ЗБТБ32

ЗБТБ32
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3M5B
Идентификаторы
Псевдонимы	ZBTB32 , FAXF, FAZF, Rog, TZFP, ZNF538, цинковый палец и домен BTB, содержащий 32
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605859 ; МГИ : 1891838 ; Гомологен : 8661 ; Генные карты : ZBTB32 ; ОМА : ZBTB32 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	35,717,038 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	30,298,334 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; left testis; ; right testis; ; gonad; ; spleen; ; lymph node; ; right uterine tube; ; sural nerve; ; appendix; ; granulocyte;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; zygote; ; embryo; ; embryo; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; blastocyst; ; morula;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleic acid binding; DNA binding; zinc ion binding; protein binding; transcription corepressor activity; metal ion binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27033
	58206
	ENSG00000011590
	ENSMUSG00000006310
	Q9Y2Y4
	Q9JKD9
	НМ_014383 ; НМ_001316902 ; НМ_001316903
	НМ_021397
	НП_001303831 ; НП_001303832 ; НП_055198
	НП_067372
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 32, содержащий цинковый палец и домен BTB, представляет собой белок который у человека кодируется ZBTB32 геном , длиной 1960 п.н. Белок массой 52 кДа (487 аминокислот) является репрессором транскрипции , и при активации этот ген экспрессируется в Т- и В-клетках , а также в значительной степени в клетках семенников. Он является членом семейства Po xвирусов и белков цинкового пальца (POZ) и Krüppel (POK). ^[5]^[6] и был идентифицирован в ходе нескольких скринингов, включающих либо онкогенез иммунных клеток, либо развитие иммунных клеток.

Белок рекрутирует ферменты модификации гистонов в хроматин, чтобы повлиять на активацию генов. ^[7] ZBTB32 рекрутирует корепрессоры, такие как N-CoR и HDAC, к своим генам-мишеням, индуцирует репрессивные состояния хроматина и действует совместно с другими белками, например, с Blimp-1 . ^[7] подавлять транскрипцию генов. ^[7]

Он содержит N-концевой домен BTB/POZ (IPR000210) или домен SKP1/BTB/POZ (IPR011333) и три C-концевых цинковых пальца , Znf_C2H2_sf. (IPR036236), домен Znf_C2H2_type (IPR013087), домен Znf_RING/FYVE/ PHD (IPR013083), за которым следует предполагаемый домен UBZ4. ^[8]

Номенклатура

Белок 32, содержащий цинковый палец и домен BTB, также известен как:

Белок цинковых пальцев Фанкони при анемии (FAZF),
Белок цинковых пальцев семенников (TZFP),
FANCC-взаимодействующий белок (FAXP),
Белок цинковых пальцев 538 (ZNF538),
Репрессор GATA3 (ROG),
Промиелоцитарный лейкоз «Цинковый палец» и Zbtb16 (PLZF)-подобный белок «цинковый палец» (PLZP)

Взаимодействия

Было показано, что Zbtb32 взаимодействует с:

Группа C при анемии Фанкони (Fancc) ^[9]^[10]
Белок, взаимодействующий с тиоредоксином (Txnip), но взаимодействие может быть неспецифичным; однако белок 1, активируемый витамином D3 (VDUP1), по-видимому, взаимодействует ^[11]
Белок 16, содержащий цинковый палец и домен BTB (Zbtb16) ^[5]
Белок 2 пролинового домена, связанный с локтем цинкового пальца (Zpo2) ^[12]
GATA-связывающий белок (Gata2) ^[13]

Иммунная система

Экспрессия ZBTB32 индуцируется воспалительными цитокинами и способствует пролиферации естественных клеток-киллеров . ^[14]

Zbtb32 У мышей с нокаутом наблюдается тенденция к развитию диабета 1 типа , хотя разница статистически не отличается. Более того, Zbtb32 не демонстрирует различий в пролиферации лимфоцитов , возможно, из-за компенсации со стороны других генов. ^[15]

Рак

ZBTB32 высоко экспрессируется в сперматогониальных стволовых клетках, в гемопоэтических стволовых клетках и клетках-предшественниках, при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (DLBCL) и, по-видимому, подавляет иммунную систему, подавляя ген CIITA . ^[16]

Ген транскрипционного фактора GATA3 изменяется в опухолях молочной железы. Подавление экспрессии и активности GATA3 с помощью белка 2 пролинового домена, связанного с локтем цинкового пальца (Zpo2), тогда как Zbtb32 облегчает нацеливание Zpo2 на промотор GATA3 , что приводит к развитию агрессивного рака молочной железы. ^[12]

Сеть корреляции метилирования ДНК была построена на основе корреляции метилирования между дифференциально метилированными генами. Был проведен анализ выживаемости потенциальных биомаркеров. Идентифицирован один из восьми биомаркеров и хаб-геновпри раке толстой кишки - ZBTB32 . ^[17]

Экспрессия Zbtb32 повышается после воздействия цисплатина . ^[18]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011590 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006310 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Хоатлин М.Э., Чжи Ю., Болл Х., Силви К., Мельник А., Стоун С., Араи С., Хоу Н., Оуэн Г., Зелент А., Лихт Дж.Д. (декабрь 1999 г.). «Новый белок-репрессор транскрипции BTB/POZ взаимодействует с белком группы C анемии Фанкони и PLZF». Кровь . 94 (11): 3737–47. дои : 10.1182/blood.V94.11.3737 . ПМИД 10572087 .
^ «Ген Энтрез: цинковый палец ZBTB32 и домен BTB, содержащий 32» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Юн Х.С., Шарер К.Д., Маджумдер П., Дэвис К.В., Батлер Р., Зинцов-Крамер В., Скунцу И., Кутсонанос Д.Г., Ахмед Р., Босс Дж.М. (2012). «ZBTB32 является ранним репрессором экспрессии генов CIITA и MHC класса II во время дифференцировки B-клеток в плазматические клетки» . Журнал иммунологии . 189 (5): 2393–403. doi : 10.4049/jimmunol.1103371 . ПМЦ 3424359 . ПМИД 22851713 .
^ Риццо А.А., Салерно П.Е., Безсонова И., Коржнев Д.М. (сентябрь 2014 г.). «ЯМР-структура цинкового пальца человека Rad18 в комплексе с убиквитином определяет класс UBZ-доменов в белках, связанных с реакцией на повреждение ДНК». Биохимия . 53 (37): 5895–906. дои : 10.1021/bi500823h . ПМИД 25162118 .
^ Хоатлин М.Э., Чжи Ю., Болл Х., Силви К., Мельник А., Стоун С., Араи С., Хоу Н., Оуэн Г., Зелент А., Лихт Дж.Д. (декабрь 1999 г.). «Новый белок-репрессор транскрипции BTB/POZ взаимодействует с белком группы C анемии Фанкони и PLZF». Кровь . 94 (11): 3737–47. дои : 10.1182/blood.V94.11.3737 . ПМИД 10572087 .
^ Рейтер Т., Медхерст А.Л., Вайсфис К., Чжи Й., Хертерих С., Хен Х., Гросс Х.Дж., Йоэндже Х., Хоатлин М.Э., Мэтью К.Г., Хубер П.А. (октябрь 2003 г.). «Двугибридные дрожжевые скрининги подразумевают участие белков анемии Фанкони в регуляции транскрипции, передаче сигналов в клетках, окислительном метаболизме и клеточном транспорте». Экспериментальные исследования клеток . 289 (2): 211–21. дои : 10.1016/s0014-4827(03)00261-1 . ПМИД 14499622 .
^ Хан Ш., Чон Дж. Х., Джу Х. Р., Чон Ю, Ким К. Ю., Ю Х. С., Ли Ю. Х., Сон К. С., Хван Х. М., На Ю. С., Ян Ю., Ли К. Н., Чхве И (июнь 2003 г.). «VDUP1, активируемый TGF-бета1 и 1,25-дигидроксивитамином D3, ингибирует рост опухолевых клеток, блокируя развитие клеточного цикла» . Онкоген . 22 (26): 4035–46. дои : 10.1038/sj.onc.1206610 . ПМИД 12821938 .
^ Jump up to: ^а ^б Шахи П., Ван С.И., Лоусон Д.А., Слорач Э.М., Лу А., Ю Ю, Лай М.Д., Гонсалес Велосо Х., Верб З. (2017). «ZNF503/Zpo2 способствует агрессивному прогрессированию рака молочной железы за счет снижения экспрессии GATA3» . Proc Natl Acad Sci США . 114 (12): 3169–3174. Бибкод : 2017PNAS..114.3169S . дои : 10.1073/pnas.1701690114 . ПМЦ 5373372 . ПМИД 28258171 .
^ Цузуки С., Энвер Т. (май 2002 г.). «Взаимодействие GATA-2 с белком цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза (PLZF), его гомологом FAZF и альфа-онкобелком рецептора ретиноевой кислоты t(11;17)» . Кровь . 99 (9): 3404–10. дои : 10.1182/blood.V99.9.3404 . ПМИД 11964310 .
^ Болье А.М., Мадера С., Сан Дж.К. (2015). «Молекулярное программирование иммунологической памяти в естественных клетках-киллерах». Перекресток между врожденным и адаптивным иммунитетом V . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 850. стр. 81–91. дои : 10.1007/978-3-319-15774-0_7 . ISBN 978-3-319-15773-3 . ПМИД 26324348 .
^ Коли У.Д., Чжао Ю., Бенк СиДжей, Лю Ю., Хотта-Ивамура С., Рахман М.Дж., Тарбелл К.В. (2018). «Потеря Zbtb32 у мышей NOD существенно не меняет ответы Т-клеток» . F1000Исследования . 7 : 318. doi : 10.12688/f1000research.13864.1 . ПМК 5909056 . ПМИД 29707204 .
^ Чжу С, Чэнь Г, Чжао Ю, Гао XM, Ван Дж (2018). «Регуляция развития и функции B-клеток факторами транскрипции ZBTB» . Границы в иммунологии . 9 : 580. дои : 10.3389/fimmu.2018.00580 . ПМК 5869932 . ПМИД 29616049 .
^ Чжан С, Чжао Х, Ли Дж, Лю Х, Ван Ф, Вэй Ю, Су Дж, Чжан Д, Лю Т, Чжан Ю (2015). «Идентификация специфических закономерностей метилирования при различных видах рака» . ПЛОС ОДИН . 10 (3): e0120361. Бибкод : 2015PLoSO..1020361Z . дои : 10.1371/journal.pone.0120361 . ПМЦ 4361543 . ПМИД 25774687 .
^ Суриссо Т., Хелисси С., Лефевр С., Понсоннайлес Ф., Малка-Майе Х., Олауссен К.А., Андре Ф., Вагнер С., Сориа Х.К. (2016). «Регуляция трансляции мРНК, кодирующей убиквитинпептидазу USP1, участвующую в реакции на повреждение ДНК, как детерминант устойчивости к цисплатину» . Клеточный цикл . 15 (2): 295–302. дои : 10.1080/15384101.2015.1120918 . ПМЦ 4825832 . ПМИД 26825230 .

Дальнейшее чтение

Линь В., Лай CH, Тан CJ, Хуан CJ, Тан Т.К. (ноябрь 1999 г.). «Идентификация и генная структура нового гена транскрипционного фактора, связанного с PLZF человека, TZFP». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (3): 789–95. дои : 10.1006/bbrc.1999.1594 . ПМИД 10544010 .
Дай М.С., Шевалье Н., Стоун С., Генрих М.К., МакКоннелл М., Рейтер Т., Броксмейер Х.Э., Лихт Дж.Д., Лу Л., Хоатлин М.Э. (июль 2002 г.). «Влияние цинкового пальца при анемии Фанкони (FAZF) на клеточный цикл, апоптоз и пролиферацию зависит от стадии дифференцировки» . Журнал биологической химии . 277 (29): 26327–34. дои : 10.1074/jbc.M201834200 . ПМИД 11986317 .
Хан Ш., Чон Дж. Х., Джу Х. Р., Чон Ю, Ким К. Ю., Ю Х. С., Ли Ю. Х., Сон К. С., Хван Х. М., На Ю. С., Ян Ю., Ли К. Н., Чхве И (июнь 2003 г.). «VDUP1, активируемый TGF-бета1 и 1,25-дигидроксивитамином D3, ингибирует рост опухолевых клеток, блокируя развитие клеточного цикла» . Онкоген . 22 (26): 4035–46. дои : 10.1038/sj.onc.1206610 . ПМИД 12821938 .
Рейтер Т., Медхерст А.Л., Вайсфис К., Чжи Й., Хертерих С., Хен Х., Гросс Х.Дж., Йоэндже Х., Хоатлин М.Э., Мэтью К.Г., Хубер П.А. (октябрь 2003 г.). «Двугибридные дрожжевые скрининги подразумевают участие белков анемии Фанкони в регуляции транскрипции, передаче сигналов в клетках, окислительном метаболизме и клеточном транспорте». Экспериментальные исследования клеток . 289 (2): 211–21. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . ПМИД 14499622 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте белково-белкового взаимодействия человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Икеда Р., Ёсида К., Иноуэ И. (май 2007 г.). «Идентификация FAZF как нового транскрипционного фактора, индуцированного BMP2, во время остеобластной дифференцировки» . Журнал клеточной биохимии . 101 (1): 147–54. дои : 10.1002/jcb.21165 . ПМИД 17171645 . S2CID 46504508 .

Внешние ссылки

ZBTB32+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011590 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006310 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10572087-5] Jump up to: ^а ^б Хоатлин М.Э., Чжи Ю., Болл Х., Силви К., Мельник А., Стоун С., Араи С., Хоу Н., Оуэн Г., Зелент А., Лихт Дж.Д. (декабрь 1999 г.). «Новый белок-репрессор транскрипции BTB/POZ взаимодействует с белком группы C анемии Фанкони и PLZF». Кровь . 94 (11): 3737–47. дои : 10.1182/blood.V94.11.3737 . ПМИД 10572087 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: цинковый палец ZBTB32 и домен BTB, содержащий 32» .

[Yoon_2012-7] Jump up to: ^а ^б ^с Юн Х.С., Шарер К.Д., Маджумдер П., Дэвис К.В., Батлер Р., Зинцов-Крамер В., Скунцу И., Кутсонанос Д.Г., Ахмед Р., Босс Дж.М. (2012). «ZBTB32 является ранним репрессором экспрессии генов CIITA и MHC класса II во время дифференцировки B-клеток в плазматические клетки» . Журнал иммунологии . 189 (5): 2393–403. doi : 10.4049/jimmunol.1103371 . ПМЦ 3424359 . ПМИД 22851713 .

[pmid25162118-8] Риццо А.А., Салерно П.Е., Безсонова И., Коржнев Д.М. (сентябрь 2014 г.). «ЯМР-структура цинкового пальца человека Rad18 в комплексе с убиквитином определяет класс UBZ-доменов в белках, связанных с реакцией на повреждение ДНК». Биохимия . 53 (37): 5895–906. дои : 10.1021/bi500823h . ПМИД 25162118 .

[autogenerated1-9] Хоатлин М.Э., Чжи Ю., Болл Х., Силви К., Мельник А., Стоун С., Араи С., Хоу Н., Оуэн Г., Зелент А., Лихт Дж.Д. (декабрь 1999 г.). «Новый белок-репрессор транскрипции BTB/POZ взаимодействует с белком группы C анемии Фанкони и PLZF». Кровь . 94 (11): 3737–47. дои : 10.1182/blood.V94.11.3737 . ПМИД 10572087 .

[pmid14499622-10] Рейтер Т., Медхерст А.Л., Вайсфис К., Чжи Й., Хертерих С., Хен Х., Гросс Х.Дж., Йоэндже Х., Хоатлин М.Э., Мэтью К.Г., Хубер П.А. (октябрь 2003 г.). «Двугибридные дрожжевые скрининги подразумевают участие белков анемии Фанкони в регуляции транскрипции, передаче сигналов в клетках, окислительном метаболизме и клеточном транспорте». Экспериментальные исследования клеток . 289 (2): 211–21. дои : 10.1016/s0014-4827(03)00261-1 . ПМИД 14499622 .

[pmid12821938-11] Хан Ш., Чон Дж. Х., Джу Х. Р., Чон Ю, Ким К. Ю., Ю Х. С., Ли Ю. Х., Сон К. С., Хван Х. М., На Ю. С., Ян Ю., Ли К. Н., Чхве И (июнь 2003 г.). «VDUP1, активируемый TGF-бета1 и 1,25-дигидроксивитамином D3, ингибирует рост опухолевых клеток, блокируя развитие клеточного цикла» . Онкоген . 22 (26): 4035–46. дои : 10.1038/sj.onc.1206610 . ПМИД 12821938 .

[pmid28258171-12] Jump up to: ^а ^б Шахи П., Ван С.И., Лоусон Д.А., Слорач Э.М., Лу А., Ю Ю, Лай М.Д., Гонсалес Велосо Х., Верб З. (2017). «ZNF503/Zpo2 способствует агрессивному прогрессированию рака молочной железы за счет снижения экспрессии GATA3» . Proc Natl Acad Sci США . 114 (12): 3169–3174. Бибкод : 2017PNAS..114.3169S . дои : 10.1073/pnas.1701690114 . ПМЦ 5373372 . ПМИД 28258171 .

[pmid11964310-13] Цузуки С., Энвер Т. (май 2002 г.). «Взаимодействие GATA-2 с белком цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза (PLZF), его гомологом FAZF и альфа-онкобелком рецептора ретиноевой кислоты t(11;17)» . Кровь . 99 (9): 3404–10. дои : 10.1182/blood.V99.9.3404 . ПМИД 11964310 .

[pmid26324348-14] Болье А.М., Мадера С., Сан Дж.К. (2015). «Молекулярное программирование иммунологической памяти в естественных клетках-киллерах». Перекресток между врожденным и адаптивным иммунитетом V . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 850. стр. 81–91. дои : 10.1007/978-3-319-15774-0_7 . ISBN 978-3-319-15773-3 . ПМИД 26324348 .

[pmid29707204-15] Коли У.Д., Чжао Ю., Бенк СиДжей, Лю Ю., Хотта-Ивамура С., Рахман М.Дж., Тарбелл К.В. (2018). «Потеря Zbtb32 у мышей NOD существенно не меняет ответы Т-клеток» . F1000Исследования . 7 : 318. doi : 10.12688/f1000research.13864.1 . ПМК 5909056 . ПМИД 29707204 .

[Zhu-16] Чжу С, Чэнь Г, Чжао Ю, Гао XM, Ван Дж (2018). «Регуляция развития и функции B-клеток факторами транскрипции ZBTB» . Границы в иммунологии . 9 : 580. дои : 10.3389/fimmu.2018.00580 . ПМК 5869932 . ПМИД 29616049 .

[pmid25774687-17] Чжан С, Чжао Х, Ли Дж, Лю Х, Ван Ф, Вэй Ю, Су Дж, Чжан Д, Лю Т, Чжан Ю (2015). «Идентификация специфических закономерностей метилирования при различных видах рака» . ПЛОС ОДИН . 10 (3): e0120361. Бибкод : 2015PLoSO..1020361Z . дои : 10.1371/journal.pone.0120361 . ПМЦ 4361543 . ПМИД 25774687 .

[Sourisseau_2016-18] Суриссо Т., Хелисси С., Лефевр С., Понсоннайлес Ф., Малка-Майе Х., Олауссен К.А., Андре Ф., Вагнер С., Сориа Х.К. (2016). «Регуляция трансляции мРНК, кодирующей убиквитинпептидазу USP1, участвующую в реакции на повреждение ДНК, как детерминант устойчивости к цисплатину» . Клеточный цикл . 15 (2): 295–302. дои : 10.1080/15384101.2015.1120918 . ПМЦ 4825832 . ПМИД 26825230 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]