HDAC8

HDAC8
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1T64, 1T67, 1T69, 1VKG, 1W22, 2V5W, 2V5X, 3EW8, 3EWF, 3EZP, 3EZT, 3F06, 3F07, 3F0R, 3MZ3, 3MZ4, 3MZ6, 3MZ7, 3RQD, 3SFF, 3SFH, 4QA0, 4QA1, 4QA2, 4QA3, 4QA4, 4QA5, 4QA6, 4QA7, 4RN0, 4RN1, 4RN2, 5DC7, 5D1D, 5D1C, 5DC8, 5D1B, 5DC5, 5DC6, 5BWZ
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC8 , CDLS5, HD8, HDACL1, MRXS6, RPD3, WTS, CDA07, деацетилаза гистонов 8, KDAC8
Внешние идентификаторы	Опустить : 300269 ; МГИ : 1917565 ; Гомологен : 41274 ; Генные карты : HDAC8 ; OMA : HDAC8 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	72,573,101 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	101,548,965 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	epithelium of colon; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right adrenal gland; ; tendon of biceps brachii; ; right adrenal cortex; ; gonad; ; Achilles tendon; ; cerebellar hemisphere; ; anterior pituitary;
	Top expressed in
	wall of esophagus; ; mucosa of esophagus; ; epithelium of esophagus; ; ventricular zone; ; Rathke's pouch; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; right kidney; ; zygote; ; embryo;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	Hsp90 protein binding; NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); histone deacetylase activity; metal ion binding; Hsp70 protein binding; protein binding; hydrolase activity; chromatin binding; transcription factor binding; deacetylase activity;
Cellular component	cytoplasm; histone deacetylase complex; cytosol; plasma membrane; nucleoplasm; nuclear chromosome; nucleus;
Biological process	histone H3 deacetylation; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of protein stability; regulation of telomere maintenance; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; sister chromatid cohesion; regulation of cohesin loading; negative regulation of protein ubiquitination; histone deacetylation; negative regulation of gene expression; cellular response to trichostatin A; negative regulation of osteoblast differentiation; cellular response to forskolin; negative regulation of histone H3-K9 acetylation; chromatin organization; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; histone H4 deacetylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	55869
	70315
	ENSG00000147099
	ENSMUSG00000067567
	Q9BY41
	Q8VH37
показывать НМ_001166418 ; НМ_001166419 ; НМ_001166420 ; НМ_001166422 ; НМ_001166448 ;
	NM_018486
	НМ_027382 ; НМ_001313742
показывать НП_001159890 ; NP_001159891 ; NP_001159892 ; NP_001159894 ; НП_001159920 ;
	NP_060956
	НП_001300671 ; НП_081658
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гистондеацетилаза 8 — это фермент , который у человека кодируется HDAC8 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции , развитии клеточного цикла и событиях развития. гистонов Ацетилирование /деацетилирование изменяет структуру хромосом и влияет на доступ транскрипционных факторов к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу I семейства гистонов деацетилазы/acuc/apha. Он обладает активностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию при связывании с промотором . ^{[ 7 ]}

Гистондеацетилаза 8 участвует в морфогенезе черепа. ^{[ 8 ]} и метаболический контроль транскрипционного комплекса ERR-альфа / PGC1-альфа . ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

HDAC8 связан с рядом болезненных состояний, в частности с острым миелоидным лейкозом , и связан с актиновым цитоскелетом в гладкомышечных клетках. siRNA, нацеленная на HDAC8, продемонстрировала противораковый эффект. ^{[ 10 ]} Ингибирование апоптоза, индуцированного HDAC8, наблюдалось при Т-клеточных лимфомах . ^{[ 11 ]} Кроме того, фермент HDAC8 участвует в патогенезе нейробластомы . ^{[ 12 ]} Поэтому существует интерес к разработке селективных ингибиторов HDAC8. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} Было обнаружено по меньшей мере 20 мутаций этого гена, вызывающих заболевания. ^{[ 15 ]}

Взаимодействия

ЭРР-альфа . ^{[ 9 ]}

См. также

Гистоновая деацетилаза

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147099 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067567 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ МакДонелл Н., Рамсер Дж., Фрэнсис Ф., Винет М.К., Райдер С., Судбрак Р., Риссельман Л., Яспо М.Л., Рейнхардт Р., Монако А.П., Росс Ф., Кан А., Кирни Л., Бакл В., Челли Дж. (май 2000 г.). «Характеристика очень сложной области Xq13 и картирование трех изодицентрических точек разрыва, связанных с прелейкемией». Геномика . 64 (3): 221–9. дои : 10.1006/geno.2000.6128 . ПМИД 10756090 .
^ Ван ден Вингаерт И., де Врис В., Кремер А., Нифс Дж., Верхасселт П., Люйтен В.Х., Касс С.У. (август 2000 г.). «Клонирование и характеристика деацетилазы гистонов человека 8» . ФЭБС Летт . 478 (1–2): 77–83. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01813-5 . ПМИД 10922473 . S2CID 12335886 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC8 8» .
^ Хаберланд М., Мокаллед М.Х., Монтгомери Р.Л., Олсон Э.Н. (июль 2009 г.). «Эпигенетический контроль морфогенеза черепа с помощью деацетилазы гистонов 8» . Генс Дев . 23 (14): 1625–30. дои : 10.1101/gad.1809209 . ПМЦ 2714711 . ПМИД 19605684 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Уилсон Б.Дж., Трембле А.М., Деблуа Дж., Сильвен-Дроле Дж., Жигер В. (июль 2010 г.). «Переключатель ацетилирования модулирует транскрипционную активность эстроген-связанного рецептора альфа» . Мол. Эндокринол . 24 (7): 1349–58. дои : 10.1210/me.2009-0441 . ПМК 5417470 . ПМИД 20484414 .
^ Галлинари П., Ди Марко С., Джонс П., Паллаоро М., Стейнкюлер С. (март 2007 г.). «HDAC, деацетилирование гистонов и транскрипция генов: от молекулярной биологии до лечения рака». Сотовый Res . 17 (3): 195–211. дои : 10.1038/sj.cr.7310149 . ПМИД 17325692 . S2CID 30268983 .
^ Баласубраманиан С., Рамос Дж., Луо В., Сирисавад М., Вернер Э., Багги Дж.Дж. (май 2008 г.). «Новый ингибитор гистондеацетилазы 8 (HDAC8) PCI-34051 индуцирует апоптоз при Т-клеточных лимфомах» . Лейкемия . 22 (5): 1026–34. дои : 10.1038/leu.2008.9 . ПМИД 18256683 .
^ Оме И, Дойбцер Х.Э., Вегенер Д., Пикерт Д., Линке Дж.П., Херо Б, Копп-Шнайдер А., Вестерманн Ф., Ульрих С.М., фон Даймлинг А., Фишер М., Витт О (январь 2009 г.). «Гистондеацетилаза 8 в онкогенезе нейробластомы» . Клин. Рак Рез . 15 (1): 91–9. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-08-0684 . ПМИД 19118036 .
^ Патил В., Соджи К.Х., Корнаки-младший, Мркшич М., Ойелере А.К. (май 2013 г.). «3-Гидроксипиридин-2-тион как новая цинксвязывающая группа для селективного ингибирования деацетилазы гистонов» . Журнал медицинской химии . 56 (9): 3492–506. дои : 10.1021/jm301769u . ПМЦ 3657749 . ПМИД 23547652 .
^ Сузуки Т., Ота Ю., Ри М., Бандо М., Гото А., Ито Ю., Цумото Х., Татум П.Р., Мизуками Т., Накагава Х., Иида С., Уэда Р., Сирахигэ К., Мията Н. (ноябрь 2012 г.). «Быстрое открытие высокоэффективных и селективных ингибиторов деацетилазы гистонов 8 с использованием клик-химии для создания библиотек-кандидатов». Журнал медицинской химии . 55 (22): 9562–75. дои : 10.1021/jm300837y . ПМИД 23116147 .
^ Шимчикова Д., Хенеберг П. (декабрь 2019 г.). «Уточнение прогнозов эволюционной медицины на основе клинических данных о проявлениях менделевских болезней» . Научные отчеты . 9 (1): 18577. Бибкод : 2019NatSR...918577S . дои : 10.1038/s41598-019-54976-4 . ПМК 6901466 . ПМИД 31819097 .

Дальнейшее чтение

Вальтреньи Д., Де Леваль Л., Глениссон В., Ли Тран С., Норт Б.Дж., Белласен А., Вейдл У., Вердин Э., Кастроново В. (2004). «Экспрессия гистондеацетилазы 8, гистондеацетилазы класса I, ограничена клетками, демонстрирующими дифференцировку гладкомышечных клеток в нормальных тканях человека» . Я Джей Патол . 165 (2): 553–64. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63320-2 . ПМК 1618574 . ПМИД 15277229 .
Глениссон В., Вальтреньи Д., Тран С.Л., Норт Б.Дж., Вердин Э., Колидж А., Кастроново В. (июнь 2005 г.). «Гистондеацетилаза HDAC8 связывается с альфа-актином гладких мышц и необходима для сократимости гладкомышечных клеток» . ФАСЕБ Дж . 19 (8): 966–8. doi : 10.1096/fj.04-2303fje . ПМИД 15772115 . S2CID 12006005 .
Ведель Т., Ван Эйс Г.Дж., Валтреньи Д., Глениссон В., Кастроново В., Вандервинден Дж.М. (2006). «Новые маркеры гладких мышц выявляют аномалии мускулатуры кишечника при тяжелых нарушениях моторики толстой кишки». Нейрогастроэнтерол. Мотиль . 18 (7): 526–38. дои : 10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x . ПМИД 16771768 . S2CID 58462 .
Вердин Э., Декьедт Ф., Каслер Х.Г. (2003). «Гистондеацетилазы класса II: универсальные регуляторы». Тенденции Жене . 19 (5): 286–93. CiteSeerX 10.1.1.464.415 . дои : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . ПМИД 12711221 .
Ху Э, Чен З, Фредриксон Т и др. (2000). «Клонирование и характеристика новой деацетилазы гистонов класса I человека, которая действует как репрессор транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 275 (20): 15254–64. дои : 10.1074/jbc.M908988199 . ПМИД 10748112 .
Багги Дж.Дж., Сидерис М.Л., Мак П. и др. (2001). «Клонирование и характеристика новой деацетилазы гистонов человека, HDAC8» . Биохим. Дж . 350 (1): 199–205. дои : 10.1042/0264-6021:3500199 . ПМЦ 1221242 . ПМИД 10926844 .
Аманн Дж.М., Нип Дж., Стром Д.К. и др. (2001). «ETO, мишень t(8;21) при остром лейкозе, устанавливает четкие контакты с несколькими деацетилазами гистонов и связывает mSin3A через свой домен олигомеризации» . Мол. Клетка. Биол . 21 (19): 6470–83. дои : 10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001 . ПМК 99794 . ПМИД 11533236 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Дерст К.Л., Луттербах Б., Куммалу Т. и др. (2003). «Слитый белок inv(16) связывается с корепрессорами через домен тяжелой цепи гладкомышечного миозина» . Мол. Клетка. Биол . 23 (2): 607–19. дои : 10.1128/MCB.23.2.607-619.2003 . ПМЦ 151524 . ПМИД 12509458 .
Родригес М., Юй Х, Чен Дж., Сунъян З. (2004). «Специфичность связывания фосфопептидов COOH-концевых доменов BRCA1 (BRCT)» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52914–8. дои : 10.1074/jbc.C300407200 . ПМИД 14578343 .
Джонсон Дж.М., Касл Дж., Гарретт-Энгеле П. и др. (2004). «Полногеномное исследование альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов экзонных соединений». Наука . 302 (5653): 2141–4. CiteSeerX 10.1.1.1017.9438 . дои : 10.1126/science.1090100 . ПМИД 14684825 . S2CID 10007258 .
Ли Х, Резай-Заде Н, Сето Э (2004). «Негативная регуляция активности гистондеацетилазы 8 циклической AMP-зависимой протеинкиназой А» . Мол. Клетка. Биол . 24 (2): 765–73. дои : 10.1128/MCB.24.2.765-773.2004 . ПМЦ 343812 . ПМИД 14701748 .
Ваннини А., Вольпари С., Филокамо Г. и др. (2004). «Кристаллическая структура эукариотической цинк-зависимой деацетилазы гистонов, HDAC8 человека, в комплексе с ингибитором гидроксамовой кислоты» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (42): 15064–9. Бибкод : 2004PNAS..10115064V . дои : 10.1073/pnas.0404603101 . ПМК 524051 . ПМИД 15477595 .
Уолтреньи Д., Норт Б., Ван Мелларт Ф. и др. (2005). «Скрининг экспрессии гистондеацетилаз (HDAC) при раке предстательной железы человека выявляет различные профили HDAC класса I между эпителиальными и стромальными клетками». Европейский журнал гистохимии . 48 (3): 273–90. ПМИД 15590418 .
Вальтреньи Д., Глениссон В., Тран С.Л. и др. (2006). «Гистондеацетилаза HDAC8 связывается с альфа-актином гладких мышц и необходима для сократимости гладкомышечных клеток» . ФАСЕБ Дж . 19 (8): 966–8. doi : 10.1096/fj.04-2303fje . ПМИД 15772115 . S2CID 12006005 .
Гантт С.Л., Гаттис С.Г., Фиерке К.А. (2006). «Каталитическая активность и ингибирование деацетилазы гистонов человека 8 зависит от идентичности иона металла в активном центре». Биохимия . 45 (19): 6170–8. дои : 10.1021/bi060212u . ПМИД 16681389 .
Ли Х., Сенгупта Н., Виллагра А. и др. (2006). «Гистондеацетилаза 8 защищает белок человеческих теломер 1B (hEST1B) от деградации, опосредованной убиквитином» . Мол. Клетка. Биол . 26 (14): 5259–69. дои : 10.1128/MCB.01971-05 . ПМЦ 1592721 . ПМИД 16809764 .
Ваннини А., Вольпари С., Галлинари П. и др. (2007). «Связывание субстрата с деацетилазами гистонов, как показано кристаллической структурой комплекса HDAC8-субстрат» . Отчеты ЭМБО . 8 (9): 879–84. дои : 10.1038/sj.embor.7401047 . ЧВК 1973954 . ПМИД 17721440 .
Накагава М., Ода Ю., Эгучи Т. и др. (2007). «Профиль экспрессии деацетилаз гистонов класса I в раковых тканях человека» . Онкол. Представитель . 18 (4): 769–74. дои : 10.3892/или.18.4.769 . ПМИД 17786334 .

Внешние ссылки

HDAC8 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147099 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067567 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10756090-5] МакДонелл Н., Рамсер Дж., Фрэнсис Ф., Винет М.К., Райдер С., Судбрак Р., Риссельман Л., Яспо М.Л., Рейнхардт Р., Монако А.П., Росс Ф., Кан А., Кирни Л., Бакл В., Челли Дж. (май 2000 г.). «Характеристика очень сложной области Xq13 и картирование трех изодицентрических точек разрыва, связанных с прелейкемией». Геномика . 64 (3): 221–9. дои : 10.1006/geno.2000.6128 . ПМИД 10756090 .

[pmid10922473-6] Ван ден Вингаерт И., де Врис В., Кремер А., Нифс Дж., Верхасселт П., Люйтен В.Х., Касс С.У. (август 2000 г.). «Клонирование и характеристика деацетилазы гистонов человека 8» . ФЭБС Летт . 478 (1–2): 77–83. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01813-5 . ПМИД 10922473 . S2CID 12335886 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: деацетилаза гистонов HDAC8 8» .

[pmid19605684-8] Хаберланд М., Мокаллед М.Х., Монтгомери Р.Л., Олсон Э.Н. (июль 2009 г.). «Эпигенетический контроль морфогенеза черепа с помощью деацетилазы гистонов 8» . Генс Дев . 23 (14): 1625–30. дои : 10.1101/gad.1809209 . ПМЦ 2714711 . ПМИД 19605684 .

[pmid20484414-9] Перейти обратно: ^а ^б Уилсон Б.Дж., Трембле А.М., Деблуа Дж., Сильвен-Дроле Дж., Жигер В. (июль 2010 г.). «Переключатель ацетилирования модулирует транскрипционную активность эстроген-связанного рецептора альфа» . Мол. Эндокринол . 24 (7): 1349–58. дои : 10.1210/me.2009-0441 . ПМК 5417470 . ПМИД 20484414 .

[pmid17325692-10] Галлинари П., Ди Марко С., Джонс П., Паллаоро М., Стейнкюлер С. (март 2007 г.). «HDAC, деацетилирование гистонов и транскрипция генов: от молекулярной биологии до лечения рака». Сотовый Res . 17 (3): 195–211. дои : 10.1038/sj.cr.7310149 . ПМИД 17325692 . S2CID 30268983 .

[pmid18256683-11] Баласубраманиан С., Рамос Дж., Луо В., Сирисавад М., Вернер Э., Багги Дж.Дж. (май 2008 г.). «Новый ингибитор гистондеацетилазы 8 (HDAC8) PCI-34051 индуцирует апоптоз при Т-клеточных лимфомах» . Лейкемия . 22 (5): 1026–34. дои : 10.1038/leu.2008.9 . ПМИД 18256683 .

[pmid19118036-12] Оме И, Дойбцер Х.Э., Вегенер Д., Пикерт Д., Линке Дж.П., Херо Б, Копп-Шнайдер А., Вестерманн Ф., Ульрих С.М., фон Даймлинг А., Фишер М., Витт О (январь 2009 г.). «Гистондеацетилаза 8 в онкогенезе нейробластомы» . Клин. Рак Рез . 15 (1): 91–9. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-08-0684 . ПМИД 19118036 .

[pmid23547652-13] Патил В., Соджи К.Х., Корнаки-младший, Мркшич М., Ойелере А.К. (май 2013 г.). «3-Гидроксипиридин-2-тион как новая цинксвязывающая группа для селективного ингибирования деацетилазы гистонов» . Журнал медицинской химии . 56 (9): 3492–506. дои : 10.1021/jm301769u . ПМЦ 3657749 . ПМИД 23547652 .

[pmid23116147-14] Сузуки Т., Ота Ю., Ри М., Бандо М., Гото А., Ито Ю., Цумото Х., Татум П.Р., Мизуками Т., Накагава Х., Иида С., Уэда Р., Сирахигэ К., Мията Н. (ноябрь 2012 г.). «Быстрое открытие высокоэффективных и селективных ингибиторов деацетилазы гистонов 8 с использованием клик-химии для создания библиотек-кандидатов». Журнал медицинской химии . 55 (22): 9562–75. дои : 10.1021/jm300837y . ПМИД 23116147 .

[Šimčíková_2019_-_supplementary_table_S7-15] Шимчикова Д., Хенеберг П. (декабрь 2019 г.). «Уточнение прогнозов эволюционной медицины на основе клинических данных о проявлениях менделевских болезней» . Научные отчеты . 9 (1): 18577. Бибкод : 2019NatSR...918577S . дои : 10.1038/s41598-019-54976-4 . ПМК 6901466 . ПМИД 31819097 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

v т и Гидролазы : углеродно-азотные непептидные ( EC 3,5)
3.5.1: Linear amides / Amidohydrolases	Asparaginase Glutaminase Urease Biotinidase Aminoacylase ACY1 Aspartoacylase(ACY2) ACY3 Ceramidase Aspartylglucosaminidase Fatty acid amide hydrolase Histone deacetylase Sirtuin
3.5.2: Cyclic amides/ Amidohydrolases	Barbiturase Beta-lactamase Dihydroorotase
3.5.3: Linear amidines/ Ureohydrolases	Arginase Agmatinase Protein-arginine deiminase
3.5.4: Cyclic amidines/ Aminohydrolases	Guanine deaminase Adenosine deaminase AMP deaminase Inosine monophosphate synthase DCMP deaminase GTP cyclohydrolase I Cytidine deaminase AICDA Activation-induced cytidine deaminase
3.5.5: Nitriles/ Aminohydrolases	Nitrilase
3.5.99: Other	Riboflavinase Thiaminase II

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)