✖


Jump to content

Гистоновая деацетилаза

(Перенаправлено с HDAC )
Гистоновая деацетилаза
Каталитический домен гистондеацетилазы 4 человека со связанным ингибитором. Рендеринг PDB на основе 2vqj . [ 1 ]
Идентификаторы
Номер ЕС. 3.5.1.98
Номер CAS. 9076-57-7
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
Экспаси Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins
Суперсемейство гистонов деацетилаз
Идентификаторы
Символ Hist_deacetyl
Пфам PF00850
ИнтерПро IPR000286
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1с3с / СКОПе / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Гистоновые деацетилазы ( EC 3.5.1.98 , HDAC ) представляют собой класс ферментов , которые удаляют ацетильные группы (O=C-CH 3 ε-N-ацетиллизина как ) из аминокислоты на гистоновых , так и на негистоновых белках . [ 2 ] HDAC позволяют гистонам плотнее обволакивать ДНК. [ 3 ] Это важно, поскольку ДНК обернута вокруг гистонов, а экспрессия ДНК регулируется посредством ацетилирования и деацетилирования. Действие HDAC противоположно действию гистон-ацетилтрансферазы . Белки HDAC теперь также называют лизиндеацетилазами (KDAC), чтобы описать их функцию, а не их мишень, которая также включает негистоновые белки . [ 4 ] В целом они подавляют экспрессию генов. [ 5 ]

Суперсемейство HDAC

[ редактировать ]

Вместе с ацетилполиаминамидогидролазами и белками, утилизирующими ацетоин , деацетилазы гистонов образуют древнее суперсемейство белков, известное как суперсемейство деацетилаз гистонов. [ 6 ]

Классы HDAC у высших эукариот

[ редактировать ]

HDAC подразделяются на четыре класса в зависимости от гомологии последовательностей исходных ферментов дрожжей и организации домена: [ 7 ]

Классификация HDAC у высших эукариот
Сорт Члены Каталитические сайты Субклеточная локализация Распределение тканей Субстраты Обязательные партнеры Нокаутный фенотип
я HDAC1 1 Ядро Вездесущий Андрогенный рецептор , SHP , p53 , MyoD , E2F1 , STAT3 – Эмбриональная летальность, повышенное ацетилирование гистонов, увеличение p21 и p27.
HDAC2 1 Ядро Вездесущий Глюкокортикоидный рецептор , YY1 , BCL6 , STAT3 – Порок сердца
HDAC3 1 Ядро Вездесущий ШП , ГГ1 , ГАТА1 , РЕЛА , СТАТ3 , МЕФ2Д НКОР1 [ 8 ] –
HDAC8 1 Ядро/цитоплазма Вездесущий? – EST1B –
ИМА HDAC4 1 Ядро/цитоплазма сердце, скелетные мышцы, мозг ГХМА , ГАТА1 , HP1 RFXANK Дефекты хондроцитов дифференцировки
HDAC5 1 Ядро/цитоплазма сердце, скелетные мышцы, мозг ГХМА , СМАД7 , HP1 REA , рецептор эстрогена Порок сердца
HDAC7 1 Ядро/цитоплазма/митохондрии сердце, скелетные мышцы, поджелудочная железа, плацента PLAG1 , PLAG2 HIF1A , BCL6 , рецептор эндотелина , ACTN1 , ACTN4 , рецептор андрогена , Tip60 Поддержание целостности сосудов, увеличение MMP10
HDAC9 1 Ядро/цитоплазма мозг, скелетные мышцы – ФОКС3 Порок сердца
МИБ HDAC6 2 Преимущественно цитоплазма сердце, печень, почки, плацента α-Тубулин , HSP90 , SHP , SMAD7 РУНКС2 –
HDAC10 1 Преимущественно цитоплазма печень, селезенка, почки – – –
III сиртуины млекопитающих ( SIRT1 , SIRT2 , SIRT3 , SIRT4 , SIRT5 , SIRT6 , SIRT7 ) – – – – – –
Sir2 в дрожжах S. cerevisiae – – – – – –
IV HDAC11 2 Ядро/цитоплазма мозг, сердце, скелетные мышцы, почки – – –

HDAC (кроме класса III) содержат цинк и известны как Zn. 2+ -зависимые гистондеацетилазы. [ 9 ] Они имеют классическую аргиназную складку и структурно и механически отличаются от сиртуинов (класс III), которые складываются в архитектуру Россмана и представляют собой НАД. + зависимый. [ 10 ]

Подтипы

[ редактировать ]

Белки HDAC сгруппированы в четыре класса (см. Выше) на основе сходства функций и последовательностей ДНК. Классы I, II и IV считаются «классическими» HDAC, активность которых ингибируется трихостатином А (TSA) и имеют цинк-зависимый активный центр, тогда как ферменты класса III представляют собой семейство НАД. + -зависимые белки, известные как сиртуины , на которые не влияет TSA. [ 11 ] Гомологи этих трех групп обнаружены у дрожжей, имеющих названия: пониженная зависимость от калия 3 (Rpd3), что соответствует классу I; гистондеацетилаза 1 (hda1), соответствующая классу II; и регулятор молчаливой информации 2 ( Sir2 ), соответствующий классу III. Класс IV содержит только одну изоформу (HDAC11), которая не очень гомологична дрожжевым ферментам Rpd3 или hda1. [ 12 ] и поэтому HDAC11 отнесен к собственному классу. Ферменты класса III считаются отдельным типом ферментов и имеют другой механизм действия; эти ферменты НАД + -зависимый, тогда как HDAC других классов требуют Zn 2+ в качестве кофактора. [ 13 ]

Эволюция

[ редактировать ]

HDACs консервативны в ходе эволюции, обнаруживая ортологи у всех эукариот и даже у архей . Все высшие эукариоты, включая позвоночных, растения и членистоногих, обладают по крайней мере одним HDAC в каждом классе, в то время как большинство позвоночных несут 11 канонических HDAC, за исключением костных рыб, у которых отсутствует HDAC2, но, по-видимому, имеется дополнительная копия HDAC11, получившая название HDAC12. . Растения несут дополнительные HDAC по сравнению с животными, предположительно для осуществления более сложной регуляции транскрипции, необходимой этим сидячим организмам. HDAC, по-видимому, происходят из предкового ацетилсвязывающего домена, поскольку гомологи HDAC были обнаружены у бактерий в форме белков, утилизирующих ацетоин (AcuC). [ 3 ]

Представление топологического филогенетического дерева 226 членов семейства белков HDAC. [ 3 ]

Субклеточное распределение

[ редактировать ]

В HDAC класса I HDAC1, 2 и 3 обнаруживаются преимущественно в ядре, тогда как HDAC8 обнаруживается как в ядре, так и в цитоплазме, а также связан с мембраной. HDAC класса II (HDAC4, 5, 6, 7, 9 и 10) способны перемещаться в ядро ​​и из него в зависимости от различных сигналов. [ 14 ] [ 15 ]

HDAC6 представляет собой цитоплазматический фермент, связанный с микротрубочками. HDAC6 деацетилирует тубулин , Hsp90 и кортактин , образует комплексы с другими белками-партнерами и, следовательно, участвует во множестве биологических процессов. [ 16 ]

Функция

[ редактировать ]

Модификация гистонов

[ редактировать ]

Гистоновые хвосты обычно заряжены положительно благодаря аминогруппам , присутствующим в их лизине и аргинине аминокислотах . Эти положительные заряды помогают хвостам гистонов взаимодействовать и связываться с отрицательно заряженными фосфатными группами на остове ДНК. Ацетилирование , которое обычно происходит в клетке, нейтрализует положительные заряды гистонов путем превращения аминов в амиды и снижает способность гистонов связываться с ДНК. Это снижение связывания позволяет расширять хроматин , обеспечивая генетической транскрипции возможность . Деацетилазы гистонов удаляют эти ацетильные группы, увеличивая положительный заряд хвостов гистонов и способствуя высокоаффинному связыванию между гистонами и основной цепью ДНК. Повышенное связывание ДНК уплотняет структуру ДНК, предотвращая транскрипцию.

Гистоновая деацетилаза участвует в ряде путей внутри живой системы. Согласно Киотской энциклопедии генов и геномов ( KEGG ), это:

Некоторые сигналы активации нуклеосомы . Нуклеосомы состоят из четырех пар белков -гистонов в плотно собранной сердцевинной области плюс до 30% каждого гистона, остающегося в свободно организованном хвосте (показан только один хвост каждой пары). ДНК обернута вокруг белков ядра гистонов в хромосомах . Лизины (К) обозначены цифрами, обозначающими их положение, например (К4), что указывает на то, что лизин является четвертой аминокислотой от амино(N)-конца хвоста в гистоновом белке. Метилирование {Me} и ацетилирование [Ac] являются распространенными посттрансляционными модификациями лизинов гистоновых хвостов.
Некоторые сигналы репрессии на нуклеосоме .

Ацетилирование гистонов играет важную роль в регуляции экспрессии генов. Гиперацетилированный хроматин транскрипционно активен, а гипоацетилированный хроматин «молчит». Исследование на мышах показало, что определенная подгруппа мышиных генов (7%) нарушалась в отсутствие HDAC1. [ 17 ] Их исследование также выявило регуляторные перекрестные помехи между HDAC1 и HDAC2 и предполагает новую функцию HDAC1 в качестве коактиватора транскрипции. Было обнаружено, что экспрессия HDAC1 повышена в префронтальной коре больных шизофренией. [ 18 ] отрицательно коррелирует с экспрессией мРНК GAD67 .

Негистоновые эффекты

[ редактировать ]

Ошибочно рассматривать HDACs исключительно в контексте регуляции транскрипции генов путем модификации гистонов и структуры хроматина, хотя это, по-видимому, является преобладающей функцией. Функцию, активность и стабильность белков можно контролировать с помощью посттрансляционных модификаций . белков Фосфорилирование , пожалуй, наиболее широко изученная и понятная модификация, при которой определенные аминокислотные остатки фосфорилируются под действием протеинкиназ или дефосфорилируются под действием фосфатаз . Ацетилирование остатков лизина представляет собой аналогичный механизм , при котором негистоновые белки подвергаются воздействию ацетилаз и деацетилаз. [ 19 ] Именно в этом контексте обнаружено, что HDACs взаимодействуют с множеством негистоновых белков — некоторые из них являются факторами транскрипции и корегуляторами , некоторые — нет. Обратите внимание на следующие четыре примера:

  • HDAC6 связан с агресомами . Неправильно свернутые белковые агрегаты помечаются путем убиквитинирования и удаляются из цитоплазмы динеиновыми моторами через сеть микротрубочек в органеллу, называемую агресомой. HDAC 6 связывает полиубиквитинированные неправильно свернутые белки и связывается с динеиновыми моторами, тем самым позволяя физически транспортировать неправильно свернутый белковый груз к шаперонам и протеасомам для последующего разрушения. [ 20 ] HDAC6 является важным регулятором функции HSP90 и его ингибитором, предложенным для лечения метаболических нарушений. [ 21 ]
  • PTEN является важной фосфатазой, участвующей в передаче сигналов в клетках через фосфоинозитолы и путь AKT / киназный PI3 . PTEN подвергается сложному регуляторному контролю посредством фосфорилирования, убиквитинирования, окисления и ацетилирования. Ацетилирование PTEN фактором, ассоциированным с гистон-ацетилтрансферазой p300/CBP ( PCAF ), может подавлять его активность; наоборот, деацетилирование PTEN деацетилазой SIRT1 и HDAC1 может стимулировать его активность. [ 22 ] [ 23 ]
  • APE1/Ref-1 ( APEX1 ) представляет собой многофункциональный белок, обладающий как активностью репарации ДНК (на сайтах абазовых и одноцепочечных разрывов), так и транскрипционной регуляторной активностью, связанной с окислительным стрессом . APE1/Ref-1 ацетилируется PCAF; наоборот, он стабильно связывается с HDAC класса I и деацетилируется ими. Состояние ацетилирования APE1/Ref-1, по-видимому, не влияет на его активность по репарации ДНК , но регулирует его транскрипционную активность, такую ​​как его способность связываться с промотором ПТГ и инициировать транскрипцию гена паратиреоидного гормона . [ 24 ] [ 25 ]
  • NF-κB является ключевым фактором транскрипции и эффекторной молекулой, участвующей в ответах на клеточный стресс, и состоит из гетеродимера p50/p65. Субъединица p65 контролируется ацетилированием через PCAF и деацетилированием через HDAC3 и HDAC6. [ 26 ]

Это лишь некоторые примеры постоянно появляющихся негистоновых и нехроматиновых ролей HDACs.

Ингибиторы HDAC

[ редактировать ]
Основная статья: Ингибитор деацетилазы гистонов

Ингибиторы гистондеацетилазы (ИГД) уже давно используются в психиатрии и неврологии в качестве стабилизаторов настроения и противоэпилептических средств, например вальпроевая кислота . В последнее время ИЧР изучаются в качестве средства смягчения или лечения нейродегенеративных заболеваний . [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] Также в последние годы предпринимались попытки разработать ИЧР для лечения рака. [ 30 ] [ 31 ] Вориностат (SAHA) был одобрен FDA в 2006 году для лечения кожных проявлений у пациентов с кожной Т-клеточной лимфомой (CTCL), у которых предыдущее лечение оказалось неэффективным. Второй ИГД, Истодакс ( ромидепсин ), был одобрен в 2009 году для пациентов с CTCL. Точные механизмы действия этих соединений неясны, но эпигенетические пути. предполагаются [ 32 ] Кроме того, в ходе клинических испытаний изучается влияние вальпроевой кислоты на латентные пулы ВИЧ у инфицированных людей. [ 33 ] ИГД в настоящее время исследуются в качестве химиосенсибилизаторов для цитотоксической химиотерапии или лучевой терапии или в сочетании с ингибиторами метилирования ДНК на основе синергизма in vitro. [ 34 ] Были разработаны селективные по изоформам HDI, которые могут помочь в выяснении роли отдельных изоформ HDAC. [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 29 ]

Ингибиторы HDAC оказывают воздействие на негистоновые белки, связанные с ацетилированием. HDI могут изменять степень ацетилирования этих молекул и, следовательно, увеличивать или подавлять их активность. В четырех примерах, приведенных выше (см. « Функция ») действия HDAC на негистоновые белки, в каждом из этих случаев ингибитор HDAC трихостатин А (TSA) блокирует эффект. Было показано, что HDI изменяют активность многих факторов транскрипции, включая ACTR , cMyb , E2F1, EKLF , FEN1 , GATA, HNF-4 , HSP90, Ku70 , NFκB, PCNA , p53, RB , Runx, SF1 Sp3, STAT, TFIIE , TCF и YY1. [ 38 ] [ 39 ]

экспрессию гена FOXO3a На мышах было показано, что кетоновые тела β-гидроксибутират увеличивают за счет ингибирования деацетилазы гистонов. [ 40 ]

Ингибиторы гистондеацетилазы могут модулировать латентный период некоторых вирусов, что приводит к реактивации. [ 41 ] Было показано, что это происходит, например, при латентной инфекции вируса герпеса-6 человека .

Ингибиторы гистондеацетилазы продемонстрировали активность против определенных видов и стадий Plasmodium , что может указывать на их потенциал в лечении малярии. Было показано, что HDI накапливают ацетилированный гистон H3K9/H3K14, нижестоящую мишень HDAC класса I. [ 42 ]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Боттомли М.Дж., Ло Сурдо П., Ди Джовин П., Чирилло А., Скарпелли Р., Ферриньо Ф. и др. (сентябрь 2008 г.). «Структурный и функциональный анализ каталитического домена HDAC4 человека выявил регуляторный структурный цинксвязывающий домен» . Журнал биологической химии . 283 (39): 26694–26704. дои : 10.1074/jbc.M803514200 . ПМЦ   3258910 . ПМИД   18614528 .
  2. ^ Сето, Эдвард; Ёсида, Минору (01 апреля 2014 г.). «Ластики ацетилирования гистонов: ферменты деацетилазы гистонов» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 6 (4): а018713. doi : 10.1101/cshperspect.a018713 . ISSN   1943-0264 . ПМК   3970420 . ПМИД   24691964 .
  3. ^ Jump up to: а б с Милаццо Дж., Меркателли Д., Ди Муцио Дж., Триболи Л., Де Роза П., Перини Дж., Джорджи Ф.М. (май 2020 г.). «Гистоновые деацетилазы (HDAC): эволюция, специфичность, роль в транскрипционных комплексах и фармакологическая эффективность» . Гены . 11 (5): 556–604. дои : 10.3390/genes11050556 . ПМЦ   7288346 . ПМИД   32429325 .
  4. ^ Чоудхари С., Кумар С., Гнад Ф., Нильсен М.Л., Рехман М., Вальтер Т.С. и др. (август 2009 г.). «Ацетилирование лизина нацелено на белковые комплексы и совместно регулирует основные клеточные функции» . Наука . 325 (5942): 834–840. Бибкод : 2009Sci...325..834C . дои : 10.1126/science.1175371 . ПМИД   19608861 . S2CID   206520776 .
  5. ^ Чен, Хун Пин; Чжао, Ю Тина; Чжао, Тин С (2015). «Гистондеацетилазы и механизмы регуляции экспрессии генов (гистондеацетилазы при раке)» . Крит Рев Онког . 20 (1–2): 35–47. дои : 10.1615/critrevoncog.2015012997 . ПМЦ   4809735 . ПМИД   25746103 .
  6. ^ Лейпе Д.Д., Ландсман Д. (сентябрь 1997 г.). «Деацетилазы гистонов, белки, утилизирующие ацетоин, и ацетилполиаминоамидогидролазы являются членами древнего суперсемейства белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (18): 3693–3697. дои : 10.1093/нар/25.18.3693 . ПМК   146955 . ПМИД   9278492 .
  7. ^ Докманович М., Кларк С., Маркс П.А. (октябрь 2007 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: обзор и перспективы». Молекулярные исследования рака . 5 (10): 981–989. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-07-0324 . ПМИД   17951399 .
  8. ^ Ю Ш., Лим Х.В., Сан З., Броуч М., Вон К.Дж., Лазар М.А. (февраль 2013 г.). «Корепрессоры ядерных рецепторов необходимы для гистон-деацетилазной активности HDAC3 in vivo» . Структурная и молекулярная биология природы . 20 (2): 182–187. дои : 10.1038/nsmb.2476 . ПМК   3565028 . ПМИД   23292142 .
  9. ^ Маркс П.А., Сюй В.С. (июль 2009 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: потенциал в терапии рака» . Журнал клеточной биохимии . 107 (4): 600–608. дои : 10.1002/jcb.22185 . ПМЦ   2766855 . ПМИД   19459166 .
  10. ^ Бюргер М., Чори Дж. (2018). «Структурная и химическая биология деацетилаз углеводов, белков, малых молекул и гистонов» . Коммуникационная биология . 1 : 217. дои : 10.1038/s42003-018-0214-4 . ПМК   6281622 . ПМИД   30534609 .
  11. ^ Имаи С., Армстронг К.М., Каберлейн М., Гуаренте Л. (февраль 2000 г.). «Белок молчания транскрипции и долголетия Sir2 представляет собой НАД-зависимую гистондеацетилазу». Природа . 403 (6771): 795–800. Бибкод : 2000Natur.403..795I . дои : 10.1038/35001622 . ПМИД   10693811 . S2CID   2967911 .
  12. ^ Ян XJ, Сето Э (март 2008 г.). «Семейство лизиндеацетилаз Rpd3/Hda1: от бактерий и дрожжей до мышей и людей» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 9 (3): 206–218. дои : 10.1038/nrm2346 . ПМЦ   2667380 . ПМИД   18292778 .
  13. ^ Барнеда-Захонеро Б., Парра М. (декабрь 2012 г.). «Гистоновые деацетилазы и рак» . Молекулярная онкология . 6 (6): 579–589. дои : 10.1016/j.molonc.2012.07.003 . ПМЦ   5528343 . ПМИД   22963873 .
  14. ^ де Рюйтер А.Дж., ван Геннип А.Х., Кэрон Х.Н., Кемп С., ван Куиленбург А.Б. (март 2003 г.). «Гистоновые деацетилазы (HDAC): характеристика классического семейства HDAC» . Биохимический журнал . 370 (Часть 3): 737–749. дои : 10.1042/BJ20021321 . ПМЦ   1223209 . ПМИД   12429021 .
  15. ^ Лонгворт М.С., Лайминс Л.А. (июль 2006 г.). «Гистондеацетилаза 3 локализуется на плазматической мембране и является субстратом Src». Онкоген . 25 (32): 4495–4500. дои : 10.1038/sj.onc.1209473 . ПМИД   16532030 .
  16. ^ Валенсуэла-Фернандес А., Кабреро-младший, Серрадор Х.М., Санчес-Мадрид Ф (июнь 2008 г.). «HDAC6: ключевой регулятор цитоскелета, миграции клеток и межклеточных взаимодействий». Тенденции в клеточной биологии . 18 (6): 291–297. дои : 10.1016/j.tcb.2008.04.003 . ПМИД   18472263 .
  17. ^ Зупковиц Г., Тишлер Дж., Пош М., Садзак И., Рамзауэр К., Эггер Г. и др. (ноябрь 2006 г.). «Отрицательная и положительная регуляция экспрессии генов деацетилазой гистонов 1 мыши» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (21): 7913–7928. дои : 10.1128/MCB.01220-06 . ПМЦ   1636735 . ПМИД   16940178 .
  18. ^ Шарма Р.П., Грейсон Д.Р., Гэвин Д.П. (январь 2008 г.). «Экспрессия гистондеактилазы 1 увеличивается в префронтальной коре больных шизофренией: анализ коллекции микрочипов Национального банка данных мозга» . Исследования шизофрении . 98 (1–3): 111–117. doi : 10.1016/j.schres.2007.09.020 . ПМК   2254186 . ПМИД   17961987 .
  19. ^ Глозак М.А., Сенгупта Н., Чжан Х, Сето Э (декабрь 2005 г.). «Ацетилирование и деацетилирование негистоновых белков». Джин . 363 : 15–23. дои : 10.1016/j.gene.2005.09.010 . ПМИД   16289629 .
  20. ^ Родригес-Гонсалес А., Лин Т., Икеда А.К., Симмс-Уолдрип Т., Фу С., Сакамото К.М. (апрель 2008 г.). «Роль агресомного пути при раке: воздействие на деградацию белка, зависимую от гистондеацетилазы 6» . Исследования рака . 68 (8): 2557–2560. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-5989 . ПМИД   18413721 .
  21. ^ Махла РС (июль 2012 г.). «Комментарий к: Винклер и др. Деацетилаза гистонов 6 (HDAC6) является важным модификатором глюкокортикоид-индуцированного печеночного глюконеогенеза. Диабет 2012;61:513-523» . Диабет . 61 (7): e10, ответ автора e11. дои : 10.2337/db12-0323 . ПМЦ   3379673 . ПМИД   22723278 .
  22. ^ Икеноуэ Т., Иноки К., Чжао Б., Гуань К.Л. (сентябрь 2008 г.). «Ацетилирование PTEN модулирует его взаимодействие с доменом PDZ» . Исследования рака . 68 (17): 6908–6912. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-08-1107 . ПМИД   18757404 .
  23. ^ Яо XH, Ньомба Б.Л. (июнь 2008 г.). «Инсулинорезистентность печени, вызванная пренатальным воздействием алкоголя, связана со снижением ацетилирования PTEN и TRB3 у потомства взрослых крыс». Американский журнал физиологии. Регуляторная, интегративная и сравнительная физиология . 294 (6): R1797–R1806. дои : 10.1152/ajpregu.00804.2007 . ПМИД   18385463 .
  24. ^ Бхакат К.К., Изуми Т., Ян Ш., Хазра Т.К., Митра С. (декабрь 2003 г.). «Роль ацетилированной AP-эндонуклеазы человека (APE1/Ref-1) в регуляции гена паратиреоидного гормона» . Журнал ЭМБО . 22 (23): 6299–6309. дои : 10.1093/emboj/cdg595 . ПМК   291836 . ПМИД   14633989 .
  25. ^ Фантини Д., Васкотто С., Дегануто М., Биви Н., Густинчич С., Маркон Г. и др. (январь 2008 г.). «APE1/Ref-1 регулирует экспрессию PTEN, опосредованную Egr-1» . Свободные радикальные исследования . 42 (1): 20–29. дои : 10.1080/10715760701765616 . ПМК   2677450 . ПМИД   18324520 .
  26. ^ Хассельгрен П.О. (декабрь 2007 г.). «Убиквитинирование, фосфорилирование и ацетилирование — тройная угроза атрофии мышц» . Журнал клеточной физиологии . 213 (3): 679–689. дои : 10.1002/jcp.21190 . ПМИД   17657723 .
  27. ^ Ханен Э., Хауке Дж., Транкле С., Эйюпоглу И.Ю., Вирт Б., Блюмке И. (февраль 2008 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: возможные последствия нейродегенеративных заболеваний». Экспертное мнение об исследуемых препаратах . 17 (2): 169–184. дои : 10.1517/13543784.17.2.169 . ПМИД   18230051 . S2CID   14344174 .
  28. ^ «Ученые «обратили» потерю памяти» . Новости Би-би-си . 29 апреля 2007 г. Проверено 8 июля 2007 г.
  29. ^ Jump up to: а б Герс С., Кларисса Д., Бэле Ф., Франсеус Дж., Десмет Т., Де Босшер К., Д'Хуг М. (май 2022 г.). «Идентификация ингибиторов HDAC6 на основе меркаптоацетамида с помощью стратегии экономичного ингибитора: скрининг, синтез и биологическая оценка» . Химические коммуникации . 58 (42): 6239–6242. дои : 10.1039/D2CC01550A . hdl : 1854/LU-8752799 . ПМИД   35510683 . S2CID   248527466 .
  30. ^ Мваквари С.К., Патил В., Геррант В., Ойелере А.К. (2010). «Макроциклические ингибиторы гистондеацетилазы» . Актуальные темы медицинской химии . 10 (14): 1423–1440. дои : 10.2174/156802610792232079 . ПМК   3144151 . ПМИД   20536416 .
  31. ^ Миллер Т.А., Виттер DJ, Belvedere S (ноябрь 2003 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы». Журнал медицинской химии . 46 (24): 5097–5116. дои : 10.1021/jm0303094 . ПМИД   14613312 .
  32. ^ Моннере С (апрель 2007 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы для эпигенетической терапии рака». Противораковые препараты . 18 (4): 363–370. дои : 10.1097/CAD.0b013e328012a5db . ПМИД   17351388 . S2CID   39017666 .
  33. ^ Истощение латентного ВИЧ в клетках CD4 - полнотекстовый просмотр - ClinicalTrials.gov
  34. ^ Бэтти Н., Малуф Г.Г., Исса Дж.П. (август 2009 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы как противоопухолевые средства». Письма о раке . 280 (2): 192–200. дои : 10.1016/j.canlet.2009.03.013 . ПМИД   19345475 .
  35. ^ Патил В., Соджи К.Х., Корнаки-младший, Мркшич М., Ойелере А.К. (май 2013 г.). «3-Гидроксипиридин-2-тион как новая цинксвязывающая группа для селективного ингибирования деацетилазы гистонов» . Журнал медицинской химии . 56 (9): 3492–3506. дои : 10.1021/jm301769u . ПМЦ   3657749 . ПМИД   23547652 .
  36. ^ Мваквари С.К., Геррант В., Патил В., Хан С.И., Теквани Б.Л., Гурард-Левин З.А. и др. (август 2010 г.). «Непептидные макроциклические ингибиторы деацетилазы гистонов, полученные из скелета трициклических кетолидов» . Журнал медицинской химии . 53 (16): 6100–6111. дои : 10.1021/jm100507q . ПМЦ   2924451 . ПМИД   20669972 .
  37. ^ Батлер К.В., Калин Дж., Брошер С., Вистоли Г., Лэнгли Б., Козиковски А.П. (август 2010 г.). «Рациональный дизайн и простая химия позволили получить превосходный нейропротекторный ингибитор HDAC6 — тубастатин А» . Журнал Американского химического общества . 132 (31): 10842–10846. дои : 10.1021/ja102758v . ПМК   2916045 . ПМИД   20614936 .
  38. ^ Драммонд, округ Колумбия, Нобл, Ко, Кирпотин Д.Б., Го З, Скотт Г.К., Бенц CC (2005). «Клиническая разработка ингибиторов гистондеацетилазы в качестве противораковых средств». Ежегодный обзор фармакологии и токсикологии . 45 : 495–528. doi : 10.1146/annurev.pharmtox.45.120403.095825 . ПМИД   15822187 .
  39. ^ Ян XJ, Сето Э (август 2007 г.). «HAT и HDAC: от структуры, функции и регуляции к новым стратегиям терапии и профилактики» . Онкоген . 26 (37): 5310–5318. дои : 10.1038/sj.onc.1210599 . ПМИД   17694074 .
  40. ^ Симадзу Т., Хирши М.Д., Ньюман Дж., Хе В., Сиракава К., Ле Моан Н. и др. (январь 2013 г.). «Подавление окислительного стресса β-гидроксибутиратом, эндогенным ингибитором деацетилазы гистонов» . Наука . 339 (6116): 211–214. Бибкод : 2013Sci...339..211S . дои : 10.1126/science.1227166 . ПМЦ   3735349 . ПМИД   23223453 .
  41. ^ Арбакл Дж. Х., Медвечки П. Г. (август 2011 г.). «Молекулярная биология латентного периода вируса герпеса-6 человека и интеграции теломер» . Микробы и инфекции . 13 (8–9): 731–741. дои : 10.1016/j.micinf.2011.03.006 . ПМК   3130849 . ПМИД   21458587 .
  42. ^ Беус М., Раич З., Майсингер Д., Млинарич З., Антунович М., Марианович И. и др. (август 2018 г.). «SAHAquines, новые гибриды на основе мотивов SAHA и примахина, как потенциальные цитостатические и антиплазмодические агенты» . ХимияОткрыть . 7 (8): 624–638. дои : 10.1002/open.201800117 . ПМК   6104433 . ПМИД   30151334 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Histone_deacetylase&oldid=1239893145"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 3a2b4a489b09c6366035d128a8c63694__1723435920
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/3a/94/3a2b4a489b09c6366035d128a8c63694.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Histone deacetylase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)