HDAC9
| HDAC9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | HDAC9 , HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, деацетилаза гистонов 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 606543 ; МГИ : 1931221 ; Гомологен : 128578 ; Генные карты : HDAC9 ; OMA : ортологи HDAC9. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Гистондеацетилаза 9 — это фермент , который у человека кодируется HDAC9 геном . [5] [6] [7]
Функция
[ редактировать ]Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции, развитии клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ транскрипционных факторов к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию последовательности с членами семейства гистондеацетилаз. Этот ген ортологичен генам Xenopus и MITR мыши. В белке MITR отсутствует каталитический домен гистондеацетилазы. Он подавляет активность MEF2 посредством рекрутирования многокомпонентных корепрессорных комплексов, включающих CtBP и HDAC. Этот кодируемый белок может играть роль в кроветворении. Для этого гена описано множество альтернативно сплайсированных транскриптов, но полноразмерная природа некоторых из них не определена. [7]
Гистондеацетилаза 9 (HDAC9), представитель HDAC класса II, регулирует широкий спектр нормальных и аномальных физиологических функций.
Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции, развитии клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ транскрипционных факторов к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию последовательности с членами семейства гистондеацетилаз. Этот ген ортологичен генам Xenopus и MITR мыши. В белке MITR отсутствует каталитический домен гистондеацетилазы. Он подавляет активность MEF2 посредством рекрутирования многокомпонентных корепрессорных комплексов, включающих CtBP и HDAC. Этот кодируемый белок может играть роль в кроветворении. Для этого гена описано множество альтернативно сплайсированных транскриптов, но полноразмерная природа некоторых из них не определена.
Исследовать
[ редактировать ]внутричерепная аневризма
[ редактировать ]Уровень HDAC9 и BCL2L11 повышен, тогда как уровень миР-92a снижен в клинических образцах и на крысиных моделях внутричерепной аневризмы (IA). Ингибирование HDAC9 или повышение уровня миР-92а улучшали патологические изменения и подавляли апоптоз и экспрессию MMP-2, MMP-9, VEGF и воспалительных факторов в сосудистых тканях крыс IA. Напротив, сверхэкспрессия HDAC9 или снижение уровня миР-92а имели противоположные эффекты. Снижение уровня экспрессии миР-92a обращало вспять эффект подавления HDAC9 на крысах IA. Ингибирование HDAC9 активирует миР-92a, подавляя прогрессирование IA посредством подавления BCL2L11. [8]
Данные частично подтвердили более ранние результаты и показали, что варианты CDKN2B -AS1, RP1 и HDAC9 могут быть генетическими факторами предрасположенности к ИА в китайской популяции. [9]
ишемическое повреждение головного мозга
[ редактировать ]Сообщалось, что уровень гистондеацетилазы 9 (HDAC9) повышается при ишемическом повреждении головного мозга , но механизм его действия при инсульте до сих пор остается загадочным. CTCF ингибировал экспрессию миР-383-5p за счет своего обогащения промоторной областью миР-383-5p, тогда как миР-383-5p нацеливалась на экспрессию HDAC9 и ингибировала ее. [10] В модели клеток с депривацией кислорода и глюкозы и модели крыс с окклюзией средней мозговой артерии повышение HDAC9 регулируется путем CTCF/miR-383-5p/HDAC9, опосредованным апоптозом, индуцированным стрессом эндоплазматического ретикулума, тогда как снижение HDAC9 облегчало апоптоз и симптомы. инфаркта головного мозга у крыс MCAO . Таким образом, путь CTCF/miR-383-5p/HDAC9 может стать мишенью для разработки лекарств против ишемического повреждения головного мозга 6). [11]
HDAC9 высоко экспрессируется у мышей MCAO и клеток, стимулированных депривацией кислорода и глюкозы (OGD). Замалчивание HDAC9 ингибировало апоптоз нейронов и высвобождение воспалительного фактора in vitro. HDAC9 подавлял экспрессию миР-20а за счет обогащения ее промоторной области, тогда как подавление HDCA9 способствовало экспрессии миР-20а. миР-20а нацеливалась на Neurod1 и подавляла его экспрессию. Замалчивание HDAC9 уменьшало индуцированный OGD апоптоз нейронов и высвобождение воспалительных факторов in vitro, а также ишемическое повреждение головного мозга in vivo путем регуляции передачи сигналов miR-20a/NeuroD1. Замалчивание HDAC9 может замедлить ишемическое повреждение головного мозга посредством передачи сигналов miR-20a/Neurod1. [11]
Глиобластома
[ редактировать ]HDAC9 сверхэкспрессируется у пациентов с прогностически плохой глиобластомой . Нокдаун HDAC9 уменьшал пролиферацию in vitro и образование опухолей in vivo. HDAC9 ускорял клеточный цикл отчасти за счет усиления сигнального пути EGFR . Кроме того, HDAC9 взаимодействовал с TAZ, ключевым нижестоящим эффектором пути Hippo. Нокдаун HDAC9 снижал экспрессию TAZ. Мы обнаружили, что сверхэкспрессия TAZ в клетках с нокдауном HDAC9 устраняет эффекты, вызванные подавлением HDAC9 как in vitro, так и in vivo. HDAC9 способствует образованию опухоли глиобластомы посредством TAZ-опосредованной активации пути EGFR. [12]
Синдром Сэтре-Чотцена
[ редактировать ]Было высказано предположение, что HDAC9 способствует задержке развития у пациентов с синдромом Сэтре-Чотцена (СКС) с мироделецией 7p21. [13]
Двигательный иннервационный контроль экспрессии генов
[ редактировать ]Моторная иннервация контролирует ацетилирование хроматина в скелетных мышцах , и что гистондеацетилаза 9 (HDAC9) является сигнально-зависимым репрессором транскрипции, активность которого снижается при денервации с последующим усилением регуляции ацетилирования хроматина и экспрессии AChR . Принудительная экспрессия Hdac9 в денервированных мышцах предотвращает активацию зависимых от активности генов и ацетилирование хроматина путем связывания фактора 2 энхансера миоцитов ( MEF2 ) и HDAC класса I. Напротив, мыши с нулевым значением Hdac9 сверхчувствительны к вызванным денервацией изменениям в экспрессии генов и демонстрируют гиперацетилирование хроматина и замедленное перинатальное подавление миогенина , активатора генов AChR. Эти данные показывают молекулярный механизм, объясняющий контроль ацетилирования хроматина пресинаптическими нейронами и зависимую от активности регуляцию генов скелетных мышц посредством моторной иннервации. [14]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что HDAC9 взаимодействует с:
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000048052 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004698 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Ван А.Х., Бертос Н.Р., Везмар М., Пеллетье Н., Кросато М., Хенг Х.Х. и др. (ноябрь 1999 г.). «HDAC4, деацетилаза гистонов человека, родственная дрожжевому HDA1, является корепрессором транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7816–7827. дои : 10.1128/mcb.19.11.7816 . ПМЦ 84849 . ПМИД 10523670 .
- ^ Воробей Д.Б., Миска Е.А., Лэнгли Е., Рейно-Деонаут С., Котеча С., Тауэрс Н. и др. (сентябрь 1999 г.). «Функция MEF-2 модифицируется новым ко-репрессором MITR» . Журнал ЭМБО . 18 (18): 5085–5098. дои : 10.1093/emboj/18.18.5085 . ПМЦ 1171579 . ПМИД 10487760 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC9 9» .
- ^ Цай Ю, Хуан Д, Ма В, Ван М, Цинь Ц, Цзян Цз, Лю М (август 2021 г.). «Ингибирование гистонов деацетилазы 9 усиливает микроРНК-92a, подавляя прогрессирование внутричерепной аневризмы посредством подавления Bcl-2-подобного белка 11». Журнал по борьбе с наркотиками . 29 (7): 761–770. дои : 10.1080/1061186X.2021.1878365 . ПМИД 33480300 . S2CID 231678641 .
- ^ Ли Б, Ху С, Лю Дж, Ляо X, Сюнь Дж, Сяо М, Ян Дж (июль 2019 г.). «Связь между генетическими вариантами и внутричерепной аневризмой в популяции Китая» . Медицинский журнал Йонсей . 60 (7): 651–658. дои : 10.3349/ymj.2019.60.7.651 . ПМК 6597466 . ПМИД 31250579 .
- ^ Шэнь Дж, Хань Ц, Ли В, Чен Икс, Лу Дж, Чжэн Дж, Сюэ С (август 2022 г.). «МиР-383-5p, регулируемая транскрипционным фактором CTCF, влияет на повреждение нейронов при церебральной ишемии, опосредуя активность деацетилазы HDAC9». Молекулярная нейробиология . 59 (10): 6307–6320. дои : 10.1007/s12035-022-02840-4 . ПМИД 35927544 . S2CID 251349105 .
- ^ Перейти обратно: а б Чжун Л., Ян Дж., Ли Х., Мэн Л. (2020). «Замалчивание HDAC9 обеспечивает нейропротекцию против ишемического повреждения головного мозга посредством миР-20а-зависимого подавления NeuroD1» . Границы клеточной нейронауки . 14 : 544285. doi : 10.3389/fncel.2020.544285 . ПМЦ 7873949 . ПМИД 33584204 .
- ^ Ян Р., У Ю, Ван М, Сунь З, Цзоу Дж, Чжан Ю, Цуй Х (апрель 2015 г.). «HDAC9 способствует росту глиобластомы посредством TAZ-опосредованной активации пути EGFR» . Онкотаргет . 6 (10): 7644–7656. дои : 10.18632/oncotarget.3223 . ПМК 4480706 . ПМИД 25760078 .
- ^ Симбо Х., Оёси Т., Куросава К. (январь 2018 г.). «Непрерывная делеция гена, соседнего с TWIST1, выявленная у пациента с синдромом Сэтре-Чотцена, связанная с задержкой нервного развития: возможный вклад HDAC9» . Врожденные аномалии . 58 (1): 33–35. дои : 10.1111/cga.12216 . ПМИД 28220539 . S2CID 44464369 .
- ^ Меджат А., Рамон Ф., Бассель-Дюби Р., Хохбин С., Олсон Э.Н., Шеффер Л. (март 2005 г.). «Гистондеацетилаза 9 связывает активность нейронов с ацетилированием мышечного хроматина и экспрессией генов». Природная неврология . 8 (3): 313–321. дои : 10.1038/nn1408 . ПМИД 15711539 . S2CID 9965030 .
- ^ Перейти обратно: а б Асаре Ю., Кэмпбелл-Джеймс Т.А., Боков Ю., Ю.Л.Л., Престель М., Эль Бункари О. и др. (август 2020 г.). «Гистондеацетилаза 9 активирует IKK для регулирования уязвимости атеросклеротических бляшек» . Исследование кровообращения . 127 (6): 811–823. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.120.316743 . ПМИД 32546048 . S2CID 219726725 .
- ^ Перейти обратно: а б Чжан С.Л., McKinsey Т.А., Олсон Э.Н. (октябрь 2002 г.). «Ассоциация деацетилаз гистонов класса II с белком гетерохроматина 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (20): 7302–7312. дои : 10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002 . ПМК 139799 . ПМИД 12242305 .
- ^ Перейти обратно: а б с Петри К., Гидес Ф., Хауэлл Л., Хили Л., Ваксман С., Гривз М., Зелент А. (май 2003 г.). «Ген гистондеацетилазы 9 кодирует несколько изоформ белка» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16059–16072. дои : 10.1074/jbc.M212935200 . ПМИД 12590135 .
- ^ Чжоу X, Ришон В.М., Рифкинд Р.А., Маркс П.А. (февраль 2000 г.). «Идентификация репрессора транскрипции, связанного с некаталитическим доменом деацетилаз гистонов 4 и 5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1056–1061. Бибкод : 2000PNAS...97.1056Z . дои : 10.1073/pnas.97.3.1056 . ПМК 15519 . ПМИД 10655483 .
- ^ Микели Л., Д'Андреа Дж., Леонарди Л., Тироне Ф. (июль 2017 г.). «HDAC1, HDAC4 и HDAC9 связываются с PC3/Tis21/Btg2 и необходимы для ингибирования прогрессирования клеточного цикла и экспрессии циклина D1». Журнал клеточной физиологии . 232 (7): 1696–1707. дои : 10.1002/jcp.25467 . ПМИД 27333946 . S2CID 4070837 .
- ^ Миска Э.А., Карлссон С., Лэнгли Э., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывается с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его» . Журнал ЭМБО . 18 (18): 5099–5107. дои : 10.1093/emboj/18.18.5099 . ПМК 1171580 . ПМИД 10487761 .
- ^ Лемерсье С., Вердель А., Галлу Б., Курте С., Брокар М.П., Хохбин С. (май 2000 г.). «Гистондеацетилаза mHDA1/HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее» . Журнал биологической химии . 275 (20): 15594–15599. дои : 10.1074/jbc.M908437199 . ПМИД 10748098 . S2CID 39220205 .
- ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2002 г.). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют С-концевого связывающего белка и участвуют в независимом от деацетилазы режиме репрессии» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23143–23149. дои : 10.1074/jbc.M202079200 . ПМИД 11959865 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маркс П.А., Ришон В.М., Рифкинд Р.А. (август 2000 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: индукторы дифференцировки или апоптоза трансформированных клеток» . Журнал Национального института рака . 92 (15): 1210–1216. дои : 10.1093/jnci/92.15.1210 . ПМИД 10922406 .
- Вердин Э., Декьедт Ф., Каслер Х.Г. (май 2003 г.). «Деацетилазы гистонов класса II: универсальные регуляторы». Тенденции в генетике . 19 (5): 286–293. дои : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 . ПМИД 12711221 .
- Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–1108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
- Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А. и др. (октябрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (5): 277–286. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .
- Миска Э.А., Карлссон С., Лэнгли Э., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывается с фактором транскрипции MEF2 и подавляет его» . Журнал ЭМБО . 18 (18): 5099–5107. дои : 10.1093/emboj/18.18.5099 . ПМК 1171580 . ПМИД 10487761 .
- Чжоу X, Ришон В.М., Рифкинд Р.А., Маркс П.А. (февраль 2000 г.). «Идентификация репрессора транскрипции, связанного с некаталитическим доменом деацетилаз гистонов 4 и 5» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1056–1061. Бибкод : 2000PNAS...97.1056Z . дои : 10.1073/pnas.97.3.1056 . ПМК 15519 . ПМИД 10655483 .
- Юн Х.Д., Грозингер С.М., Лю ДЖО (июль 2000 г.). «Кальций регулирует репрессию транскрипции фактора-энхансера 2 миоцитов с помощью деацетилазы гистонов 4» . Журнал биологической химии . 275 (29): 22563–22567. дои : 10.1074/jbc.C000304200 . ПМИД 10825153 .
- Чжан С.Л., McKinsey Т.А., Лу Дж.Р., Олсон Э.Н. (январь 2001 г.). «Ассоциация COOH-концевого связывающего белка (CtBP) и репрессора транскрипции, взаимодействующего с MEF2 (MITR), способствует репрессии транскрипции фактора транскрипции MEF2» . Журнал биологической химии . 276 (1): 35–39. дои : 10.1074/jbc.M007364200 . ПМИД 11022042 .
- Фишле В., Декиедт Ф., Филлион М., Хендзель М.Дж., Фельтер В., Вердин Э. (сентябрь 2001 г.). «Активность деацетилазы гистонов HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo» . Журнал биологической химии . 276 (38): 35826–35835. дои : 10.1074/jbc.M104935200 . ПМИД 11466315 .
- Чжоу X, Маркс П.А., Рифкинд Р.А., Ришон В.М. (сентябрь 2001 г.). «Клонирование и характеристика деацетилазы гистонов HDAC9» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (19): 10572–10577. Бибкод : 2001PNAS...9810572Z . дои : 10.1073/pnas.191375098 . ПМК 58507 . ПМИД 11535832 .
- Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2002 г.). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют С-концевого связывающего белка и участвуют в независимом от деацетилазы режиме репрессии» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23143–23149. дои : 10.1074/jbc.M202079200 . ПМИД 11959865 .
- Кирш О., Зеелер Дж.С., Пихлер А., Гаст А., Мюллер С., Миска Э. и др. (июнь 2002 г.). «Лигаза SUMO E3 RanBP2 способствует модификации деацетилазы HDAC4» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2682–2691. дои : 10.1093/emboj/21.11.2682 . ПМК 125385 . ПМИД 12032081 .
- Малькнехт У, Шнитгер С, Уилл Дж, Чичек Н, Хельцер Д (апрель 2002 г.). «Хромосомная организация и локализация гена гистондеацетилазы 9 человека (HDAC9)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 293 (1): 182–191. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00193-6 . ПМИД 12054582 .
- Чжан С.Л., McKinsey Т.А., Олсон Э.Н. (октябрь 2002 г.). «Ассоциация деацетилаз гистонов класса II с белком гетерохроматина 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (20): 7302–7312. дои : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . ПМК 139799 . ПМИД 12242305 .
- Хугевен А.Т., Россетти С., Стоянова В., Шонкерен Дж., Фенароли А., Шиаффонати Л. и др. (сентябрь 2002 г.). «Транскрипционный корепрессор MTG16a содержит новую последовательность ядрышкового нацеливания, нарушенную при t (16; 21)-позитивных миелоидных злокачественных новообразованиях» . Онкоген . 21 (43): 6703–6712. дои : 10.1038/sj.onc.1205882 . ПМИД 12242670 .
- Петри К., Гидес Ф., Хауэлл Л., Хили Л., Ваксман С., Гривз М., Зелент А. (май 2003 г.). «Ген гистондеацетилазы 9 кодирует несколько изоформ белка» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16059–16072. дои : 10.1074/jbc.M212935200 . ПМИД 12590135 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- HDAC9 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
