SIM1

SIM1
Идентификаторы
Псевдонимы	SIM1 , bHLHe14, однонаправленное семейство транскрипционного фактора 1 bHLH, SIM bHLH транскрипционного фактора 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603128 ; МГИ : 98306 ; Гомологен : 3715 ; Генные карты : SIM1 ; ОМА : SIM1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	100,464,921 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	50,865,248 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	renal medulla; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; human penis; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; corpus epididymis; ; caput epididymis; ; testicle; ; vastus lateralis muscle; ; islet of Langerhans; ; kidney tubule;
	Top expressed in
	supraoptic nucleus; ; inner renal medulla; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; mammillary body; ; right kidney; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; soleus muscle; ; outer renal medulla; ; Bowman's capsule;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein dimerization activity; protein heterodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; multicellular organism development; cell differentiation; ureteric bud development; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; nervous system development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6492
	20464
	ENSG00000112246
	ENSMUSG00000019913
	P81133
	Q61045
	НМ_005068 ; НМ_001374769
	НМ_011376
	НП_005059 ; НП_001361698
	НП_035506
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Однонаправленный гомолог 1 , также известный как основной белок спираль-петля-спираль класса E 14 (bHLHe14), представляет собой белок , который у людей кодируется SIM1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Гены SIM1 и SIM2 являются гомологами Drosophila melanogaster single-minded ( sim ), названного так потому, что клетки средней линии мутантного эмбриона не способны правильно развиваться и в конечном итоге погибают, и, таким образом, парные пучки продольных аксонов, охватывающие передне-заднюю оси эмбриона (аналогично спинному мозгу эмбриона) свернуты в «единственный» рудиментарный пучок аксонов по средней линии. SIM представляет собой «спираль-петля-спираль» – домен PAS базовый фактор транскрипции , который регулирует экспрессию генов в клетках средней линии. Поскольку ген sim играет важную роль в развитии дрозофилы и имеет пиковые уровни экспрессии в период нейрогенеза , было высказано предположение, что человеческий ген SIM2 , который находится в критической области хромосомы 21, является кандидатом на участие в некоторых дисморфических нарушениях. особенности (особенно черты лица и черепа), аномалии развития мозга или умственная отсталость при синдроме Дауна . ^[7]

Клиническое значение

Было показано, что гаплонедостаточность SIM1 сбалансированной вызывает тяжелое ожирение с ранним началом у девочки со транслокацией de novo между хромосомами 1p22.1 и 6q16.2. ^[8] и было высказано предположение, что в других случаях он вызывает фенотип Прадера-Вилли. ^[9] Кроме того, исследования на мышах показали, что гаплонедостаточность Sim1 вызывает ожирение, вызванное гиперфагией , и не реагирует должным образом на увеличение количества жиров в рационе. ^[6]^[10] Сверхэкспрессия SIM1 защищает от ожирения, вызванного диетой, и спасает гиперфагию у желтых мышей агути. ^[11] которые нарушили передачу сигналов меланокортина . Ожирение и гиперфагия могут быть опосредованы нарушением активации меланокортина ПВЯ . нейронов ^[12] и дефицит окситоцина у этих мышей. ^[13] Было продемонстрировано, что модуляция уровней SIM1 в постнатальном периоде также приводит к гиперфагии и ожирению. ^[14]^[15] предполагая, что физиологическая роль SIM1 отделена от его роли в развитии.

Взаимодействия

Было показано, что SIM1 взаимодействует с ядерным транслокатором арилуглеводородного рецептора . ^[16]^[17]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112246 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019913 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Краст Р., Скотт Х.С., Чен Х., Кудо Дж., Россье С., Миношима С., Ван Ю., Симидзу Н., Антонаракис С.Е. (июнь 1997 г.). «Клонирование двух человеческих гомологов однонаправленного гена SIM1 дрозофилы на хромосоме 6q и SIM2 на 21q в хромосомной области синдрома Дауна» . Геномные исследования . 7 (6): 615–24. дои : 10.1101/гр.7.6.615 . ПМК 310662 . ПМИД 9199934 .
^ Jump up to: ^а ^б Мишо Дж.Л., Буше Ф., Мельник А., Готье Ф., Гошу Э., Леви Э., Митчелл Г.А., Химмс-Хаген Дж., Фан СМ (июль 2001 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 вызывает гиперфагию, ожирение и уменьшение паравентрикулярного ядра гипоталамуса» . Молекулярная генетика человека . 10 (14): 1465–73. дои : 10.1093/hmg/10.14.1465 . ПМИД 11448938 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: однонаправленный гомолог 1 SIM1 (Дрозофила)» .
^ Холдер Дж.Л., Бьютт Н.Ф., Зинн А.Р. (январь 2000 г.). «Глубокое ожирение, связанное со сбалансированной транслокацией, разрушающей ген SIM1» . Молекулярная генетика человека . 9 (1): 101–8. дои : 10.1093/hmg/9.1.101 . ПМИД 10587584 .
^ Фавр Л., Кормье-Дэр В., Лапьер Ж.М., Колло Л., Жакмон С., Женевьева Д., Сонье П., Мюнхен А., Тюрло С., Романа С., Приер М., Де Блуа М.К., Векеманс М. (август 2002 г.). «Делекция гена SIM1 (6q16.2) у пациента с фенотипом Прадера-Вилли» . Журнал медицинской генетики . 39 (8): 594–6. дои : 10.1136/jmg.39.8.594 . ПМЦ 1735217 . ПМИД 12161602 .
^ Холдер Дж.Л., Чжан Л., Кублауи Б.М., ДиЛеоне Р.Дж., Оз ОК, Баир СН, Ли Й.Х., Зинн А.Р. (июль 2004 г.). «Доза гена Sim1 модулирует гомеостатическую реакцию кормления на повышенное содержание жиров в рационе у мышей». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 287 (1): Е105-13. дои : 10.1152/ajpendo.00446.2003 . ПМИД 14982752 .
^ Кублауи Б.М., Холдер Дж.Л., Толсон К.П., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия SIM1 частично спасает желтую агути и вызванное диетой ожирение за счет нормализации потребления пищи» . Эндокринология . 147 (10): 4542–9. дои : 10.1210/en.2006-0453 . ПМИД 16709610 .
^ Кублауи Б.М., Холдер Дж.Л., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 нарушает меланокортин-опосредованную анорексию и активацию нейронов паравентрикулярного ядра» . Молекулярная эндокринология . 20 (10): 2483–92. дои : 10.1210/me.2005-0483 . ПМИД 16728530 .
^ Кублауи Б.М., Джемелли Т., Толсон К.П., Ван Ю., Зинн А.Р. (июль 2008 г.). «Дефицит окситоцина опосредует гиперфагическое ожирение у мышей с гаплонедостаточностью Sim1» . Молекулярная эндокринология . 22 (7): 1723–34. дои : 10.1210/me.2008-0067 . ПМЦ 2453606 . ПМИД 18451093 .
^ Толсон К.П., Джемелли Т., Гаутрон Л., Элмквист Дж.К., Зинн А.Р., Кублауи Б.М. (март 2010 г.). «Постнатальный дефицит Sim1 вызывает гиперфагическое ожирение и снижение экспрессии Mc4r и окситоцина» . Журнал неврологии . 30 (10): 3803–12. doi : 10.1523/JNEUROSCI.5444-09.2010 . ПМЦ 3285557 . ПМИД 20220015 .
^ Ян С., Ганьон Д., Вашон П., Трембле А., Леви Э., Мэсси Б., Мишо Дж.Л. (июнь 2006 г.). «Аденовирусная модуляция экспрессии Sim1 в паравентрикулярном ядре влияет на потребление пищи» . Журнал неврологии . 26 (26): 7116–20. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0672-06.2006 . ПМК 6673926 . ПМИД 16807340 .
^ Пробст М.Р., Фан К.М., Тессье-Лавин М., Хэнкинсон О. (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однонаправленного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком-транслокатором ядерного рецептора арильного углеводорода мыши» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4451–7. дои : 10.1074/jbc.272.7.4451 . ПМИД 9020169 .
^ Вудс С.Л., Уайтлоу М.Л. (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 в отношении элемента гипоксического ответа. Перекрестные помехи между основными факторами транскрипции гомологии спираль-петля-спираль/per-Arnt-Sim» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10236–43. дои : 10.1074/jbc.M110752200 . ПМИД 11782478 .

Дальнейшее чтение

Фан СМ, Кувана Э, Бульфоне А, Флетчер К.Ф., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А., Крюс С., Мартинес С., Пуэльес Л., Рубенштейн Дж.Л., Тессье-Лавинь М. (январь 1996 г.). «Схемы экспрессии двух мышиных гомологов дрозофилы целеустремленной предполагают возможную роль в формировании эмбрионального паттерна и в патогенезе синдрома Дауна». Молекулярная и клеточная нейронауки . 7 (1): 1–16. дои : 10.1006/mcne.1996.0001 . ПМИД 8812055 . S2CID 11411254 .
Пробст М.Р., Фан К.М., Тессье-Лавин М., Хэнкинсон О. (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однонаправленного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком-транслокатором ядерного рецептора арильного углеводорода мыши» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4451–7. дои : 10.1074/jbc.272.7.4451 . ПМИД 9020169 .
Холдер Дж.Л., Бьютт Н.Ф., Зинн А.Р. (январь 2000 г.). «Глубокое ожирение, связанное со сбалансированной транслокацией, разрушающей ген SIM1» . Молекулярная генетика человека . 9 (1): 101–8. дои : 10.1093/hmg/9.1.101 . ПМИД 10587584 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Вудс С.Л., Уайтлоу М.Л. (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 в отношении элемента гипоксического ответа. Перекрестные помехи между основными факторами транскрипции гомологии спираль-петля-спираль/per-Arnt-Sim» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10236–43. дои : 10.1074/jbc.M110752200 . ПМИД 11782478 .
Фавр Л., Кормье-Дэр В., Лапьер Ж.М., Колло Л., Жакмон С., Женевьева Д., Сонье П., Мюнхен А., Тюрло С., Романа С., Приер М., Де Блуа М.К., Векеманс М. (август 2002 г.). «Делекция гена SIM1 (6q16.2) у пациента с фенотипом Прадера-Вилли» . Журнал медицинской генетики . 39 (8): 594–6. дои : 10.1136/jmg.39.8.594 . ПМЦ 1735217 . ПМИД 12161602 .
Ямаки А., Кудо Дж., Симидзу Н., Симидзу Ю. (январь 2004 г.). «Новый сигнал ядерной локализации в человеческих белках SIM1 и SIM2» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 313 (3): 482–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.11.168 . ПМИД 14697214 .
Мейр Д., Лекёр С., Дельпланк Дж., Франк С., Ватин В., Дюран Э., Вейль Дж., Дина С., Фрогель П. (март 2004 г.). «Полногеномное сканирование черт, связанных с детским ожирением, во французских семьях показывает значительное сцепление на хромосоме 6q22.31-q23.2» . Диабет . 53 (3): 803–11. дои : 10.2337/диабет.53.3.803 . ПМИД 14988267 .
Кублауи Б.М., Холдер Дж.Л., Толсон К.П., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия SIM1 частично спасает желтую агути и вызванное диетой ожирение за счет нормализации потребления пищи» . Эндокринология . 147 (10): 4542–9. дои : 10.1210/en.2006-0453 . ПМИД 16709610 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000112246 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019913 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9199934-5] Краст Р., Скотт Х.С., Чен Х., Кудо Дж., Россье С., Миношима С., Ван Ю., Симидзу Н., Антонаракис С.Е. (июнь 1997 г.). «Клонирование двух человеческих гомологов однонаправленного гена SIM1 дрозофилы на хромосоме 6q и SIM2 на 21q в хромосомной области синдрома Дауна» . Геномные исследования . 7 (6): 615–24. дои : 10.1101/гр.7.6.615 . ПМК 310662 . ПМИД 9199934 .

[pmid11448938-6] Jump up to: ^а ^б Мишо Дж.Л., Буше Ф., Мельник А., Готье Ф., Гошу Э., Леви Э., Митчелл Г.А., Химмс-Хаген Дж., Фан СМ (июль 2001 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 вызывает гиперфагию, ожирение и уменьшение паравентрикулярного ядра гипоталамуса» . Молекулярная генетика человека . 10 (14): 1465–73. дои : 10.1093/hmg/10.14.1465 . ПМИД 11448938 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: однонаправленный гомолог 1 SIM1 (Дрозофила)» .

[pmid10587584-8] Холдер Дж.Л., Бьютт Н.Ф., Зинн А.Р. (январь 2000 г.). «Глубокое ожирение, связанное со сбалансированной транслокацией, разрушающей ген SIM1» . Молекулярная генетика человека . 9 (1): 101–8. дои : 10.1093/hmg/9.1.101 . ПМИД 10587584 .

[pmid12161602-9] Фавр Л., Кормье-Дэр В., Лапьер Ж.М., Колло Л., Жакмон С., Женевьева Д., Сонье П., Мюнхен А., Тюрло С., Романа С., Приер М., Де Блуа М.К., Векеманс М. (август 2002 г.). «Делекция гена SIM1 (6q16.2) у пациента с фенотипом Прадера-Вилли» . Журнал медицинской генетики . 39 (8): 594–6. дои : 10.1136/jmg.39.8.594 . ПМЦ 1735217 . ПМИД 12161602 .

[pmid14982752-10] Холдер Дж.Л., Чжан Л., Кублауи Б.М., ДиЛеоне Р.Дж., Оз ОК, Баир СН, Ли Й.Х., Зинн А.Р. (июль 2004 г.). «Доза гена Sim1 модулирует гомеостатическую реакцию кормления на повышенное содержание жиров в рационе у мышей». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 287 (1): Е105-13. дои : 10.1152/ajpendo.00446.2003 . ПМИД 14982752 .

[pmid16709610-11] Кублауи Б.М., Холдер Дж.Л., Толсон К.П., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия SIM1 частично спасает желтую агути и вызванное диетой ожирение за счет нормализации потребления пищи» . Эндокринология . 147 (10): 4542–9. дои : 10.1210/en.2006-0453 . ПМИД 16709610 .

[pmid16728530-12] Кублауи Б.М., Холдер Дж.Л., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 нарушает меланокортин-опосредованную анорексию и активацию нейронов паравентрикулярного ядра» . Молекулярная эндокринология . 20 (10): 2483–92. дои : 10.1210/me.2005-0483 . ПМИД 16728530 .

[pmid18451093-13] Кублауи Б.М., Джемелли Т., Толсон К.П., Ван Ю., Зинн А.Р. (июль 2008 г.). «Дефицит окситоцина опосредует гиперфагическое ожирение у мышей с гаплонедостаточностью Sim1» . Молекулярная эндокринология . 22 (7): 1723–34. дои : 10.1210/me.2008-0067 . ПМЦ 2453606 . ПМИД 18451093 .

[pmid20220015-14] Толсон К.П., Джемелли Т., Гаутрон Л., Элмквист Дж.К., Зинн А.Р., Кублауи Б.М. (март 2010 г.). «Постнатальный дефицит Sim1 вызывает гиперфагическое ожирение и снижение экспрессии Mc4r и окситоцина» . Журнал неврологии . 30 (10): 3803–12. doi : 10.1523/JNEUROSCI.5444-09.2010 . ПМЦ 3285557 . ПМИД 20220015 .

[pmid16807340-15] Ян С., Ганьон Д., Вашон П., Трембле А., Леви Э., Мэсси Б., Мишо Дж.Л. (июнь 2006 г.). «Аденовирусная модуляция экспрессии Sim1 в паравентрикулярном ядре влияет на потребление пищи» . Журнал неврологии . 26 (26): 7116–20. doi : 10.1523/JNEUROSCI.0672-06.2006 . ПМК 6673926 . ПМИД 16807340 .

[pmid9020169-16] Пробст М.Р., Фан К.М., Тессье-Лавин М., Хэнкинсон О. (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однонаправленного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком-транслокатором ядерного рецептора арильного углеводорода мыши» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4451–7. дои : 10.1074/jbc.272.7.4451 . ПМИД 9020169 .

[pmid11782478-17] Вудс С.Л., Уайтлоу М.Л. (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 в отношении элемента гипоксического ответа. Перекрестные помехи между основными факторами транскрипции гомологии спираль-петля-спираль/per-Arnt-Sim» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10236–43. дои : 10.1074/jbc.M110752200 . ПМИД 11782478 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]