ПИН-домен
| ПИН-домен | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура домена PIN (N-конец PilT) (AF0591) из Archaeoglobus fulgidus с разрешением 1,90 Ангстрем. 1o4w | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ПРИКОЛОТЬ | ||
| Пфам | PF01850 | ||
| ИнтерПро | ИПР002716 | ||
| УМНЫЙ | CBS | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 3дбо / СКОПе / СУПФАМ | ||
| CDD | cd09852 | ||
| |||
В молекулярной биологии PIN-домен представляет собой белковый домен длиной около 130 аминокислот. Домены PIN функционируют как ферменты нуклеазы , которые расщепляют одноцепочечную РНК в зависимости от последовательности или структуры. [ 1 ] [ 2 ]
PIN-домены содержат четыре почти инвариантных кислотных остатка. [ 2 ] Кристаллические структуры показывают, что эти остатки сгруппированы вместе в предполагаемом активном центре . У эукариот PIN-домены обнаружены в белках, участвующих в нонсенс-опосредованном распаде мРНК , в таких белках, как SMG5 и SMG6 , а также в процессинге 18S рибосомальной РНК . Большинство белков PIN-домена, обнаруженных у прокариот, являются токсичными компонентами токсин-антитоксиновых оперонов . [ 2 ] Эти локусы обеспечивают механизм контроля, который помогает свободноживущим прокариотам справляться с пищевым стрессом. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Аркус В.Л., Маккензи Дж.Л., Робсон Дж., Кук ГМ (январь 2011 г.). «Рибонуклеазы PIN-домена и прокариотический массив токсин-антитоксин VapBC» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 24 (1–2): 33–40. doi : 10.1093/протеин/gzq081 . ПМИД 21036780 .
- ^ Jump up to: а б с Мательска Д., Стешкевич К., Гинальский К. (июль 2017 г.). «Комплексная классификация суперсемейства PIN-доменов» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (12): 6995–7020. дои : 10.1093/нар/gkx494 . ПМЦ 5499597 . ПМИД 28575517 .
- ^ Гердес К., Кристенсен С.К., Лёбнер-Олесен А. (май 2005 г.). «Локусы реакции на стресс прокариотического токсина-антитоксина». Обзоры природы. Микробиология . 3 (5): 371–82. дои : 10.1038/nrmicro1147 . ПМИД 15864262 . S2CID 13417307 .