и жизнеспособность клеток посредством сигнального пути TGF-β/smad в клетках карциномы шейки матки» . Международная организация раковых клеток . 18 (1): 204. дои : 10.1186/s12935-018-0680-2 . ПМК 6290547 . ПМИД 30559605 .

[12] Мун С.М., Ким С.А., Юн Дж.Х., Ан С.Г. (октябрь 2012 г.). «HOXC6 дерегулируется при плоскоклеточном раке головы и шеи человека и модулирует экспрессию Bcl-2» . Журнал биологической химии . 287 (42): 35678–35688. дои : 10.1074/jbc.M112.361675 . ПМЦ 3471680 . ПМИД 22896703 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]