ПП5

ПП5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2HWY
Идентификаторы
Псевдонимы	SMG5 , EST1B, LPTS-RP1, LPTSRP1, SMG-5, нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК, нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК SMG5
Внешние идентификаторы	Опустить : 610962 ; МГИ : 2447364 ; Гомологен : 9095 ; Генные карты : SMG5 ; ОМА : SMG5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	156,282,825 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	88,269,645 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; gastrocnemius muscle; ; anterior pituitary; ; right adrenal gland; ; granulocyte; ; right hemisphere of cerebellum; ; C1 segment; ; right adrenal cortex; ; left adrenal cortex; ; skin of leg;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; spermatid; ; superior frontal gyrus; ; neural layer of retina; ; ventricular zone; ; lip; ; muscle of thigh; ; seminiferous tubule; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; tail of embryo;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein phosphatase 2A binding; histone deacetylase binding; protein binding; telomeric DNA binding; ubiquitin protein ligase binding; ribonuclease activity; ribonucleoprotein complex binding; telomerase RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; nucleus; telomerase holoenzyme complex;
Biological process	regulation of dephosphorylation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; mRNA export from nucleus; regulation of telomere maintenance; regulation of telomere maintenance via telomerase; regulation of RNA stability; RNA phosphodiester bond hydrolysis; telomere maintenance via telomerase;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23381
	229512
	ENSG00000198952
	ENSMUSG00000001415
	Q9UPR3
	Q6ZPY2
	НМ_015327 ; НМ_001323614 ; НМ_001323615 ; НМ_001323616 ; НМ_001323617
	НМ_173188 ; НМ_178246
	НП_001310543 ; НП_001310544 ; НП_001310545 ; НП_001310546 ; НП_056142
	НП_839977
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок SMG5 — это белок , который у человека кодируется SMG5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот белок содержит домен PIN , который, по-видимому, мутировал остатки в активном сайте. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198952 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001415 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Райхенбах П., Хосс М., Аззалин С.М., Набхольц М., Бухер П., Лингнер Дж. (апрель 2003 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого Est1 связывается с теломеразой и открывает концы хромосом при сверхэкспрессии» . Курр Биол . 13 (7): 568–74. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00173-8 . ПМИД 12676087 . S2CID 14423276 .
^ Сноу Б.Е., Эрдманн Н., Круикшанк Дж., Голдман Х., Гилл Р.М., Робинсон М.О., Харрингтон Л. (апрель 2003 г.). «Функциональная консервативность белка теломеразы Est1p у человека» . Курр Биол . 13 (8): 698–704. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00210-0 . ПМИД 12699629 . S2CID 6685276 .
^ «Ген Энтрез: гомолог SMG5 Smg-5, нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК (C. elegans)» .
^ Главан Ф., Бем-Ансмант И., Изаурральде Э., Конти Э. (ноябрь 2006 г.). «Структуры PIN-доменов SMG6 и SMG5 обнаруживают нуклеазу в комплексе наблюдения мРНК» . ЭМБО Дж . 25 (21): 5117–25. дои : 10.1038/sj.emboj.7601377 . ПМК 1630413 . ПМИД 17053788 .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ониши Т., Ямасита А., Касима И. и др. (2004). «Фосфорилирование hUPF1 индуцирует образование комплексов наблюдения мРНК, содержащих hSMG-5 и hSMG-7» . Мол. Клетка . 12 (5): 1187–200. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00443-X . ПМИД 14636577 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Унтерхольцнер Л., Изаурральде Э (2005). «SMG7 действует как молекулярное звено между надзором за мРНК и распадом мРНК» . Мол. Клетка . 16 (4): 587–96. doi : 10.1016/j.molcel.2004.10.013 . ПМИД 15546618 .
Фукухара Н., Эберт Дж., Унтерхольцнер Л. и др. (2005). «SMG7 представляет собой 14-3-3-подобный адаптер в нонсенс-опосредованном пути распада мРНК» . Мол. Клетка . 17 (4): 537–47. doi : 10.1016/j.molcel.2005.01.010 . ПМИД 15721257 .
Аззалин СМ, Лингнер Дж (2006). «Фактор наблюдения за РНК человека UPF1 необходим для прогрессирования S-фазы и стабильности генома» . Курс. Биол . 16 (4): 433–9. дои : 10.1016/j.cub.2006.01.018 . PMID 16488880 . S2CID 17197870 .
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека» . Природа . 441 (7091): 315–21. Бибкод : 2006Natur.441..315G . дои : 10.1038/nature04727 . ПМИД 16710414 .
Ли Х., Сенгупта Н., Виллагра А. и др. (2006). «Гистондеацетилаза 8 защищает белок человеческих теломер 1B (hEST1B) от деградации, опосредованной убиквитином» . Мол. Клетка. Биол . 26 (14): 5259–69. дои : 10.1128/MCB.01971-05 . ПМЦ 1592721 . ПМИД 16809764 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198952 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001415 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12676087-5] Райхенбах П., Хосс М., Аззалин С.М., Набхольц М., Бухер П., Лингнер Дж. (апрель 2003 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого Est1 связывается с теломеразой и открывает концы хромосом при сверхэкспрессии» . Курр Биол . 13 (7): 568–74. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00173-8 . ПМИД 12676087 . S2CID 14423276 .

[pmid12699629-6] Сноу Б.Е., Эрдманн Н., Круикшанк Дж., Голдман Х., Гилл Р.М., Робинсон М.О., Харрингтон Л. (апрель 2003 г.). «Функциональная консервативность белка теломеразы Est1p у человека» . Курр Биол . 13 (8): 698–704. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00210-0 . ПМИД 12699629 . S2CID 6685276 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: гомолог SMG5 Smg-5, нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК (C. elegans)» .

[pmid17053788-8] Главан Ф., Бем-Ансмант И., Изаурральде Э., Конти Э. (ноябрь 2006 г.). «Структуры PIN-доменов SMG6 и SMG5 обнаруживают нуклеазу в комплексе наблюдения мРНК» . ЭМБО Дж . 25 (21): 5117–25. дои : 10.1038/sj.emboj.7601377 . ПМК 1630413 . ПМИД 17053788 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]